Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is ntt_2 [H]

Identifier: 46445875

GI number: 46445875

Start: 338779

End: 340329

Strand: Direct

Name: ntt_2 [H]

Synonym: pc0241

Alternate gene names: 46445875

Gene position: 338779-340329 (Clockwise)

Preceding gene: 46445874

Following gene: 46445881

Centisome position: 14.03

GC content: 35.85

Gene sequence:

>1551_bases
ATGTCTCAACAAGAATCAGAGTTTGGTAAATTGAGGGCATTTTTTTGGCCTATTCACGGCCATGAAGTCAAAAAAGTGCT
GCCGATGATGTTGATGCTATTTTTGATTTGTTTCAACTATAGTATTTTACGCAATGTTAAAGATGCTATTGTTGTGACTG
CTAAGGCTTCAGGGGCTGAAGTTATTCCATTTATTAAAGTATGGGTGCTGTTACCCACGGCAGTCTTATTTACTTTAATT
TTTACTAAGTTGTCTAACCGTTTTAGCCAAGAAAAAGTTTTTTATATTGTCATTTCTACATTTTTGCTATTTTTTGGTTC
GTTTACTTATATTTTTTATCCTTTACGTGACGTACTACATCCTCATCAACTATGCGATTACTTAGAAACGATTTTACCAG
CGGGATTTAAAGGATTAATTGCCATGTTCCGTAATTGGTCATTTACTTTGTTTTATGTAATTTGTGAACTTTGGGGCAGT
ATTGTTTTAACTGTCCTTTTTTGGGGATTTGCGAATGAAATCACAAAAATGACTGAAGCTCGTCGTTTTTATAGTATGCT
TGGTGTCATTGCAAGTTTTGCCGCGACGATAGCAGGAATCATAGCCAATCTTCTTTCTAATGATCAAAGTTGGGAACAGA
CTTTAAATATTCTCATGGTTGCTGTAATTGTAAGTGGAACGATAGCCATGGTTATTTTTCGTTGGATGAATAAAAATGTA
CTCAATGGCCCAGAATTCCAAGAATTCCATGAAGCAAAACGCATTCAAAAAATGAAAAAAAGATTATCGATCCGAGAAAG
TTTTACCTATCTCGCTAATTCTAAATATCTTATTTGTATTGCAGTTTTAGTTATTTCTTATAATCTTGTCATTAACTTAG
TTGAAATTGTATGGAAAGACCAGCTTCGCCAACTTTATTCGTCAGCCCTTGATTATAATCGCTATATGAATAACATGACA
TCAGCAGTCGGAATTATTGCCACAATCACATCCTTATTTATGTCTACAATGATTACTCGGTTTGGATGGACACGGACAGC
TCTAGTAACACCGACTATTATGCTTGTCACAAGTGTGGGATTTTTTGCTTTTATGCTATTTCGAAATGATTTGGCTGATC
CTGTTTATATATTAACAGGAACGACACCTTTAACTATAGCCGTCTTTTTTGGTGCAGCTCAAGTCTGCATGAGTAAAGCC
TGTAAGTATTCTGTTTTTGATTCTACAAAAGAAATGGCTTTTATCCCTCTGGATTATGAAAGTAAATTGAAAGGAAAAGC
TGCGATTGATGGTGTGGGTTCTCGTCTTGGTAAATCGGGCGGTTCCTTAATTCATCAAAGTTTATTGATGATTTTTGCAA
CTGTTAGCTCCAGCGCTCCTTATGTAGCTGTGATCTTAATTGGCGTTATCATTGTTTGGATGCTCTGCGTACGTTCATTA
GGTAAGCAATTTGCTGCTATTATTGGGGAAAAGGCTCGAGAAGATATTGGTGAATCTACTCCAAGAACGAGTGAAGAGCA
AGTTTTACATCCCTTAAAAGCTGCATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTATTTATTATTAATGTGCTTTTTATTTTTTTATTAATTAAATAAATAGTTGAGAATTAATAAAAAATATAATATACTAT
TTTATAACAAAAGGTTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATATCATGTTTTGGTGCAGCAAATTTTACTAAAAAACAAGCGTTAAGGGTGGATATATATATATCCCTATATATATGA
GTTTATTTTCAAATATCATT

Product: ADP/ATP translocase

Products: NA

Alternate protein names: ADP/ATP translocase 1 [H]

Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515

Protein sequence:

>516_residues
MSQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLI
FTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGS
IVLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV
LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMT
SAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKA
CKYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL
GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS

Sequences:

>Translated_516_residues
MSQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLI
FTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGS
IVLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV
LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMT
SAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKA
CKYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL
GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS
>Mature_515_residues
SQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLIF
TKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGSI
VLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNVL
NGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMTS
AVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKAC
KYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSLG
KQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS

Specific function: Unknown

COG id: COG3202

COG function: function code C; ATP/ADP translocase

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ADP/ATP translocase tlc family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004667
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58149; Mature: 58017

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAE
CCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEECCCCCC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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10192388; 10684935; 10871362 [H]