| Definition | Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004567 |
| Length | 3,308,274 |
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The map label for this gene is 28378156
Identifier: 28378156
GI number: 28378156
Start: 1310325
End: 1312361
Strand: Direct
Name: 28378156
Synonym: lp_1431
Alternate gene names: NA
Gene position: 1310325-1312361 (Clockwise)
Preceding gene: 28378155
Following gene: 28378157
Centisome position: 39.61
GC content: 52.38
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678
Protein sequence:
>678_residues MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE
Sequences:
>Translated_678_residues MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE >Mature_678_residues MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75876; Mature: 75876
Theoretical pI: Translated: 11.87; Mature: 11.87
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQLSSRQYRWLLIGLVGLIAIVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFM HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE IYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDTGLISGLYLLNRWRYWQPGAV EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH SFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEECCCHHHHH GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TRQADAALPATSWIAMSLNPQSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGV CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQRQLQFWLVLMTQTIYLTMLV HHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHCCCCC VTTPLAVSGKSNVLRLKPVATHGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLR CCCCEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEECCCCEE LAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIKQQFIKPHALTTGAASLAVVG EEEECCCCCCHHHCEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH CVALATILALGRLRPETE HHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQLSSRQYRWLLIGLVGLIAIVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFM HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE IYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDTGLISGLYLLNRWRYWQPGAV EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH SFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEECCCHHHHH GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TRQADAALPATSWIAMSLNPQSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGV CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQRQLQFWLVLMTQTIYLTMLV HHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHCCCCC VTTPLAVSGKSNVLRLKPVATHGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLR CCCCEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEECCCCEE LAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIKQQFIKPHALTTGAASLAVVG EEEECCCCCCHHHCEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH CVALATILALGRLRPETE HHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA