| Definition | Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004557 |
| Length | 2,799,251 |
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The map label for this gene is 28210007
Identifier: 28210007
GI number: 28210007
Start: 208774
End: 210420
Strand: Direct
Name: 28210007
Synonym: CTC00241
Alternate gene names: NA
Gene position: 208774-210420 (Clockwise)
Preceding gene: 28210006
Following gene: 28210008
Centisome position: 7.46
GC content: 24.53
Gene sequence:
>1647_bases ATGAGTAGATTTATATCTCTTACAAAGGTTTTTATTAAGACTAATTTAGGAGAGGATAAAAAGAAGGCTATTACGTTGGT AATATTATTAGCCATAGGATTTGCGCCTCTTTTAAAAAGTTTTGCCATGGCAACCTCCGCTGCTTATGATATATTAAAAG AAATAAATGAAGAAAGTATACTTTTATATACAGGTTTATCAGCTACTTCTTTGGCTATATTCATATTTGCTATATTTCAT GTAATGAATACATTTTATTTTTCTATGGATATAGAAAGTTTACTACCACTTCCACTGCGTTCATATGAAATAATGGGGAG TAAATTAATACTTATAGTGATATATGAATATGTAACAGAAATAATATTTTTATTACCTATATTGATACAATATGGTATAA AAATTAATGCAGGAGTCAGTTATTATATTTATGGAGCTATAATATTTTTGGTAAATCCAATTGTTCCAACAATTCTATGT ACTATATTAATAATGATAATCATGAGATTTTCTAATTTAGGAAAAAACAAAGATAGATTTAAGATGATTAGTGGAGTTAT TGCATTAGGTATAGGTATAGGAATTAATCTACTTATACAAGGTACTTTTTCTAAAGATCAAAGTAAAGATCAGATTCAAA ATATAATAATGGGAATTAAGAATAAATACGTAGGAGTTTTATCCAAAATTTTTACTACTACTAAATCAGGAGTATATAGT TTAGTAGAACATAATAATATCAAAGGATTTATTAATATTTGTTTATTTTTAATAATAACTTTATTATTTTTAGTAATATT TATATATATAGCAGAAAAACTTTATTTAAAAGGAGTTGTAGGAATATCAGAAACTACATCCACAAGAAAGGTGATAGAAG ATAATAAATTACATAAGTATACCACAAAAAGAGATGTTGTTATATCTTATGTTTTAAAAGAAATAAAAGTACTTTTAAGA ACACCTATATATTTTATAAATTGTATATTGATGAATTTTTTATGGCCAATATTTTTTATATTACCTATAGCTATGCAGAA AGATATAAATGAAATAACACAATATGCAAATGCAATGTTGCAAGATAGTAATGGGATGAAGACTGTAGTTATTATAGCTT TTTCAGTTATATTATTTATAACTGCCACAAATGGTATAGCTGCATCTTCAATATCACGGGAAGGACAAAATCTATATTTC AATAAATTTATACCACTAGATATAAAGAAGCTGTTTATATCTAAGATATTAACAGCGGTTATAATAGAAGTTGTAAGTAC ATTCCTTATTCTACTATTAGTAAATTTAATAATTAAAGTTCCTTTAATTGTTGCTATGAGTATAGTTATTATAGCCATAC CAGCTATGTTTTTTTCATCATTAATGGGCTTGATTATAGATTTATATTATCCTAAGTTAAATTGGGATAATGAACAAAAA GCAGTAAAGCAAAATCTTAATATAGTAGGTAATATGGTGTTAAATATAATAATAGCAGTAATAACAGCTATTACATTTAT AGATCTAAATTTAAATTTAACCATCACCGTTTTACTTATTATGGCAATATATACTTTAATAGATATTTTCATGTATAATT TCTTGAAAAATAAAGGAGTATCTATGTTTAATGATATCGAAGTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AACAATGGTAAAGTATTATTATGTGGAAAGCTTAATGAAATAAAGGAAAAGTTTAAGGAAGATGAATCTTTAGAAAAAAT ATTCCTAGAGGTAACTGAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAAATTTGTGAAATATTTGTTTGGAGTGAAGTTTTGTGTTAGGGTGGAAAGAACTACATAATAATTGTTTGGCTTGTA ACAAGTGTGATTTATCTAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 548; Mature: 547
Protein sequence:
>548_residues MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFH VMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILC TILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLR TPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYF NKFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV
Sequences:
>Translated_548_residues MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFH VMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILC TILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLR TPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYF NKFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV >Mature_547_residues SRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFHV MNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCT ILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYSL VEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLRT PIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFN KFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQKA VKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61754; Mature: 61623
Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESI CCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE LLYTGLSATSLAIFIFAIFHVMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTE EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH IIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCTILIMIIMRFSNLGKNKDRF HHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH KMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKY HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH TTKRDVVISYVLKEIKVLLRTPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAML CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFNKFIPLDIKKLFISKILTAV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SMFNDIEV CCCCCCCC >Mature Secondary Structure SRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESI CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE LLYTGLSATSLAIFIFAIFHVMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTE EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH IIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCTILIMIIMRFSNLGKNKDRF HHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH KMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKY HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH TTKRDVVISYVLKEIKVLLRTPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAML CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFNKFIPLDIKKLFISKILTAV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SMFNDIEV CCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA