| Definition | Eubacterium rectale ATCC 33656, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012781 |
| Length | 3,449,685 |
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The map label for this gene is 238925025
Identifier: 238925025
GI number: 238925025
Start: 2552723
End: 2555734
Strand: Reverse
Name: 238925025
Synonym: EUBREC_2676
Alternate gene names: NA
Gene position: 2555734-2552723 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238925028
Following gene: 238925022
Centisome position: 74.09
GC content: 29.15
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ATCTCCTTTTGATAATTTGATATTAGTGATTATTATACTATTATAATTATATTGACATAAAGAATGTTTACTTTTATTAA AAAAGCGGTACTATAGACTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGGCTGGGTATATGATTTATAAACTTAATATATGATCTACAGATTTGTTGGATTCTGCATTTATTACCAACAAATCTGA TCGTGTTTGCTTTGAAACTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1003; Mature: 1003
Protein sequence:
>1003_residues MMYVSTLYEKIFKKYEGTNMDKQFIEEAYRKLKGSVYLDKTVPFLRMRIVEFERGDIDKKIENIYAALNDEIKWKVFKKN ILETINVLTFPKEIKTKSDNVIEDEPIVISNISGTDVTIEKYNNFIDMCVEGHIIGILWILTIGYGMDKALDKNCYGNRL NEKLIFNDQTTTASPNLFKPYFNQYESWRNQGLKKADDVVNNNSNNDEDNNKSVILTMLDLSRYYYNIEITEKIFEKMTN TFYDNKDDSLNRLNYCVYDIMKKYSELCGCDKEYMLPIGFLPSSIISNYYLKDIDEKMSKSKGGVYYGRYVDDMILVTQI ENWDDLKERILNEGNQCVCNYMIKLLEESKILENDNDEYSLSGFSKLKFQKSKFRFFYIDKDGYSTIIEKIQDDICKNSS EFNYIPETAIEELDTDILKFEREDTVNKIRAINKSTIDKYTLSKTVGKNIMMSKFAEDDTAEKFAKSLEQVLNHKEILSN YTLWESILNYYVINNYVEGIIYLSRAISSAIKHMDEEKNKSGEYIYLKSLQIENVGNSLIYYYLACLTRATAISWGEEIK KALQESIKVIKSLEKYEKFNNLYNWMNIENLRKAYCNSRMINKSLLPVSIEDCMSAFQRNDMKNNGGFFSLDNYLNSVLK CRFSKQNQKYAPYIKSPFEILYSDLINQIRAGKGELRSDQESVQILCKKYAENFGKMDEEYIKEYIEADFYDGGKYIVKI KSDKKYKDSKVKIAVANVRMSDEDILNILNGKNRDISKRCQEIGRILNEAIRYKADILVFPEAYIPLEYLKILQSKAAKH NMVIIGGIEHITHNKLVYNLTATILPIKSNSMSYAVPFFHQKLYFSPQELKEVQKRGYKPAKGQKHTLFSWGDMYFVTYC CYELTSISLRHEFQGLADIVFGVEWNKDTYYFGNIMEALSRDIYCYCVQSNMSEYGDSRIIQPTKKDLMNILKVKGGINA SVLIGEIDIEELRKHQNNNTPNNGVYKPLPAGWDLSKTNLKNK
Sequences:
>Translated_1003_residues MMYVSTLYEKIFKKYEGTNMDKQFIEEAYRKLKGSVYLDKTVPFLRMRIVEFERGDIDKKIENIYAALNDEIKWKVFKKN ILETINVLTFPKEIKTKSDNVIEDEPIVISNISGTDVTIEKYNNFIDMCVEGHIIGILWILTIGYGMDKALDKNCYGNRL NEKLIFNDQTTTASPNLFKPYFNQYESWRNQGLKKADDVVNNNSNNDEDNNKSVILTMLDLSRYYYNIEITEKIFEKMTN TFYDNKDDSLNRLNYCVYDIMKKYSELCGCDKEYMLPIGFLPSSIISNYYLKDIDEKMSKSKGGVYYGRYVDDMILVTQI ENWDDLKERILNEGNQCVCNYMIKLLEESKILENDNDEYSLSGFSKLKFQKSKFRFFYIDKDGYSTIIEKIQDDICKNSS EFNYIPETAIEELDTDILKFEREDTVNKIRAINKSTIDKYTLSKTVGKNIMMSKFAEDDTAEKFAKSLEQVLNHKEILSN YTLWESILNYYVINNYVEGIIYLSRAISSAIKHMDEEKNKSGEYIYLKSLQIENVGNSLIYYYLACLTRATAISWGEEIK KALQESIKVIKSLEKYEKFNNLYNWMNIENLRKAYCNSRMINKSLLPVSIEDCMSAFQRNDMKNNGGFFSLDNYLNSVLK CRFSKQNQKYAPYIKSPFEILYSDLINQIRAGKGELRSDQESVQILCKKYAENFGKMDEEYIKEYIEADFYDGGKYIVKI