Definition Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome.
Accession NC_004557
Length 2,799,251

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The map label for this gene is 28212034

Identifier: 28212034

GI number: 28212034

Start: 2589120

End: 2590199

Strand: Direct

Name: 28212034

Synonym: CTC02449

Alternate gene names: NA

Gene position: 2589120-2590199 (Clockwise)

Preceding gene: 28212030

Following gene: 28212036

Centisome position: 92.49

GC content: 22.04

Gene sequence:

>1080_bases
TTGGATAATATTAATGCTAAACATTTATTTTTTATAATATCAGCTATTACAATAGTTTCTTTAAAAACTTATCCAACAAT
ATTTATAAGAAATGCCGGAAGAGATAGTTGGATAGTTGTAATTATAGCTTCATTAATAATTCTTTTTTCCTTTATTTTTA
TGCTAAAAACAAGTTTAAAGACAAATACCTTTGATTTTTATAATATATATACAAGTTCTTTTGGTAAGATTTTAGGTACT
ATCTTACACTTTTTCTTTGTTTTTTCTTTGTTTTTAACTTTAATAGAATGTGCAGGAATAGAGAGTAGTTCTATGCATGC
TAATATATTATTAGACACACCAACTTGGTATATTGCAATATTTATAGTATTCACAGCTATTTACCCAGTAAAAAAAGGCC
ATCTTTCAGTATTAGCTGTCACTATAATCGGTATAATTTTAATGATTTTAGCTGGTATTAACTTAGCAATACTAACTTCT
TCTTATAAAAAATATAAATATTTATTTCCTATATTAGAAAATGGACTAAATAAAAATCATTTTTTAGCTCTCTTAAAAGT
CCTAGGATTATATGCACATATAGTGATTTTTTTCCCTTACTTAGAGCTCGTACATAATAAAAATAAAATATTTAAGGTAA
GTATTTGGTCTTTTATTTTTGTTATACAAATGCAGATAATTGCTATAGTTGGTATATTATCTACTTTTGAAATAAATCAT
GCTAAAAATTTAATATATCCAAAACTCTTACAAACTCAATTAATAAGTTATTGGAGATTTATAGAAAGTGGTGAATTTTT
CGTAATGCTTCAAACTGTAGGTGGGTGGTATGTAAAATATGTTCTAGTATTAAATATATTAAATAAAAGTTTTGAAAAAA
TATTTACAGGAAATAAATATTTAATTTATATAGTAAGTATATTAACATATATATTTACTTCATTTTTAACGCAAAAGCTT
TTAAGATTTTTTGACTTTCTTAACTTTTATTCACTAATATCTTTTATAAATTTTTTATTAATACCTTTTATAGCTTTTAT
AATTTTATATTTTAAAAATAATAAATCTATTTCATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTGCTTATAATTAGAATATTATTCAACTTTTAAGTCAAGAATATATTATTAATTAACAGTTTTAATAAAATATTCC
ATGATATAAAGGGTGATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTTGCTATTTTTTATTGTTGTAATTTTTATTTTTTGTGTTAAAATATATGATATAATATATTTTTAGAAATAGGTTAA
TTTTATTTAGTATTAGATAA

Product: spore germination protein B2/KB

Products: NA

Alternate protein names: Spore Germination /KB

Number of amino acids: Translated: 359; Mature: 359

Protein sequence:

>359_residues
MDNINAKHLFFIISAITIVSLKTYPTIFIRNAGRDSWIVVIIASLIILFSFIFMLKTSLKTNTFDFYNIYTSSFGKILGT
ILHFFFVFSLFLTLIECAGIESSSMHANILLDTPTWYIAIFIVFTAIYPVKKGHLSVLAVTIIGIILMILAGINLAILTS
SYKKYKYLFPILENGLNKNHFLALLKVLGLYAHIVIFFPYLELVHNKNKIFKVSIWSFIFVIQMQIIAIVGILSTFEINH
AKNLIYPKLLQTQLISYWRFIESGEFFVMLQTVGGWYVKYVLVLNILNKSFEKIFTGNKYLIYIVSILTYIFTSFLTQKL
LRFFDFLNFYSLISFINFLLIPFIAFIILYFKNNKSISS

Sequences:

>Translated_359_residues
MDNINAKHLFFIISAITIVSLKTYPTIFIRNAGRDSWIVVIIASLIILFSFIFMLKTSLKTNTFDFYNIYTSSFGKILGT
ILHFFFVFSLFLTLIECAGIESSSMHANILLDTPTWYIAIFIVFTAIYPVKKGHLSVLAVTIIGIILMILAGINLAILTS
SYKKYKYLFPILENGLNKNHFLALLKVLGLYAHIVIFFPYLELVHNKNKIFKVSIWSFIFVIQMQIIAIVGILSTFEINH
AKNLIYPKLLQTQLISYWRFIESGEFFVMLQTVGGWYVKYVLVLNILNKSFEKIFTGNKYLIYIVSILTYIFTSFLTQKL
LRFFDFLNFYSLISFINFLLIPFIAFIILYFKNNKSISS
>Mature_359_residues
MDNINAKHLFFIISAITIVSLKTYPTIFIRNAGRDSWIVVIIASLIILFSFIFMLKTSLKTNTFDFYNIYTSSFGKILGT
ILHFFFVFSLFLTLIECAGIESSSMHANILLDTPTWYIAIFIVFTAIYPVKKGHLSVLAVTIIGIILMILAGINLAILTS
SYKKYKYLFPILENGLNKNHFLALLKVLGLYAHIVIFFPYLELVHNKNKIFKVSIWSFIFVIQMQIIAIVGILSTFEINH
AKNLIYPKLLQTQLISYWRFIESGEFFVMLQTVGGWYVKYVLVLNILNKSFEKIFTGNKYLIYIVSILTYIFTSFLTQKL
LRFFDFLNFYSLISFINFLLIPFIAFIILYFKNNKSISS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41554; Mature: 41554

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNINAKHLFFIISAITIVSLKTYPTIFIRNAGRDSWIVVIIASLIILFSFIFMLKTSLK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TNTFDFYNIYTSSFGKILGTILHFFFVFSLFLTLIECAGIESSSMHANILLDTPTWYIAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHH
FIVFTAIYPVKKGHLSVLAVTIIGIILMILAGINLAILTSSYKKYKYLFPILENGLNKNH
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FLALLKVLGLYAHIVIFFPYLELVHNKNKIFKVSIWSFIFVIQMQIIAIVGILSTFEINH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKNLIYPKLLQTQLISYWRFIESGEFFVMLQTVGGWYVKYVLVLNILNKSFEKIFTGNKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LIYIVSILTYIFTSFLTQKLLRFFDFLNFYSLISFINFLLIPFIAFIILYFKNNKSISS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNINAKHLFFIISAITIVSLKTYPTIFIRNAGRDSWIVVIIASLIILFSFIFMLKTSLK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TNTFDFYNIYTSSFGKILGTILHFFFVFSLFLTLIECAGIESSSMHANILLDTPTWYIAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHH
FIVFTAIYPVKKGHLSVLAVTIIGIILMILAGINLAILTSSYKKYKYLFPILENGLNKNH
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FLALLKVLGLYAHIVIFFPYLELVHNKNKIFKVSIWSFIFVIQMQIIAIVGILSTFEINH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKNLIYPKLLQTQLISYWRFIESGEFFVMLQTVGGWYVKYVLVLNILNKSFEKIFTGNKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LIYIVSILTYIFTSFLTQKLLRFFDFLNFYSLISFINFLLIPFIAFIILYFKNNKSISS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA