Definition Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome.
Accession NC_012778
Length 2,144,190

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 238917144

Identifier: 238917144

GI number: 238917144

Start: 1228819

End: 1231545

Strand: Direct

Name: 238917144

Synonym: EUBELI_01216

Alternate gene names: NA

Gene position: 1228819-1231545 (Clockwise)

Preceding gene: 238917137

Following gene: 238917145

Centisome position: 57.31

GC content: 33.7

Gene sequence:

>2727_bases
ATGACATCTTCAAAGAAATCAATTCTTAATTCTAATCTGACTTATGTAATAGCATTTGTGCTTCCTTTAATTATGATGGC
AGCACTCTATTATACCCGGGAAATATTTCCATGGGGAAGCGACTGCTATCTAAGATCAGACATGTATCACCAGTATGCCC
CTTTCTTTTCGGAATTGTGGCACAAGATAAGGAATGGTGAAAGTCTTACCTATTCATGGGATATTGGTATGGGAACCAAC
TTTACATCATTATATGCGTATTATCTTGCCAGTCCTGCGAACTGGTTTATTGTATTATTTCCGCAGAAATATATGATTGA
AATTATGAATTCCCTTATCATATTAAAAATTGCCGGCAGCAGTCTTGCAATAACATATTACATAACCAGACATTTCGATA
CTAAAAACTGTGTGGCTGCTCTGTTTGGCATGTTCTATGGAATGTCCGGATTCATTGCAGCATACAGCTGGAACATCATG
TGGCTTGACTGCGTAATATTATTACCACTAATAATGCTTGGTCTTGAACGACTTGTTAATGAAAATAAATGTATCTTCTA
CTGTATAACACTGGGATTATGTATATTTACCAACTATTATATTTCAATCATGGTATGTATTTCTGTTGTTATTTACTTTA
TCATACTTATGATTTCATATAATGGTCCGGTAAGCATATTACAATATGTAAAGAAATTCATTAATTTCTGTATATATTCA
CTCCTCGCAGGTGGACTTGGTGCCTGCCTTTTACTGCCGGAATTTTATACATTTTCTTTATCTGCATCAAGTGACACTTC
ATTTCCTGCACAGTTAAAATCATATTTCAGCATACTTTCAATGCTTACAAGGCAGCTTATTAATGTTCCTGTCCATCTCG
GACTTGAACATTTTCCTAACATATATTGTGGTGTTGCTGTATTTTTGCTTATTCCGCTCTATGTTATGTGCAAAAAAATC
AATGCCCGTGAAAAAATTGGAAAATGTATAATTCTTCTGATTTTCTTAACAGCATTTAACCTCAATATACCTAATTATAT
ATGGCACGGACTGCATTTTCCAAACAGTCTTCCATGCAGACAGTCTTTTATCTACATATTTTTTGTTCTTACTATGTGTT
TTGAGGCTGTATATAATATAAAAGAGTTATCTAATAAACAGATTGGTACTTCATTATGGATTTCAATCGGTCTGCTTGTT
CTTTTTGAACAGTTATTTATGGCGGATGGAAGTACTTATTCATTCAAGATTGCATATGTAAGTGGAATATTCATATTGTT
ATATGCTCTTCTTATGTTTATTAACAATAATGCAAAGCTTAAAATACCGCTTGTACTTCTGCTTACATTTTCTGTATCAA
TCATAGAATGTACTCTTAATATGGATTCGACAGGTATCGGTACAACGAGCCGTACATCATATCTTCTTGATTATGATGCA
GTAAAGACTGTTACTAAAACAGTTGCTGATAACGACGATTCATTTTACCGTATGGACAAGCTTTTTGGTGCAAGAACCAA
AAATGATGGTGCATGGCATAATTACAAAACTGTATCCACATTTTCTTCTACATGTAATGCAGGTATGTCAAAACTATTCA
ATTATCTTGGTTTAGAGAATTCAACCAATGCATATGGATGCAATGGTCTCACAGAAGTAACTGATATGATATTCTCTGTT
AAATATACCATAAGCAACAAGCTTCTTGCAGAAAGTAATTTAAGAAGCTACTATACAGGAAGTGACGGTGAGTTCATATA
TAAAAATAATTATACTCTTCCGATAGGATTTGCTATTAATGAACAGTCTGCTTCCAAAATGAATTTCATGACTGCCAATA
ACGGTATTGAAAACCAGAATCTTATGATTCAGAATATGACAGGGATAAGTGATGTATTCACTGTAGTTGATGAATTTCCT
AACGAATCAGACTGTACTATAAAGCCACAAAAAGATGGACATTTGTATCTTATAGCTGCCAACCAGTCCGTTGATTACAT
AACCGTAACGCTTAATAATTCAGACAAATCTTATTCTTACAGTAACTTAAAGAGTAATAACAGAATTATTGATGTAGGTT
ATATCACAAAATCTGACACAGTGGAAGTTACCGCCGAAACAGGTATGAATCTTACTGCTTATATGCTTGATTCTGATAAG
TTAATCAAGGCTTACAATATTCTCAATGCAGAAAGTTATCAGGTTGATTCATATACAGATACTCATTTTAAAGGATCAAT
CAGCTTATCTTCTGACAAGACTGTTCTGTTTTCTATTCCGTACGATGCCGGATGGTCTGTATATGTTGATGGCAAACGTG
TAGATACATTTGTATGGAAGAACGCTTTGTTATGTGTTGATGTTCCAGCCGGAACACACTCACTTGAATTAAGGTATGTT
CCACACAATTTAATATTGGGTTGCGTTTTAACTGCATTTAGCATTATTATATTGATTGGCATATATGTGTCTGCCCGTCT
TATAAGGAACGGCAGAATACATACTTATAACTGGCCTGTTTTCATCAGAAAGTATCTTGAACTTCCTGTTATAGAATCTG
TTGCAGAATCTCATTCTGATAATGAGGACTACAATTTCCTTAATAAGAATATACAAGAAACTATTCTTGATGAAATGAAT
GATTTTGATAATCTCGAATCTCCGGATTTCGAAGATGATACATCAGATTATAATTTAAAAGACAATGAAACCAAGGAGGA
TTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAATTGTTACAACGAATACAAGCCTAATTTTAGTTTAAATGTTTACACATTTTTTGTTCTTTGGTAAAATGTTACTATTA
TCGGCTAAGGGAGGAAAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAATTATGGGGTGGACGATTCACCAAAGAAACTAATGAGCTTGTCAACAACTTCAACGCATCAATTTCATTTGACCA
GAAGTTCTATAAGCAGGATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 908; Mature: 907

Protein sequence:

>908_residues
MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTN
FTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIM
WLDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS
LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKI
NAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLV
LFEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA
VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSV
KYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFP
NESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK
LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYV
PHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMN
DFDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL

Sequences:

>Translated_908_residues
MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTN
FTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIM
WLDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS
LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKI
NAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLV
LFEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA
VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSV
KYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFP
NESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK
LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYV
PHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMN
DFDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL
>Mature_907_residues
TSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTNF
TSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMW
LDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYSL
LAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKIN
AREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVL
FEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDAV
KTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSVK
YTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPN
ESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDKL
IKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYVP
HNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMND
FDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103101; Mature: 102970

Theoretical pI: Translated: 5.30; Mature: 5.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELW
CCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH
HKIRNGESLTYSWDIGMGTNFTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGS
HHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCEEEEEECCC
SLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMWLDCVILLPLIMLGLERLVN
CEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPN
HHHCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCC
IYCGVAVFLLIPLYVMCKKINAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH
QSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVLFEQLFMADGSTYSFKIAYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHH
SGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHH
VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLEN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
STNAYGCNGLTEVTDMIFSVKYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAIN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHCCHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCEEEEEEEEEC
EQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPNESDCTIKPQKDGHLYLIAA
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEEEEE
NQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK
CCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCC
LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWK
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEHHHHC
NALLCVDVPAGTHSLELRYVPHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPV
CEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHH
FIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMNDFDNLESPDFEDDTSDYNLK
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DNETKEDL
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELW
CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH
HKIRNGESLTYSWDIGMGTNFTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGS
HHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCEEEEEECCC
SLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMWLDCVILLPLIMLGLERLVN
CEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPN
HHHCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCC
IYCGVAVFLLIPLYVMCKKINAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH
QSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVLFEQLFMADGSTYSFKIAYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHH
SGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHH
VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLEN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
STNAYGCNGLTEVTDMIFSVKYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAIN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHCCHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCEEEEEEEEEC
EQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPNESDCTIKPQKDGHLYLIAA
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEEEEE
NQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK
CCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCC
LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWK
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEHHHHC
NALLCVDVPAGTHSLELRYVPHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPV
CEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHH
FIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMNDFDNLESPDFEDDTSDYNLK
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DNETKEDL
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA