| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238917144
Identifier: 238917144
GI number: 238917144
Start: 1228819
End: 1231545
Strand: Direct
Name: 238917144
Synonym: EUBELI_01216
Alternate gene names: NA
Gene position: 1228819-1231545 (Clockwise)
Preceding gene: 238917137
Following gene: 238917145
Centisome position: 57.31
GC content: 33.7
Gene sequence:
>2727_bases ATGACATCTTCAAAGAAATCAATTCTTAATTCTAATCTGACTTATGTAATAGCATTTGTGCTTCCTTTAATTATGATGGC AGCACTCTATTATACCCGGGAAATATTTCCATGGGGAAGCGACTGCTATCTAAGATCAGACATGTATCACCAGTATGCCC CTTTCTTTTCGGAATTGTGGCACAAGATAAGGAATGGTGAAAGTCTTACCTATTCATGGGATATTGGTATGGGAACCAAC TTTACATCATTATATGCGTATTATCTTGCCAGTCCTGCGAACTGGTTTATTGTATTATTTCCGCAGAAATATATGATTGA AATTATGAATTCCCTTATCATATTAAAAATTGCCGGCAGCAGTCTTGCAATAACATATTACATAACCAGACATTTCGATA CTAAAAACTGTGTGGCTGCTCTGTTTGGCATGTTCTATGGAATGTCCGGATTCATTGCAGCATACAGCTGGAACATCATG TGGCTTGACTGCGTAATATTATTACCACTAATAATGCTTGGTCTTGAACGACTTGTTAATGAAAATAAATGTATCTTCTA CTGTATAACACTGGGATTATGTATATTTACCAACTATTATATTTCAATCATGGTATGTATTTCTGTTGTTATTTACTTTA TCATACTTATGATTTCATATAATGGTCCGGTAAGCATATTACAATATGTAAAGAAATTCATTAATTTCTGTATATATTCA CTCCTCGCAGGTGGACTTGGTGCCTGCCTTTTACTGCCGGAATTTTATACATTTTCTTTATCTGCATCAAGTGACACTTC ATTTCCTGCACAGTTAAAATCATATTTCAGCATACTTTCAATGCTTACAAGGCAGCTTATTAATGTTCCTGTCCATCTCG GACTTGAACATTTTCCTAACATATATTGTGGTGTTGCTGTATTTTTGCTTATTCCGCTCTATGTTATGTGCAAAAAAATC AATGCCCGTGAAAAAATTGGAAAATGTATAATTCTTCTGATTTTCTTAACAGCATTTAACCTCAATATACCTAATTATAT ATGGCACGGACTGCATTTTCCAAACAGTCTTCCATGCAGACAGTCTTTTATCTACATATTTTTTGTTCTTACTATGTGTT TTGAGGCTGTATATAATATAAAAGAGTTATCTAATAAACAGATTGGTACTTCATTATGGATTTCAATCGGTCTGCTTGTT CTTTTTGAACAGTTATTTATGGCGGATGGAAGTACTTATTCATTCAAGATTGCATATGTAAGTGGAATATTCATATTGTT ATATGCTCTTCTTATGTTTATTAACAATAATGCAAAGCTTAAAATACCGCTTGTACTTCTGCTTACATTTTCTGTATCAA TCATAGAATGTACTCTTAATATGGATTCGACAGGTATCGGTACAACGAGCCGTACATCATATCTTCTTGATTATGATGCA GTAAAGACTGTTACTAAAACAGTTGCTGATAACGACGATTCATTTTACCGTATGGACAAGCTTTTTGGTGCAAGAACCAA AAATGATGGTGCATGGCATAATTACAAAACTGTATCCACATTTTCTTCTACATGTAATGCAGGTATGTCAAAACTATTCA ATTATCTTGGTTTAGAGAATTCAACCAATGCATATGGATGCAATGGTCTCACAGAAGTAACTGATATGATATTCTCTGTT AAATATACCATAAGCAACAAGCTTCTTGCAGAAAGTAATTTAAGAAGCTACTATACAGGAAGTGACGGTGAGTTCATATA TAAAAATAATTATACTCTTCCGATAGGATTTGCTATTAATGAACAGTCTGCTTCCAAAATGAATTTCATGACTGCCAATA ACGGTATTGAAAACCAGAATCTTATGATTCAGAATATGACAGGGATAAGTGATGTATTCACTGTAGTTGATGAATTTCCT AACGAATCAGACTGTACTATAAAGCCACAAAAAGATGGACATTTGTATCTTATAGCTGCCAACCAGTCCGTTGATTACAT AACCGTAACGCTTAATAATTCAGACAAATCTTATTCTTACAGTAACTTAAAGAGTAATAACAGAATTATTGATGTAGGTT ATATCACAAAATCTGACACAGTGGAAGTTACCGCCGAAACAGGTATGAATCTTACTGCTTATATGCTTGATTCTGATAAG TTAATCAAGGCTTACAATATTCTCAATGCAGAAAGTTATCAGGTTGATTCATATACAGATACTCATTTTAAAGGATCAAT CAGCTTATCTTCTGACAAGACTGTTCTGTTTTCTATTCCGTACGATGCCGGATGGTCTGTATATGTTGATGGCAAACGTG TAGATACATTTGTATGGAAGAACGCTTTGTTATGTGTTGATGTTCCAGCCGGAACACACTCACTTGAATTAAGGTATGTT CCACACAATTTAATATTGGGTTGCGTTTTAACTGCATTTAGCATTATTATATTGATTGGCATATATGTGTCTGCCCGTCT TATAAGGAACGGCAGAATACATACTTATAACTGGCCTGTTTTCATCAGAAAGTATCTTGAACTTCCTGTTATAGAATCTG TTGCAGAATCTCATTCTGATAATGAGGACTACAATTTCCTTAATAAGAATATACAAGAAACTATTCTTGATGAAATGAAT GATTTTGATAATCTCGAATCTCCGGATTTCGAAGATGATACATCAGATTATAATTTAAAAGACAATGAAACCAAGGAGGA TTTATAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATGAAATTATGGGGTGGACGATTCACCAAAGAAACTAATGAGCTTGTCAACAACTTCAACGCATCAATTTCATTTGACCA GAAGTTCTATAAGCAGGATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 908; Mature: 907
Protein sequence:
>908_residues MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTN FTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIM WLDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKI NAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLV LFEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSV KYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFP NESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYV PHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMN DFDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL
Sequences:
>Translated_908_residues MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTN FTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIM WLDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKI NAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLV LFEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSV KYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFP NESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYV PHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMN DFDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL >Mature_907_residues TSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELWHKIRNGESLTYSWDIGMGTNF TSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGSSLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMW LDCVILLPLIMLGLERLVNENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYSL LAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPNIYCGVAVFLLIPLYVMCKKIN AREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCRQSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVL FEQLFMADGSTYSFKIAYVSGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDAV KTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLENSTNAYGCNGLTEVTDMIFSVK YTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAINEQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPN ESDCTIKPQKDGHLYLIAANQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDKL IKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWKNALLCVDVPAGTHSLELRYVP HNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPVFIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMND FDNLESPDFEDDTSDYNLKDNETKEDL
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103101; Mature: 102970
Theoretical pI: Translated: 5.30; Mature: 5.30
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 5.4 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 5.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELW CCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH HKIRNGESLTYSWDIGMGTNFTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGS HHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCEEEEEECCC SLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMWLDCVILLPLIMLGLERLVN CEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPN HHHCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCC IYCGVAVFLLIPLYVMCKKINAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH QSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVLFEQLFMADGSTYSFKIAYV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHH SGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHH VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLEN HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC STNAYGCNGLTEVTDMIFSVKYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAIN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHCCHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCEEEEEEEEEC EQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPNESDCTIKPQKDGHLYLIAA CCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEEEEE NQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK CCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCC LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWK HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEHHHHC NALLCVDVPAGTHSLELRYVPHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPV CEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHH FIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMNDFDNLESPDFEDDTSDYNLK HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC DNETKEDL CCCCCCCC >Mature Secondary Structure TSSKKSILNSNLTYVIAFVLPLIMMAALYYTREIFPWGSDCYLRSDMYHQYAPFFSELW CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH HKIRNGESLTYSWDIGMGTNFTSLYAYYLASPANWFIVLFPQKYMIEIMNSLIILKIAGS HHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCEEEEEECCC SLAITYYITRHFDTKNCVAALFGMFYGMSGFIAAYSWNIMWLDCVILLPLIMLGLERLVN CEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ENKCIFYCITLGLCIFTNYYISIMVCISVVIYFIILMISYNGPVSILQYVKKFINFCIYS CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLAGGLGACLLLPEFYTFSLSASSDTSFPAQLKSYFSILSMLTRQLINVPVHLGLEHFPN HHHCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCC IYCGVAVFLLIPLYVMCKKINAREKIGKCIILLIFLTAFNLNIPNYIWHGLHFPNSLPCR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH QSFIYIFFVLTMCFEAVYNIKELSNKQIGTSLWISIGLLVLFEQLFMADGSTYSFKIAYV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHH SGIFILLYALLMFINNNAKLKIPLVLLLTFSVSIIECTLNMDSTGIGTTSRTSYLLDYDA HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHH VKTVTKTVADNDDSFYRMDKLFGARTKNDGAWHNYKTVSTFSSTCNAGMSKLFNYLGLEN HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC STNAYGCNGLTEVTDMIFSVKYTISNKLLAESNLRSYYTGSDGEFIYKNNYTLPIGFAIN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHCCHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCEEEEEEEEEC EQSASKMNFMTANNGIENQNLMIQNMTGISDVFTVVDEFPNESDCTIKPQKDGHLYLIAA CCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEEEEE NQSVDYITVTLNNSDKSYSYSNLKSNNRIIDVGYITKSDTVEVTAETGMNLTAYMLDSDK CCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCC LIKAYNILNAESYQVDSYTDTHFKGSISLSSDKTVLFSIPYDAGWSVYVDGKRVDTFVWK HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEHHHHC NALLCVDVPAGTHSLELRYVPHNLILGCVLTAFSIIILIGIYVSARLIRNGRIHTYNWPV CEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHH FIRKYLELPVIESVAESHSDNEDYNFLNKNIQETILDEMNDFDNLESPDFEDDTSDYNLK HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC DNETKEDL CCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA