Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yjeP [H]

Identifier: 326423646

GI number: 326423646

Start: 7740

End: 10289

Strand: Reverse

Name: yjeP [H]

Synonym: NA

Alternate gene names: 326423646

Gene position: 10289-7740 (Counterclockwise)

Preceding gene: 27363498

Following gene: 326423645

Centisome position: 0.31

GC content: 37.61

Gene sequence:

>2550_bases
GTGATTAGAAAAAAAGAAACCTACTCATATATCATGGCATTCATAGCAATGATTGCCATGTCAATTGCTATCTATCTTCT
GACCAGTGAGGATGAAAATTCGTACTCGAGAGTCCTCAATAGTGACAGTTTTATAGCTAAGGAGCTGGAATTTAGCCAAG
AGAATTTTACAGATACTCACAAGCTTGAATCGGAGATTGAAAAAGTCAAACTTGAAATTGCTAAAACGGCCACCGATCTA
CAAAATGTGAACCTAGAATATACCGAACTTTCGGATGAAATGAAGGCAATAAAGGATAACCTAAATTGGCTTAATAAGAC
GACGACATTCGGAGCCTATACAAGGAATTTGCTGCAAGAGTTACCGAAAGGAATCAACATCCAAAGCCTTCACGATTATC
GCTCACAGGTAAATCTTCGGTTCTATGAAATTACCAAAGCTTCAAGGGCTTCCGATTCGCTTGCACGAGACAGTTCTAAT
CTAAAAAAACTCCAAGAGTTAATGTCATTATATAAACAGCTCTCGACAGAGGTAGACAAGTTAATTGACGTATCTGAAAA
TTATTCTGTAACGCTTGAAACAGCCATAGCCTTTCTTAAAGAACGACAGGTCTGGACCTACAGTAATACACCTCTTTGGG
AAAGCATTTTTAATCTGAACGGTAAGAAACTGTTCGGGGTGATATATTCGTCTGGTTCTAGTTCTAAGAATATTGATTGG
TCAAAAATGAATGTGGCATTAATTTTTCTAGCCGTCTTCTCCCTAACATTGCTGTTTTTAAATTGGTGGCTTAAGTTAAA
ACTTGATCTTATATCACAGCGACAAGAAAAAATATTTGGTCATCCATTAAAAGACAGCTTTTCAAATAGCATCATCGTTT
TACTAATAACCGTCTTAGCATCATCAATGCTCCCTATATTTTTCTTCAACTGCGTATGGTTTCTCGATTTCATGTCGCTG
CGTCATCCATCAATTTTGTTTGATGAGATCATGATAGCTAGCTTTGTTCTATTGTGGAGTGTGGGTTTTCTTTATCATTT
GAGTAGAAAAAAAGGGATGCTTGAATTACATTTTCGCTGGTCAAGCGAAGTGTGCCACACGATTCATCATCGAATACGGA
