Definition Shigella flexneri 2a str. 2457T, complete genome.
Accession NC_004741
Length 4,599,354

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The map label for this gene is 30062577

Identifier: 30062577

GI number: 30062577

Start: 1095591

End: 1096931

Strand: Direct

Name: 30062577

Synonym: S4815

Alternate gene names: NA

Gene position: 1095591-1096931 (Clockwise)

Preceding gene: 30062574

Following gene: 30062578

Centisome position: 23.82

GC content: 41.69

Gene sequence:

>1341_bases
ATGACATTGCCTGTTTTTATAACGGTAATTGCAGACCATGACAAGCCGCAGCCGTCAGGCTGCCTACTCGATAATTTAAG
TTCAGCAGCAGTTAAAACAGCAGGTGTACTTATCAGCTTTCAGGCTGTACTATCCGCTTATCAGCGAGTAATGGAAGTTG
GCCTTCAACGTGCAAGTGCTGAACGTTCAATTGATTTCGTATTTTCTAAAGATGCAAATCAAGTAAAAGATTTCACAAAG
TCATTAGCTCAAACAACGGGTTTAGATATCGCTGAACTGCAATCACAGTTTGCTGGTTTCGGTGCTTCAGCTAGAGAGTC
TCTAGGCATTCAAGGTTCTGAAGAACTTTTTAGAAATATGATTGGCTATTCTCGTCTGATGGGGCGAAGTGAAGAAGAGA
TTAAGCGAGCACTGACAGCATTATCACAGATGGCTGGTAAGGGTCAGATTATGGCTGAAGAGCTTAAGGGGCAACTAGCT
GAAGCTGTTCCTGGTATGGTTCAGGTATTCGCTAAAGCAACCGGAAAGACTGAACAGGAATTATTTGATGCTATGAAGAA
GGGGGCTTTAAAATCTGCCGATACTCTTCAGAAGGTCACTCAGGAACTGAATAAACAAATCACCGCTAAAGGTGGCTGGA
AAGCTATTTCAGAAAGTACACAGGCACAACTAGGGAACTTGAAAAACTCTTGGAATACCACGCTTGATAGTATCTTCAGA
GGTTCTGAAAATGGTCTGCAAGATTTTACAAGAAGCTTAACCAATCTTTTAAACGCTCTTGGTGGAAGTGGTAAGAGTCT
TGGTGAATCTCTTGGTAGTCTCATGACTTCTATGTCACATGGTGTCGATTCATTGACCGATATTAGTTACAGGGTAAGGG
CGTTCTTTGATGAGGTGACATTAGCTTACCGTCCACTAAATGACACTCAGAGGAAAATTGTTGATGGTTTATCTGATGGG
TTAATTGATGGTCTGAAGATGCTTGCTGTGGCTGTTACTGCTCAAAAGGCTGCAAATGTAGCAGGAGGCTTGTTAAACCT
TGCAAACGCTGTTACTTCATTCGGTGACGCTGTTAATAAAGCTAAAGCTGGCAAGGCTGGTTCTTCAGGTGGTGCGCTAA
ATAAAGTCGGTAGAGTTGTCCTTTATGCTGAGTTGGTAAATTTTGCTCTTGATAATTTAAACCCTGAAGCAGCTAAGAAT
CCGAACTTACATCAATCAGGTATTGGCACAGAAACAAACTTCAACCCTGAATACAAAGGTGATTCATCTAAGCCAATAGT
TCTATCGCTGACTGGTTTAATGGTGCAACTAATAAAATTGCTAACTTCCAAGAACCGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTGAAGCTTCACGACATAGCGGGGAAGTTTGCTTCTTTGAGAGGCGGGTTTACGTTTACGGGGTTTAGCTGAACGGGCC
ATATAACCACCTGAAAGACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAACTTCGTAAATAACACACAATCAACTCCATCAGCTATCACAGGTGACATGGTTAATAGCAATGCTCAATTAGCTATG
GCTGTATCAGAGTTAGGAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 445

Protein sequence:

>446_residues
MTLPVFITVIADHDKPQPSGCLLDNLSSAAVKTAGVLISFQAVLSAYQRVMEVGLQRASAERSIDFVFSKDANQVKDFTK
SLAQTTGLDIAELQSQFAGFGASARESLGIQGSEELFRNMIGYSRLMGRSEEEIKRALTALSQMAGKGQIMAEELKGQLA
EAVPGMVQVFAKATGKTEQELFDAMKKGALKSADTLQKVTQELNKQITAKGGWKAISESTQAQLGNLKNSWNTTLDSIFR
GSENGLQDFTRSLTNLLNALGGSGKSLGESLGSLMTSMSHGVDSLTDISYRVRAFFDEVTLAYRPLNDTQRKIVDGLSDG
LIDGLKMLAVAVTAQKAANVAGGLLNLANAVTSFGDAVNKAKAGKAGSSGGALNKVGRVVLYAELVNFALDNLNPEAAKN
PNLHQSGIGTETNFNPEYKGDSSKPIVLSLTGLMVQLIKLLTSKNR

Sequences:

>Translated_446_residues
MTLPVFITVIADHDKPQPSGCLLDNLSSAAVKTAGVLISFQAVLSAYQRVMEVGLQRASAERSIDFVFSKDANQVKDFTK
SLAQTTGLDIAELQSQFAGFGASARESLGIQGSEELFRNMIGYSRLMGRSEEEIKRALTALSQMAGKGQIMAEELKGQLA
EAVPGMVQVFAKATGKTEQELFDAMKKGALKSADTLQKVTQELNKQITAKGGWKAISESTQAQLGNLKNSWNTTLDSIFR
GSENGLQDFTRSLTNLLNALGGSGKSLGESLGSLMTSMSHGVDSLTDISYRVRAFFDEVTLAYRPLNDTQRKIVDGLSDG
LIDGLKMLAVAVTAQKAANVAGGLLNLANAVTSFGDAVNKAKAGKAGSSGGALNKVGRVVLYAELVNFALDNLNPEAAKN
PNLHQSGIGTETNFNPEYKGDSSKPIVLSLTGLMVQLIKLLTSKNR
>Mature_445_residues
TLPVFITVIADHDKPQPSGCLLDNLSSAAVKTAGVLISFQAVLSAYQRVMEVGLQRASAERSIDFVFSKDANQVKDFTKS
LAQTTGLDIAELQSQFAGFGASARESLGIQGSEELFRNMIGYSRLMGRSEEEIKRALTALSQMAGKGQIMAEELKGQLAE
AVPGMVQVFAKATGKTEQELFDAMKKGALKSADTLQKVTQELNKQITAKGGWKAISESTQAQLGNLKNSWNTTLDSIFRG
SENGLQDFTRSLTNLLNALGGSGKSLGESLGSLMTSMSHGVDSLTDISYRVRAFFDEVTLAYRPLNDTQRKIVDGLSDGL
IDGLKMLAVAVTAQKAANVAGGLLNLANAVTSFGDAVNKAKAGKAGSSGGALNKVGRVVLYAELVNFALDNLNPEAAKNP
NLHQSGIGTETNFNPEYKGDSSKPIVLSLTGLMVQLIKLLTSKNR

Specific function: Unknown

COG id: COG3941

COG function: function code R; Mu-like prophage protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47452; Mature: 47320

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: PS00359 RIBOSOMAL_L11

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLPVFITVIADHDKPQPSGCLLDNLSSAAVKTAGVLISFQAVLSAYQRVMEVGLQRASA
CCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERSIDFVFSKDANQVKDFTKSLAQTTGLDIAELQSQFAGFGASARESLGIQGSEELFRNM
HHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHH
IGYSRLMGRSEEEIKRALTALSQMAGKGQIMAEELKGQLAEAVPGMVQVFAKATGKTEQE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LFDAMKKGALKSADTLQKVTQELNKQITAKGGWKAISESTQAQLGNLKNSWNTTLDSIFR
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC
GSENGLQDFTRSLTNLLNALGGSGKSLGESLGSLMTSMSHGVDSLTDISYRVRAFFDEVT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYRPLNDTQRKIVDGLSDGLIDGLKMLAVAVTAQKAANVAGGLLNLANAVTSFGDAVNK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKAGKAGSSGGALNKVGRVVLYAELVNFALDNLNPEAAKNPNLHQSGIGTETNFNPEYKG
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSSKPIVLSLTGLMVQLIKLLTSKNR
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
TLPVFITVIADHDKPQPSGCLLDNLSSAAVKTAGVLISFQAVLSAYQRVMEVGLQRASA
CCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERSIDFVFSKDANQVKDFTKSLAQTTGLDIAELQSQFAGFGASARESLGIQGSEELFRNM
HHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHH
IGYSRLMGRSEEEIKRALTALSQMAGKGQIMAEELKGQLAEAVPGMVQVFAKATGKTEQE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LFDAMKKGALKSADTLQKVTQELNKQITAKGGWKAISESTQAQLGNLKNSWNTTLDSIFR
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC
GSENGLQDFTRSLTNLLNALGGSGKSLGESLGSLMTSMSHGVDSLTDISYRVRAFFDEVT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYRPLNDTQRKIVDGLSDGLIDGLKMLAVAVTAQKAANVAGGLLNLANAVTSFGDAVNK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKAGKAGSSGGALNKVGRVVLYAELVNFALDNLNPEAAKNPNLHQSGIGTETNFNPEYKG
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSSKPIVLSLTGLMVQLIKLLTSKNR
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA