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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 46445978

GI number: 46445978

Start: 467371

End: 468978

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: pc0344

Alternate gene names: 46445978

Gene position: 468978-467371 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46445981

Following gene: 46445977

Centisome position: 19.42

GC content: 34.45

Gene sequence:

>1608_bases
ATGACTGATTCTACTCATACAATTTTTCAATCAGCTAAACGTTTTTTTTCAGGAACTTTATTAAGTCGTTTATCTGGTAT
GGTACGCGATATCAGTATGGCTTATGCCTTTGGAACAGAAGCTTCTATTGCATCATTCATGGTAGCTTACCGTTTGGCTC
ATTTATGTCGTCGCCTATTTGGAGAAGGCTCTTTACAATCTGCTTTTATTCCCGAATTTGAATCAATTCGTCATAGTGAT
ACGGAACGTGCATTTCGCTTTTTTAGAGATTTAGTAATTTCTTTAACGCTTTTTTTAGTTTTTTTTGTTTTGTCTCTTTC
TTTAGGAATAGGGGCTTTTTTAACATGGGGAAATCCAACAAATGACACAAAAGAAATTCTGAGCCTGACATTATTAATGC
TTCCTAGTCTATTATTCATTTGTTTATTTGGATTAAATGCATCTTTGCTACAATGCGAAAAAATCTACTTTACCCCTGCT
GTTGCACCTTTAGCTTTTAATTGTGCGTGGATTGCAGCTGTGTGGATTTTAAAATCCTACAAAATTCCAGAAGCTATTTC
TTGGCTAGCTCTTGCAGTCATTATAGCCTGCCTTTCTCAGTGGCTTGTCACAATTCCCCAAACATTTTCTATTCTCAAAA
AAAATTTATCAACACCTCTTTGGGCAGAACTTAGAAAAAGTTTTTTTTCTACAGATGTTATCAAACTTGGAAAACCTTTT
TTACTTGGAATGGTTGGAGTAATGGCTTCTCAAATCAATGCAGCAATCGACGCCATATTTGGAAGGTACGCTGAATTAGA
AGGGCCCGCCTTCCTTTGGTATGCAATTAGAATTCAGCAACTTCCCTTAGCACTTTTTGGTATCGCTATCGCAGGAGCTC
TTTTACCCCCTTTGACACGTGCACTAAAAGCACAAAATTGGGCTCTTTATTATCAATTTTTAAATGATGCAGTTCTTTAT
ACATGTACAATTATGATTCCCTTTACTGCTGCACTTTTCGTGCTAGGGTATTCAAGTGTGAATCTTATTTTTGGTCACGG
CAATTTCCATGCTTCTTCTGTGATTGGCACGACAAAATGTTTGTGGGGCTATGGAATAGGTTTATTACCAAGCACCTTAA
TTCTATTACTTGCGCCCGCATGTTACGCGCAAAATAATTATCGACTCCCAGCTATCGCCTCCATTTTAAATATGATTTTA
AATTTTTCTTTGAACTATATGTTTATTATTTTTTTTGGATGGGGAGCAACGAGCGTTGCCGTTGCTACGAGTTTAAGTGC
ATGGGTGAATGTATTTTTTCTTGGAATTTTTCTTAACAACAAAGAAAAAAGTTGGCTGATTTTTAAAACTAATCCAATTT
TTCTAAAAATATTTTTCATAACCTTCATTGCCTTTATAGGAACAGAAGCGAGTAAATATTTTTTTCATCAATCTACAATT
TTAAATGTTTTGAATTCAAATATTTTCCTAATTTCGTTTAGCCAACAACTCATCGAATTAATTATTCAACTAAGTATTTT
TATTTTTTTTTGGATATCTAGTTGCTGTTTATTCGGTGTTTCTTTAAAATTTCACTCGTCGGGGCCTAATTTTATGTTAA
AAACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTTACACTGTTCTCAACATGAAGATCTTCAACTTAAATAATTTATACTCATTTCTAACCCATTTTCTATGAAATATAA
AAAATTTATAAAGAACACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATTGAAGCTATAAATACATTTAATTTGACAACAGGTGTTGTTTGTAATTAGGAAATTAAATTAATTGTTTTTTTAAAA
TTTTGACTTTATGTTTTTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 534

Protein sequence:

>535_residues
MTDSTHTIFQSAKRFFSGTLLSRLSGMVRDISMAYAFGTEASIASFMVAYRLAHLCRRLFGEGSLQSAFIPEFESIRHSD
TERAFRFFRDLVISLTLFLVFFVLSLSLGIGAFLTWGNPTNDTKEILSLTLLMLPSLLFICLFGLNASLLQCEKIYFTPA
VAPLAFNCAWIAAVWILKSYKIPEAISWLALAVIIACLSQWLVTIPQTFSILKKNLSTPLWAELRKSFFSTDVIKLGKPF
LLGMVGVMASQINAAIDAIFGRYAELEGPAFLWYAIRIQQLPLALFGIAIAGALLPPLTRALKAQNWALYYQFLNDAVLY
TCTIMIPFTAALFVLGYSSVNLIFGHGNFHASSVIGTTKCLWGYGIGLLPSTLILLLAPACYAQNNYRLPAIASILNMIL
NFSLNYMFIIFFGWGATSVAVATSLSAWVNVFFLGIFLNNKEKSWLIFKTNPIFLKIFFITFIAFIGTEASKYFFHQSTI
LNVLNSNIFLISFSQQLIELIIQLSIFIFFWISSCCLFGVSLKFHSSGPNFMLKT

Sequences:

>Translated_535_residues
MTDSTHTIFQSAKRFFSGTLLSRLSGMVRDISMAYAFGTEASIASFMVAYRLAHLCRRLFGEGSLQSAFIPEFESIRHSD
TERAFRFFRDLVISLTLFLVFFVLSLSLGIGAFLTWGNPTNDTKEILSLTLLMLPSLLFICLFGLNASLLQCEKIYFTPA
VAPLAFNCAWIAAVWILKSYKIPEAISWLALAVIIACLSQWLVTIPQTFSILKKNLSTPLWAELRKSFFSTDVIKLGKPF
LLGMVGVMASQINAAIDAIFGRYAELEGPAFLWYAIRIQQLPLALFGIAIAGALLPPLTRALKAQNWALYYQFLNDAVLY
TCTIMIPFTAALFVLGYSSVNLIFGHGNFHASSVIGTTKCLWGYGIGLLPSTLILLLAPACYAQNNYRLPAIASILNMIL
NFSLNYMFIIFFGWGATSVAVATSLSAWVNVFFLGIFLNNKEKSWLIFKTNPIFLKIFFITFIAFIGTEASKYFFHQSTI
LNVLNSNIFLISFSQQLIELIIQLSIFIFFWISSCCLFGVSLKFHSSGPNFMLKT
>Mature_534_residues
TDSTHTIFQSAKRFFSGTLLSRLSGMVRDISMAYAFGTEASIASFMVAYRLAHLCRRLFGEGSLQSAFIPEFESIRHSDT
ERAFRFFRDLVISLTLFLVFFVLSLSLGIGAFLTWGNPTNDTKEILSLTLLMLPSLLFICLFGLNASLLQCEKIYFTPAV
APLAFNCAWIAAVWILKSYKIPEAISWLALAVIIACLSQWLVTIPQTFSILKKNLSTPLWAELRKSFFSTDVIKLGKPFL
LGMVGVMASQINAAIDAIFGRYAELEGPAFLWYAIRIQQLPLALFGIAIAGALLPPLTRALKAQNWALYYQFLNDAVLYT
CTIMIPFTAALFVLGYSSVNLIFGHGNFHASSVIGTTKCLWGYGIGLLPSTLILLLAPACYAQNNYRLPAIASILNMILN
FSLNYMFIIFFGWGATSVAVATSLSAWVNVFFLGIFLNNKEKSWLIFKTNPIFLKIFFITFIAFIGTEASKYFFHQSTIL
NVLNSNIFLISFSQQLIELIIQLSIFIFFWISSCCLFGVSLKFHSSGPNFMLKT

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=402, Percent_Identity=27.1144278606965, Blast_Score=126, Evalue=3e-30,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59777; Mature: 59646

Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTDSTHTIFQSAKRFFSGTLLSRLSGMVRDISMAYAFGTEASIASFMVAYRLAHLCRRLF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GEGSLQSAFIPEFESIRHSDTERAFRFFRDLVISLTLFLVFFVLSLSLGIGAFLTWGNPT
CCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEECCCCC
NDTKEILSLTLLMLPSLLFICLFGLNASLLQCEKIYFTPAVAPLAFNCAWIAAVWILKSY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KIPEAISWLALAVIIACLSQWLVTIPQTFSILKKNLSTPLWAELRKSFFSTDVIKLGKPF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHH
LLGMVGVMASQINAAIDAIFGRYAELEGPAFLWYAIRIQQLPLALFGIAIAGALLPPLTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKAQNWALYYQFLNDAVLYTCTIMIPFTAALFVLGYSSVNLIFGHGNFHASSVIGTTKC
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
LWGYGIGLLPSTLILLLAPACYAQNNYRLPAIASILNMILNFSLNYMFIIFFGWGATSVA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHH
VATSLSAWVNVFFLGIFLNNKEKSWLIFKTNPIFLKIFFITFIAFIGTEASKYFFHQSTI
HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LNVLNSNIFLISFSQQLIELIIQLSIFIFFWISSCCLFGVSLKFHSSGPNFMLKT
HHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEC
>Mature Secondary Structure 
TDSTHTIFQSAKRFFSGTLLSRLSGMVRDISMAYAFGTEASIASFMVAYRLAHLCRRLF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GEGSLQSAFIPEFESIRHSDTERAFRFFRDLVISLTLFLVFFVLSLSLGIGAFLTWGNPT
CCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEECCCCC
NDTKEILSLTLLMLPSLLFICLFGLNASLLQCEKIYFTPAVAPLAFNCAWIAAVWILKSY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KIPEAISWLALAVIIACLSQWLVTIPQTFSILKKNLSTPLWAELRKSFFSTDVIKLGKPF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHH
LLGMVGVMASQINAAIDAIFGRYAELEGPAFLWYAIRIQQLPLALFGIAIAGALLPPLTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKAQNWALYYQFLNDAVLYTCTIMIPFTAALFVLGYSSVNLIFGHGNFHASSVIGTTKC
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
LWGYGIGLLPSTLILLLAPACYAQNNYRLPAIASILNMILNFSLNYMFIIFFGWGATSVA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHH
VATSLSAWVNVFFLGIFLNNKEKSWLIFKTNPIFLKIFFITFIAFIGTEASKYFFHQSTI
HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LNVLNSNIFLISFSQQLIELIIQLSIFIFFWISSCCLFGVSLKFHSSGPNFMLKT
HHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10684935 [H]