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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 49185747

GI number: 49185747

Start: 2717912

End: 2720344

Strand: Reverse

Name: ydgH [H]

Synonym: BAS2741

Alternate gene names: 49185747

Gene position: 2720344-2717912 (Counterclockwise)

Preceding gene: 49185748

Following gene: 49185746

Centisome position: 52.03

GC content: 33.42

Gene sequence:

>2433_bases
ATGATCCAAATGAGCAAGCTGAAAAATTGGAGAAGTTTATCTTTTCTATTATGGATAGTTATTACTATTACAATGATCGT
AACGATGCCTAATATGGATAAATTAGTGAAAGAAAAAGGGCACATTACGATTCCTAATACAGAACAAAGTAGTATTGCTG
ACAAAATGATAAAAGAAATGAATAAAGACGGGACAGAAAAGTATGACATTATAGCAGTTTTTAATAGTGGTAGTAAAACA
GCTTTAACGACTGAACAAAAAGAGGAAATAACAAAAACAATCAACGCTTTGCAAAATGAAAAGGAACAATTAGGAATTAA
AGAAGTTGTTTCACATTTAGATAATAAAGAATTAGAGAAACAATTAGTTTCTAAAGATAATACGACTATTTTAACGCAAA
TATCGATAGATAAAAAACATGGTGAAATATCGAAAGTTTCAAATAATCTTCATAATAAAGTGAAAACGAAAGGGGTAAAA
ACGTACTTAACAGGAAGTGACTTAATCGCGGGTGATTTTCTTACATCTTCTCAAGAGGGAGTGAAAAAGACTGAAGTTAT
TTCAATCATTTTCATTCTAGTTATATTAATCATTGTATTTCGTTCACCGATTGTTCCAATTGTTTCTCTTCTTACTGTTG
GGGTATCATATTTAGTTTCAATGGGGATTATTGCTCATCTTGTAGATCAATTTAATTTTCCGTTTTCTAACTTTACACAA
GTGTTTGTAGTTGTTGTCCTGTTTGGGGTTGGAACGGACTATAACATTTTATTATTTACGAGATTTAAAGAAGAATTAAG
TAAACAAGAAAACGCATTTTTGGCTACGAAAGAAACATTTAAATCGGCAGGGAAAACTGTTTTATATAGTGGGATAGCAG
TACTAATTGGTTTTGCATCTCTTGCTTTAGCGAGCTTTAAATTATATCAATCTACTTCAGCGGTAGCAATTGGTGTCGCA
GTATTATTACTCGTATTAACTACGTTAAATCCATTTTTCATGGTGCTTCTAGGAAAAGGGATGTTTTATCCAGTTAAAAC
ATTTAAAGGTCATGAAGATAGTCGCCTATGGGGATTCTTTGCGAAAAATTCAGTTGCAAGACCGTTTGTCGCTTTAATTA
TTGTATTCGTGATATCGATTCCTATCGTATTAAAGTATTCTAATACACTTAATTACAACGATTTATTTGAAGTAGACAAT
AAATATGAGTCGAAAATGGGGATTAACGTAATAGAAGAACATTTTCCACCTGGTTTTTCTTCACCAAGTACGTTAGTCAT
TCAATCGAATAATAAGTTAGATGAGGCGAGTTCGCTTCAAACTTTAGATGAACTAACTGAAAAGATTTTGAAAGTGAAAG
GTGTTTCAGAAGTATATGCACCGACACGTCCAACTGGTGAAAGAATTAAAGAACTATATATAAATAAACAAGCGGATGAA
CTAAATACAGGTTTAGGAGATGCCAATGGTGGTATAAAGGAAATTAATGATGGATTAACTACTGCGAAAGATAAAATGGG
TAGTAAGGATTCAAATAGTCTTGCAAACGTTCAAAAGTTAATTGATGGAACAAATGAAGCGAAAAATGGTGTGTCGGCAT
TAGGAACAGCTTTAAATCAACTATCAAATGGCATAAATGACGGAGCAAAAGGTGCGCAGCAAATTGAGAGGGGGTTAACT
TCAGTAAATGAAAATATAAGTGTATTATCTAATGCAACTTCACAACTTCATGCTGGCTATACACAGTTAGAGAAAGGTTT
AAGTTCTTACGATCAATACTTCGGAAGTATTTCTCAAGCGATTGACGGTGCGAAGAAAGGTTATGAACAAATTGAAATGT
TAATGACCAATTTCATTCAAATGAAACCAGAATTAGCAAATGATCCTAACATTCTGCAGACGATAGGAATTGCTAAAGAG
GCTCAAAAGCAATTAGGTGGGCTGTCAAATGAATTAAATCAATTAGCAACGCAGCATAATGCGGCGATGGGATCATTTAA
AGAAGCGAATCAATCGTTATTGAAAGTGGATAACGGCTTAAAAGAAATGAGCAATGGAGTTACTAAGTTACAAAAAGGAG
CAGCTGATCTTAAAAATGGATTAAATGAAGGTGCTTCAGGTTCAAAACAAATTGCGAACAAGTCATCTGAGTTACAAACC
GGATTAACGAAAATAAACGATGGGCAAGGACAGGTATTAACAGGACTGAAAGACTTGCAAGAACAGATGGGACAATTACA
ATCAGGACTATCTAAAAGTACAGAAGGCCTTGAAAAGGTAAGTAATGGCTTAGGGGATGCTCAGAAATATTTAGGAGAAC
TAAATGAATCAAAAAGCTCTGAGAAATTTTATATTCCAAAAGAAGTTTTGGAGGGAGAAGATTTCCAAAAAGCTTTGAAT
ACGTACATGTCACATGATAGAAAGACTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAGAACGAGAGGAATGAATGTTCATTCCGAAAAGGTGTTTTCAAAATAATAGGAATGAATATTCATTCCGTAACTAATA
TAAAATTTTAATCGCGGGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGACAATCATTTTAGACGTAAATCCGTATTCAAAAGAAGCGATGCCAATTATTCAAGAAATCAATAAAACGATAGATGG
TACTTTGAAGGGGACAGAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 810; Mature: 810

Protein sequence:

>810_residues
MIQMSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKT
ALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVK
TYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQ
VFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVA
VLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDN
KYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADE
LNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLT
SVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKE
AQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQT
GLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALN
TYMSHDRKTA

Sequences:

>Translated_810_residues
MIQMSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKT
ALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVK
TYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQ
VFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVA
VLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDN
KYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADE
LNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLT
SVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKE
AQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQT
GLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALN
TYMSHDRKTA
>Mature_810_residues
MIQMSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKT
ALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVK
TYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQ
VFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVA
VLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDN
KYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADE
LNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLT
SVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKE
AQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQT
GLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALN
TYMSHDRKTA

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88596; Mature: 88596

Theoretical pI: Translated: 7.11; Mature: 7.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIQMSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEM
CCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHH
NKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEK
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHH
QLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEG
HHHCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCHHC
VKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
VFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFAS
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFF
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHH
AKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFS
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHCCCCCC
SPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADE
CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHH
LNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQ
HHCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQA
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
AAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQT
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHH
GLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSS
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCC
EKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA
CCEECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIQMSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEM
CCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHH
NKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEK
CCCCCCCEEEEEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHH
QLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEG
HHHCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCHHC
VKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
VFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFAS
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFF
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHH
AKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFS
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHCCCCCC
SPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADE
CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHH
LNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQ
HHCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQA
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
AAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQT
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHH
GLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSS
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCC
EKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA
CCEECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]