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The map label for this gene is yttB [H]

Identifier: 28376987

GI number: 28376987

Start: 15393

End: 16616

Strand: Direct

Name: yttB [H]

Synonym: lp_0015

Alternate gene names: 28376987

Gene position: 15393-16616 (Clockwise)

Preceding gene: 28376986

Following gene: 28376988

Centisome position: 0.47

GC content: 44.04

Gene sequence:

>1224_bases
GTGGCACAAAAGCAACTCATTAAAACGCCGTGGCTAATTGCCGGGCAGTTTATGAATAACATTGGTATGAGTTTCATTTG
GCCGTTAACGACGATCTACATGCACAATGTGTTAGGTAAGTCGTTGACGGAGACTGGAATTGTCCTGATGCTCAATTCAG
TTGCCAACGTTTTGGCAAGTACGATTGGTGGGCGTATATTTGATCGAGGTAATCCTTATCACCTGTTACTGATGGGAATC
ACGTTGAATGGCCTCGCGAACTTTGCTCTGATCTTTTTTCATGGATGGCCGTGGTATCCGATGTTGTTAGTCGTGACCGG
GTTTGCTAGTGGCTGGCTAAATACGATGTTTAATGCTTTGGCTGCCAGTGTCCCCCGCGATAAAGTGCGGCGAACGTTTA
CGTTGATGTATCTCGCTGCCAATCTCGGAGTTGTCTTCGGCACGATGCTGGTTGGTATCGTGTATAGCATGGGGATGGCC
TTGCTATTCTCGATGACCACGAGCCTCTTCGTGATTTTCTTGATTATTGCATTATTTGAATACAATGTGGATTCGTCGAA
CGTGACCGGGGTTGATCCGCGCCAAGGACAAGATGTGCACTTGCCACGGGCCAATTTTCACATTGTCTGGACCTTCTTTA
TTAGTTTATTTATTATCTGGTTGCTATACGAACAGTGGGTCAGCAATTTATCCGTCTACATGACGAATTTGGGGATGCCG
CTGCGGAATTACAGTTTTCTATGGACAATCAACGCGGGCTTACTGGTCCTTATTCAGAGTATTTTAAGTTTGCTGGGGAA
TCGGATTAAAAATTTATATAATCAATTTTTCTTCGGCATGCTATTCGTGGGCTTATCATTTCTATCACTTGTGATTGCGC
ATGATTACCCACACTTTATCTTTGCCATGATTTTATTGACGATTGGTGAAGCAACTTGGTCACCAGCCATGCCAACACTA
GTGAGTCAGTTATCACCAGTTAGTGCTAAGGGGCGTTACCAAGGACTAGTACAAGCCTTTTGTGCGTTAGGGCGCTCGCT
AGGGCCGTTATTTGGTGGTGTGATTATCGATAATTGGTCTTATAAGGTGCTGTTTTTGTTGGCATTTGTGGTTTTATTGA
TCGTGTTGGCAGTTAATATCGGTGTCGTTCACTTTAATTTACGCAAGGCCGTTAATTATATGAAGACGGACGTTCAGACC
GATGTTTCACGTGAAACAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCCGTGATAATAATGAGTTAGTGAGATAAATGTCCCTGTTATTTTAAATAAACTTTGCTATGATGAAAAGTAGACAGAT
TTAATAATGGTGGTGATGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAGAGAAGTTGGTGGCAGTAGTGAAAGTGATACGAAAACTAAAGGCTAAACGAGTCGTGATTAAAGTCGGGACAAGCAC
GCTAGTTTATCCAGATGGAT

Product: transport protein

Products: Proton [Cytoplasm]; drug [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 407; Mature: 406

Protein sequence:

>407_residues
MAQKQLIKTPWLIAGQFMNNIGMSFIWPLTTIYMHNVLGKSLTETGIVLMLNSVANVLASTIGGRIFDRGNPYHLLLMGI
TLNGLANFALIFFHGWPWYPMLLVVTGFASGWLNTMFNALAASVPRDKVRRTFTLMYLAANLGVVFGTMLVGIVYSMGMA
LLFSMTTSLFVIFLIIALFEYNVDSSNVTGVDPRQGQDVHLPRANFHIVWTFFISLFIIWLLYEQWVSNLSVYMTNLGMP
LRNYSFLWTINAGLLVLIQSILSLLGNRIKNLYNQFFFGMLFVGLSFLSLVIAHDYPHFIFAMILLTIGEATWSPAMPTL
VSQLSPVSAKGRYQGLVQAFCALGRSLGPLFGGVIIDNWSYKVLFLLAFVVLLIVLAVNIGVVHFNLRKAVNYMKTDVQT
DVSRETK

Sequences:

>Translated_407_residues
MAQKQLIKTPWLIAGQFMNNIGMSFIWPLTTIYMHNVLGKSLTETGIVLMLNSVANVLASTIGGRIFDRGNPYHLLLMGI
TLNGLANFALIFFHGWPWYPMLLVVTGFASGWLNTMFNALAASVPRDKVRRTFTLMYLAANLGVVFGTMLVGIVYSMGMA
LLFSMTTSLFVIFLIIALFEYNVDSSNVTGVDPRQGQDVHLPRANFHIVWTFFISLFIIWLLYEQWVSNLSVYMTNLGMP
LRNYSFLWTINAGLLVLIQSILSLLGNRIKNLYNQFFFGMLFVGLSFLSLVIAHDYPHFIFAMILLTIGEATWSPAMPTL
VSQLSPVSAKGRYQGLVQAFCALGRSLGPLFGGVIIDNWSYKVLFLLAFVVLLIVLAVNIGVVHFNLRKAVNYMKTDVQT
DVSRETK
>Mature_406_residues
AQKQLIKTPWLIAGQFMNNIGMSFIWPLTTIYMHNVLGKSLTETGIVLMLNSVANVLASTIGGRIFDRGNPYHLLLMGIT
LNGLANFALIFFHGWPWYPMLLVVTGFASGWLNTMFNALAASVPRDKVRRTFTLMYLAANLGVVFGTMLVGIVYSMGMAL
LFSMTTSLFVIFLIIALFEYNVDSSNVTGVDPRQGQDVHLPRANFHIVWTFFISLFIIWLLYEQWVSNLSVYMTNLGMPL
RNYSFLWTINAGLLVLIQSILSLLGNRIKNLYNQFFFGMLFVGLSFLSLVIAHDYPHFIFAMILLTIGEATWSPAMPTLV
SQLSPVSAKGRYQGLVQAFCALGRSLGPLFGGVIIDNWSYKVLFLLAFVVLLIVLAVNIGVVHFNLRKAVNYMKTDVQTD
VSRETK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45623; Mature: 45492

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AQKQLIKTPWLIAGQFMNNIGMSFIWPLTTIYMHNVLGKSLTETGIVLMLNSVANVLAS
CCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIGGRIFDRGNPYHLLLMGITLNGLANFALIFFHGWPWYPMLLVVTGFASGWLNTMFNAL
HHCCCEECCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AASVPRDKVRRTFTLMYLAANLGVVFGTMLVGIVYSMGMALLFSMTTSLFVIFLIIALFE
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNVDSSNVTGVDPRQGQDVHLPRANFHIVWTFFISLFIIWLLYEQWVSNLSVYMTNLGMP
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LRNYSFLWTINAGLLVLIQSILSLLGNRIKNLYNQFFFGMLFVGLSFLSLVIAHDYPHFI
CCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
FAMILLTIGEATWSPAMPTLVSQLSPVSAKGRYQGLVQAFCALGRSLGPLFGGVIIDNWS
HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC
YKVLFLLAFVVLLIVLAVNIGVVHFNLRKAVNYMKTDVQTDVSRETK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; drug [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + drug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + drug [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377 [H]