Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 45657992

Identifier: 45657992

GI number: 45657992

Start: 2591907

End: 2593928

Strand: Reverse

Name: 45657992

Synonym: LIC12144

Alternate gene names: NA

Gene position: 2593928-2591907 (Counterclockwise)

Preceding gene: 45657993

Following gene: 45657991

Centisome position: 60.65

GC content: 30.86

Gene sequence:

>2022_bases
TTGGAAATTATGAAATTCGGATTAGATGCTAATGTAGCTTATCCTCCACTATCTGTATTATATTCTATTTTTTTAATATT
TGGCTGTGATTTTTTAGGATTTTATATTTTAAAATTATTTGAAAGTAGTTTAGGAAAAGTTAAAAATACTTGGATAAGAT
GGCAGGCCCCATTAATTGGAGCGTTACTATTAAGTGTTATCCTTTATCCTTTAGCTTTGTCTGCTCTTACACCTCGATTT
TTGATGAAAAGTGCGGCTATTTTTTTATCTGTACTAGGTTGTGCTAATATTTGTTTCTTTGTTAAAAATGGGACCAAAAA
TTTAGTTTCGATCAGTTATTATTCCAATATCTTCAAGAGTATTCAGTACCATTCTTTTTTTGAAAAAATTGGAAATGATA
AAAAGATTAAAAAAAGTTTTTCCCTATTCAAATTAATCGGTTTTATTAAAAATAAATTTAATTTAATCAATAAAAATGAT
GTGCTTAACGTATTTATAATATTATTAATGATTGGTTATGGGTTTCTTGCTCTTTGTCCTATTACGAATGCAGATTCGCT
AGATTATCATATTGGTGTTGCCATTGAAATTTTAAATCAGGGAAAAATGCCAGTATTCTCCGGTTGGTTTCATGGAAGAT
TGGCTGGAAGCGGAGAAGTTTTAAATGCCCTTGGGCTTGCTATAGGAGCGGAGCAATTTGGTTCTTTGCTTCAGTTTTGT
GGTCTTTTAAGTATTTATGGAATATTATCGTTTTATTCTTTTGCCGAAAAATTCTCTGAAAGTGACGGAGTATGGAGAAA
AATTATTATAATCGCATTTCTTTCATCTCCTGTTTTGGTTTTTTTGGTCAGTTCACCGAAACCTCAGTTACTTCAGATTG
GAATGACTTCTTTTGCAATAACCTTACTTTTAGAAATTTTCTCTAAAATAAAAACTGATAAAAATAAACTATTTGCATTT
AGTCTTATTTGTATATTGATCATGTCTGCTACGCAGGCTAAGTTTTCCTTTTTTTTGTCAGCTTTTCTGATAGGTTTATT
CTCAATTTTCTCTTTAGGTTCTATTAGATTATTTTTCTACGGATTATTAATTTCCCTTTTTTTCTTTGTTTTAATAAACT
TTCCTGCGATATTTTGGAAGATAAAAAATTATAATAGCACTTTCATTGATGTACTCATTCATCCTTTACCAGGAAATACG
TTTCCGGGTGTAAATGAGTTTGAGGTGTCGTTGCGTAATTATCAGGATAGTGCACTAATTTTTCCATTATCGTTAATTTT
TCCTAATCAATTCGGAGTAATTACTACAGTGATTGGCTTGGGTTTATTTTTAATAATATTTGTGAAACCAATAGTAACTC
AAAAAGCATTTTTATTAAGTGTAATGATAATTCTTTTTGTTATATTAGGAAGTTTAATGGGTCAAAAAGCTTCCAGATTT
TTTTTGGAACCGTTTGTATGGATGTTAATTTCTTTAATTGGTTTGAATTCGTTTGGAAAGTGGAATATTAGATTTGTGAA
AGAGGCAGTGAGTACAGGAATTCTATTACAAGCTTGTGCTACTTTCGTCATTATTTCTGTTGGAATTTATCAGTTGTTTC
CTGGGGTTTTTTCTATTTCTCTAAGAGAAAAAGTAATGAGCCAGTATGCAAATGGTTATAGTTTAATGAAATGGGTAGGT
TTAACCTTACCTAAGGAAGCCGTTTTATTATCACAGCATAGATCGATTGCACTATCCGAAAGAAAGACTTTGTCCTTAGA
TTGGATTCCTTTTGTGGATTTTAATTCTGCTGTTGCTAGTCCCTATTTAAAGCAAATCAAAGATGAAAATGTGACTCATA
TCCTAATGTTCGGAGATACGTCTAAGAATACTCCTTTTTCAGGGTGTATAGGAAATACAATAGGCAAAACTAAAAGTAAC
CAGGTGGCTAGAAATCCGTTTAACAGAAACGATTTTTTTACAGTAATACTCGTTGAGTTTCAGTCCGATAAATTACCGCA
ATGTGCGAATTTTATACTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGTTTTGATTTAGGAGGAATTGATCAGGAGAAAACTCCTGGTATAGCTGAATTTAAATTGGGTATGAACGGAGATAAA
TACGATCTTTCCGGAGAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCGGTAAACGATAGATCATTTTTCTTTTTACAATGGAAATGGATTTATTTTTTAACAGTTTGAAACATTAGAACAATGT
TTGCACATTTAAAAACTTAA

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 673; Mature: 673

Protein sequence:

>673_residues
MEIMKFGLDANVAYPPLSVLYSIFLIFGCDFLGFYILKLFESSLGKVKNTWIRWQAPLIGALLLSVILYPLALSALTPRF
LMKSAAIFLSVLGCANICFFVKNGTKNLVSISYYSNIFKSIQYHSFFEKIGNDKKIKKSFSLFKLIGFIKNKFNLINKND
VLNVFIILLMIGYGFLALCPITNADSLDYHIGVAIEILNQGKMPVFSGWFHGRLAGSGEVLNALGLAIGAEQFGSLLQFC
GLLSIYGILSFYSFAEKFSESDGVWRKIIIIAFLSSPVLVFLVSSPKPQLLQIGMTSFAITLLLEIFSKIKTDKNKLFAF
SLICILIMSATQAKFSFFLSAFLIGLFSIFSLGSIRLFFYGLLISLFFFVLINFPAIFWKIKNYNSTFIDVLIHPLPGNT
FPGVNEFEVSLRNYQDSALIFPLSLIFPNQFGVITTVIGLGLFLIIFVKPIVTQKAFLLSVMIILFVILGSLMGQKASRF
FLEPFVWMLISLIGLNSFGKWNIRFVKEAVSTGILLQACATFVIISVGIYQLFPGVFSISLREKVMSQYANGYSLMKWVG
LTLPKEAVLLSQHRSIALSERKTLSLDWIPFVDFNSAVASPYLKQIKDENVTHILMFGDTSKNTPFSGCIGNTIGKTKSN
QVARNPFNRNDFFTVILVEFQSDKLPQCANFIL

Sequences:

>Translated_673_residues
MEIMKFGLDANVAYPPLSVLYSIFLIFGCDFLGFYILKLFESSLGKVKNTWIRWQAPLIGALLLSVILYPLALSALTPRF
LMKSAAIFLSVLGCANICFFVKNGTKNLVSISYYSNIFKSIQYHSFFEKIGNDKKIKKSFSLFKLIGFIKNKFNLINKND
VLNVFIILLMIGYGFLALCPITNADSLDYHIGVAIEILNQGKMPVFSGWFHGRLAGSGEVLNALGLAIGAEQFGSLLQFC
GLLSIYGILSFYSFAEKFSESDGVWRKIIIIAFLSSPVLVFLVSSPKPQLLQIGMTSFAITLLLEIFSKIKTDKNKLFAF
SLICILIMSATQAKFSFFLSAFLIGLFSIFSLGSIRLFFYGLLISLFFFVLINFPAIFWKIKNYNSTFIDVLIHPLPGNT
FPGVNEFEVSLRNYQDSALIFPLSLIFPNQFGVITTVIGLGLFLIIFVKPIVTQKAFLLSVMIILFVILGSLMGQKASRF
FLEPFVWMLISLIGLNSFGKWNIRFVKEAVSTGILLQACATFVIISVGIYQLFPGVFSISLREKVMSQYANGYSLMKWVG
LTLPKEAVLLSQHRSIALSERKTLSLDWIPFVDFNSAVASPYLKQIKDENVTHILMFGDTSKNTPFSGCIGNTIGKTKSN
QVARNPFNRNDFFTVILVEFQSDKLPQCANFIL
>Mature_673_residues
MEIMKFGLDANVAYPPLSVLYSIFLIFGCDFLGFYILKLFESSLGKVKNTWIRWQAPLIGALLLSVILYPLALSALTPRF
LMKSAAIFLSVLGCANICFFVKNGTKNLVSISYYSNIFKSIQYHSFFEKIGNDKKIKKSFSLFKLIGFIKNKFNLINKND
VLNVFIILLMIGYGFLALCPITNADSLDYHIGVAIEILNQGKMPVFSGWFHGRLAGSGEVLNALGLAIGAEQFGSLLQFC
GLLSIYGILSFYSFAEKFSESDGVWRKIIIIAFLSSPVLVFLVSSPKPQLLQIGMTSFAITLLLEIFSKIKTDKNKLFAF
SLICILIMSATQAKFSFFLSAFLIGLFSIFSLGSIRLFFYGLLISLFFFVLINFPAIFWKIKNYNSTFIDVLIHPLPGNT
FPGVNEFEVSLRNYQDSALIFPLSLIFPNQFGVITTVIGLGLFLIIFVKPIVTQKAFLLSVMIILFVILGSLMGQKASRF
FLEPFVWMLISLIGLNSFGKWNIRFVKEAVSTGILLQACATFVIISVGIYQLFPGVFSISLREKVMSQYANGYSLMKWVG
LTLPKEAVLLSQHRSIALSERKTLSLDWIPFVDFNSAVASPYLKQIKDENVTHILMFGDTSKNTPFSGCIGNTIGKTKSN
QVARNPFNRNDFFTVILVEFQSDKLPQCANFIL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75348; Mature: 75348

Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEIMKFGLDANVAYPPLSVLYSIFLIFGCDFLGFYILKLFESSLGKVKNTWIRWQAPLIG
CCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHH
ALLLSVILYPLALSALTPRFLMKSAAIFLSVLGCANICFFVKNGTKNLVSISYYSNIFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHH
IQYHSFFEKIGNDKKIKKSFSLFKLIGFIKNKFNLINKNDVLNVFIILLMIGYGFLALCP
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ITNADSLDYHIGVAIEILNQGKMPVFSGWFHGRLAGSGEVLNALGLAIGAEQFGSLLQFC
CCCCCCCCEEHHHEEEEECCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
GLLSIYGILSFYSFAEKFSESDGVWRKIIIIAFLSSPVLVFLVSSPKPQLLQIGMTSFAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
TLLLEIFSKIKTDKNKLFAFSLICILIMSATQAKFSFFLSAFLIGLFSIFSLGSIRLFFY
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLISLFFFVLINFPAIFWKIKNYNSTFIDVLIHPLPGNTFPGVNEFEVSLRNYQDSALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE
FPLSLIFPNQFGVITTVIGLGLFLIIFVKPIVTQKAFLLSVMIILFVILGSLMGQKASRF
EEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLEPFVWMLISLIGLNSFGKWNIRFVKEAVSTGILLQACATFVIISVGIYQLFPGVFSIS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LREKVMSQYANGYSLMKWVGLTLPKEAVLLSQHRSIALSERKTLSLDWIPFVDFNSAVAS
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEECEECCCCCHHHHH
PYLKQIKDENVTHILMFGDTSKNTPFSGCIGNTIGKTKSNQVARNPFNRNDFFTVILVEF
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEEE
QSDKLPQCANFIL
CCCCCCHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MEIMKFGLDANVAYPPLSVLYSIFLIFGCDFLGFYILKLFESSLGKVKNTWIRWQAPLIG
CCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHH
ALLLSVILYPLALSALTPRFLMKSAAIFLSVLGCANICFFVKNGTKNLVSISYYSNIFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHH
IQYHSFFEKIGNDKKIKKSFSLFKLIGFIKNKFNLINKNDVLNVFIILLMIGYGFLALCP
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ITNADSLDYHIGVAIEILNQGKMPVFSGWFHGRLAGSGEVLNALGLAIGAEQFGSLLQFC
CCCCCCCCEEHHHEEEEECCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
GLLSIYGILSFYSFAEKFSESDGVWRKIIIIAFLSSPVLVFLVSSPKPQLLQIGMTSFAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
TLLLEIFSKIKTDKNKLFAFSLICILIMSATQAKFSFFLSAFLIGLFSIFSLGSIRLFFY
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLISLFFFVLINFPAIFWKIKNYNSTFIDVLIHPLPGNTFPGVNEFEVSLRNYQDSALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE
FPLSLIFPNQFGVITTVIGLGLFLIIFVKPIVTQKAFLLSVMIILFVILGSLMGQKASRF
EEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLEPFVWMLISLIGLNSFGKWNIRFVKEAVSTGILLQACATFVIISVGIYQLFPGVFSIS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LREKVMSQYANGYSLMKWVGLTLPKEAVLLSQHRSIALSERKTLSLDWIPFVDFNSAVAS
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEECEECCCCCHHHHH
PYLKQIKDENVTHILMFGDTSKNTPFSGCIGNTIGKTKSNQVARNPFNRNDFFTVILVEF
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEEE
QSDKLPQCANFIL
CCCCCCHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA