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The map label for this gene is 28572292

Identifier: 28572292

GI number: 28572292

Start: 132629

End: 134734

Strand: Direct

Name: 28572292

Synonym: TW129

Alternate gene names: NA

Gene position: 132629-134734 (Clockwise)

Preceding gene: 28572291

Following gene: 28572293

Centisome position: 14.32

GC content: 44.11

Gene sequence:

>2106_bases
TTGGCGCGTCTTCTCTCTGCCCGTTTCTTTTCTATTCTTATTGTTTTTTTTGCTTTATCGTTTTTTCTCGCCTCTTTTGT
TTTGCCTCGCCTCTTGGGCGGTTTTGATATCAACTGGGCCCTTGTTTCCGTAACCGGTGCGCTTCGTTTTCTTGTGGCGA
TTCTGGTGGGCTGCCTTGTATCCATTGCTTATTCTCTAAGTCCCAGATTTCCCGAGTATGGAAAGTTGTTAATTGTTGCG
CGCACTCTTTCGTGTTGTGTGGTTCCGGTTGTTTTCTTTTGTATACTTTTCGCTTTTCTGACTGAGAAAGCTGAGTTTTC
TGGGCTCAATTTTGAAACTTACTTAACTGGGCCCGGTTTTGTTTGGATTATTGTCTTGGCACTGGTTCTGCTTATCTCTT
TGGCTCTTTTGTTTTGCAAAAAACGTATTCAGATTGCCGTTATAAGTACAATTACCCTTTTGCTCCTAATTCCTCTTGCA
TTCAGTGAACATTCGGGTCACAGCACTGTTTCTGCCAATGTTTCGCAGCACGTAACGGATTATCAGGGTTCTGTGTCTGA
CAAGTCGCATCACGCTCATCATTCACATAATCATTCACATAATCATTCACAGGGCGAAACACGTTCTGCGCACGATGTGC
CATTAGATGCGATAGGCGCGTCTCGCACTCCGGCGATGCATGGTGGGTCGCACGGAGCTATGGGCGCATCGTTAGTGTAC
GCCATTTCTATTTCAGTTTTAGCAGGGGTAATTTTCTCAATGCTTTACATTACCGGACTATATTTTGCGCGGATCAAACA
CATAAAGTCCTCTGTTCAAATAATGCCTCAGAGATTCTTTAGCATTACAAACAGATTGTCAGTGCTATCCATGTTTTTAC
TTTTATTCGCATTTTTTTCCGATGCTGTGACTGCGATGCCGTACATTAGCTCTGAATTTACCCCATACGGGATTTTGTCT
GCAACAAAAATTGCACTGTTTCTTCTGCTTGCCCTGTGTGCGCTGTACATTCATTTTTTTTACTTTATTAAAAGTAGGAT
GACGTGTGCGCTAATTGTCATTCTGGCATGTGAAGCTGTTATTACGGGTTTGATTTTTTTAATTACTGCTTCGGCTGTTA
CCCAGATACCCCAGGCATCAGTATCTGACAGAACACCAACCCCTGCTGAATTGTTAACAGGCCAGATACTGCCCCCAAGG
GAGAGTTTCACTAATTATCTATCAATTTGGATGATCGATCCTTTGTGGCTTTCTATATGCGTTGTTTTAGCCTTTTTCTA
TCTTCTTGGGGTTATAAAACTCCACCGCCGTGGGGATAGATGGCCATGGCTAAAGACAGTAAGCTGGCTTTTCGCCGTGC
TTGTTATGTTCTACGTAACCAATGGGGGAGTTGCTGTATACGGTATGTATCTTTTTTCAGCTCATATGGTTATGCATATG
ACCCTTGGCGCCATCGTCCCGATATTCTTGGTTGTGGCATCACCGGTCACACTTTTACTGAGAGCTGTTCCGGCACGCCG
GGATGGCAGCTTTGGCCCGAGAGAATGGATATTGTTTTTTCTGAATACCAGATTTATTCAGTTTATTAGTTTGCCTCCTA
TTGCTGCTGCAATATTTATCCTGTCAATGTTCATTTTTTATTTCACAGATCTATTACAGTTTGGAATACAAAATTACTTA
GGCCATCAGGTAATGATGTTTCATTTTCTGCTGAGTGGATATCTTTTTGCCCAGAGTATTCTGGTAACAGACCCTTCCAG
ACATCGCTTTAGCATACCTTCCAGAATGTTAGTGCTAGTATTGGCGATGGCGACGCATGCGTTTTTTGGTATCGCTATCA
TGTCGTCCAGGTATCTTTTTTTACCAGAATGGTTTGGCGCCATGGGGCGCACGTGGGGTAGTCCTCCCTTGGTAGATCAG
CAAATGGGCGGCGCTTTGGCGTGGGGGACAACCGAAATACCGACCATCTTGCTTGTTACTTTCTTGTTTTTCAAGTGGTT
CAAACAGGACCAGCGTGAGGCGCTTCGAAGAGATCGTGCGGAGGATCGCAATGGCGACAAAGCCCTTGTGGCGTATAACG
AATATTTAGCCCGACTACAGGGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTCTGTTCGTATCGCTCCCGGCAGCAAGTTGAAAGCCGCAGTTAAGTAGACTGGGGGCACTTATTTCCGCCCCCAATT
CATTACAGGGATAAAGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGTTTCCCGAAATTCAGGAGAATATGACAAACGCGGTTATAAAGGACAGGACTTCGCATTTACTGTCGGCTCTTGCAA
GAACTGTAAGGGAGGTTGAG

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 700

Protein sequence:

>701_residues
MARLLSARFFSILIVFFALSFFLASFVLPRLLGGFDINWALVSVTGALRFLVAILVGCLVSIAYSLSPRFPEYGKLLIVA
RTLSCCVVPVVFFCILFAFLTEKAEFSGLNFETYLTGPGFVWIIVLALVLLISLALLFCKKRIQIAVISTITLLLLIPLA
FSEHSGHSTVSANVSQHVTDYQGSVSDKSHHAHHSHNHSHNHSQGETRSAHDVPLDAIGASRTPAMHGGSHGAMGASLVY
AISISVLAGVIFSMLYITGLYFARIKHIKSSVQIMPQRFFSITNRLSVLSMFLLLFAFFSDAVTAMPYISSEFTPYGILS
ATKIALFLLLALCALYIHFFYFIKSRMTCALIVILACEAVITGLIFLITASAVTQIPQASVSDRTPTPAELLTGQILPPR
ESFTNYLSIWMIDPLWLSICVVLAFFYLLGVIKLHRRGDRWPWLKTVSWLFAVLVMFYVTNGGVAVYGMYLFSAHMVMHM
TLGAIVPIFLVVASPVTLLLRAVPARRDGSFGPREWILFFLNTRFIQFISLPPIAAAIFILSMFIFYFTDLLQFGIQNYL
GHQVMMFHFLLSGYLFAQSILVTDPSRHRFSIPSRMLVLVLAMATHAFFGIAIMSSRYLFLPEWFGAMGRTWGSPPLVDQ
QMGGALAWGTTEIPTILLVTFLFFKWFKQDQREALRRDRAEDRNGDKALVAYNEYLARLQG

Sequences:

>Translated_701_residues
MARLLSARFFSILIVFFALSFFLASFVLPRLLGGFDINWALVSVTGALRFLVAILVGCLVSIAYSLSPRFPEYGKLLIVA
RTLSCCVVPVVFFCILFAFLTEKAEFSGLNFETYLTGPGFVWIIVLALVLLISLALLFCKKRIQIAVISTITLLLLIPLA
FSEHSGHSTVSANVSQHVTDYQGSVSDKSHHAHHSHNHSHNHSQGETRSAHDVPLDAIGASRTPAMHGGSHGAMGASLVY
AISISVLAGVIFSMLYITGLYFARIKHIKSSVQIMPQRFFSITNRLSVLSMFLLLFAFFSDAVTAMPYISSEFTPYGILS
ATKIALFLLLALCALYIHFFYFIKSRMTCALIVILACEAVITGLIFLITASAVTQIPQASVSDRTPTPAELLTGQILPPR
ESFTNYLSIWMIDPLWLSICVVLAFFYLLGVIKLHRRGDRWPWLKTVSWLFAVLVMFYVTNGGVAVYGMYLFSAHMVMHM
TLGAIVPIFLVVASPVTLLLRAVPARRDGSFGPREWILFFLNTRFIQFISLPPIAAAIFILSMFIFYFTDLLQFGIQNYL
GHQVMMFHFLLSGYLFAQSILVTDPSRHRFSIPSRMLVLVLAMATHAFFGIAIMSSRYLFLPEWFGAMGRTWGSPPLVDQ
QMGGALAWGTTEIPTILLVTFLFFKWFKQDQREALRRDRAEDRNGDKALVAYNEYLARLQG
>Mature_700_residues
ARLLSARFFSILIVFFALSFFLASFVLPRLLGGFDINWALVSVTGALRFLVAILVGCLVSIAYSLSPRFPEYGKLLIVAR
TLSCCVVPVVFFCILFAFLTEKAEFSGLNFETYLTGPGFVWIIVLALVLLISLALLFCKKRIQIAVISTITLLLLIPLAF
SEHSGHSTVSANVSQHVTDYQGSVSDKSHHAHHSHNHSHNHSQGETRSAHDVPLDAIGASRTPAMHGGSHGAMGASLVYA
ISISVLAGVIFSMLYITGLYFARIKHIKSSVQIMPQRFFSITNRLSVLSMFLLLFAFFSDAVTAMPYISSEFTPYGILSA
TKIALFLLLALCALYIHFFYFIKSRMTCALIVILACEAVITGLIFLITASAVTQIPQASVSDRTPTPAELLTGQILPPRE
SFTNYLSIWMIDPLWLSICVVLAFFYLLGVIKLHRRGDRWPWLKTVSWLFAVLVMFYVTNGGVAVYGMYLFSAHMVMHMT
LGAIVPIFLVVASPVTLLLRAVPARRDGSFGPREWILFFLNTRFIQFISLPPIAAAIFILSMFIFYFTDLLQFGIQNYLG
HQVMMFHFLLSGYLFAQSILVTDPSRHRFSIPSRMLVLVLAMATHAFFGIAIMSSRYLFLPEWFGAMGRTWGSPPLVDQQ
MGGALAWGTTEIPTILLVTFLFFKWFKQDQREALRRDRAEDRNGDKALVAYNEYLARLQG

Specific function: Unknown

COG id: COG3336

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.leprae ML1998 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008457
- InterPro:   IPR019108 [H]

Pfam domain/function: PF09678 Caa3_CtaG; PF05425 CopD [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78316; Mature: 78185

Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MARLLSARFFSILIVFFALSFFLASFVLPRLLGGFDINWALVSVTGALRFLVAILVGCLV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIAYSLSPRFPEYGKLLIVARTLSCCVVPVVFFCILFAFLTEKAEFSGLNFETYLTGPGF
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHH
VWIIVLALVLLISLALLFCKKRIQIAVISTITLLLLIPLAFSEHSGHSTVSANVSQHVTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHH
YQGSVSDKSHHAHHSHNHSHNHSQGETRSAHDVPLDAIGASRTPAMHGGSHGAMGASLVY
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
AISISVLAGVIFSMLYITGLYFARIKHIKSSVQIMPQRFFSITNRLSVLSMFLLLFAFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DAVTAMPYISSEFTPYGILSATKIALFLLLALCALYIHFFYFIKSRMTCALIVILACEAV
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITGLIFLITASAVTQIPQASVSDRTPTPAELLTGQILPPRESFTNYLSIWMIDPLWLSIC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLAFFYLLGVIKLHRRGDRWPWLKTVSWLFAVLVMFYVTNGGVAVYGMYLFSAHMVMHM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLGAIVPIFLVVASPVTLLLRAVPARRDGSFGPREWILFFLNTRFIQFISLPPIAAAIFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LSMFIFYFTDLLQFGIQNYLGHQVMMFHFLLSGYLFAQSILVTDPSRHRFSIPSRMLVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHH
LAMATHAFFGIAIMSSRYLFLPEWFGAMGRTWGSPPLVDQQMGGALAWGTTEIPTILLVT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHH
FLFFKWFKQDQREALRRDRAEDRNGDKALVAYNEYLARLQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
ARLLSARFFSILIVFFALSFFLASFVLPRLLGGFDINWALVSVTGALRFLVAILVGCLV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIAYSLSPRFPEYGKLLIVARTLSCCVVPVVFFCILFAFLTEKAEFSGLNFETYLTGPGF
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHH
VWIIVLALVLLISLALLFCKKRIQIAVISTITLLLLIPLAFSEHSGHSTVSANVSQHVTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHH
YQGSVSDKSHHAHHSHNHSHNHSQGETRSAHDVPLDAIGASRTPAMHGGSHGAMGASLVY
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
AISISVLAGVIFSMLYITGLYFARIKHIKSSVQIMPQRFFSITNRLSVLSMFLLLFAFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DAVTAMPYISSEFTPYGILSATKIALFLLLALCALYIHFFYFIKSRMTCALIVILACEAV
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITGLIFLITASAVTQIPQASVSDRTPTPAELLTGQILPPRESFTNYLSIWMIDPLWLSIC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVLAFFYLLGVIKLHRRGDRWPWLKTVSWLFAVLVMFYVTNGGVAVYGMYLFSAHMVMHM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLGAIVPIFLVVASPVTLLLRAVPARRDGSFGPREWILFFLNTRFIQFISLPPIAAAIFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LSMFIFYFTDLLQFGIQNYLGHQVMMFHFLLSGYLFAQSILVTDPSRHRFSIPSRMLVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHH
LAMATHAFFGIAIMSSRYLFLPEWFGAMGRTWGSPPLVDQQMGGALAWGTTEIPTILLVT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHH
FLFFKWFKQDQREALRRDRAEDRNGDKALVAYNEYLARLQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]