| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006155 |
| Length | 4,744,671 |
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The map label for this gene is 51597529
Identifier: 51597529
GI number: 51597529
Start: 3783316
End: 3792627
Strand: Reverse
Name: 51597529
Synonym: YPTB3219
Alternate gene names: NA
Gene position: 3792627-3783316 (Counterclockwise)
Preceding gene: 51597530
Following gene: 51597522
Centisome position: 79.93
GC content: 37.12
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCAAAATAGATTAGCAGGAAGAGAGGCTGAGGGCAGGTTTCTGCCCTCAGAGACACCAGTCATACTGCAAACTGCTTG TGTGTTGGTTGCCTTCCTGC
Product: pore forming RTX toxin family protein
Products: NA
Alternate protein names: RTX xin RtxA; RTX-Family Protein; RTX-Like xin; Autotransporter Adhesin; FG-GAP Repeat Containing RTX-Family Protein; Xin Protein RtxA; Mcf Protein; FG-GAP Repeat And RTX-Family Protein; Xin RtxA; Virulence Determinant; Xin RtxA Protein; Rtx xin RtxA
Number of amino acids: Translated: 3103; Mature: 3102
Protein sequence:
>3103_residues MPNGNEMAGFYINKLSLSQRLSILSETYDRINKNNKKEKFKYSYADIEMIKKRFIKYIDAQLYSLIREGFSVPTTLTQEE KIKIADLAIDAALYNDYGRFNELIIYISSLGISVTPPLPQEEGGSRLYIYFSGDIHTYMDVWRGDLLVGSGTELSDIQSI TGLRFMIDMAESLKLNIINPSDKAMVDLINHLRYKMISYASSFYATYSAERGGTVYLSSPGGLRINNYFWNSELPVLRAL QKQGLIGDIRILHKPLEFYKDTPLDELGDLLTAKDLSMTAEYQFLPVWLQEKLLVDIYQQWLDEEFQPSLFTVRKEIINT IDIDRNAPEVELLRYFLSKIHEQLDEITEYKVLIEAERIDFIKKKIAVGSEIESWLDNVPAIDVNERKVILENLLQKESL LFSNVRDIKKFPIPLDFNSDVINVNTSKLKNTFIPFNLLREKWDIIISDRSLVDGTLTIHFSAGRKIMIKVDANRNQLKQ MATLERFLLANFTPKNAPQDLQLIENVIMSGDAVLAERKGDKGWHNDQQMIEKVKLSEFDYFLKSNDLGIKINDNGFVLY LISDPEDSRDVIINPNNDYNLKSIKDFIENNYLFFDDVPEYLIVKKNAENKECIFAHNERETYQVAYRDEGTWVLLYKKD LSDQIKIINEITTSVNMNNAESRSVALILCLLNKHVRLVSILPDTHPKVMENLLDIDSLLKNSKHPFSHPHYNKILDSLS NDINDNVNSLQEIKDFTRFFSYDIKPGMYMNTWDKIDKNVVLEYAVKQNNKNQYPQFIVLLQDDSLSKRVGEVLSSYHHD KSVVLQFDARSSEARIAYGVPSNIAEMGGFELSFVTHGAPDGLYSFSIANIIDIYKLTTNSFALPPPVKIRLVICSIADN GQGAQGFNGTHPALGIVNMMHQEGFDIPILAYTTKVGVSVEYPGELVVFNSENQGGVLENIDDYQVLYHYKNNILLIDGI PAVELLLKDVRDKIKSVDQLIESYSQYLVPFFSDNNGVIDRNLLELTINDSNTHSKFENFLDIIRQRPELRNSDNWQLVV ANNATGFLITTLDEPVVKYPDIVKVNEWDLPAIANIDKTATASQYDMQIVFQCENNPTVNRAATRLAGKHAKNSIIIQLD VDNNHRAFIIDDNIHAEWREISHNELVTKLKIQPENGKIRWQVVGHGRSEGGNDKHPTLAGQRPEQLTARLNQFSDYLQT EHQINISPQQVSLVGCAMSSSDRYTSFAHKFMSHLNENGIRTNVSASTKAIEVDPLGHKHDVDTPDIDSYNNKYLSSIKG TEKLYWNRWGEITTERKKDINGRLNNIDSLLDNLITRQLSVNQINKKQQRKLAEIFPQLTDKKLNKGELLLTLHDSWRMQ TLKYDLLFLQKISDRPDFDTELWRVTDRWRITETDGNTLQDVRIKSGSQHKTDLATYPHSITSDPDLKTSNPKARTAIFG RFGYGMQGYGFISALRLSADYQRWMSNGDLTEKQEEEIQLQLAMAWGGIGANLATDGLQYAFGKWGIGYLQKLVSKGGRL SPALLSQLTLLKRNPALLLAPGFLKDLRKLALNQFAHGAARFSMPLLSALTSGIDIYQAYHAFSQLATETDPHVRRDLIA SGVFSTINATIGLGVAFAMAMGGTAATAAGPAGIALAFTMIIVGDIYSAVSQIERIRDIVPDMTGSQRFENGLRLFLKFG LTPGLDNQIRYNQTMESVYQRQRDYYEALLASKQGVDTLFYSRGEAVLKAIPFIKRDERSQTERDLEKISIFSGDPFTNA KIYTTYAEMGKHEYYELDKINDVDDYVIADFFEDNNRSVVKLQNKNLHQAFSELDIDSTYSPFILSADVDRNGLNDFIVI NEKYNTTIASRKNSVGMTVIDDYVSRWHYELYTWLAQPDGSYLKIDTRLEWEKLFHAIEVDKFNEVVFPVLGDFNGDNVF ELVIFHDDKMTTYHYDSLDFNQSGKDNHNVINIGDFIEPVRLAFEGEKSKNYPYSLVGDINNDGFDDILLLNKSGDMLHL MGNSSGVFRQHKTKLSSELTSLLSSSNLHRSQLQLTDLNKDGGLDLVIILNDGIYYQALGDKIDGEYHFDTPSMVNKITI KTEGGDSVRYQQNRLSQINKNKIIAISPSDQGENRLISLSDSGELLAHPLREIKENDVAALFDLGGGDDVAKGYHKKKNI FTIGSGFKQYQGGENADTFILTSAAASKSHILSGGEGNDTVALGEVLGNEIDSIIDISKGYYSQVNGGVEKQVALLYDFE NILGHENVNDTIIGNDVDNYLNGMGGDDKIWGNGGNDLLALQSGLAQGGTGLDSYHILKSTHEKSLQIRIEEVSENNNTD MQISNIFLEHKLNQIKSIELDNIDVLININNDNGFMTQIRLVGVYNINNNQKQQVLNFTIQTVDGFTMVPLWPSYLNEIT EFSPNMVAYYSSLVDRNYKELVGKGDPDDIVVRFSLDNGYQQQQVTHLQRVEGEKDIVLRQAILPDFIRLSPQEHSMLMG FLPRYELLGDNKDNLLQVLSGEGLLEGRGGQDTYLIQEKEGSPTDIIINNFDDSLASDNLVLSSWLLCDVIVERSDDDLL LRYRDQPEKHQSIRLVNYMNDERYRHLKITDKSGQSQYRDPVTGTFIDYQINLDKNGHPFIAAQQAPVVSSGNDEVVINS ATFLPGNYIDTGDGNDAIIYIRGHEGTMLKGGGGDDTYYYSAGSGAINIADTSGLDHLYLDKHILLHTLSAERRENNLVL NIADNTSGRIIFVDWYLADENKVDFIWVEGSQITFDELFSLCPYSDEYYQLCQQLKSMGLSLTVRQLADLDSQDGYNTLN QLRTIKAWATKNPIYDVADLDYLVAMSSIAWRGNARNTDPLPLIEQKIDAFFQPLIAERISLTEEHVTWIQREEFDTVDI AKWVKNYHLRSQNEINYLLEQLGLLKESPLSDKALDFTFKNRIDLAQADIELCQQECGINRQSLINLAMKYHVTGRGHFE LLISNIQVLKEYGVVVSESEQPLVLRKPIDLRQYFNQKNLTKDHVGRLAEHDMSFDELTLLLDKNIPIEQAFTQRLQTQL GPLKLFNDERVLNQGDIFDQDISQLAEAMGGLESTESYSLPLERQTAMAITTHQFVSDSIAAY
Sequences:
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