| Definition | Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004663 |
| Length | 6,260,361 |
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The map label for this gene is 29348276
Identifier: 29348276
GI number: 29348276
Start: 3587548
End: 3588792
Strand: Reverse
Name: 29348276
Synonym: BT_2867
Alternate gene names: NA
Gene position: 3588792-3587548 (Counterclockwise)
Preceding gene: 29348277
Following gene: 29348275
Centisome position: 57.33
GC content: 36.71
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GTGGATGGCGGTAAAACGATATTTCATTTTGTTGAGGTTATATTATCGGACGGTATTTAAGCTGGTTTATGGTATTATTT ATAAATAATATAGTTGGAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATCGTTTACTGTATAGCCGGAACCTACAATTCCGGAGGAATGGAACGGGTATTGGCAAATAAAGCCAATTATCTGGTC AGTCATGGATATGAAGTTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414
Protein sequence:
>414_residues MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF YCLDWKMEPVLIEE
Sequences:
>Translated_414_residues MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF YCLDWKMEPVLIEE >Mature_414_residues MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF YCLDWKMEPVLIEE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47580; Mature: 47580
Theoretical pI: Translated: 8.01; Mature: 8.01
Prosite motif: PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
2.7 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 5.6 %Cys+Met (Translated Protein) 2.7 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 5.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLL CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHH GAIVFAFIFSFICFVAADYNHTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH IAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQEVGRLYGIGAALDPAGVRFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH IVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRT HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DSTDKLNTMMWVWPEDVKSWIIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYN CCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALFYCLDWKMEPVLIEE HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECC >Mature Secondary Structure MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLL CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHH GAIVFAFIFSFICFVAADYNHTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH IAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQEVGRLYGIGAALDPAGVRFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH IVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRT HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DSTDKLNTMMWVWPEDVKSWIIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYN CCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALFYCLDWKMEPVLIEE HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA