Definition Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome.
Accession NC_005966
Length 3,598,621

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The map label for this gene is 50086181

Identifier: 50086181

GI number: 50086181

Start: 3113146

End: 3115422

Strand: Reverse

Name: 50086181

Synonym: ACIAD3184

Alternate gene names: NA

Gene position: 3115422-3113146 (Counterclockwise)

Preceding gene: 50086182

Following gene: 50086176

Centisome position: 86.57

GC content: 42.69

Gene sequence:

>2277_bases
CTGAAAGGTATCAACCGATTGCCAAGGACATCATATTTATTGATAGATAAATGTGAAAATCAAAAAAGTGGAACAGATAT
GCAAGAAAATCAAGAACAAAGATCTGGCCTAGGGTTTCTAGGTTATATCTGGAATGAATGGATTTCGACATTTGCCATCC
TGATTTTACTGTTACTGACGTTAATTGTTGGTACAGGTGAAATGATTCATGGGCAGTTGCTGCGAATGGGTGAGCAACTC
TATGGTGATCAGACCACAGGAATGCAATATTCCTTCCTGCGCGCAGAACCACAAAAACCAACCTGCGAACGCCATCCCAA
TATTGATGCCCAAGTACAGCAACAAATGAAGGCAAACAAAAATGATGAGTTTGCTGATTTCTTTGGTGCAGCATCTGAAC
AGGATGTTCGCGCTTCTCTGATGGCGGCACAACAACTGTGTGAAGAAAAATATCAGTTTTATGATAAAGCGATTGCGCAT
CTGGATAAACATCCAACACTACGGGCTTATCGCACATTAGAAACTGGTTTTTTTGCAATTTTTAAATTCGGAAGTGAAAA
CCGAACGATTTTCCTGCTGATCATGGTGTTTTTTGCTGCGATTACAGCAAGCCTAAAAATTCATCATATTGGGTTGCGTA
GCCCAAAAACCAAAATTGATTTTATTGTTTATTCTGTTGCGATGATCATTGGTAATGGCCTGTTGACGATGTCAACCATC
AGCCAGTATCGTTCATTAATTCATTCTGGCGTTACAGCAACGACAGAAACCTTGGTGATCTCTTGGCTTTGGATTACTCT
ATTTGCAGCTTTAACGCTGATTAGCGTATTTCAGTTGTTTAGAATTCCTAAGACTGCACAGCCAGGAGGCAATTTCGGTC
TGGCCTTACTTAGTGTGCCGCTCTACGCTTTCATGTCGATTTTGACAGGTCTGGCTTTTACCTTCTTTATGGATTATCCA
ATGGGTCAGGGGATCTATCTGGGTATTCTTGTGGAGTTCTCAGGTATTTTCCTGAACTTGGCGTTGTTTATCTGGGCAGG
GATGTTGCTGACCCAAACCCGTGTAATGGATCTGTTCTTGGATATTTTACGTCCATGGAATCTGGCACCAGAAACACTAA
CATGGTTAATCTTATTGGCGGCTGCAATTCCAACTGCATATACTGGCGCTTCAGGAATTTTCGTGATCGCGGCGGGTGCG
ATTATTTATAAAGAGGTCTGGAATTCTGGCGCACGTCGTCAGTATGCATTGGCGGTTTCGGCAATGTCAGGTTCTTTAGG
TGTCGTGATTCGTCCATGTCTATTGGTGGTATTGATTGCCATGCTTGATAGCCGTCATGTCACTTCTGATGAGTTATTCG
ATCATGGTTTTTATGTTTTCTGGCTAACGGCATTTATTTTCTTGGGGGTTTCGTTACTTCTGGCAGAGACTAAATTCCGT
GTGAATTCGCCACGGATTGCTGTGCCAAAGATGCTACGTGCCTGTGTGCCAGTGATTCCTTACGTGTTGATCACAGTTGT
GGTACTGGTATTCTACAAATATGCACTAGATACTGGCATGAATGAATTCACCGCGCCCATGATTCTACCACTGATTCTGA
TTGCGATTATTTTCTATGACAAACTTGGAAAACAGCCTAAATCGACTCCAGTCATGGCTGAGCATGAATCCTTGATCAAG
GAGCATGAACAGAATTCTCCATTTTTACGTGAACATGGTGCACAAAGTACGCAATATCGTCGTGGTTTTGCCAAGTCAAT
GCATTTTGCTACCGCAGAAACAGTGGGACATATTGGGGCATTAATTATTTTAATGGCTTTATCTGCCAGTGTCGGTGGCC
TAATTGAACGCACAGAAATCGTTGAATATTTACCAACTCACTTGGGCAGTATTACAATTTCATTGTTCTTTATTGCGATG
TTGCTTGCGCTGATTGGAATGTGTACTGACCCATTTGGGGCAGTGATTTTGGTGGCAGCAACGATTGCACCTGTTGCCTA
CGAAAATGGAATCCATCCGATTCATTTCTGGATGATTGTGTTGGTTGCCTTTGAGCTGGGCTATGTGACGCCGCCAGTTG
CATTGAACCATTTGCTGACCAGGCTATCAGTCGGAGATGAAGAGGTTTCTGCTGCCGATCAGGAGGCCAAAGAAAAGTAC
ACCAGTTTTTATTACCGTTATGAACGCTGGTTGTTACCGATTATGGTGTTATTCCCAGCCTTGATGATTGTGACCTTTGC
ACCGTACATCTTTAAAATGTTCGGTTGGTATTCATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAGTGAGAGTAAGTTGACAAAATAAACCTAGAAAAAAATGATTCAAGTCATTCTTTCACTATGTCGTTTATTGCAAAG
ATACATCAATAAAAGAATGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGATTACGATATAAAAAAAGCACCCAAAGGTGCTTTTTTTATTTTTATGATTTAGATCGGGGTTTAAACTGGATGACACC
CACTTCATCTGCTACCGTAG

Product: integral membrane protein, transporter

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 758; Mature: 758

Protein sequence:

>758_residues
MKGINRLPRTSYLLIDKCENQKSGTDMQENQEQRSGLGFLGYIWNEWISTFAILILLLLTLIVGTGEMIHGQLLRMGEQL
YGDQTTGMQYSFLRAEPQKPTCERHPNIDAQVQQQMKANKNDEFADFFGAASEQDVRASLMAAQQLCEEKYQFYDKAIAH
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LLALIGMCTDPFGAVILVAATIAPVAYENGIHPIHFWMIVLVAFELGYVTPPVALNHLLTRLSVGDEEVSAADQEAKEKY
TSFYYRYERWLLPIMVLFPALMIVTFAPYIFKMFGWYS

Sequences:

>Translated_758_residues
MKGINRLPRTSYLLIDKCENQKSGTDMQENQEQRSGLGFLGYIWNEWISTFAILILLLLTLIVGTGEMIHGQLLRMGEQL
YGDQTTGMQYSFLRAEPQKPTCERHPNIDAQVQQQMKANKNDEFADFFGAASEQDVRASLMAAQQLCEEKYQFYDKAIAH
LDKHPTLRAYRTLETGFFAIFKFGSENRTIFLLIMVFFAAITASLKIHHIGLRSPKTKIDFIVYSVAMIIGNGLLTMSTI
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MGQGIYLGILVEFSGIFLNLALFIWAGMLLTQTRVMDLFLDILRPWNLAPETLTWLILLAAAIPTAYTGASGIFVIAAGA
IIYKEVWNSGARRQYALAVSAMSGSLGVVIRPCLLVVLIAMLDSRHVTSDELFDHGFYVFWLTAFIFLGVSLLLAETKFR
VNSPRIAVPKMLRACVPVIPYVLITVVVLVFYKYALDTGMNEFTAPMILPLILIAIIFYDKLGKQPKSTPVMAEHESLIK
EHEQNSPFLREHGAQSTQYRRGFAKSMHFATAETVGHIGALIILMALSASVGGLIERTEIVEYLPTHLGSITISLFFIAM
LLALIGMCTDPFGAVILVAATIAPVAYENGIHPIHFWMIVLVAFELGYVTPPVALNHLLTRLSVGDEEVSAADQEAKEKY
TSFYYRYERWLLPIMVLFPALMIVTFAPYIFKMFGWYS
>Mature_758_residues
MKGINRLPRTSYLLIDKCENQKSGTDMQENQEQRSGLGFLGYIWNEWISTFAILILLLLTLIVGTGEMIHGQLLRMGEQL
YGDQTTGMQYSFLRAEPQKPTCERHPNIDAQVQQQMKANKNDEFADFFGAASEQDVRASLMAAQQLCEEKYQFYDKAIAH
LDKHPTLRAYRTLETGFFAIFKFGSENRTIFLLIMVFFAAITASLKIHHIGLRSPKTKIDFIVYSVAMIIGNGLLTMSTI
SQYRSLIHSGVTATTETLVISWLWITLFAALTLISVFQLFRIPKTAQPGGNFGLALLSVPLYAFMSILTGLAFTFFMDYP
MGQGIYLGILVEFSGIFLNLALFIWAGMLLTQTRVMDLFLDILRPWNLAPETLTWLILLAAAIPTAYTGASGIFVIAAGA
IIYKEVWNSGARRQYALAVSAMSGSLGVVIRPCLLVVLIAMLDSRHVTSDELFDHGFYVFWLTAFIFLGVSLLLAETKFR
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EHEQNSPFLREHGAQSTQYRRGFAKSMHFATAETVGHIGALIILMALSASVGGLIERTEIVEYLPTHLGSITISLFFIAM
LLALIGMCTDPFGAVILVAATIAPVAYENGIHPIHFWMIVLVAFELGYVTPPVALNHLLTRLSVGDEEVSAADQEAKEKY
TSFYYRYERWLLPIMVLFPALMIVTFAPYIFKMFGWYS

Specific function: Unknown

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84864; Mature: 84864

Theoretical pI: Translated: 7.15; Mature: 7.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKGINRLPRTSYLLIDKCENQKSGTDMQENQEQRSGLGFLGYIWNEWISTFAILILLLLT
CCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIVGTGEMIHGQLLRMGEQLYGDQTTGMQYSFLRAEPQKPTCERHPNIDAQVQQQMKANK
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCC
NDEFADFFGAASEQDVRASLMAAQQLCEEKYQFYDKAIAHLDKHPTLRAYRTLETGFFAI
CCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FKFGSENRTIFLLIMVFFAAITASLKIHHIGLRSPKTKIDFIVYSVAMIIGNGLLTMSTI
EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SQYRSLIHSGVTATTETLVISWLWITLFAALTLISVFQLFRIPKTAQPGGNFGLALLSVP
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LYAFMSILTGLAFTFFMDYPMGQGIYLGILVEFSGIFLNLALFIWAGMLLTQTRVMDLFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILRPWNLAPETLTWLILLAAAIPTAYTGASGIFVIAAGAIIYKEVWNSGARRQYALAVS
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEE
AMSGSLGVVIRPCLLVVLIAMLDSRHVTSDELFDHGFYVFWLTAFIFLGVSLLLAETKFR
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VNSPRIAVPKMLRACVPVIPYVLITVVVLVFYKYALDTGMNEFTAPMILPLILIAIIFYD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLGKQPKSTPVMAEHESLIKEHEQNSPFLREHGAQSTQYRRGFAKSMHFATAETVGHIGA
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIILMALSASVGGLIERTEIVEYLPTHLGSITISLFFIAMLLALIGMCTDPFGAVILVAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
TIAPVAYENGIHPIHFWMIVLVAFELGYVTPPVALNHLLTRLSVGDEEVSAADQEAKEKY
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TSFYYRYERWLLPIMVLFPALMIVTFAPYIFKMFGWYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKGINRLPRTSYLLIDKCENQKSGTDMQENQEQRSGLGFLGYIWNEWISTFAILILLLLT
CCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIVGTGEMIHGQLLRMGEQLYGDQTTGMQYSFLRAEPQKPTCERHPNIDAQVQQQMKANK
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NDEFADFFGAASEQDVRASLMAAQQLCEEKYQFYDKAIAHLDKHPTLRAYRTLETGFFAI
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILRPWNLAPETLTWLILLAAAIPTAYTGASGIFVIAAGAIIYKEVWNSGARRQYALAVS
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HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TSFYYRYERWLLPIMVLFPALMIVTFAPYIFKMFGWYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA