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The map label for this gene is 45657991

Identifier: 45657991

GI number: 45657991

Start: 2590413

End: 2591702

Strand: Reverse

Name: 45657991

Synonym: LIC12143

Alternate gene names: NA

Gene position: 2591702-2590413 (Counterclockwise)

Preceding gene: 45657992

Following gene: 45657990

Centisome position: 60.59

GC content: 26.74

Gene sequence:

>1290_bases
ATGATTATCGGATTTGTTTTTTTTGCAATAACACTTCTTTTGTTATACATTCTAAAGACAAATATTAAAGAATGGAAATT
AATCATAGATCATAATTTTCTACTTATGTTCGGATTTATTTATTATTGGTATTTGCCTTTTATTTCCTATGAAATGCAAG
ATAGAGGAAATGTATTTTTAAGTATTGATGTGGTTGAATCCTACGAGCGAGTAAGTTACGAAGCAAAAGTTTGGTATTTA
ATTACTTCCGTGCTTTTAATCCTTTCATTTATATTAGGAGAAATCATTTTTAAAAAAAAATCTCATAAATGGAATTTTTT
AAAAAGTAAATACGATTTTTCTAAGACGCCAATCCACCTATTTTTTTACGGATTAGTATTATTTGGTATTATATCTCTAA
AATATATGCTTCCGGTTTTGTTTAGAGGATATTCTGCGGTCTCTGAATGGCCATTACAGAGGGGCTGGTTTATATCCGTA
AATGTTTCTTTGATAGTTTTATTTTGTATTTATGCTTCGAATCGGGTTGATTTTTATAATATTTCCGGAAATCGGAAAGA
TAAGTTTAAGATTTTTTTTAATCAATACTTAATCGTTTCCTTTCTATTTGGATTTTTAATGTATTCAACCGGAAATCGTG
GGTATCTAACGTTATCAGTAATTTCTATTCTTTTAGTTTTACATAAAGTATCAAAAGGTTTTCCAATTATACCATCTATT
TTCGTTATAAGCTTTTTAGGAATTCTCAATGCGATTTGGGGACATATACGCGCTCAAAATTCTGTTACTTTTTTTAAAAT
ATTACAAGCAATTCTTATGGAACCTGGATATGTAGGAATGACTTTAATTTCTCACCTAATTAGAAATGAATTCAGTTTTA
TTGAATTTCCGATTTCTTTATTAGGCAATATCATTGGAATGATTCCTTCTATAATATTTCCGGATAAATTTAAATATATC
CAGGCTATAACTGAGATGGGAAAACCTATTAATGTATTTCAAGGAACAACTCATAACTATGTAGAATTGATGGCAAACTT
TGGGTTGATTGGTTCTATGATTTTTATGTTTTTATTATCTTTAAGTTTAAATTTTCTAAAAAGAAATGAGAGTTTGTCTG
GTATTTACATAGCGATTTGTTCTTTTTTGCCTTTTTTCTTTTTTAGAGATCTTCCGAATACTTTAATTAAATATATATTT
GAGTTCACTATAATTTTAAGCATTTTATTGTATTATTCTAATTCTATAATTATCAAAATTAGAAATAAAATTATTTCTAG
AAATGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTGCCTAACACGATAAATCTTAAACTTTAATTTTTTAAAAAAAAGTATAAGAAAACTAAACTATAGTTGTTTGTTAGT
TGGAAATTGGAGAATATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTGGATAATTGTAATTTGAGTAATTTATAATTATCTTTTATATTAAATAATATTAGTTTATTTTTATAACGTTATTTAC
CTTTTCGCAATGATTTTAGG

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 429; Mature: 429

Protein sequence:

>429_residues
MIIGFVFFAITLLLLYILKTNIKEWKLIIDHNFLLMFGFIYYWYLPFISYEMQDRGNVFLSIDVVESYERVSYEAKVWYL
ITSVLLILSFILGEIIFKKKSHKWNFLKSKYDFSKTPIHLFFYGLVLFGIISLKYMLPVLFRGYSAVSEWPLQRGWFISV
NVSLIVLFCIYASNRVDFYNISGNRKDKFKIFFNQYLIVSFLFGFLMYSTGNRGYLTLSVISILLVLHKVSKGFPIIPSI
FVISFLGILNAIWGHIRAQNSVTFFKILQAILMEPGYVGMTLISHLIRNEFSFIEFPISLLGNIIGMIPSIIFPDKFKYI
QAITEMGKPINVFQGTTHNYVELMANFGLIGSMIFMFLLSLSLNFLKRNESLSGIYIAICSFLPFFFFRDLPNTLIKYIF
EFTIILSILLYYSNSIIIKIRNKIISRND

Sequences:

>Translated_429_residues
MIIGFVFFAITLLLLYILKTNIKEWKLIIDHNFLLMFGFIYYWYLPFISYEMQDRGNVFLSIDVVESYERVSYEAKVWYL
ITSVLLILSFILGEIIFKKKSHKWNFLKSKYDFSKTPIHLFFYGLVLFGIISLKYMLPVLFRGYSAVSEWPLQRGWFISV
NVSLIVLFCIYASNRVDFYNISGNRKDKFKIFFNQYLIVSFLFGFLMYSTGNRGYLTLSVISILLVLHKVSKGFPIIPSI
FVISFLGILNAIWGHIRAQNSVTFFKILQAILMEPGYVGMTLISHLIRNEFSFIEFPISLLGNIIGMIPSIIFPDKFKYI
QAITEMGKPINVFQGTTHNYVELMANFGLIGSMIFMFLLSLSLNFLKRNESLSGIYIAICSFLPFFFFRDLPNTLIKYIF
EFTIILSILLYYSNSIIIKIRNKIISRND
>Mature_429_residues
MIIGFVFFAITLLLLYILKTNIKEWKLIIDHNFLLMFGFIYYWYLPFISYEMQDRGNVFLSIDVVESYERVSYEAKVWYL
ITSVLLILSFILGEIIFKKKSHKWNFLKSKYDFSKTPIHLFFYGLVLFGIISLKYMLPVLFRGYSAVSEWPLQRGWFISV
NVSLIVLFCIYASNRVDFYNISGNRKDKFKIFFNQYLIVSFLFGFLMYSTGNRGYLTLSVISILLVLHKVSKGFPIIPSI
FVISFLGILNAIWGHIRAQNSVTFFKILQAILMEPGYVGMTLISHLIRNEFSFIEFPISLLGNIIGMIPSIIFPDKFKYI
QAITEMGKPINVFQGTTHNYVELMANFGLIGSMIFMFLLSLSLNFLKRNESLSGIYIAICSFLPFFFFRDLPNTLIKYIF
EFTIILSILLYYSNSIIIKIRNKIISRND

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50095; Mature: 50095

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIIGFVFFAITLLLLYILKTNIKEWKLIIDHNFLLMFGFIYYWYLPFISYEMQDRGNVFL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEE
SIDVVESYERVSYEAKVWYLITSVLLILSFILGEIIFKKKSHKWNFLKSKYDFSKTPIHL
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHH
FFYGLVLFGIISLKYMLPVLFRGYSAVSEWPLQRGWFISVNVSLIVLFCIYASNRVDFYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ISGNRKDKFKIFFNQYLIVSFLFGFLMYSTGNRGYLTLSVISILLVLHKVSKGFPIIPSI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FVISFLGILNAIWGHIRAQNSVTFFKILQAILMEPGYVGMTLISHLIRNEFSFIEFPISL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LGNIIGMIPSIIFPDKFKYIQAITEMGKPINVFQGTTHNYVELMANFGLIGSMIFMFLLS
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLNFLKRNESLSGIYIAICSFLPFFFFRDLPNTLIKYIFEFTIILSILLYYSNSIIIKI
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
RNKIISRND
EHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIIGFVFFAITLLLLYILKTNIKEWKLIIDHNFLLMFGFIYYWYLPFISYEMQDRGNVFL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEE
SIDVVESYERVSYEAKVWYLITSVLLILSFILGEIIFKKKSHKWNFLKSKYDFSKTPIHL
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHH
FFYGLVLFGIISLKYMLPVLFRGYSAVSEWPLQRGWFISVNVSLIVLFCIYASNRVDFYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ISGNRKDKFKIFFNQYLIVSFLFGFLMYSTGNRGYLTLSVISILLVLHKVSKGFPIIPSI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FVISFLGILNAIWGHIRAQNSVTFFKILQAILMEPGYVGMTLISHLIRNEFSFIEFPISL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LGNIIGMIPSIIFPDKFKYIQAITEMGKPINVFQGTTHNYVELMANFGLIGSMIFMFLLS
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLNFLKRNESLSGIYIAICSFLPFFFFRDLPNTLIKYIFEFTIILSILLYYSNSIIIKI
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
RNKIISRND
EHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA