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The map label for this gene is 28378343

Identifier: 28378343

GI number: 28378343

Start: 1504712

End: 1506310

Strand: Direct

Name: 28378343

Synonym: lp_1649

Alternate gene names: NA

Gene position: 1504712-1506310 (Clockwise)

Preceding gene: 28378342

Following gene: 28378344

Centisome position: 45.48

GC content: 44.28

Gene sequence:

>1599_bases
ATGATGCATAAAAGTCAGTTGCGTGTTTTGTTGGCCGTTAATCTCAGGTTGTTGAATCCGCAACTAACGGATCGGCTACG
TAAAAAGGGCGCTTCGGGGCCAGCTTTGAGTAAGAAGTTGATGCGGCAATTTTACTTGAATGCCTTGATGTTTCTTGGCA
TTTATGGCTTGACGATGCTGGCCTTTGATTTTAGCAAGTTGCCAGGCATGTTTACGTTCTATGTGGCGTTATTTATCTTA
TTGGGAATTTCACAGAGTATCTCCGGTATTTATAACGTCTTTTTTGCCGGCAATGATCTTGTTGAATACTTACCGTTACC
TTTTCGCAATCAAGAAATTTTTATGAGTAAGATTTTGGTCGTGATATTCAACACGGTACCCTTTACCATTCCGTTACTTT
TAATTTTTATCATGACCGCAACACGGGCCGGAATCTTTGTGGTGTTAGGTGTGCTGATGGCCGTCTTGATGTATGGCCTA
ATACTGAGTGTGTTACTATGCTTGTGCGCCCTAATAGTTTTTGGCTTAACCAAGCTAACTGTGTTTCGCACCCATCAAAA
AATGGTGATGAATGTCATGTTAGGCCTTAATGCTGTCTTAGTGCTAGTCGGGCTCTACTTCATGAATCGCGGCTCATCAT
CTGACACCGGAACGCAGGTTGACCGCGCAGCATTACCCCTATTGATACCGATTTTTAAAGTTTTCACGACGCCGTTGACA
ATGACGAGTTTGCTAACTTGGGCGAGTTTAATTGTCATCTCGCTGATTTTGTTCGCACTGACTGGACGGTTTGTTCTGAC
CCACTTGGCGGAACAGCTTACGCAAGTTAACTCAGTGTTAGTGGCAACACCACCGCGTCGACATTCGCGACAACATAACC
GCAATAAAATTTTGCGTACCTACCAGTTTCAGTTACTGAAAGAACCCAGTTTAGCCTTACAATTATTCACAAATTCAATC
CTGCTGCCATTGATTTTAGTCGGGACCGTTCTCTTTTCGGGGACCGCCCCTAATTTTAGTCGGCTATCGCTGAACTGGCT
CGGTGTCTGGTTTGTCAGTGGGATGGCTGGTGCGATCATCAATGTTAATCAAACCTCATTAGTCGGTAACCTCATTTCAC
TTGATAAAATGAACTTTGACTTTGTGCGTGCACTGCCAATCCCAATGTCCCGTTACTTACGACAAAAGTTTTACTTGGGT
TATTGGTTTCAGGTCATGATCAATGGTGTGATGGTTCTAGTGGTGGGTATCGCCGGGCGAGCACCATTAGCCTTAGATTT
GGCTCTAATATTGGGCGTTGCTTGGGGGACGTACCTAGCTGCCCAACATTACTTTAAGCGTGATTATCAGCTACGGCTGA
CGAATTGGACTAATGTGACCCAATTATTTAATCGGGGCGGCGGTAATCTTGGTTTGATGCTTAACTTGTTGGCCTGCAGT
ATTGTGGGTGTGCTGACAATTGTGATCTATAGTGTGCTGATTAAGCTGTTCGCGGCGGCAGCCATGCTGATTAATATCAT
TGTATTAGTTGGCGTCGGAATTATTTCTGCTGGCTTGGTCTGGCATTACTACAAGACTTTTTGGCAGCAACTTGACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTACTAGCTCAACATCCGCAACAATCACTTGAGGCGATATATTTACAAATGGCCGGGCGGTTGACGGATGATCACCTTGT
CGATGCGCTGGAGGGTGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAGTGTTAATTTCACAATCGCAAAATATTAAATTAAGATAAAAGTATTGACAAATCGCTCATTGAGTTTTAATGTTAAT
GACAACTTAATATTCGTCCA

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Protein; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 532; Mature: 532

Protein sequence:

>532_residues
MMHKSQLRVLLAVNLRLLNPQLTDRLRKKGASGPALSKKLMRQFYLNALMFLGIYGLTMLAFDFSKLPGMFTFYVALFIL
LGISQSISGIYNVFFAGNDLVEYLPLPFRNQEIFMSKILVVIFNTVPFTIPLLLIFIMTATRAGIFVVLGVLMAVLMYGL
ILSVLLCLCALIVFGLTKLTVFRTHQKMVMNVMLGLNAVLVLVGLYFMNRGSSSDTGTQVDRAALPLLIPIFKVFTTPLT
MTSLLTWASLIVISLILFALTGRFVLTHLAEQLTQVNSVLVATPPRRHSRQHNRNKILRTYQFQLLKEPSLALQLFTNSI
LLPLILVGTVLFSGTAPNFSRLSLNWLGVWFVSGMAGAIINVNQTSLVGNLISLDKMNFDFVRALPIPMSRYLRQKFYLG
YWFQVMINGVMVLVVGIAGRAPLALDLALILGVAWGTYLAAQHYFKRDYQLRLTNWTNVTQLFNRGGGNLGLMLNLLACS
IVGVLTIVIYSVLIKLFAAAAMLINIIVLVGVGIISAGLVWHYYKTFWQQLD

Sequences:

>Translated_532_residues
MMHKSQLRVLLAVNLRLLNPQLTDRLRKKGASGPALSKKLMRQFYLNALMFLGIYGLTMLAFDFSKLPGMFTFYVALFIL
LGISQSISGIYNVFFAGNDLVEYLPLPFRNQEIFMSKILVVIFNTVPFTIPLLLIFIMTATRAGIFVVLGVLMAVLMYGL
ILSVLLCLCALIVFGLTKLTVFRTHQKMVMNVMLGLNAVLVLVGLYFMNRGSSSDTGTQVDRAALPLLIPIFKVFTTPLT
MTSLLTWASLIVISLILFALTGRFVLTHLAEQLTQVNSVLVATPPRRHSRQHNRNKILRTYQFQLLKEPSLALQLFTNSI
LLPLILVGTVLFSGTAPNFSRLSLNWLGVWFVSGMAGAIINVNQTSLVGNLISLDKMNFDFVRALPIPMSRYLRQKFYLG
YWFQVMINGVMVLVVGIAGRAPLALDLALILGVAWGTYLAAQHYFKRDYQLRLTNWTNVTQLFNRGGGNLGLMLNLLACS
IVGVLTIVIYSVLIKLFAAAAMLINIIVLVGVGIISAGLVWHYYKTFWQQLD
>Mature_532_residues
MMHKSQLRVLLAVNLRLLNPQLTDRLRKKGASGPALSKKLMRQFYLNALMFLGIYGLTMLAFDFSKLPGMFTFYVALFIL
LGISQSISGIYNVFFAGNDLVEYLPLPFRNQEIFMSKILVVIFNTVPFTIPLLLIFIMTATRAGIFVVLGVLMAVLMYGL
ILSVLLCLCALIVFGLTKLTVFRTHQKMVMNVMLGLNAVLVLVGLYFMNRGSSSDTGTQVDRAALPLLIPIFKVFTTPLT
MTSLLTWASLIVISLILFALTGRFVLTHLAEQLTQVNSVLVATPPRRHSRQHNRNKILRTYQFQLLKEPSLALQLFTNSI
LLPLILVGTVLFSGTAPNFSRLSLNWLGVWFVSGMAGAIINVNQTSLVGNLISLDKMNFDFVRALPIPMSRYLRQKFYLG
YWFQVMINGVMVLVVGIAGRAPLALDLALILGVAWGTYLAAQHYFKRDYQLRLTNWTNVTQLFNRGGGNLGLMLNLLACS
IVGVLTIVIYSVLIKLFAAAAMLINIIVLVGVGIISAGLVWHYYKTFWQQLD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59382; Mature: 59382

Theoretical pI: Translated: 10.79; Mature: 10.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA