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The map label for this gene is betT [H]

Identifier: 50084215

GI number: 50084215

Start: 1002681

End: 1004741

Strand: Direct

Name: betT [H]

Synonym: ACIAD1012

Alternate gene names: 50084215

Gene position: 1002681-1004741 (Clockwise)

Preceding gene: 50084214

Following gene: 50084216

Centisome position: 27.86

GC content: 43.04

Gene sequence:

>2061_bases
ATGGCAACAGATAATCCAAGAGCAGTTGATGATCAAGAGACTCATCCAAAAGATCGTTTAAATCGTGTGGTCTTTTATGT
TTCTGCCCTTATTATTTTAATATTTTCACTCACCACGATTTTATTTAATGATTTTGCTAATCGTGCATTAAATCAAGTAC
TGGATTGGGTCAGCTCTACCTTTAGCTGGTACTACTTGTTGGCAGCCACCTTATATATGGTGTTTGTCATTTTTATTGCC
TGCTCTCGTTATGGCAATATCAAGCTAGGACCCAAACACTCGAAGCCTGAGTTTAGTCTGTTAAGCTGGTCGGCCATGCT
CTTTTCGGCAGGGATCGGCATTGATTTGATGTTCTTCTCGGTGGCAGAGCCGTTATCGCATTATATGCATCCGCCAGTGG
GTGAGGGACAGACTTATGAAGCTGCGCGTCAGGGCATGGTCTGGACACTATTTCACTATGGACTGACAGGCTGGTGTATG
TATGCCTTGATTGGTATGGCACTGGGTTATTTTAGTTATCGTTATAATTTACCACTCACGATCCGCTCTGCCTTGTATCC
AATTTTTGGTAAGAAAATTAATGGCCCGATTGGACATAGTGTGGATACTGCTGCCGTCATCGGAACAATTTTTGGTATTG
CGACGACTTGCGGTATTGGTGTCGTACAACTGAATTATGGACTACACGTTTTATTCGATTTACCTGAAAATTTATGGGTT
CAAACTGCCCTCATTTTGGTTGCCGTCATTATTACCATTATTTCTGTGACTTCAGGTGTCAATAAAGGTTTACGGATTTT
GTCTGAGGTTAACATTTATGTTTCTGTTGGCCTGATGCTGTTTATTTTATTTTTGGGCAATACCGAGTTTTTACTCAATG
CACTTGTTCAAAACGTGGGAGATTATCTAAGCCGTTTTCCAAGTCTGGCGCTAGAAAGTTTTGCTTTTGATCAACCGAAA
GAATGGATGAATAGTTGGACGCTGTTTTTCTGGGCATGGTGGGTGGCGTGGTCTCCATTTGTGGGGCTGTTTCTTGCACG
TATTTCACGTGGACGTACCATTCGTGAGTTTGTATCTGGGACCTTGATTATTCCGTTGCTGTTTACCTTAACCTGGCTCT
CCATTTTTGGAAATAGTGCGCTACACAATGTCATCTTTGATGGCAATATTGCACTTGCTGAAACAGTCCTTTCCAATCCT
GCACATGGTTTTTACGATTTACTGGCACAATACCCATGGTTTCCATTTATTGCGGGCGTGGCAACCATTACAGGATTACT
GTTTTATGTGACTTCGGCAGATTCTGGTGCATTGGTTCTGGGTAACTTCACCACACAATTTACCAATATTGATCACGATG
CGCCGCGCTGGCTGAGTGTGTTTTGGGCAGTGGCGATTGGTTTATTGACCTTGGCTATGCTGATGACCAATGGAATTACT
GCACTGCAAAATGCCACCATCATCATGGGGTTACCGTTTAGTTTCGTGATGTTTCTGGTGATGGCAGGTCTGTATAAATC
CTTGCGGCTTGAAGATTATCGACAGGCCAGCGCCAGTTTAAATGCTGCTCCAGTAGTGGGTAATGTCGATATTCTGAACT
GGAAAAAGCGCTTAACGCGTGTGATGCATCATCCTGGAACGTTTGAAACCAAACGCATGCTCAATGAAATCTGTCGTCCC
GCTGTACATGCAGTTGCAGAGGAGTTACAAAAACGCGCGGTACAAGTGGATGTACTTGAAGTGCCACTTGAAGAAGATGA
AGAACTTTACCATTTGGATATTACGATCCATTTGGAAGAAGAGCAAAACTTTATCTATCAGATCTGGCCTGTCCGTTATA
TTGCACCCAATTTTAGTGAGCGAGGCAAGCGAGGCAAGCAGTTTTACTATCGTCTGGAAACCTATCTTTATGAAGGTTCG
CAAGGCAATGACCTTGTGGGTTATACCAAAGAGCAGGTGATCAACGATATTTTAGATCGCTATGAACGCCACATGACCTT
CTTACATATTAATCGTATTAGTCCGGGTAATCGCCCGCTATTTCCAGATCCTAAAGCCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATGTCATCTATTTTGTCAATCTTTAAGCGGCTGTGAGAGTCAGACTTGAAGATTGGCGTTTTATATTTTTAATTTTCTT
TTTATACCCTTGAGGATTGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGAGCTTTTGAATGTTGACCCCCTATATCCATTCTTTTGCCTTGTTTTTTTCACTGCTGAATCCGTTCCTGATGAGTAT
TTACATGATCGGGATGATCC

Product: choline transport protein BetT

Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 686; Mature: 685

Protein sequence:

>686_residues
MATDNPRAVDDQETHPKDRLNRVVFYVSALIILIFSLTTILFNDFANRALNQVLDWVSSTFSWYYLLAATLYMVFVIFIA
CSRYGNIKLGPKHSKPEFSLLSWSAMLFSAGIGIDLMFFSVAEPLSHYMHPPVGEGQTYEAARQGMVWTLFHYGLTGWCM
YALIGMALGYFSYRYNLPLTIRSALYPIFGKKINGPIGHSVDTAAVIGTIFGIATTCGIGVVQLNYGLHVLFDLPENLWV
QTALILVAVIITIISVTSGVNKGLRILSEVNIYVSVGLMLFILFLGNTEFLLNALVQNVGDYLSRFPSLALESFAFDQPK
EWMNSWTLFFWAWWVAWSPFVGLFLARISRGRTIREFVSGTLIIPLLFTLTWLSIFGNSALHNVIFDGNIALAETVLSNP
AHGFYDLLAQYPWFPFIAGVATITGLLFYVTSADSGALVLGNFTTQFTNIDHDAPRWLSVFWAVAIGLLTLAMLMTNGIT
ALQNATIIMGLPFSFVMFLVMAGLYKSLRLEDYRQASASLNAAPVVGNVDILNWKKRLTRVMHHPGTFETKRMLNEICRP
AVHAVAEELQKRAVQVDVLEVPLEEDEELYHLDITIHLEEEQNFIYQIWPVRYIAPNFSERGKRGKQFYYRLETYLYEGS
QGNDLVGYTKEQVINDILDRYERHMTFLHINRISPGNRPLFPDPKA

Sequences:

>Translated_686_residues
MATDNPRAVDDQETHPKDRLNRVVFYVSALIILIFSLTTILFNDFANRALNQVLDWVSSTFSWYYLLAATLYMVFVIFIA
CSRYGNIKLGPKHSKPEFSLLSWSAMLFSAGIGIDLMFFSVAEPLSHYMHPPVGEGQTYEAARQGMVWTLFHYGLTGWCM
YALIGMALGYFSYRYNLPLTIRSALYPIFGKKINGPIGHSVDTAAVIGTIFGIATTCGIGVVQLNYGLHVLFDLPENLWV
QTALILVAVIITIISVTSGVNKGLRILSEVNIYVSVGLMLFILFLGNTEFLLNALVQNVGDYLSRFPSLALESFAFDQPK
EWMNSWTLFFWAWWVAWSPFVGLFLARISRGRTIREFVSGTLIIPLLFTLTWLSIFGNSALHNVIFDGNIALAETVLSNP
AHGFYDLLAQYPWFPFIAGVATITGLLFYVTSADSGALVLGNFTTQFTNIDHDAPRWLSVFWAVAIGLLTLAMLMTNGIT
ALQNATIIMGLPFSFVMFLVMAGLYKSLRLEDYRQASASLNAAPVVGNVDILNWKKRLTRVMHHPGTFETKRMLNEICRP
AVHAVAEELQKRAVQVDVLEVPLEEDEELYHLDITIHLEEEQNFIYQIWPVRYIAPNFSERGKRGKQFYYRLETYLYEGS
QGNDLVGYTKEQVINDILDRYERHMTFLHINRISPGNRPLFPDPKA
>Mature_685_residues
ATDNPRAVDDQETHPKDRLNRVVFYVSALIILIFSLTTILFNDFANRALNQVLDWVSSTFSWYYLLAATLYMVFVIFIAC
SRYGNIKLGPKHSKPEFSLLSWSAMLFSAGIGIDLMFFSVAEPLSHYMHPPVGEGQTYEAARQGMVWTLFHYGLTGWCMY
ALIGMALGYFSYRYNLPLTIRSALYPIFGKKINGPIGHSVDTAAVIGTIFGIATTCGIGVVQLNYGLHVLFDLPENLWVQ
TALILVAVIITIISVTSGVNKGLRILSEVNIYVSVGLMLFILFLGNTEFLLNALVQNVGDYLSRFPSLALESFAFDQPKE
WMNSWTLFFWAWWVAWSPFVGLFLARISRGRTIREFVSGTLIIPLLFTLTWLSIFGNSALHNVIFDGNIALAETVLSNPA
HGFYDLLAQYPWFPFIAGVATITGLLFYVTSADSGALVLGNFTTQFTNIDHDAPRWLSVFWAVAIGLLTLAMLMTNGITA
LQNATIIMGLPFSFVMFLVMAGLYKSLRLEDYRQASASLNAAPVVGNVDILNWKKRLTRVMHHPGTFETKRMLNEICRPA
VHAVAEELQKRAVQVDVLEVPLEEDEELYHLDITIHLEEEQNFIYQIWPVRYIAPNFSERGKRGKQFYYRLETYLYEGSQ
GNDLVGYTKEQVINDILDRYERHMTFLHINRISPGNRPLFPDPKA

Specific function: High-affinity uptake of choline driven by a proton- motive force [H]

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=675, Percent_Identity=69.037037037037, Blast_Score=975, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=466, Percent_Identity=28.755364806867, Blast_Score=184, Evalue=1e-47,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=510, Percent_Identity=26.8627450980392, Blast_Score=166, Evalue=4e-42,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77563; Mature: 77432

Theoretical pI: Translated: 6.56; Mature: 6.56

Prosite motif: PS01303 BCCT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MATDNPRAVDDQETHPKDRLNRVVFYVSALIILIFSLTTILFNDFANRALNQVLDWVSST
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSWYYLLAATLYMVFVIFIACSRYGNIKLGPKHSKPEFSLLSWSAMLFSAGIGIDLMFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VAEPLSHYMHPPVGEGQTYEAARQGMVWTLFHYGLTGWCMYALIGMALGYFSYRYNLPLT
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEE
IRSALYPIFGKKINGPIGHSVDTAAVIGTIFGIATTCGIGVVQLNYGLHVLFDLPENLWV
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEEECCHHHHH
QTALILVAVIITIISVTSGVNKGLRILSEVNIYVSVGLMLFILFLGNTEFLLNALVQNVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
DYLSRFPSLALESFAFDQPKEWMNSWTLFFWAWWVAWSPFVGLFLARISRGRTIREFVSG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC
TLIIPLLFTLTWLSIFGNSALHNVIFDGNIALAETVLSNPAHGFYDLLAQYPWFPFIAGV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEECCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ATITGLLFYVTSADSGALVLGNFTTQFTNIDHDAPRWLSVFWAVAIGLLTLAMLMTNGIT
HHHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
ALQNATIIMGLPFSFVMFLVMAGLYKSLRLEDYRQASASLNAAPVVGNVDILNWKKRLTR
HHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHH
VMHHPGTFETKRMLNEICRPAVHAVAEELQKRAVQVDVLEVPLEEDEELYHLDITIHLEE
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEC
EQNFIYQIWPVRYIAPNFSERGKRGKQFYYRLETYLYEGSQGNDLVGYTKEQVINDILDR
CCCEEEEECCHHEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
YERHMTFLHINRISPGNRPLFPDPKA
HHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ATDNPRAVDDQETHPKDRLNRVVFYVSALIILIFSLTTILFNDFANRALNQVLDWVSST
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSWYYLLAATLYMVFVIFIACSRYGNIKLGPKHSKPEFSLLSWSAMLFSAGIGIDLMFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VAEPLSHYMHPPVGEGQTYEAARQGMVWTLFHYGLTGWCMYALIGMALGYFSYRYNLPLT
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEE
IRSALYPIFGKKINGPIGHSVDTAAVIGTIFGIATTCGIGVVQLNYGLHVLFDLPENLWV
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEEECCHHHHH
QTALILVAVIITIISVTSGVNKGLRILSEVNIYVSVGLMLFILFLGNTEFLLNALVQNVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
DYLSRFPSLALESFAFDQPKEWMNSWTLFFWAWWVAWSPFVGLFLARISRGRTIREFVSG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC
TLIIPLLFTLTWLSIFGNSALHNVIFDGNIALAETVLSNPAHGFYDLLAQYPWFPFIAGV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEECCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ATITGLLFYVTSADSGALVLGNFTTQFTNIDHDAPRWLSVFWAVAIGLLTLAMLMTNGIT
HHHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
ALQNATIIMGLPFSFVMFLVMAGLYKSLRLEDYRQASASLNAAPVVGNVDILNWKKRLTR
HHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHH
VMHHPGTFETKRMLNEICRPAVHAVAEELQKRAVQVDVLEVPLEEDEELYHLDITIHLEE
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEC
EQNFIYQIWPVRYIAPNFSERGKRGKQFYYRLETYLYEGSQGNDLVGYTKEQVINDILDR
CCCEEEEECCHHEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
YERHMTFLHINRISPGNRPLFPDPKA
HHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]