KSDKKYKDSKVKIAVANVRMSDEDILNILNGKNRDISKRCQEIGRILNEAIRYKADILVFPEAYIPLEYLKILQSKAAKH NMVIIGGIEHITHNKLVYNLTATILPIKSNSMSYAVPFFHQKLYFSPQELKEVQKRGYKPAKGQKHTLFSWGDMYFVTYC CYELTSISLRHEFQGLADIVFGVEWNKDTYYFGNIMEALSRDIYCYCVQSNMSEYGDSRIIQPTKKDLMNILKVKGGINA SVLIGEIDIEELRKHQNNNTPNNGVYKPLPAGWDLSKTNLKNK >Mature_1003_residues MMYVSTLYEKIFKKYEGTNMDKQFIEEAYRKLKGSVYLDKTVPFLRMRIVEFERGDIDKKIENIYAALNDEIKWKVFKKN ILETINVLTFPKEIKTKSDNVIEDEPIVISNISGTDVTIEKYNNFIDMCVEGHIIGILWILTIGYGMDKALDKNCYGNRL NEKLIFNDQTTTASPNLFKPYFNQYESWRNQGLKKADDVVNNNSNNDEDNNKSVILTMLDLSRYYYNIEITEKIFEKMTN TFYDNKDDSLNRLNYCVYDIMKKYSELCGCDKEYMLPIGFLPSSIISNYYLKDIDEKMSKSKGGVYYGRYVDDMILVTQI ENWDDLKERILNEGNQCVCNYMIKLLEESKILENDNDEYSLSGFSKLKFQKSKFRFFYIDKDGYSTIIEKIQDDICKNSS EFNYIPETAIEELDTDILKFEREDTVNKIRAINKSTIDKYTLSKTVGKNIMMSKFAEDDTAEKFAKSLEQVLNHKEILSN YTLWESILNYYVINNYVEGIIYLSRAISSAIKHMDEEKNKSGEYIYLKSLQIENVGNSLIYYYLACLTRATAISWGEEIK KALQESIKVIKSLEKYEKFNNLYNWMNIENLRKAYCNSRMINKSLLPVSIEDCMSAFQRNDMKNNGGFFSLDNYLNSVLK CRFSKQNQKYAPYIKSPFEILYSDLINQIRAGKGELRSDQESVQILCKKYAENFGKMDEEYIKEYIEADFYDGGKYIVKI KSDKKYKDSKVKIAVANVRMSDEDILNILNGKNRDISKRCQEIGRILNEAIRYKADILVFPEAYIPLEYLKILQSKAAKH NMVIIGGIEHITHNKLVYNLTATILPIKSNSMSYAVPFFHQKLYFSPQELKEVQKRGYKPAKGQKHTLFSWGDMYFVTYC CYELTSISLRHEFQGLADIVFGVEWNKDTYYFGNIMEALSRDIYCYCVQSNMSEYGDSRIIQPTKKDLMNILKVKGGINA SVLIGEIDIEELRKHQNNNTPNNGVYKPLPAGWDLSKTNLKNK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 117046; Mature: 117046
Theoretical pI: Translated: 6.98; Mature: 6.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 4.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MMYVSTLYEKIFKKYEGTNMDKQFIEEAYRKLKGSVYLDKTVPFLRMRIVEFERGDIDKK CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHH IENIYAALNDEIKWKVFKKNILETINVLTFPKEIKTKSDNVIEDEPIVISNISGTDVTIE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEHH KYNNFIDMCVEGHIIGILWILTIGYGMDKALDKNCYGNRLNEKLIFNDQTTTASPNLFKP HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHH YFNQYESWRNQGLKKADDVVNNNSNNDEDNNKSVILTMLDLSRYYYNIEITEKIFEKMTN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHEEEEEHHHHHHHHHHH TFYDNKDDSLNRLNYCVYDIMKKYSELCGCDKEYMLPIGFLPSSIISNYYLKDIDEKMSK HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKGGVYYGRYVDDMILVTQIENWDDLKERILNEGNQCVCNYMIKLLEESKILENDNDEYS CCCCEEEEHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE LSGFSKLKFQKSKFRFFYIDKDGYSTIIEKIQDDICKNSSEFNYIPETAIEELDTDILKF CCCHHHHHEECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH EREDTVNKIRAINKSTIDKYTLSKTVGKNIMMSKFAEDDTAEKFAKSLEQVLNHKEILSN HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLWESILNYYVINNYVEGIIYLSRAISSAIKHMDEEKNKSGEYIYLKSLQIENVGNSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHH YYYLACLTRATAISWGEEIKKALQESIKVIKSLEKYEKFNNLYNWMNIENLRKAYCNSRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHH INKSLLPVSIEDCMSAFQRNDMKNNGGFFSLDNYLNSVLKCRFSKQNQKYAPYIKSPFEI HCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH LYSDLINQIRAGKGELRSDQESVQILCKKYAENFGKMDEEYIKEYIEADFYDGGKYIVKI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE KSDKKYKDSKVKIAVANVRMSDEDILNILNGKNRDISKRCQEIGRILNEAIRYKADILVF ECCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEC PEAYIPLEYLKILQSKAAKHNMVIIGGIEHITHNKLVYNLTATILPIKSNSMSYAVPFFH CCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHH QKLYFSPQELKEVQKRGYKPAKGQKHTLFSWGDMYFVTYCCYELTSISLRHEFQGLADIV HHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVEWNKDTYYFGNIMEALSRDIYCYCVQSNMSEYGDSRIIQPTKKDLMNILKVKGGINA EEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCE SVLIGEIDIEELRKHQNNNTPNNGVYKPLPAGWDLSKTNLKNK EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MMYVSTLYEKIFKKYEGTNMDKQFIEEAYRKLKGSVYLDKTVPFLRMRIVEFERGDIDKK CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHH IENIYAALNDEIKWKVFKKNILETINVLTFPKEIKTKSDNVIEDEPIVISNISGTDVTIE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEHH KYNNFIDMCVEGHIIGILWILTIGYGMDKALDKNCYGNRLNEKLIFNDQTTTASPNLFKP HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHH YFNQYESWRNQGLKKADDVVNNNSNNDEDNNKSVILTMLDLSRYYYNIEITEKIFEKMTN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHEEEEEHHHHHHHHHHH TFYDNKDDSLNRLNYCVYDIMKKYSELCGCDKEYMLPIGFLPSSIISNYYLKDIDEKMSK HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKGGVYYGRYVDDMILVTQIENWDDLKERILNEGNQCVCNYMIKLLEESKILENDNDEYS CCCCEEEEHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE LSGFSKLKFQKSKFRFFYIDKDGYSTIIEKIQDDICKNSSEFNYIPETAIEELDTDILKF CCCHHHHHEECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH EREDTVNKIRAINKSTIDKYTLSKTVGKNIMMSKFAEDDTAEKFAKSLEQVLNHKEILSN HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLWESILNYYVINNYVEGIIYLSRAISSAIKHMDEEKNKSGEYIYLKSLQIENVGNSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHH YYYLACLTRATAISWGEEIKKALQESIKVIKSLEKYEKFNNLYNWMNIENLRKAYCNSRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHH INKSLLPVSIEDCMSAFQRNDMKNNGGFFSLDNYLNSVLKCRFSKQNQKYAPYIKSPFEI HCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH LYSDLINQIRAGKGELRSDQESVQILCKKYAENFGKMDEEYIKEYIEADFYDGGKYIVKI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE KSDKKYKDSKVKIAVANVRMSDEDILNILNGKNRDISKRCQEIGRILNEAIRYKADILVF ECCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEC PEAYIPLEYLKILQSKAAKHNMVIIGGIEHITHNKLVYNLTATILPIKSNSMSYAVPFFH CCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHH QKLYFSPQELKEVQKRGYKPAKGQKHTLFSWGDMYFVTYCCYELTSISLRHEFQGLADIV HHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVEWNKDTYYFGNIMEALSRDIYCYCVQSNMSEYGDSRIIQPTKKDLMNILKVKGGINA EEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCE SVLIGEIDIEELRKHQNNNTPNNGVYKPLPAGWDLSKTNLKNK EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA