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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 28379108

GI number: 28379108

Start: 2292070

End: 2294805

Strand: Direct

Name: ydgH [H]

Synonym: lp_2575

Alternate gene names: 28379108

Gene position: 2292070-2294805 (Clockwise)

Preceding gene: 28379105

Following gene: 28379111

Centisome position: 69.28

GC content: 48.03

Gene sequence:

>2736_bases
ATGGTAAGATTAAGTCAAAATAAAGTAATTGATGTGGGGGCGTCAAGACGAATGCGAAAATTATTAAAACCAAAGTGGTT
GTTCTTATTTTTCTGGGGAATCGTGGTGTTTGCAAGTATTCTGATTTTACCGAACATTACCACGTTTGTGAATGAACAAA
CCGCAATGCCACAAGATGCAACAACGAGTCCTAAATATCAACAACAATGGGGTCACGGGTTAACCAACAGCCAGTCCTTA
ACGTTAGTCTTCAACAATTCAAATGGTAAATTATCCAAACAGCAACGCCAACAAATCTCCACGACCCTAGCCAAACTTAA
TCGCCGAGCCGATGATTATGGCATTAACCAACTTCGAACGCCAACCGGTATGACTAATGACCGGCACTTATTGCGTTCCA
ATGATGGTTCCACCGAATTAGCCCTTGTCGCCGTTCAGACATCCCGGGCTGACCTATCTGTGATTGCAAATCAACTTAAT
AATGCGATTTCAATCGCCGACCTCAATACGAGTGTCACCAGTACGGACTTGATCTACCAACAACACGTGCAACAACAACG
TCGCAACTTGCTGATTAGCATGCTTATCGGTAGTCTGCTCAGTTTAATCATTCTCGGCCTCATCTTCCGCTCACTGTTAG
TGCCATTACTGAACTTACTGTGTCAAGTGGTCACTCTGATCACAACGATTAGCTTTATCACTAACGCGCGTTTAGCTTGG
CATTGGCCACTGACGGCTAATGCGCTGAGCCTTGCTGGTCTAATCAGTTTAATACTGACTAGTCTATTGACATGGCACTT
TATGTACGCGTATTGGCAATCGAGCGCAACAACCGCACCGACCACTGTCAGTCTCAAAATTCTGACACTTCAATATCGAC
AGTGGGCACTTGTTTTTATCCCATTAATACTCATAACCATCACTTTACACTGGACTGCCTTCATCTCATTAGCCGCTGCT
TGGGCCATTACTGTAGCGCTTGGAATCACCTTACTGGCGGTACCGCCGCTCAATTACGCCTTTACCGCTTGGCTCGGTGA
TAATTTATTTTGGCCAGGAACAACGGCTTGGCCGACCCGTCCACGCAATCTATGGGGCCAATTGAGCAAGTTCGGCTACT
GGCAGCCAGCGCTTGGGAGCTTGGCCGTCGCACTGTTACTACTCCCCGGCCTAATTCTTGCTAACGGCCAGTTTGCCGAT
GACAACTTACGACCCTGGCGCCAAAATCAGCTTAGTAATGCTGAATTAGGTCAGCAATTAGTCCAAGCTCACTTCGGTAC
CGGTGCCACGGCGCCAATCACAATTACACTACGAGCACCGCAGAATTTAACGCAGCAGCAATCATTACAAACAATCGATC
ACCTGACGACTAAACTGCGGGCCGTACCAAATGTGGCTCAAGTCATCTCAGTGACCCAGCCCACCGGCCAACCACTAAGT
ACTTTCTACGTTAACCAGCAACTTGCAACTATCAACATTGATTTGGCTGGTAAACTGACGAGTATGGCGAAACTCAAGAG
CCAACTCACGACTGACCAACAAAGTCTGGAACAAGCAGCGACTAGTCGCCATACCAAGTCGGTCGACCAGTTGTCCGACC
GCATCAATGATTTGGCTGAACTGAATGATCAGGTGCAACGGCAATTACAGGCTATTGACACGACGCTAACGACATCAGCT
GAGGCTGAACCCGATTTAACCAAAGTTAATCAGCAGGTCACCAAGTTAGATCACCTGACTGACCGCATGACGACCGCACT
AAATCACGTGGTAACGGCCCAAACTACGGTCGCAACCGAAGCTGGACACGTTGATCAGCGTGTTCACCACGTCAACCAAT
CATTGAAGCAGACCGTTCAACCCTTAACCACCTTACTCGCTTCACTGAAAAATACGAAGACCTATCTACATGATTTAGCC
GCTAGTCAAGTTGGCCGGAGTTTTTACCTGCCTGCTAACGCGGCTACTAATCAGGCCTATCAAAACAGTCTTTTTACTAA
TATTAGTAGTGATTTAAGCATGACACAGCTAACGGTCACTTTGAAATCAGCGCCGGCTAGTGCGGCTAGTCGCAGGACCC
TGCAACGACTTCAGGCAGTCACCCACGACAGCCTACTCGCCACGCCCTTAGCGCACGCCAAAATCCTAACAACCGGGGTA
ACACAGCAACAGCACTATCAGCATACCCTGATTGCGACCCACGCACTGAGATGGCTCACACTCGGATTAATCATCGGCAT
AGTTGTTTTATGGTTCGGCCTGCGTTCATTGACCTTCAGTCTGTTAATGACCGCGTGCTTAACTGGCGTGACGTTAACTA
GTTGGGGTTGGACTCAGTTAATATTAACACGCTGGTTGCAAACCGGGCCGCTCAGTAGCAGTGTCTTGCTTGGTAGCTTG
ATGTTGTTGACACTGCACTGGCTAATGATTACCACCGCAACCGGTTACCGTCAAAGTTGGTTACGGCACTTGGAGCCCGC
TCATCTGCAACAGCACTTTTATACTAGTGGACGATTCGTTTGCCCGGTAACAATGATTGAATTGACCTACTTACTGCCAC
TGCTTTTGACGACCGCACCAACCTTAAAGGGGCTTGCACTCATGAGTCTCATTGGGATTACGATAAGTAACCTCATCGTT
CCATTGGGATTTTCAGGGTGGACACGTTGGGCTAATGAGCCACCAGCTATAGCCACGCTTTGGCAGCACTTTCGCCCATC
ATCTACCAACCGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAGCACCTCCCACAGCGTTTTAGGATACCATAACTCACAAGTAATTACTGTAATTAACTTTTCAAACTGACGACCAAA
CTGCTTCTCTAACACCTGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATTAGTTAGCCTAATCTTTGAGTAAAAAAAGTTGCGTTTCCAGACGTCAAATCTGGAAACGCAACTTTTTTACAATAC
TAAATTGAATCGTAGCAAAC

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 911; Mature: 911

Protein sequence:

>911_residues
MVRLSQNKVIDVGASRRMRKLLKPKWLFLFFWGIVVFASILILPNITTFVNEQTAMPQDATTSPKYQQQWGHGLTNSQSL
TLVFNNSNGKLSKQQRQQISTTLAKLNRRADDYGINQLRTPTGMTNDRHLLRSNDGSTELALVAVQTSRADLSVIANQLN
NAISIADLNTSVTSTDLIYQQHVQQQRRNLLISMLIGSLLSLIILGLIFRSLLVPLLNLLCQVVTLITTISFITNARLAW
HWPLTANALSLAGLISLILTSLLTWHFMYAYWQSSATTAPTTVSLKILTLQYRQWALVFIPLILITITLHWTAFISLAAA
WAITVALGITLLAVPPLNYAFTAWLGDNLFWPGTTAWPTRPRNLWGQLSKFGYWQPALGSLAVALLLLPGLILANGQFAD
DNLRPWRQNQLSNAELGQQLVQAHFGTGATAPITITLRAPQNLTQQQSLQTIDHLTTKLRAVPNVAQVISVTQPTGQPLS
TFYVNQQLATINIDLAGKLTSMAKLKSQLTTDQQSLEQAATSRHTKSVDQLSDRINDLAELNDQVQRQLQAIDTTLTTSA
EAEPDLTKVNQQVTKLDHLTDRMTTALNHVVTAQTTVATEAGHVDQRVHHVNQSLKQTVQPLTTLLASLKNTKTYLHDLA
ASQVGRSFYLPANAATNQAYQNSLFTNISSDLSMTQLTVTLKSAPASAASRRTLQRLQAVTHDSLLATPLAHAKILTTGV
TQQQHYQHTLIATHALRWLTLGLIIGIVVLWFGLRSLTFSLLMTACLTGVTLTSWGWTQLILTRWLQTGPLSSSVLLGSL
MLLTLHWLMITTATGYRQSWLRHLEPAHLQQHFYTSGRFVCPVTMIELTYLLPLLLTTAPTLKGLALMSLIGITISNLIV
PLGFSGWTRWANEPPAIATLWQHFRPSSTNR

Sequences:

>Translated_911_residues
MVRLSQNKVIDVGASRRMRKLLKPKWLFLFFWGIVVFASILILPNITTFVNEQTAMPQDATTSPKYQQQWGHGLTNSQSL
TLVFNNSNGKLSKQQRQQISTTLAKLNRRADDYGINQLRTPTGMTNDRHLLRSNDGSTELALVAVQTSRADLSVIANQLN
NAISIADLNTSVTSTDLIYQQHVQQQRRNLLISMLIGSLLSLIILGLIFRSLLVPLLNLLCQVVTLITTISFITNARLAW
HWPLTANALSLAGLISLILTSLLTWHFMYAYWQSSATTAPTTVSLKILTLQYRQWALVFIPLILITITLHWTAFISLAAA
WAITVALGITLLAVPPLNYAFTAWLGDNLFWPGTTAWPTRPRNLWGQLSKFGYWQPALGSLAVALLLLPGLILANGQFAD
DNLRPWRQNQLSNAELGQQLVQAHFGTGATAPITITLRAPQNLTQQQSLQTIDHLTTKLRAVPNVAQVISVTQPTGQPLS
TFYVNQQLATINIDLAGKLTSMAKLKSQLTTDQQSLEQAATSRHTKSVDQLSDRINDLAELNDQVQRQLQAIDTTLTTSA
EAEPDLTKVNQQVTKLDHLTDRMTTALNHVVTAQTTVATEAGHVDQRVHHVNQSLKQTVQPLTTLLASLKNTKTYLHDLA
ASQVGRSFYLPANAATNQAYQNSLFTNISSDLSMTQLTVTLKSAPASAASRRTLQRLQAVTHDSLLATPLAHAKILTTGV
TQQQHYQHTLIATHALRWLTLGLIIGIVVLWFGLRSLTFSLLMTACLTGVTLTSWGWTQLILTRWLQTGPLSSSVLLGSL
MLLTLHWLMITTATGYRQSWLRHLEPAHLQQHFYTSGRFVCPVTMIELTYLLPLLLTTAPTLKGLALMSLIGITISNLIV
PLGFSGWTRWANEPPAIATLWQHFRPSSTNR
>Mature_911_residues
MVRLSQNKVIDVGASRRMRKLLKPKWLFLFFWGIVVFASILILPNITTFVNEQTAMPQDATTSPKYQQQWGHGLTNSQSL
TLVFNNSNGKLSKQQRQQISTTLAKLNRRADDYGINQLRTPTGMTNDRHLLRSNDGSTELALVAVQTSRADLSVIANQLN
NAISIADLNTSVTSTDLIYQQHVQQQRRNLLISMLIGSLLSLIILGLIFRSLLVPLLNLLCQVVTLITTISFITNARLAW
HWPLTANALSLAGLISLILTSLLTWHFMYAYWQSSATTAPTTVSLKILTLQYRQWALVFIPLILITITLHWTAFISLAAA
WAITVALGITLLAVPPLNYAFTAWLGDNLFWPGTTAWPTRPRNLWGQLSKFGYWQPALGSLAVALLLLPGLILANGQFAD
DNLRPWRQNQLSNAELGQQLVQAHFGTGATAPITITLRAPQNLTQQQSLQTIDHLTTKLRAVPNVAQVISVTQPTGQPLS
TFYVNQQLATINIDLAGKLTSMAKLKSQLTTDQQSLEQAATSRHTKSVDQLSDRINDLAELNDQVQRQLQAIDTTLTTSA
EAEPDLTKVNQQVTKLDHLTDRMTTALNHVVTAQTTVATEAGHVDQRVHHVNQSLKQTVQPLTTLLASLKNTKTYLHDLA
ASQVGRSFYLPANAATNQAYQNSLFTNISSDLSMTQLTVTLKSAPASAASRRTLQRLQAVTHDSLLATPLAHAKILTTGV
TQQQHYQHTLIATHALRWLTLGLIIGIVVLWFGLRSLTFSLLMTACLTGVTLTSWGWTQLILTRWLQTGPLSSSVLLGSL
MLLTLHWLMITTATGYRQSWLRHLEPAHLQQHFYTSGRFVCPVTMIELTYLLPLLLTTAPTLKGLALMSLIGITISNLIV
PLGFSGWTRWANEPPAIATLWQHFRPSSTNR

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100942; Mature: 100942

Theoretical pI: Translated: 10.57; Mature: 10.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVRLSQNKVIDVGASRRMRKLLKPKWLFLFFWGIVVFASILILPNITTFVNEQTAMPQDA
CCEECCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCC
TTSPKYQQQWGHGLTNSQSLTLVFNNSNGKLSKQQRQQISTTLAKLNRRADDYGINQLRT
CCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCC
PTGMTNDRHLLRSNDGSTELALVAVQTSRADLSVIANQLNNAISIADLNTSVTSTDLIYQ
CCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHH
QHVQQQRRNLLISMLIGSLLSLIILGLIFRSLLVPLLNLLCQVVTLITTISFITNARLAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
HWPLTANALSLAGLISLILTSLLTWHFMYAYWQSSATTAPTTVSLKILTLQYRQWALVFI
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHH
PLILITITLHWTAFISLAAAWAITVALGITLLAVPPLNYAFTAWLGDNLFWPGTTAWPTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
PRNLWGQLSKFGYWQPALGSLAVALLLLPGLILANGQFADDNLRPWRQNQLSNAELGQQL
CHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHH
VQAHFGTGATAPITITLRAPQNLTQQQSLQTIDHLTTKLRAVPNVAQVISVTQPTGQPLS
HHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCHH
TFYVNQQLATINIDLAGKLTSMAKLKSQLTTDQQSLEQAATSRHTKSVDQLSDRINDLAE
HHEECCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNDQVQRQLQAIDTTLTTSAEAEPDLTKVNQQVTKLDHLTDRMTTALNHVVTAQTTVATE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AGHVDQRVHHVNQSLKQTVQPLTTLLASLKNTKTYLHDLAASQVGRSFYLPANAATNQAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHH
QNSLFTNISSDLSMTQLTVTLKSAPASAASRRTLQRLQAVTHDSLLATPLAHAKILTTGV
HHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TQQQHYQHTLIATHALRWLTLGLIIGIVVLWFGLRSLTFSLLMTACLTGVTLTSWGWTQL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCHHHH
ILTRWLQTGPLSSSVLLGSLMLLTLHWLMITTATGYRQSWLRHLEPAHLQQHFYTSGRFV
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEE
CPVTMIELTYLLPLLLTTAPTLKGLALMSLIGITISNLIVPLGFSGWTRWANEPPAIATL
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCHHHHH
WQHFRPSSTNR
HHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVRLSQNKVIDVGASRRMRKLLKPKWLFLFFWGIVVFASILILPNITTFVNEQTAMPQDA
CCEECCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCC
TTSPKYQQQWGHGLTNSQSLTLVFNNSNGKLSKQQRQQISTTLAKLNRRADDYGINQLRT
CCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCC
PTGMTNDRHLLRSNDGSTELALVAVQTSRADLSVIANQLNNAISIADLNTSVTSTDLIYQ
CCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHH
QHVQQQRRNLLISMLIGSLLSLIILGLIFRSLLVPLLNLLCQVVTLITTISFITNARLAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
HWPLTANALSLAGLISLILTSLLTWHFMYAYWQSSATTAPTTVSLKILTLQYRQWALVFI
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHH
PLILITITLHWTAFISLAAAWAITVALGITLLAVPPLNYAFTAWLGDNLFWPGTTAWPTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
PRNLWGQLSKFGYWQPALGSLAVALLLLPGLILANGQFADDNLRPWRQNQLSNAELGQQL
CHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHH
VQAHFGTGATAPITITLRAPQNLTQQQSLQTIDHLTTKLRAVPNVAQVISVTQPTGQPLS
HHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCHH
TFYVNQQLATINIDLAGKLTSMAKLKSQLTTDQQSLEQAATSRHTKSVDQLSDRINDLAE
HHEECCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNDQVQRQLQAIDTTLTTSAEAEPDLTKVNQQVTKLDHLTDRMTTALNHVVTAQTTVATE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AGHVDQRVHHVNQSLKQTVQPLTTLLASLKNTKTYLHDLAASQVGRSFYLPANAATNQAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHH
QNSLFTNISSDLSMTQLTVTLKSAPASAASRRTLQRLQAVTHDSLLATPLAHAKILTTGV
HHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TQQQHYQHTLIATHALRWLTLGLIIGIVVLWFGLRSLTFSLLMTACLTGVTLTSWGWTQL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCHHHH
ILTRWLQTGPLSSSVLLGSLMLLTLHWLMITTATGYRQSWLRHLEPAHLQQHFYTSGRFV
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEE
CPVTMIELTYLLPLLLTTAPTLKGLALMSLIGITISNLIVPLGFSGWTRWANEPPAIATL
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCHHHHH
WQHFRPSSTNR
HHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]