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The map label for this gene is 45656491

Identifier: 45656491

GI number: 45656491

Start: 724062

End: 726671

Strand: Direct

Name: 45656491

Synonym: LIC10593

Alternate gene names: NA

Gene position: 724062-726671 (Clockwise)

Preceding gene: 45656490

Following gene: 45656492

Centisome position: 16.93

GC content: 32.3

Gene sequence:

>2610_bases
TTGACAGCCAGAATGATAAGTGACATTATAAAATTCGATCCGAAGATATTTTACGATAAATTGATTTGGATTTTTATATT
TTTTGTATCTACTCCGATTTTTGCATTTCCGATTGATCTCACAAAAGATTGGAAAATAATTTCCGGAAAAAATCTGAACG
CTTCTATCAAGGACGTTTCCTGGAAAGAATTAAAATCTCTTCCGATTCCAGAGGATTCCATTTCTTTTTCTGAAGGTATA
TATACTTTAACATTATTGAAAACTTTTGAAGTTTCCGCAAATGACTTTCAAAAACTTGCCTTAGATGGACTTTCAATTCA
CTTTCCTTTATTGACAAACGTTTATGAAGTTTATTTTAACGGAGAAAAAATCGGAAGCGGAGGAATCGTATTAAACGGAA
AAATCATAAAGGACGGATTTAAAAGACATGTGATTCTTCCGATTCCGGAGAATAAGGTTCAAATAGGAAAGAATGAAATC
AGATTGATTTTATCATCTAACGCAGGAGAAGAATTGAATGTATATGCCAGTTTTGATTCTGCACCTCTCGTAATAGATCT
ACAATCCAAAAACGTTTTGATATTATCGGAGCGATCTAGATGGATGCTTGCGTTTTTATATTTATTTGTCGGATTTTATC
ATTTCTTATTATATTTCAAACGTCCTCAAGAAAAGTACAATCTGTTCTTTGGACTTTTTTCCACGTTTTTTTCTGTTTAT
ATCCATCTTAGAAGTAACGCGGTCTATGAACTCAATTTAGATCCACTTTTCCAAATGAAATTGGAATACATGGTAATCTT
TAACATAACCTCACTTTTTCTTTTGTTTTTAAATACGTTTTTCCAGTATAAAATAAGTTTTGTTTCTAAATTATATCAAA
TTTTTACACTTACGCTTACTTTGTTGATTCCTTTTTCTAACAGGTCCGTTTGTCTATTTCTGTTAAAACTATGGCAGTTC
TCAATTTTTACGTTTATAGTATATTCTTTTTTTATAATGTATAAATCTCTAGTTCGGAAAAATCCGGATGCAATTCGTAT
GATCTTCGGTTTTTTGGTCTTAATGATTGCGGGAGTTATGGACCTGATTGGCTCTATGGGGCTGATTGATAATTTAGAAA
ATTATGGAATTTTAAAGTATGGTTTTTTTGTTTTTGAAGTTGGAATGGTCTTTATATTAGCAAATCGGTTTTTGAGAGTA
CACAAAGAGGCGGAAGAATTAAATTTAGACTTGGATCAAAAAGTAAAAGAAAGAACAAGGCAATTGGAAAATACATTAGA
GCAAGTCCGAGAACTTAAGATTCAACAAGACGGGGATTACTTTTTAACCTCTTTAATTTTGGACCCCTTAAATCGAAATC
AGGTAGAAAATGATTTTATAGTTTTGGAAGGGTTTAGTAAACAGAAGAAAAGATTTCAGTTCAAACAATGGAAAAAAGAA
ATCGGTGGAGACATCATTATCGCAGATGAGATTTGTTTAAAGAATAGGAAATGTCTTGTTTTTGTAAACGGGGATGCGAT
GGGAAAATCTATTCAAGGAGCGAGTGGGGCTTTAGTTTTAGGGGTTGTATTTCGTTCTTTTATATCTAGAACAAAAACGG
TTTCTTCTTATCATTCCAAACCGCCTGAGTTATGGCTCAAAGAATGTTTTTTAGAACTTCAAAATATTTTTGAATCTTTT
GACGGTTCTATGTTGGTATCTGTCGTTTTGGGTTTAGTGGATTTGGAATCCGGAGTTTTATTCTTTTTGAATGCGGAACA
TCCTCCTACTGTACTTTACAGAAATGGAGTTGCAACTTTTATAGAAAATAAATTAGAACTTCGTAAAATAGGAATTACAG
GTTTGGAAAGTAAGATGAAAGTAAAGACTTTTTTTCTAGAAAAAGGAGATACTATCATTGTAAGTTCTGATGGAAGAGAC
GACATTTTGCTAGGAATGGATCAGGACGGAATACCGTTGATCAACGAAGACGAATGTCAATTTTTAAGAAGGGTGGAGGA
GTCGGGAGGAGATCTGGATTTATTAGTTCAAGGTCTTGAAAACTACGGAGAATTAACAGACGATTTAAGCATAGTTAAGC
TGACTTATCTTAAAGAGCCAGTTCGTTTAGAGTCTTTTGCAAATTTGCCATCCTTTCAATTTCCGGATGAAACGTATTTA
AAATGTCTACAGGACGAAAATTGGGAACATACAATTTATCATCTAGAAAATCTCAAAAGCAAAATATCCGAGGAGTTTCT
ACCACCGGTTTTTAAAAAAGAATTAGCAAAAGTATATTATAAAATTGAAAAGTATGAAGAAGCACTTTTTTTATTTGAAG
AGTTGATTTCGGAATTTCCGGAGGACGTTGAAATTATTTTTAACGCTTCTTTGATTTACAAAAAACTAAAACGGTATCAC
GAGTCGATCGAATTAGGAGAAAGAGTTTTATTAAGGGAACCAGATTTTCTAAACAACATTGTAAATCTTGCGGAATCTTA
TATTTTAATTTATGAAAGGGAAATGGCTCTTGGTTTGTTGGAAAAAATTGAATGTTTAGATACTGATCATTTGTACACTC
AAAAGATTAAAGCACAATTAGAACAGCCAGAACTCTATAAGAATCCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGATTTCTAAACTGAAAATGTAGATTTTCAGTTTAGTTATGATAGTCGTTTATTAATTCTTGCAAAATCAAAATTTTCT
GTTACTTTGTTTAGGGTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAATTGGAATCTATCTTAAATGTAGAGTTTTTTTGTTTTTTTCCCAACTAACAAACAATAGTTGTAGATTAAATCTT
AAATTCTAATTAGATGCGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 869; Mature: 868

Protein sequence:

>869_residues
MTARMISDIIKFDPKIFYDKLIWIFIFFVSTPIFAFPIDLTKDWKIISGKNLNASIKDVSWKELKSLPIPEDSISFSEGI
YTLTLLKTFEVSANDFQKLALDGLSIHFPLLTNVYEVYFNGEKIGSGGIVLNGKIIKDGFKRHVILPIPENKVQIGKNEI
RLILSSNAGEELNVYASFDSAPLVIDLQSKNVLILSERSRWMLAFLYLFVGFYHFLLYFKRPQEKYNLFFGLFSTFFSVY
IHLRSNAVYELNLDPLFQMKLEYMVIFNITSLFLLFLNTFFQYKISFVSKLYQIFTLTLTLLIPFSNRSVCLFLLKLWQF
SIFTFIVYSFFIMYKSLVRKNPDAIRMIFGFLVLMIAGVMDLIGSMGLIDNLENYGILKYGFFVFEVGMVFILANRFLRV
HKEAEELNLDLDQKVKERTRQLENTLEQVRELKIQQDGDYFLTSLILDPLNRNQVENDFIVLEGFSKQKKRFQFKQWKKE
IGGDIIIADEICLKNRKCLVFVNGDAMGKSIQGASGALVLGVVFRSFISRTKTVSSYHSKPPELWLKECFLELQNIFESF
DGSMLVSVVLGLVDLESGVLFFLNAEHPPTVLYRNGVATFIENKLELRKIGITGLESKMKVKTFFLEKGDTIIVSSDGRD
DILLGMDQDGIPLINEDECQFLRRVEESGGDLDLLVQGLENYGELTDDLSIVKLTYLKEPVRLESFANLPSFQFPDETYL
KCLQDENWEHTIYHLENLKSKISEEFLPPVFKKELAKVYYKIEKYEEALFLFEELISEFPEDVEIIFNASLIYKKLKRYH
ESIELGERVLLREPDFLNNIVNLAESYILIYEREMALGLLEKIECLDTDHLYTQKIKAQLEQPELYKNP

Sequences:

>Translated_869_residues
MTARMISDIIKFDPKIFYDKLIWIFIFFVSTPIFAFPIDLTKDWKIISGKNLNASIKDVSWKELKSLPIPEDSISFSEGI
YTLTLLKTFEVSANDFQKLALDGLSIHFPLLTNVYEVYFNGEKIGSGGIVLNGKIIKDGFKRHVILPIPENKVQIGKNEI
RLILSSNAGEELNVYASFDSAPLVIDLQSKNVLILSERSRWMLAFLYLFVGFYHFLLYFKRPQEKYNLFFGLFSTFFSVY
IHLRSNAVYELNLDPLFQMKLEYMVIFNITSLFLLFLNTFFQYKISFVSKLYQIFTLTLTLLIPFSNRSVCLFLLKLWQF
SIFTFIVYSFFIMYKSLVRKNPDAIRMIFGFLVLMIAGVMDLIGSMGLIDNLENYGILKYGFFVFEVGMVFILANRFLRV
HKEAEELNLDLDQKVKERTRQLENTLEQVRELKIQQDGDYFLTSLILDPLNRNQVENDFIVLEGFSKQKKRFQFKQWKKE
IGGDIIIADEICLKNRKCLVFVNGDAMGKSIQGASGALVLGVVFRSFISRTKTVSSYHSKPPELWLKECFLELQNIFESF
DGSMLVSVVLGLVDLESGVLFFLNAEHPPTVLYRNGVATFIENKLELRKIGITGLESKMKVKTFFLEKGDTIIVSSDGRD
DILLGMDQDGIPLINEDECQFLRRVEESGGDLDLLVQGLENYGELTDDLSIVKLTYLKEPVRLESFANLPSFQFPDETYL
KCLQDENWEHTIYHLENLKSKISEEFLPPVFKKELAKVYYKIEKYEEALFLFEELISEFPEDVEIIFNASLIYKKLKRYH
ESIELGERVLLREPDFLNNIVNLAESYILIYEREMALGLLEKIECLDTDHLYTQKIKAQLEQPELYKNP
>Mature_868_residues
TARMISDIIKFDPKIFYDKLIWIFIFFVSTPIFAFPIDLTKDWKIISGKNLNASIKDVSWKELKSLPIPEDSISFSEGIY
TLTLLKTFEVSANDFQKLALDGLSIHFPLLTNVYEVYFNGEKIGSGGIVLNGKIIKDGFKRHVILPIPENKVQIGKNEIR
LILSSNAGEELNVYASFDSAPLVIDLQSKNVLILSERSRWMLAFLYLFVGFYHFLLYFKRPQEKYNLFFGLFSTFFSVYI
HLRSNAVYELNLDPLFQMKLEYMVIFNITSLFLLFLNTFFQYKISFVSKLYQIFTLTLTLLIPFSNRSVCLFLLKLWQFS
IFTFIVYSFFIMYKSLVRKNPDAIRMIFGFLVLMIAGVMDLIGSMGLIDNLENYGILKYGFFVFEVGMVFILANRFLRVH
KEAEELNLDLDQKVKERTRQLENTLEQVRELKIQQDGDYFLTSLILDPLNRNQVENDFIVLEGFSKQKKRFQFKQWKKEI
GGDIIIADEICLKNRKCLVFVNGDAMGKSIQGASGALVLGVVFRSFISRTKTVSSYHSKPPELWLKECFLELQNIFESFD
GSMLVSVVLGLVDLESGVLFFLNAEHPPTVLYRNGVATFIENKLELRKIGITGLESKMKVKTFFLEKGDTIIVSSDGRDD
ILLGMDQDGIPLINEDECQFLRRVEESGGDLDLLVQGLENYGELTDDLSIVKLTYLKEPVRLESFANLPSFQFPDETYLK
CLQDENWEHTIYHLENLKSKISEEFLPPVFKKELAKVYYKIEKYEEALFLFEELISEFPEDVEIIFNASLIYKKLKRYHE
SIELGERVLLREPDFLNNIVNLAESYILIYEREMALGLLEKIECLDTDHLYTQKIKAQLEQPELYKNP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100847; Mature: 100716

Theoretical pI: Translated: 5.13; Mature: 5.13

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTARMISDIIKFDPKIFYDKLIWIFIFFVSTPIFAFPIDLTKDWKIISGKNLNASIKDVS
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC
WKELKSLPIPEDSISFSEGIYTLTLLKTFEVSANDFQKLALDGLSIHFPLLTNVYEVYFN
HHHHHCCCCCCCCCCHHCCCEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHEEC
GEKIGSGGIVLNGKIIKDGFKRHVILPIPENKVQIGKNEIRLILSSNAGEELNVYASFDS
CCEECCCCEEEECEEECCCCCCCEEEECCCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCC
APLVIDLQSKNVLILSERSRWMLAFLYLFVGFYHFLLYFKRPQEKYNLFFGLFSTFFSVY
CCEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHLRSNAVYELNLDPLFQMKLEYMVIFNITSLFLLFLNTFFQYKISFVSKLYQIFTLTLT
HHEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIPFSNRSVCLFLLKLWQFSIFTFIVYSFFIMYKSLVRKNPDAIRMIFGFLVLMIAGVM
HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLIGSMGLIDNLENYGILKYGFFVFEVGMVFILANRFLRVHKEAEELNLDLDQKVKERTR
HHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
QLENTLEQVRELKIQQDGDYFLTSLILDPLNRNQVENDFIVLEGFSKQKKRFQFKQWKKE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
IGGDIIIADEICLKNRKCLVFVNGDAMGKSIQGASGALVLGVVFRSFISRTKTVSSYHSK
HCCCEEEECHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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IENKLELRKIGITGLESKMKVKTFFLEKGDTIIVSSDGRDDILLGMDQDGIPLINEDECQ
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KCLQDENWEHTIYHLENLKSKISEEFLPPVFKKELAKVYYKIEKYEEALFLFEELISEFP
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EDVEIIFNASLIYKKLKRYHESIELGERVLLREPDFLNNIVNLAESYILIYEREMALGLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHH
EKIECLDTDHLYTQKIKAQLEQPELYKNP
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TARMISDIIKFDPKIFYDKLIWIFIFFVSTPIFAFPIDLTKDWKIISGKNLNASIKDVS
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WKELKSLPIPEDSISFSEGIYTLTLLKTFEVSANDFQKLALDGLSIHFPLLTNVYEVYFN
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GEKIGSGGIVLNGKIIKDGFKRHVILPIPENKVQIGKNEIRLILSSNAGEELNVYASFDS
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APLVIDLQSKNVLILSERSRWMLAFLYLFVGFYHFLLYFKRPQEKYNLFFGLFSTFFSVY
CCEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIPFSNRSVCLFLLKLWQFSIFTFIVYSFFIMYKSLVRKNPDAIRMIFGFLVLMIAGVM
HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLIGSMGLIDNLENYGILKYGFFVFEVGMVFILANRFLRVHKEAEELNLDLDQKVKERTR
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EDVEIIFNASLIYKKLKRYHESIELGERVLLREPDFLNNIVNLAESYILIYEREMALGLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHH
EKIECLDTDHLYTQKIKAQLEQPELYKNP
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA