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The map label for this gene is 46446640

Identifier: 46446640

GI number: 46446640

Start: 1196377

End: 1199250

Strand: Reverse

Name: 46446640

Synonym: pc1006

Alternate gene names: NA

Gene position: 1199250-1196377 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446641

Following gene: 46446635

Centisome position: 49.67

GC content: 30.58

Gene sequence:

>2874_bases
ATGAGTAATCCTTCTGATTTTAATCCGTCTTCTTTGAACAATGGTTCGTCTTCAAGTGAGTATTCAACGTCTCTTATTAA
CGATCCACTTTCTTCTGATACAACTTCTTCAACAAGAGAAGTTCAAACGAATACAAAAGAAATACAAACTGTTACGGAAG
GAATTACCAGTGAGATTTTTAGTGAATTCACTCATTCTAAAGACGAAACACAAAAATCACCATGTCTGACTGAACAAACT
GTTAAATCATTTGTAAAAGGGAAATTTTTATGCGCTTATAATAAAAAACCTAATTTAAGAGCTTCTGAATTAGAAATTTC
AAGATCATTTCAAGGTGAAATACGGGCCCGATTAAATGATCAAATTCACCAGACATTTTCTAAAAAAATCGTCAAATTAT
GGATAAAAACATGTCATGAAAACATCTCACAAGCTTCGGTTAAATTAATACGTTTATGCCAAACTGCACCGATAACAATT
AATTATAATGACACAATAAAACAACAAATTCAAAGATATCAAGATACACAAAAAGAAATAGAAGAAACTAAAATAGAATT
GAATGTTCTAAATAGGAAATTAACTAACATTGATAAAAAAAGTTATAGTGACAATCTAAAAGAATTAGAGGCATTAGAAA
AAATACAAAAAAATATAGCAAAAATTAACGACTTTCTCTCAAAGCTTGAACAGCTTGTCGAAAAATATCAGAAATGCAAT
TTAGAGACATTAGATCCATCAGAATTAAATGCACTAAAAGAAGAATTATCTTATCTTAAGGAATTTCATTTTAGCCAACT
AAAGAAAGAAGTAAGCGATACAATAACCGAGATAAATAATTATCATCGATTACAAAACAATAGAAATAAATTTCAATTAA
CTGATAATCAGTTAAATATAAAAACTAAGCGTGTGTTGGATAACCTTGAAAAAATTTTTTCGGGTGAAACACCAAAAGAT
GTCGCAAGGCAAATAGAGGAATGCAATCGGTGTATAATAGCTACTAAAAAAGATTTTTCTCCTTATACTGAAAAATTGCA
GCAAATTAAGGAAGAAACTACTATAGATTGCCGCCCTACATATGAAAAACTTCTTCAAAAGATTCGGGATGAAAATTCTA
ATGATCTTTACCCCGAGTTTATTGCTGAAATTAAGAAGGGTCTTAAATCTCTGGATCCAGTAATCCGGAAAGATGCCCAA
CAAACTTTACTTTCTTCCTTTGATATTTTTGAAAAAGAAACTCTTAAATTAACTCGAAATATTCAAAATGGATTGCCTAA
AGATGAAAATGAAATTATTCCCGAAAAAGATTATGATGTCCTTCAGACACATATTAAGTATTTAAAAGAAATTTTGGAAT
TGACCCAATTAACTTCATCTGACGCAAAATTACCGCAGTTTGAAGGCCATTTTAAAGGCTTATTTGCTTTGATTCCTGAT
AAAACTATAACAGTAAAAGAAGCTAATGCTAAATTAAATTTATTTAATCAAGCAGATGAAAGCCTTGCACGCTTAGTTGA
GCCTTATAAAAGAGTAGTAAAAAAAGCTTATTCGGAAAGTAAACAAGAACTTGAAAAACAAAAACCTATAATACAAGAAA
ATATTAAAATACTATTACAGCAATTAAAAGAAAAGAAAGCGGATAAAAAACAAATTTTAAATGATTTTATAGAAGAACTC
AATAAAATTCAATCTATTAACTTTTCTGATTTAATAATTTCTGATGTCGAACAAATTCAAGATTTTGTAGATATTTTTTT
AGGCCATTATCTTGAACATTCAGAAGAACGCTTTCCTAAAGTTTTAGACAGTCATCGAGATTTTGCTCTTAGAGTTTCTA
ACATGTTCGAAATAGTAAAAGAGAATTTATCTGATCAGCAACTAGAAGAATTACAATCAGTTCTGAAAGATTTTTTATCA
CAGCATATTACAAACCAAAAAACAATGCTGGAAGAAGGCTCTGTTGAAACACGTACTGACCACAGGGAAAGAGCTTTAGA
AAAGACTTCAGAATCTGAAAAACCTTTATATAGAAAAGTTCAGGCTATGCATGAGACTGAAGACGAATTTTCAGTAGAGT
GTCAAATGGTTGGTAAAAAAGTTGAATCACTTTTACCATGGCTTTTTGGAAAGGGTTGTTTTGTTTCACCTCAAGCTGCG
CATCTAGCTCCATTTCCAGGAATAGTTTCTTGGGATCTTAATTATCTGACTTCTCTTTTTAATCATAAGTTTGGCCTAAA
GTTGCCGACCATAGAAAAAAATGATCAAGCTGAGCTATTTAATGAGGACGTTGCGGGCTTTATAAAGACGATCCAAAGCG
AAGGAAAAGTTGACAATGGAATACTGGAAAAAGAACTCATTCAAAGATATGCTGATAGTAAAGAAGAGAAACAAGATACT
CTTCATTTCATTTTCAATGCACTTGTTTTTTTAAGCCGTATTTCCTCTTTAGAAATGTCAGAAACAAGACATTTGCCAGA
GTTTTTTAATCAAGAAATGGATAAAGTTTCGGAAACTTTAATAAAGGGTGGAGAGCAGAAAGACAGAGGATATAAACTTT
TATTAGGAGAAGCTTTTATCGATCTTCTCGCTTTTTCAAAAGAAAGCTTATTAGATCCTCAAACAGCTTTAAGCGAGAAA
CATATAGAATATTTACAAGCCACAGTTAATGCAGTTTCCGAACGTTTAGAGCAATTAGCTAGTAAAAAACAGAAAACTGG
AAAATTAACACCCTTAGAATTCGTAGAATGTCATGCTCTACATAGTATCTATTTAGGAGTGAAAAATTTATGCGATCAAA
AAAAATTGCCCACTGATATTCTACAAAATGAAGAACAAATTATTGAAAAAACTAAAGTTATTCTAAGTTATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCATTATTAATAATTAATATTATTATATTTAATTTAAAGATAATAAATTAGTTAATAATTTATAATTAAAATTAAATTAT
AATTATTAAGGGAGGTAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCAATAGACGGGCTTGCAAGCTTAATTTTAAATTTATTTTATTAGTATTTCTTGGGTAGTGCGCTAAATAGGTAAGAT
TCTCAATTATCTATGTTAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 957; Mature: 956

Protein sequence:

>957_residues
MSNPSDFNPSSLNNGSSSSEYSTSLINDPLSSDTTSSTREVQTNTKEIQTVTEGITSEIFSEFTHSKDETQKSPCLTEQT
VKSFVKGKFLCAYNKKPNLRASELEISRSFQGEIRARLNDQIHQTFSKKIVKLWIKTCHENISQASVKLIRLCQTAPITI
NYNDTIKQQIQRYQDTQKEIEETKIELNVLNRKLTNIDKKSYSDNLKELEALEKIQKNIAKINDFLSKLEQLVEKYQKCN
LETLDPSELNALKEELSYLKEFHFSQLKKEVSDTITEINNYHRLQNNRNKFQLTDNQLNIKTKRVLDNLEKIFSGETPKD
VARQIEECNRCIIATKKDFSPYTEKLQQIKEETTIDCRPTYEKLLQKIRDENSNDLYPEFIAEIKKGLKSLDPVIRKDAQ
QTLLSSFDIFEKETLKLTRNIQNGLPKDENEIIPEKDYDVLQTHIKYLKEILELTQLTSSDAKLPQFEGHFKGLFALIPD
KTITVKEANAKLNLFNQADESLARLVEPYKRVVKKAYSESKQELEKQKPIIQENIKILLQQLKEKKADKKQILNDFIEEL
NKIQSINFSDLIISDVEQIQDFVDIFLGHYLEHSEERFPKVLDSHRDFALRVSNMFEIVKENLSDQQLEELQSVLKDFLS
QHITNQKTMLEEGSVETRTDHRERALEKTSESEKPLYRKVQAMHETEDEFSVECQMVGKKVESLLPWLFGKGCFVSPQAA
HLAPFPGIVSWDLNYLTSLFNHKFGLKLPTIEKNDQAELFNEDVAGFIKTIQSEGKVDNGILEKELIQRYADSKEEKQDT
LHFIFNALVFLSRISSLEMSETRHLPEFFNQEMDKVSETLIKGGEQKDRGYKLLLGEAFIDLLAFSKESLLDPQTALSEK
HIEYLQATVNAVSERLEQLASKKQKTGKLTPLEFVECHALHSIYLGVKNLCDQKKLPTDILQNEEQIIEKTKVILSY

Sequences:

>Translated_957_residues
MSNPSDFNPSSLNNGSSSSEYSTSLINDPLSSDTTSSTREVQTNTKEIQTVTEGITSEIFSEFTHSKDETQKSPCLTEQT
VKSFVKGKFLCAYNKKPNLRASELEISRSFQGEIRARLNDQIHQTFSKKIVKLWIKTCHENISQASVKLIRLCQTAPITI
NYNDTIKQQIQRYQDTQKEIEETKIELNVLNRKLTNIDKKSYSDNLKELEALEKIQKNIAKINDFLSKLEQLVEKYQKCN
LETLDPSELNALKEELSYLKEFHFSQLKKEVSDTITEINNYHRLQNNRNKFQLTDNQLNIKTKRVLDNLEKIFSGETPKD
VARQIEECNRCIIATKKDFSPYTEKLQQIKEETTIDCRPTYEKLLQKIRDENSNDLYPEFIAEIKKGLKSLDPVIRKDAQ
QTLLSSFDIFEKETLKLTRNIQNGLPKDENEIIPEKDYDVLQTHIKYLKEILELTQLTSSDAKLPQFEGHFKGLFALIPD
KTITVKEANAKLNLFNQADESLARLVEPYKRVVKKAYSESKQELEKQKPIIQENIKILLQQLKEKKADKKQILNDFIEEL
NKIQSINFSDLIISDVEQIQDFVDIFLGHYLEHSEERFPKVLDSHRDFALRVSNMFEIVKENLSDQQLEELQSVLKDFLS
QHITNQKTMLEEGSVETRTDHRERALEKTSESEKPLYRKVQAMHETEDEFSVECQMVGKKVESLLPWLFGKGCFVSPQAA
HLAPFPGIVSWDLNYLTSLFNHKFGLKLPTIEKNDQAELFNEDVAGFIKTIQSEGKVDNGILEKELIQRYADSKEEKQDT
LHFIFNALVFLSRISSLEMSETRHLPEFFNQEMDKVSETLIKGGEQKDRGYKLLLGEAFIDLLAFSKESLLDPQTALSEK
HIEYLQATVNAVSERLEQLASKKQKTGKLTPLEFVECHALHSIYLGVKNLCDQKKLPTDILQNEEQIIEKTKVILSY
>Mature_956_residues
SNPSDFNPSSLNNGSSSSEYSTSLINDPLSSDTTSSTREVQTNTKEIQTVTEGITSEIFSEFTHSKDETQKSPCLTEQTV
KSFVKGKFLCAYNKKPNLRASELEISRSFQGEIRARLNDQIHQTFSKKIVKLWIKTCHENISQASVKLIRLCQTAPITIN
YNDTIKQQIQRYQDTQKEIEETKIELNVLNRKLTNIDKKSYSDNLKELEALEKIQKNIAKINDFLSKLEQLVEKYQKCNL
ETLDPSELNALKEELSYLKEFHFSQLKKEVSDTITEINNYHRLQNNRNKFQLTDNQLNIKTKRVLDNLEKIFSGETPKDV
ARQIEECNRCIIATKKDFSPYTEKLQQIKEETTIDCRPTYEKLLQKIRDENSNDLYPEFIAEIKKGLKSLDPVIRKDAQQ
TLLSSFDIFEKETLKLTRNIQNGLPKDENEIIPEKDYDVLQTHIKYLKEILELTQLTSSDAKLPQFEGHFKGLFALIPDK
TITVKEANAKLNLFNQADESLARLVEPYKRVVKKAYSESKQELEKQKPIIQENIKILLQQLKEKKADKKQILNDFIEELN
KIQSINFSDLIISDVEQIQDFVDIFLGHYLEHSEERFPKVLDSHRDFALRVSNMFEIVKENLSDQQLEELQSVLKDFLSQ
HITNQKTMLEEGSVETRTDHRERALEKTSESEKPLYRKVQAMHETEDEFSVECQMVGKKVESLLPWLFGKGCFVSPQAAH
LAPFPGIVSWDLNYLTSLFNHKFGLKLPTIEKNDQAELFNEDVAGFIKTIQSEGKVDNGILEKELIQRYADSKEEKQDTL
HFIFNALVFLSRISSLEMSETRHLPEFFNQEMDKVSETLIKGGEQKDRGYKLLLGEAFIDLLAFSKESLLDPQTALSEKH
IEYLQATVNAVSERLEQLASKKQKTGKLTPLEFVECHALHSIYLGVKNLCDQKKLPTDILQNEEQIIEKTKVILSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110636; Mature: 110505

Theoretical pI: Translated: 5.67; Mature: 5.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNPSDFNPSSLNNGSSSSEYSTSLINDPLSSDTTSSTREVQTNTKEIQTVTEGITSEIF
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SEFTHSKDETQKSPCLTEQTVKSFVKGKFLCAYNKKPNLRASELEISRSFQGEIRARLND
HHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIHQTFSKKIVKLWIKTCHENISQASVKLIRLCQTAPITINYNDTIKQQIQRYQDTQKEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EETKIELNVLNRKLTNIDKKSYSDNLKELEALEKIQKNIAKINDFLSKLEQLVEKYQKCN
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LETLDPSELNALKEELSYLKEFHFSQLKKEVSDTITEINNYHRLQNNRNKFQLTDNQLNI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCH
KTKRVLDNLEKIFSGETPKDVARQIEECNRCIIATKKDFSPYTEKLQQIKEETTIDCRPT
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
YEKLLQKIRDENSNDLYPEFIAEIKKGLKSLDPVIRKDAQQTLLSSFDIFEKETLKLTRN
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQNGLPKDENEIIPEKDYDVLQTHIKYLKEILELTQLTSSDAKLPQFEGHFKGLFALIPD
HHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
KTITVKEANAKLNLFNQADESLARLVEPYKRVVKKAYSESKQELEKQKPIIQENIKILLQ
CEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
QLKEKKADKKQILNDFIEELNKIQSINFSDLIISDVEQIQDFVDIFLGHYLEHSEERFPK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLDSHRDFALRVSNMFEIVKENLSDQQLEELQSVLKDFLSQHITNQKTMLEEGSVETRTD
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHH
HRERALEKTSESEKPLYRKVQAMHETEDEFSVECQMVGKKVESLLPWLFGKGCFVSPQAA
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
ILEKELIQRYADSKEEKQDTLHFIFNALVFLSRISSLEMSETRHLPEFFNQEMDKVSETL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
IKGGEQKDRGYKLLLGEAFIDLLAFSKESLLDPQTALSEKHIEYLQATVNAVSERLEQLA
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKKQKTGKLTPLEFVECHALHSIYLGVKNLCDQKKLPTDILQNEEQIIEKTKVILSY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SNPSDFNPSSLNNGSSSSEYSTSLINDPLSSDTTSSTREVQTNTKEIQTVTEGITSEIF
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SEFTHSKDETQKSPCLTEQTVKSFVKGKFLCAYNKKPNLRASELEISRSFQGEIRARLND
HHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EETKIELNVLNRKLTNIDKKSYSDNLKELEALEKIQKNIAKINDFLSKLEQLVEKYQKCN
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SKKQKTGKLTPLEFVECHALHSIYLGVKNLCDQKKLPTDILQNEEQIIEKTKVILSY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA