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The map label for this gene is ydeR [H]

Identifier: 49183971

GI number: 49183971

Start: 1005397

End: 1006617

Strand: Direct

Name: ydeR [H]

Synonym: BAS0949

Alternate gene names: 49183971

Gene position: 1005397-1006617 (Clockwise)

Preceding gene: 49183970

Following gene: 49183972

Centisome position: 19.23

GC content: 31.45

Gene sequence:

>1221_bases
ATGATAAATTTGACTAAAAAGACAAATTTTCTAATATTCATTTTAGCAATTAGTTGTGGCTCACTTGTTGCGAATATTTA
TTATGCACAGCCAATTGTACAATTCATTGCAAAAGACTTGAATATCGCTTCGGATTTATCTGGATTGCTCACTACTTTGA
CGCAAATTGGATATGGATTGGGCTTGTTTTTTATCGTACCAATGGCAGATTTATTCAAAAGTAAGAAAATAATAGGTATT
CTTATCGGACTCACTATTATTTCATTGATTGGTACGCTAATTTCGACAAATGGAATTGTTTTTTTAATACTAACAACTGT
AATTGGTATTGGAGCCTGTGCAGCTCAAATGTTAGTTCCGCTAACAATGAGGATTGTACCTATTGAAGAGATGGGTAAAT
ATGTGGGTAAAGTAATGAGTGGTTTATTAATTGGGATTATGATTGCTCGCCCATTATCTATCGGAATAACTGAATGGTTC
GGCTGGAGAATGGTATTTCTTTTTTCACTAATCATTCTAGTTGCTGTATTACTTTTACTTATAAAATTTTTGCCCAACTA
TGAAGTAGTATCAAATAGTAACATGTCATATTCAAATTTAATAGCTTCTATGGTAAAACTGCTACTACATACTTCTCCGT
TACAACAAAGAGCTTTTTATCACGCATGTTTATTTGCAACATTTAGTCTTTATTGGACAGTTATTCCAATCTTATTACGG
TCAGAACCATTACATTTCTCAAATAATGAAATTGCATTGTTTGGATTTGCTGCAATAGCTGGAGCTTTATTAACTCCTAC
TATTGGTAAAATCGCAGATAAAGGCTATATTTTTACAATGACTAATGTATCAATGGCGCTCGTACTATTATCTATCGTAC
TATTATTTTTTGTTCAAGATCATTCACTTTTTAGTGTGATTGTAATACTTATTTCAGGTATTAGCATCGATATTGGTGTA
GCAGGAAATTTATTATTAGGTCAAAAAGTTATCTTTAGTTTGAATCCTGAGATAAGAAACAGACTGAATGGATTATATAT
GACCATTTTCTTTTTGGGAGGAGCCTTTGGTTCATGTATTGGAAGTTATACGTACTATAAATTTAATAGCGAAGTACCGT
TACTCATTGGAGCGGCTTTACCTTTAATCGCCTTATTTGTGCATTTAATAAAAAATAATGCGATACATTTATCAAAAACG
AAAAATAAATATATGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAGAAAAAGCTAGCATATAATTTAGTTGATAAGGCTATTGCAGATCTATAGTCTTTCTTTTTTAATTGTTTTGGAACGA
ACGTTCCGAAAGTGGAAGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTTATACAGTTTAGACAATGAAAGTACTTGAATGAAATAGTAGAACAAAACCATCGTTCTATAATTAAGCTTGTAAATA
GAACGGCCTCATTAAGTGTT

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406

Protein sequence:

>406_residues
MINLTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGI
LIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWF
GWRMVFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLR
SEPLHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGV
AGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKT
KNKYMS

Sequences:

>Translated_406_residues
MINLTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGI
LIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWF
GWRMVFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLR
SEPLHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGV
AGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKT
KNKYMS
>Mature_406_residues
MINLTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGI
LIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWF
GWRMVFLFSLIILVAVLLLLIKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLR
SEPLHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQDHSLFSVIVILISGISIDIGV
AGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCIGSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKT
KNKYMS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44440; Mature: 44440

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINLTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGL
CCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWRMVFLFSLIILVAVLLLL
HHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLR
HHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEPLHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQD
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
HSLFSVIVILISGISIDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCI
CHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNKYMS
HCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MINLTKKTNFLIFILAISCGSLVANIYYAQPIVQFIAKDLNIASDLSGLLTTLTQIGYGL
CCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGLTIISLIGTLISTNGIVFLILTTVIGIGACAAQMLVP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTMRIVPIEEMGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGITEWFGWRMVFLFSLIILVAVLLLL
HHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKFLPNYEVVSNSNMSYSNLIASMVKLLLHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVIPILLR
HHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEPLHFSNNEIALFGFAAIAGALLTPTIGKIADKGYIFTMTNVSMALVLLSIVLLFFVQD
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
HSLFSVIVILISGISIDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSCI
CHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSYTYYKFNSEVPLLIGAALPLIALFVHLIKNNAIHLSKTKNKYMS
HCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]