| Definition | Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012785 |
| Length | 2,302,126 |
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The map label for this gene is fbpB [H]
Identifier: 239618346
GI number: 239618346
Start: 2104765
End: 2106960
Strand: Reverse
Name: fbpB [H]
Synonym: Kole_1984
Alternate gene names: 239618346
Gene position: 2106960-2104765 (Counterclockwise)
Preceding gene: 239618347
Following gene: 239618345
Centisome position: 91.52
GC content: 42.58
Gene sequence:
>2196_bases ATGAAGGCCAAAATTCTAAAACTGATAGTCACAGTTGGGCTTTTTGCGGTTTTGATTTTTTGGGTATTCAATAGCATAGA AAGAGAGTTTGTTGATGCAGCAAAGGAAAGAATTCTAGAAATATCCAACCTCATTTCCTCTTCGATTCCAGAAGACGATA TACAGAGTTGGCTGGAAGAAATAGACGCTAATTATCCCGATATACAAGCGATTTATATTAAAGGGCTTGAAGAATATGGT GAAATACCCGAATATTTTTACCAGAATCCTGAAAGCGCTGATTTGTTCGCAAAATTGAAAACGATGGATTTTTTTGATTA TGGCATAGAAAGTACCGTTTACGAGGAAATTTATTTCCATGAAAACATACTTAAACTCGGTAACAATCAGTATTTTGTTA CTTTTGTTCCGGTTCTCGAGCCGGAATATGGCATGGTGACAGGTTCGTTGGTTCTGTTACACAACGCTTCGAAAATCCTT GGCACAATACGAACTATTTGGGGTTTTGCCTTGCTCTTGATAGGAGTCGTCTTTGCGGTATCTTTCATCACAAGCTTCAT GAGAGACCCCACGCTGGGTTTTACCATACTCATTGTATTCATTATTGTAGGAACCTTCATAGCTTATCCGCTCTATGAAG CCTTTAAGCTGACGATTTTCCAAAACGGAGAATTCAGTCTAGACGTCTGGAAAAAAGTTCTAACCACAAGGAATTATTCC CGGGCACTCTGGGGAAGCATAAAGTTGGGGATGCTTACCGCCACAACATCAACGTTGGTAGGCTTTCTCTTTGCCTTCTC CCTCACGAGAATGAAGTTAAAGGGAAAGAAATTCTTCGCAACCATGGCCACTCTTCCAGTGATCTCCCCACCTTTCTCGC TTACGTTGTCTATCATTTTGCTTTTCGGAAACAACGGCCTAATCACGCGGAGACTGCTGGGGTTGACATCCTTTGACATA TACGGACTCGATGGTCTAGTGATTGTTCAAACAATGGGTATGTTTCCGATAGCTTTTCTTGTTTTAAGTGGAGTTTTGGA AGCCATTGACTCCACGCTTGAAGAGGCAGCGATGAACATGAGGGCGAATCGGTGGAAGGTATTTACCACTGTAACTTTAC CCCTTTCTATCCCGGGAATTGCCAGTTCCTGGTTGCTGGTTTTTTCAAACTCCATGGCGGATTTTGCAAATCCTTTAATC CTTTCTGGAAAGTACAAAGTGTTATCCGTTGAGGCATATCTTGAAGTTACGGGTATGCACAGATTACAAAATGGTGCCGC CCTTTCCATTCTTCTGCTCATACCAACTCTTACAGCCTTTTTGATTCAGAGGTACTGGGTAAACAGAAAGACCTATGTAA CAGTCACCGGTAAGCCGAGTGCCAGGATTATTGAAATAGTCAACAGGCCGGTGAAGATCTTCCTGACAACCATGATGGGT CTTATCTCAGCTTTTCTAATTGGTCTGTACTCCACAATAGTGGCGGGATGCTTTGTCAAAAACTGGGGAATAGATTATTC CTTCACCCTGGAGAATATCACAGAAGCCTTGTCCAGGGCCAGAGATGCCCTTATAGATACCACCACGCTGGCAGCAATTG CCACACCTATTGCTGGAATTCTAGCCATGATAGTAGCAATGATAATTGTCAGGAAAAAATTCCCTGGGAAAAAGCTTTTA CAAATGTTTGTTTTGATGCCCTTTGCTATTCCGGGAACACTGGTGGGTATCAGTTATATCATTGCTTTTAACAGGCCACC ACTGCTGCTGGTCGGAACCGGAGCGATAATAGTAATAAATTACGTTATAAGGGAGCTGCCAGTGGGGGTGGAAAGCGGAG TGGCAACCTTGAAACAGATCGATCCGGCTATCGAAGAAGCTGCTCAAAGTCTGGGCGCGGATTCGCCAACGGTTTTCAGG ACAATTGTGCTACCTTTGATAAGACCTGCATTTATCTCAAGCCTTTCATATACTTTTGTCAGATCCATGACCGCCGTGAG CGCTGTGATTTTCCTTATTTCTGCAAAATGGTATCACATCACCATTCTCATATACAACTTCTCAGAGAATTTGCGATTTG GTCTTGCAAGTGTGCTTGCAACGACTCTTATCATAATTATCCTTGCGGTGTTTGGATTGATGAGATTGCTGGTCAAAAAG AGTTCTTACATGGAAAAAACCATAATTTCGGGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GATTTCCTTTAGGTTATAAACCTCCCCTGCACCGCAAAGCGGTGCAGGGATTTGTATTATTAGCTTACTTACCGGCCAAT CTCCGGAGGTGTAATCAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATGAATGAAGTCGGTTTCGGTTACGTTAAAGAATATTTCAAAGGTTTTTAAAGGTTTTGAAGGGAACGATATAAGGGCT GTGGACGATGTATCCTTTAA
Product: binding-protein-dependent transport systems inner membrane component
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 731; Mature: 731
Protein sequence:
>731_residues MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK SSYMEKTIISG
Sequences:
>Translated_731_residues MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK SSYMEKTIISG >Mature_731_residues MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEEIDANYPDIQAIYIKGLEEYG EIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFHENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKIL GTIRTIWGFALLLIGVVFAVSFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIILLFGNNGLITRRLLGLTSFDI YGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNMRANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLI LSGKYKVLSVEAYLEVTGMHRLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGILAMIVAMIIVRKKFPGKKLL QMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVINYVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFR TIVLPLIRPAFISSLSYTFVRSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK SSYMEKTIISG
Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]
COG id: COG1178
COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788764, Length=186, Percent_Identity=26.3440860215054, Blast_Score=70, Evalue=4e-13, Organism=Escherichia coli, GI1786980, Length=157, Percent_Identity=31.8471337579618, Blast_Score=67, Evalue=3e-12, Organism=Escherichia coli, GI1787368, Length=204, Percent_Identity=26.4705882352941, Blast_Score=67, Evalue=4e-12, Organism=Escherichia coli, GI1787570, Length=229, Percent_Identity=27.0742358078603, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 [H]
Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81182; Mature: 81182
Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH IDANYPDIQAIYIKGLEEYGEIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFH HCCCCCCEEHHHEECHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKILGTIRTIWGFALLLIGVVFAV HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCH RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIIL HHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEE LFGNNGLITRRLLGLTSFDIYGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNM EECCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLILSGKYKVLSVEAYLEVTGMH CCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH RLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAMIVAMIIVRKKFPGKKLLQMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVIN HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCHHHHHH YVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFRTIVLPLIRPAFISSLSYTFV HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSYMEKTIISG HHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKAKILKLIVTVGLFAVLIFWVFNSIEREFVDAAKERILEISNLISSSIPEDDIQSWLEE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH IDANYPDIQAIYIKGLEEYGEIPEYFYQNPESADLFAKLKTMDFFDYGIESTVYEEIYFH HCCCCCCEEHHHEECHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ENILKLGNNQYFVTFVPVLEPEYGMVTGSLVLLHNASKILGTIRTIWGFALLLIGVVFAV HHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFITSFMRDPTLGFTILIVFIIVGTFIAYPLYEAFKLTIFQNGEFSLDVWKKVLTTRNYS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCH RALWGSIKLGMLTATTSTLVGFLFAFSLTRMKLKGKKFFATMATLPVISPPFSLTLSIIL HHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEE LFGNNGLITRRLLGLTSFDIYGLDGLVIVQTMGMFPIAFLVLSGVLEAIDSTLEEAAMNM EECCCCHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RANRWKVFTTVTLPLSIPGIASSWLLVFSNSMADFANPLILSGKYKVLSVEAYLEVTGMH CCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH RLQNGAALSILLLIPTLTAFLIQRYWVNRKTYVTVTGKPSARIIEIVNRPVKIFLTTMMG HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LISAFLIGLYSTIVAGCFVKNWGIDYSFTLENITEALSRARDALIDTTTLAAIATPIAGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAMIVAMIIVRKKFPGKKLLQMFVLMPFAIPGTLVGISYIIAFNRPPLLLVGTGAIIVIN HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCHHHHHH YVIRELPVGVESGVATLKQIDPAIEEAAQSLGADSPTVFRTIVLPLIRPAFISSLSYTFV HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSMTAVSAVIFLISAKWYHITILIYNFSENLRFGLASVLATTLIIIILAVFGLMRLLVKK HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSYMEKTIISG HHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8807793 [H]