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The map label for this gene is yjbG [H]

Identifier: 28211583

GI number: 28211583

Start: 2080627

End: 2082507

Strand: Direct

Name: yjbG [H]

Synonym: CTC01957

Alternate gene names: 28211583

Gene position: 2080627-2082507 (Clockwise)

Preceding gene: 28211581

Following gene: 28211593

Centisome position: 74.33

GC content: 25.89

Gene sequence:

>1881_bases
TTGTCAACGTTTTTTGTTATAATTTATAGGAAATATACAAATAATTTAAATGCTCACTATTTTTATGGAGGTTTTTATAT
GGAAAATACTAAAACTTTAAAATCTAGAGATGAAATAGATGAAAAAAGCAAGTGGAATATTAATAAATTATATGAAGATA
TAGATGCTTGGGAGTCTGACTTTCAACATTTAAAAGAAATTACTCCTAAACTTTCTAATTTTCAAGGTAAACTCAAAGAT
CCTAAACTTTTGTTGGAATATTTTAAAACAGAAGAGTCTATATTAAGACTTGCAGAAAAATTATCTGTTTATGCTCACTG
TAGGTCTGATGAAGATACTACTAATACAACTTTCCAAGGATTAAAATCAAAAATTGATAGCTTTTTCCCAGAAATTCTTG
GATTGAGTTCATTTTTTATACCTGAGATATTATCTATAAATAAAAAAGATTTACTAAATGGACTTAATGAAATACCAGAA
TTAAAAACTTATAAATTTTTATTAGAAAATATTTTAAATTTAAAGCCTCATATATTAAGTAAAGAAGAAGAAATGATATT
AGCTTCTGTAAGTGATTGTTTAAATGCTCCTAGTGATATTTACAATATGCTATCTAATGCTGATATAAGTTTTCCTAAAA
TTAAAAATGAACAAGGAGAGGAAGTAGAACTTACAGATAAAAATTATTCTGTTTTTATATCATCTAAAGATAGAAGGGTT
AGAAAGGATGCCTTTGAAGCTTTATTTGATACCTATGAAAAGTACAAAAATACATTTTCAACAGCTCTAACTTCTTCTAT
AAAAAATTTTATATTTAATTCTAAAATGCGTAAGTTTAATTCTTCTTTAGAAAGTTCTCTAAAGCCTAATAATATTCCCT
TAGAAGTTTATGATACAACCATAAAAACTATAAATGATAACTTATCTTCTCTTCATAGATATGTAAAAATAAAAAAGAAA
TTATTAGGACTAGAAGAAATGCATATGTATGATCTTTATGTGCCTTTAATAAAAACACCTGATATACACATACCCTTTGA
AGAAGGAATTAATATGGTGGAAAAGGGATTAAAACCCTTAGGTGAAGAATATTTAAATGTATTTAAAAAAGGTATTAATG
ACGGATGGATTGATATATATGAAAATAAAGGTAAAAGAGGTGGAGCATATTCATCTGGTTCTTATGATACCATGCCCTAT
GTTCTATTAAATTATAATTATAAATTAAATGATGTATCAACTTTAGCTCATGAAATGGGTCATTCCATTCATAGTTATTA
TTCAAAAGAAAATCAACCTTATATATACTCTAACTACACCATATTTTGTGCTGAAGTGGCTTCAACTACAAATGAATGTC
TTTTATCAAACTATATGATAGAAAATGAAAGCGACAAAAATATGAAATTGTATTTTATAAATCAACAATTAGAACAAATA
AGAACTACTGTATTTAGACAGGTTATGTTCGCTGAGTTTGAAAGAATAACCCATAAAAAATTAGAAGAAGGAATTCCTTT
AACTAGTTATGATTTATGTAGCATATGGCATGATTTAAATTTAAAATATTTTGGAGAAGATATTATAATAGATACCCAAA
TAGATATAGAATGGTCACGTATTCCTCACTTTTATTCTCCTTTTTATGTTTATCAATATGCTACAGGTTATGCCGCTGCA
AACTCCTTTGCTACTAAAATTTTAAAAGGTGAAGAGGGTGCTTTAGATAAATATATAGGTTTTTTAAAAAGTGGTGATAA
TGACTATCCTATTAATATATTAAAAAAAGCATGTATAGACATGACTACTTCAAAACCTATGGAGGATATTGTAAAAAGAT
TTAATGATTTATTAGACATGTTAGAAAACAACTATTACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTTTTTTCACTATTCATGTTCGTCCCCCTTCTTTATCGATATATGTTCATATGTTCATATGTCATTATATTGTTAT
TCTAATCCTTATTTTTTGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAAAGAGATAAAATCTGTTTAATTAGACTTTATCTCTTTTTTTTATGCATTTTTAATTATTTTAATTGCTTCCTCT
AAAGACATACTTTCTTGATT

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 625

Protein sequence:

>626_residues
MSTFFVIIYRKYTNNLNAHYFYGGFYMENTKTLKSRDEIDEKSKWNINKLYEDIDAWESDFQHLKEITPKLSNFQGKLKD
PKLLLEYFKTEESILRLAEKLSVYAHCRSDEDTTNTTFQGLKSKIDSFFPEILGLSSFFIPEILSINKKDLLNGLNEIPE
LKTYKFLLENILNLKPHILSKEEEMILASVSDCLNAPSDIYNMLSNADISFPKIKNEQGEEVELTDKNYSVFISSKDRRV
RKDAFEALFDTYEKYKNTFSTALTSSIKNFIFNSKMRKFNSSLESSLKPNNIPLEVYDTTIKTINDNLSSLHRYVKIKKK
LLGLEEMHMYDLYVPLIKTPDIHIPFEEGINMVEKGLKPLGEEYLNVFKKGINDGWIDIYENKGKRGGAYSSGSYDTMPY
VLLNYNYKLNDVSTLAHEMGHSIHSYYSKENQPYIYSNYTIFCAEVASTTNECLLSNYMIENESDKNMKLYFINQQLEQI
RTTVFRQVMFAEFERITHKKLEEGIPLTSYDLCSIWHDLNLKYFGEDIIIDTQIDIEWSRIPHFYSPFYVYQYATGYAAA
NSFATKILKGEEGALDKYIGFLKSGDNDYPINILKKACIDMTTSKPMEDIVKRFNDLLDMLENNYY

Sequences:

>Translated_626_residues
MSTFFVIIYRKYTNNLNAHYFYGGFYMENTKTLKSRDEIDEKSKWNINKLYEDIDAWESDFQHLKEITPKLSNFQGKLKD
PKLLLEYFKTEESILRLAEKLSVYAHCRSDEDTTNTTFQGLKSKIDSFFPEILGLSSFFIPEILSINKKDLLNGLNEIPE
LKTYKFLLENILNLKPHILSKEEEMILASVSDCLNAPSDIYNMLSNADISFPKIKNEQGEEVELTDKNYSVFISSKDRRV
RKDAFEALFDTYEKYKNTFSTALTSSIKNFIFNSKMRKFNSSLESSLKPNNIPLEVYDTTIKTINDNLSSLHRYVKIKKK
LLGLEEMHMYDLYVPLIKTPDIHIPFEEGINMVEKGLKPLGEEYLNVFKKGINDGWIDIYENKGKRGGAYSSGSYDTMPY
VLLNYNYKLNDVSTLAHEMGHSIHSYYSKENQPYIYSNYTIFCAEVASTTNECLLSNYMIENESDKNMKLYFINQQLEQI
RTTVFRQVMFAEFERITHKKLEEGIPLTSYDLCSIWHDLNLKYFGEDIIIDTQIDIEWSRIPHFYSPFYVYQYATGYAAA
NSFATKILKGEEGALDKYIGFLKSGDNDYPINILKKACIDMTTSKPMEDIVKRFNDLLDMLENNYY
>Mature_625_residues
STFFVIIYRKYTNNLNAHYFYGGFYMENTKTLKSRDEIDEKSKWNINKLYEDIDAWESDFQHLKEITPKLSNFQGKLKDP
KLLLEYFKTEESILRLAEKLSVYAHCRSDEDTTNTTFQGLKSKIDSFFPEILGLSSFFIPEILSINKKDLLNGLNEIPEL
KTYKFLLENILNLKPHILSKEEEMILASVSDCLNAPSDIYNMLSNADISFPKIKNEQGEEVELTDKNYSVFISSKDRRVR
KDAFEALFDTYEKYKNTFSTALTSSIKNFIFNSKMRKFNSSLESSLKPNNIPLEVYDTTIKTINDNLSSLHRYVKIKKKL
LGLEEMHMYDLYVPLIKTPDIHIPFEEGINMVEKGLKPLGEEYLNVFKKGINDGWIDIYENKGKRGGAYSSGSYDTMPYV
LLNYNYKLNDVSTLAHEMGHSIHSYYSKENQPYIYSNYTIFCAEVASTTNECLLSNYMIENESDKNMKLYFINQQLEQIR
TTVFRQVMFAEFERITHKKLEEGIPLTSYDLCSIWHDLNLKYFGEDIIIDTQIDIEWSRIPHFYSPFYVYQYATGYAAAN
SFATKILKGEEGALDKYIGFLKSGDNDYPINILKKACIDMTTSKPMEDIVKRFNDLLDMLENNYY

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73031; Mature: 72900

Theoretical pI: Translated: 5.37; Mature: 5.37

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTFFVIIYRKYTNNLNAHYFYGGFYMENTKTLKSRDEIDEKSKWNINKLYEDIDAWESD
CCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FQHLKEITPKLSNFQGKLKDPKLLLEYFKTEESILRLAEKLSVYAHCRSDEDTTNTTFQG
HHHHHHHCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LKSKIDSFFPEILGLSSFFIPEILSINKKDLLNGLNEIPELKTYKFLLENILNLKPHILS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
KEEEMILASVSDCLNAPSDIYNMLSNADISFPKIKNEQGEEVELTDKNYSVFISSKDRRV
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCHHH
RKDAFEALFDTYEKYKNTFSTALTSSIKNFIFNSKMRKFNSSLESSLKPNNIPLEVYDTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH
IKTINDNLSSLHRYVKIKKKLLGLEEMHMYDLYVPLIKTPDIHIPFEEGINMVEKGLKPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GEEYLNVFKKGINDGWIDIYENKGKRGGAYSSGSYDTMPYVLLNYNYKLNDVSTLAHEMG
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
HSIHSYYSKENQPYIYSNYTIFCAEVASTTNECLLSNYMIENESDKNMKLYFINQQLEQI
HHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHH
RTTVFRQVMFAEFERITHKKLEEGIPLTSYDLCSIWHDLNLKYFGEDIIIDTQIDIEWSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCEEEEEEEEEEEHHH
IPHFYSPFYVYQYATGYAAANSFATKILKGEEGALDKYIGFLKSGDNDYPINILKKACID
CCCCCCCEEHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
MTTSKPMEDIVKRFNDLLDMLENNYY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
STFFVIIYRKYTNNLNAHYFYGGFYMENTKTLKSRDEIDEKSKWNINKLYEDIDAWESD
CEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FQHLKEITPKLSNFQGKLKDPKLLLEYFKTEESILRLAEKLSVYAHCRSDEDTTNTTFQG
HHHHHHHCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LKSKIDSFFPEILGLSSFFIPEILSINKKDLLNGLNEIPELKTYKFLLENILNLKPHILS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
KEEEMILASVSDCLNAPSDIYNMLSNADISFPKIKNEQGEEVELTDKNYSVFISSKDRRV
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCHHH
RKDAFEALFDTYEKYKNTFSTALTSSIKNFIFNSKMRKFNSSLESSLKPNNIPLEVYDTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH
IKTINDNLSSLHRYVKIKKKLLGLEEMHMYDLYVPLIKTPDIHIPFEEGINMVEKGLKPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GEEYLNVFKKGINDGWIDIYENKGKRGGAYSSGSYDTMPYVLLNYNYKLNDVSTLAHEMG
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
HSIHSYYSKENQPYIYSNYTIFCAEVASTTNECLLSNYMIENESDKNMKLYFINQQLEQI
HHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHH
RTTVFRQVMFAEFERITHKKLEEGIPLTSYDLCSIWHDLNLKYFGEDIIIDTQIDIEWSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCEEEEEEEEEEEHHH
IPHFYSPFYVYQYATGYAAANSFATKILKGEEGALDKYIGFLKSGDNDYPINILKKACID
CCCCCCCEEHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
MTTSKPMEDIVKRFNDLLDMLENNYY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]