TGATAATGTTACCATTACTTATCATTCTTGTTTTATTCCACGTTTTCCGTTTGGTTGAGCATGAAAATGATGTCGAAATC
CTTCGTATACTTTATCTGCTTGTGGTTGTTTTTCTCTTTGTATTTTATACGAGCACATTGAATTTAGACGACGTTAATAC
TCACTTCCCTGCATTTTTTCAATCAGGGCTTGGTTTCTTTCTTATTTATTATTCAGTGCAGGTCTCTTTCTTTGTTGTCA
TCGCGATGGCCATATTAGGTCTGTATGTCGGTTCGTGGAAAATACTGATACTCCAGCAACTCAATATGTTTGCATTAATG
GGGGTTTTCTTAGTTTATCAGTTAGGGGAGCGGTGGTTAATCTTAGAGCAAAAACAATTGATTTATCAGCGCTTTCTTGC
AAAGCGAGAGGAAAAAATCGCTCGTGAAAGCGAAGGTTTATCAGAAGAAACTGCGTCCTTTGACGCTGAAAGCCATGCTT
TAGATAAAGCATCCATTAGCGAACAGTCTATGGCGTTGTTGAAAGGGCTGAGTTTAATTTTGTTAGTTACTGTTCTTTCG
ACAGTATGGTCAAGTCAGTTAGAATTAACCAACTGGATGGATAACGTTCTCTTATGGCAGGTTGCTTCGCCTACGAGTGG
TGGTGAAGCGGTCGATATCACCTTGAAATCACTTATGTATGCGTTGCTTACTTTAGCTATTTCATTTGTGAGTATAAGAA
ATATCCCAGGCCTTTTAGAATTGTTGGTTTTACGTAGAATGAGCCTAGCACCTGGAACTGGCTACACGATTACTACTTTA
CTTCGATACATTATATTGATGCTTGGTATTGTTATTGCTTTTACCACCATCGGTATTGAGTGGGAAAGCTTGCAATGGTT
AGTTGCTGCGGTTGGTGTTGGTTTGGGGTTTGGTCTGCAGGAAATATTTGCCAATTTTATTTCAGGTCTAATACTGTTGT
TTGAGAGACCAATAAGGATAGGTGACACGGTTACTATTAATGAGCTTTCTGGAACCGTTAGTAAAATTCAAACTCGATCT
ACAACCATTATTGATTGGGACAATAAAGAAATTGTTGTCCCTAATAAAGTATTTATCACAGACAAGCTTATCAACTGGTC
CTTGACCGATTCGGTTACTAGGGTAGTTATCCCTATTGGTGTTGCCTATGATTCAGATATAGATTTGGTTGAAGAGTTAC
TATATCGAGCCGTGGAAGGTAATCCTCACATATTAAACTCCCCTATACCGAAGGTATATTTTCTGTCTTTTGGTGACAGC
AGTTTGGAGTTTGAGCTTAGGCTTCATATCAACTCAATTGATGATCGCTTACCAACTCTTCATTTGGTAAACAAAAAGAT
TAATCAGTTATTCAATGAGAATAATGTTGAAATTGCTTATCCACAAATTGATGTGCACATGAAAAATTAG

Upstream 100 bases:
NA

Downstream 100 bases:
NA

Product: Potassium efflux system kefA / Small-conductance mechanosensitive channel

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 849; Mature: 849

Protein sequence:
NA

Sequences:

>Translated_849_residues
MIRKKETYSYIMAFIAMIAMSIAIYLLTSEDENSYSRVLNSDSFIAKELEFSQENFTDTHKLESEIEKVKLEIAKTATDL
QNVNLEYTELSDEMKAIKDNLNWLNKTTTFGAYTRNLLQELPKGINIQSLHDYRSQVNLRFYEITKASRASDSLARDSSN
LKKLQELMSLYKQLSTEVDKLIDVSENYSVTLETAIAFLKERQVWTYSNTPLWESIFNLNGKKLFGVIYSSGSSSKNIDW
SKMNVALIFLAVFSLTLLFLNWWLKLKLDLISQRQEKIFGHPLKDSFSNSIIVLLITVLASSMLPIFFFNCVWFLDFMSL
RHPSILFDEIMIASFVLLWSVGFLYHLSRKKGMLELHFRWSSEVCHTIHHRIRMIMLPLLIILVLFHVFRLVEHENDVEI
LRILYLLVVVFLFVFYTSTLNLDDVNTHFPAFFQSGLGFFLIYYSVQVSFFVVIAMAILGLYVGSWKILILQQLNMFALM
GVFLVYQLGERWLILEQKQLIYQRFLAKREEKIARESEGLSEETASFDAESHALDKASISEQSMALLKGLSLILLVTVLS
TVWSSQLELTNWMDNVLLWQVASPTSGGEAVDITLKSLMYALLTLAISFVSIRNIPGLLELLVLRRMSLAPGTGYTITTL
LRYIILMLGIVIAFTTIGIEWESLQWLVAAVGVGLGFGLQEIFANFISGLILLFERPIRIGDTVTINELSGTVSKIQTRS
TTIIDWDNKEIVVPNKVFITDKLINWSLTDSVTRVVIPIGVAYDSDIDLVEELLYRAVEGNPHILNSPIPKVYFLSFGDS
SLEFELRLHINSIDDRLPTLHLVNKKINQLFNENNVEIAYPQIDVHMKN
>Mature_849_residues
MIRKKETYSYIMAFIAMIAMSIAIYLLTSEDENSYSRVLNSDSFIAKELEFSQENFTDTHKLESEIEKVKLEIAKTATDL
QNVNLEYTELSDEMKAIKDNLNWLNKTTTFGAYTRNLLQELPKGINIQSLHDYRSQVNLRFYEITKASRASDSLARDSSN
LKKLQELMSLYKQLSTEVDKLIDVSENYSVTLETAIAFLKERQVWTYSNTPLWESIFNLNGKKLFGVIYSSGSSSKNIDW
SKMNVALIFLAVFSLTLLFLNWWLKLKLDLISQRQEKIFGHPLKDSFSNSIIVLLITVLASSMLPIFFFNCVWFLDFMSL
RHPSILFDEIMIASFVLLWSVGFLYHLSRKKGMLELHFRWSSEVCHTIHHRIRMIMLPLLIILVLFHVFRLVEHENDVEI
LRILYLLVVVFLFVFYTSTLNLDDVNTHFPAFFQSGLGFFLIYYSVQVSFFVVIAMAILGLYVGSWKILILQQLNMFALM
GVFLVYQLGERWLILEQKQLIYQRFLAKREEKIARESEGLSEETASFDAESHALDKASISEQSMALLKGLSLILLVTVLS
TVWSSQLELTNWMDNVLLWQVASPTSGGEAVDITLKSLMYALLTLAISFVSIRNIPGLLELLVLRRMSLAPGTGYTITTL
LRYIILMLGIVIAFTTIGIEWESLQWLVAAVGVGLGFGLQEIFANFISGLILLFERPIRIGDTVTINELSGTVSKIQTRS
TTIIDWDNKEIVVPNKVFITDKLINWSLTDSVTRVVIPIGVAYDSDIDLVEELLYRAVEGNPHILNSPIPKVYFLSFGDS
SLEFELRLHINSIDDRLPTLHLVNKKINQLFNENNVEIAYPQIDVHMKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI2367355, Length=601, Percent_Identity=33.1114808652246, Blast_Score=330, Evalue=2e-91,
Organism=Escherichia coli, GI1786670, Length=313, Percent_Identity=46.0063897763578, Blast_Score=319, Evalue=5e-88,
Organism=Escherichia coli, GI1789291, Length=213, Percent_Identity=33.8028169014084, Blast_Score=114, Evalue=3e-26,
Organism=Escherichia coli, GI1787591, Length=184, Percent_Identity=27.7173913043478, Blast_Score=70, Evalue=4e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010920
- InterPro:   IPR011066
- InterPro:   IPR006685
- InterPro:   IPR006686
- InterPro:   IPR011014 [H]

Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97269; Mature: 97269

Theoretical pI: Translated: 5.76; Mature: 5.76

Prosite motif: PS01246 UPF0003

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRKKETYSYIMAFIAMIAMSIAIYLLTSEDENSYSRVLNSDSFIAKELEFSQENFTDTH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH
KLESEIEKVKLEIAKTATDLQNVNLEYTELSDEMKAIKDNLNWLNKTTTFGAYTRNLLQE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LPKGINIQSLHDYRSQVNLRFYEITKASRASDSLARDSSNLKKLQELMSLYKQLSTEVDK
CCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDVSENYSVTLETAIAFLKERQVWTYSNTPLWESIFNLNGKKLFGVIYSSGSSSKNIDW
HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCH
SKMNVALIFLAVFSLTLLFLNWWLKLKLDLISQRQEKIFGHPLKDSFSNSIIVLLITVLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHH
SSMLPIFFFNCVWFLDFMSLRHPSILFDEIMIASFVLLWSVGFLYHLSRKKGMLELHFRW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
SSEVCHTIHHRIRMIMLPLLIILVLFHVFRLVEHENDVEILRILYLLVVVFLFVFYTSTL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLDDVNTHFPAFFQSGLGFFLIYYSVQVSFFVVIAMAILGLYVGSWKILILQQLNMFALM
CCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GVFLVYQLGERWLILEQKQLIYQRFLAKREEKIARESEGLSEETASFDAESHALDKASIS
HHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHCCHHHCC
EQSMALLKGLSLILLVTVLSTVWSSQLELTNWMDNVLLWQVASPTSGGEAVDITLKSLMY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHH
ALLTLAISFVSIRNIPGLLELLVLRRMSLAPGTGYTITTLLRYIILMLGIVIAFTTIGIE
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
WESLQWLVAAVGVGLGFGLQEIFANFISGLILLFERPIRIGDTVTINELSGTVSKIQTRS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCC
TTIIDWDNKEIVVPNKVFITDKLINWSLTDSVTRVVIPIGVAYDSDIDLVEELLYRAVEG
CEEEEECCCEEECCCEEEEEHHHCCCCHHHHHEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCC
NPHILNSPIPKVYFLSFGDSSLEFELRLHINSIDDRLPTLHLVNKKINQLFNENNVEIAY
CCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
PQIDVHMKN
CEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MIRKKETYSYIMAFIAMIAMSIAIYLLTSEDENSYSRVLNSDSFIAKELEFSQENFTDTH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH
KLESEIEKVKLEIAKTATDLQNVNLEYTELSDEMKAIKDNLNWLNKTTTFGAYTRNLLQE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LPKGINIQSLHDYRSQVNLRFYEITKASRASDSLARDSSNLKKLQELMSLYKQLSTEVDK
CCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDVSENYSVTLETAIAFLKERQVWTYSNTPLWESIFNLNGKKLFGVIYSSGSSSKNIDW
HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCH
SKMNVALIFLAVFSLTLLFLNWWLKLKLDLISQRQEKIFGHPLKDSFSNSIIVLLITVLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHH
SSMLPIFFFNCVWFLDFMSLRHPSILFDEIMIASFVLLWSVGFLYHLSRKKGMLELHFRW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
SSEVCHTIHHRIRMIMLPLLIILVLFHVFRLVEHENDVEILRILYLLVVVFLFVFYTSTL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLDDVNTHFPAFFQSGLGFFLIYYSVQVSFFVVIAMAILGLYVGSWKILILQQLNMFALM
CCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GVFLVYQLGERWLILEQKQLIYQRFLAKREEKIARESEGLSEETASFDAESHALDKASIS
HHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHCCHHHCC
EQSMALLKGLSLILLVTVLSTVWSSQLELTNWMDNVLLWQVASPTSGGEAVDITLKSLMY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHH
ALLTLAISFVSIRNIPGLLELLVLRRMSLAPGTGYTITTLLRYIILMLGIVIAFTTIGIE
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
WESLQWLVAAVGVGLGFGLQEIFANFISGLILLFERPIRIGDTVTINELSGTVSKIQTRS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCC
TTIIDWDNKEIVVPNKVFITDKLINWSLTDSVTRVVIPIGVAYDSDIDLVEELLYRAVEG
CEEEEECCCEEECCCEEEEEHHHCCCCHHHHHEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCC
NPHILNSPIPKVYFLSFGDSSLEFELRLHINSIDDRLPTLHLVNKKINQLFNENNVEIAY
CCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
PQIDVHMKN
CEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7610040; 9278503; 3042771 [H]