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The map label for this gene is flhA [H]

Identifier: 238916768

GI number: 238916768

Start: 843109

End: 845148

Strand: Direct

Name: flhA [H]

Synonym: EUBELI_00830

Alternate gene names: 238916768

Gene position: 843109-845148 (Clockwise)

Preceding gene: 238916767

Following gene: 238916769

Centisome position: 39.32

GC content: 36.67

Gene sequence:

>2040_bases
ATGAAGATCAAGAAAAATGACCTGTTTATCGGAATATACCTTCTTGCAGCGGTTTTATTCTTCATTATTTCAATTCCGTC
ATGGCTGCTTGATATTTTACTTGCAATTAACATTCTGGTTGCACTTGTTGTACTTTTTAATTCATTGTTTGCTAAAGAAG
TTCTGGATATGGCATCTTTTCCTACAATGCTGTTATTTACAACAATTTTCAGAATTTCTCTTAATGTATCATCGACTAAG
CTTATATTAAAGAATGGTTATGCTGGTAAGGTTGTTGATACATTTGGTAAATTTGTTGGAAGTGGTAATCTTGTCATTGG
TATTATCATATTTATTATTCTTATTATTATTCAGTTTATTGTTATTAATAAGGGTTCTGAACGAGTTGCTGAGGTAACTG
CAAGATTTACACTTGATGCTATGGCAGGAAAACAGATGGCTATTGATTCGGATCTTAATACAGGTGCCATTACTGATAAG
GAAGCAGCAGAAAGAAGAAAAAAGTTACAGCAGGAAAACAGCTTTTTCGGTTCTATGGATGGTGCTACAAAGTATGTTAA
GGGAGATGCTACAGCCGGTCTTATAATTACAGGTATCAATCTTATTGGTGGTATTGTTATGGGAATGGCGTACGGTGGAC
TTACGATTAATGATGCACTGTCTAAGTATACTATTCTTACAATTGGAGATGGCTTATGTTCTCAGATTCCTTCATTGCTT
ATTTCGCTTGCAACAGGTGTTCTTGTTACCAAGGCTTCAAGCGAAGGTGAACTTGGAGATGAAATTATAGGGCAGCTTTT
CTCTATGGACAGAGTTCTTCTTATGGTTGGTGCAGCACTTATTCTTCTGGGAGTAACAACACCTCTTCCATGGTATATTT
TTATTCCATTGGGTATGGCACTTATAATTTATGGCAGAAAGCTCAGCGCTAAGGCAGGAGAGACAGCAATAGAAGAGAGT
GCTGAACAGGAAGAGACAGAAGCTTCAGAAATAAGAAAACCAGAGAATGTTGTTTCTTTACTTAATGTTGATCCTATTGA
ACTGGAATTTGGATATGGAATTATTCCACTTGCCGATGTCAATCAGGGCGGGGATTTGTTAGACAGAGTAGTTATGATAA
GAAGACAGATTGCTTTGGAACTTGGCGCGGTTGTACCTATTATAAGACTGAGGGATAATATTCAGCTTAATCCTAATCAG
TATGTTATTAAAATTAAAGGTATTCAGGTTAGTGAAGGTGAAATTCTTTTTGACCATTACATGGCTATGAACCCTGGATA
TGTTGAAGAAGAAATAACCGGTATTCCTACATTTGAACCATCTTTTCATCTTCCAGCTATATGGATAACTGAAAGCCAGA
GAGAAAGAGCAGAATCACTTGGGTATACGGTTGTTGACCCACCATCAATCATTGCGACACATCTTACTGAAGTTATAAGG
CAGCATATAGCAGAGTTGCTTACAAGACAGGATGTGCAGAATCTTATCAATAATATTAAGGATAATAATACAACTCTTAT
TGAGGAGCTTGTTCCTAAGCTTATGGGAGTTGGCGAGATACAGAAGGTGCTTCAGAATCTCTTAGAGGAGGGAATATCTA
TAAGGGATCTTGTTACAATATTTGAAACGCTGGCTGACCATGCAGCTGTTACAAGAGATCCTGATATACTGACTGAATAT
GTAAGGCAGGCATTGAAGAGAGCTATTTCAAGCAAATATTTCCTGACAGGTGAAGTAACGAATGTTGTTACTGTAGATCC
GGCTATTGAACAGGAGATTATGAATTCGGTCAAGAATACAGAGCAGGGGTCATATTTATCACTTGATCCGGAGAGAAGCA
AGAAGATAATTGAAGCTCTTGGAAATGAACTTAAGAAATTAGAGGATATGGGAAAGAATCCGATAGTTATTACATCGCCT
ATTGTAAGAATGTATTTCAGAAATCTTGCAAAGGACTATTATAAAGACATTATTGTGATTTCATATAATGAAGTTGAATC
AAATGTTGAATTACAATCAGTTGGGATGGTGACAGCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTGAAATTCTTGCATCTGTTTTACGCGCAAATAATAGATAATAGTCGAAATATGTGATATGATATAAAATAATGACT
AAATTGAAAGGAGAGAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAGTTAAAAAATTTCAGGCAGATACAGAGACGGAAGCTATATTAAAAGCGAAGGAAGAGTTAGGCAATGGTGCAGT
AGTTCTTAATGTTAAAACAT

Product: flagellar biosynthesis protein FlhA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 679; Mature: 679

Protein sequence:

>679_residues
MKIKKNDLFIGIYLLAAVLFFIISIPSWLLDILLAINILVALVVLFNSLFAKEVLDMASFPTMLLFTTIFRISLNVSSTK
LILKNGYAGKVVDTFGKFVGSGNLVIGIIIFIILIIIQFIVINKGSERVAEVTARFTLDAMAGKQMAIDSDLNTGAITDK
EAAERRKKLQQENSFFGSMDGATKYVKGDATAGLIITGINLIGGIVMGMAYGGLTINDALSKYTILTIGDGLCSQIPSLL
ISLATGVLVTKASSEGELGDEIIGQLFSMDRVLLMVGAALILLGVTTPLPWYIFIPLGMALIIYGRKLSAKAGETAIEES
AEQEETEASEIRKPENVVSLLNVDPIELEFGYGIIPLADVNQGGDLLDRVVMIRRQIALELGAVVPIIRLRDNIQLNPNQ
YVIKIKGIQVSEGEILFDHYMAMNPGYVEEEITGIPTFEPSFHLPAIWITESQRERAESLGYTVVDPPSIIATHLTEVIR
QHIAELLTRQDVQNLINNIKDNNTTLIEELVPKLMGVGEIQKVLQNLLEEGISIRDLVTIFETLADHAAVTRDPDILTEY
VRQALKRAISSKYFLTGEVTNVVTVDPAIEQEIMNSVKNTEQGSYLSLDPERSKKIIEALGNELKKLEDMGKNPIVITSP
IVRMYFRNLAKDYYKDIIVISYNEVESNVELQSVGMVTA

Sequences:

>Translated_679_residues
MKIKKNDLFIGIYLLAAVLFFIISIPSWLLDILLAINILVALVVLFNSLFAKEVLDMASFPTMLLFTTIFRISLNVSSTK
LILKNGYAGKVVDTFGKFVGSGNLVIGIIIFIILIIIQFIVINKGSERVAEVTARFTLDAMAGKQMAIDSDLNTGAITDK
EAAERRKKLQQENSFFGSMDGATKYVKGDATAGLIITGINLIGGIVMGMAYGGLTINDALSKYTILTIGDGLCSQIPSLL
ISLATGVLVTKASSEGELGDEIIGQLFSMDRVLLMVGAALILLGVTTPLPWYIFIPLGMALIIYGRKLSAKAGETAIEES
AEQEETEASEIRKPENVVSLLNVDPIELEFGYGIIPLADVNQGGDLLDRVVMIRRQIALELGAVVPIIRLRDNIQLNPNQ
YVIKIKGIQVSEGEILFDHYMAMNPGYVEEEITGIPTFEPSFHLPAIWITESQRERAESLGYTVVDPPSIIATHLTEVIR
QHIAELLTRQDVQNLINNIKDNNTTLIEELVPKLMGVGEIQKVLQNLLEEGISIRDLVTIFETLADHAAVTRDPDILTEY
VRQALKRAISSKYFLTGEVTNVVTVDPAIEQEIMNSVKNTEQGSYLSLDPERSKKIIEALGNELKKLEDMGKNPIVITSP
IVRMYFRNLAKDYYKDIIVISYNEVESNVELQSVGMVTA
>Mature_679_residues
MKIKKNDLFIGIYLLAAVLFFIISIPSWLLDILLAINILVALVVLFNSLFAKEVLDMASFPTMLLFTTIFRISLNVSSTK
LILKNGYAGKVVDTFGKFVGSGNLVIGIIIFIILIIIQFIVINKGSERVAEVTARFTLDAMAGKQMAIDSDLNTGAITDK
EAAERRKKLQQENSFFGSMDGATKYVKGDATAGLIITGINLIGGIVMGMAYGGLTINDALSKYTILTIGDGLCSQIPSLL
ISLATGVLVTKASSEGELGDEIIGQLFSMDRVLLMVGAALILLGVTTPLPWYIFIPLGMALIIYGRKLSAKAGETAIEES
AEQEETEASEIRKPENVVSLLNVDPIELEFGYGIIPLADVNQGGDLLDRVVMIRRQIALELGAVVPIIRLRDNIQLNPNQ
YVIKIKGIQVSEGEILFDHYMAMNPGYVEEEITGIPTFEPSFHLPAIWITESQRERAESLGYTVVDPPSIIATHLTEVIR
QHIAELLTRQDVQNLINNIKDNNTTLIEELVPKLMGVGEIQKVLQNLLEEGISIRDLVTIFETLADHAAVTRDPDILTEY
VRQALKRAISSKYFLTGEVTNVVTVDPAIEQEIMNSVKNTEQGSYLSLDPERSKKIIEALGNELKKLEDMGKNPIVITSP
IVRMYFRNLAKDYYKDIIVISYNEVESNVELQSVGMVTA

Specific function: Involved in the export of flagellum proteins [H]

COG id: COG1298

COG function: function code NU; Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the FHIPEP (flagella/HR/invasion proteins export pore) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788187, Length=671, Percent_Identity=39.1952309985097, Blast_Score=483, Evalue=1e-137,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 (rich media) [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006301
- InterPro:   IPR001712 [H]

Pfam domain/function: PF00771 FHIPEP [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74731; Mature: 74731

Theoretical pI: Translated: 4.58; Mature: 4.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIKKNDLFIGIYLLAAVLFFIISIPSWLLDILLAINILVALVVLFNSLFAKEVLDMASF
CCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PTMLLFTTIFRISLNVSSTKLILKNGYAGKVVDTFGKFVGSGNLVIGIIIFIILIIIQFI
HHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VINKGSERVAEVTARFTLDAMAGKQMAIDSDLNTGAITDKEAAERRKKLQQENSFFGSMD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GATKYVKGDATAGLIITGINLIGGIVMGMAYGGLTINDALSKYTILTIGDGLCSQIPSLL
CCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHH
ISLATGVLVTKASSEGELGDEIIGQLFSMDRVLLMVGAALILLGVTTPLPWYIFIPLGMA
HHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LIIYGRKLSAKAGETAIEESAEQEETEASEIRKPENVVSLLNVDPIELEFGYGIIPLADV
HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEECCC
NQGGDLLDRVVMIRRQIALELGAVVPIIRLRDNIQLNPNQYVIKIKGIQVSEGEILFDHY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEECCCEEEEEEECEEECCCCEEEHHH
MAMNPGYVEEEITGIPTFEPSFHLPAIWITESQRERAESLGYTVVDPPSIIATHLTEVIR
HHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHH
QHIAELLTRQDVQNLINNIKDNNTTLIEELVPKLMGVGEIQKVLQNLLEEGISIRDLVTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
FETLADHAAVTRDPDILTEYVRQALKRAISSKYFLTGEVTNVVTVDPAIEQEIMNSVKNT
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCC
EQGSYLSLDPERSKKIIEALGNELKKLEDMGKNPIVITSPIVRMYFRNLAKDYYKDIIVI
CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
SYNEVESNVELQSVGMVTA
EECCCCCCCCHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKIKKNDLFIGIYLLAAVLFFIISIPSWLLDILLAINILVALVVLFNSLFAKEVLDMASF
CCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PTMLLFTTIFRISLNVSSTKLILKNGYAGKVVDTFGKFVGSGNLVIGIIIFIILIIIQFI
HHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VINKGSERVAEVTARFTLDAMAGKQMAIDSDLNTGAITDKEAAERRKKLQQENSFFGSMD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GATKYVKGDATAGLIITGINLIGGIVMGMAYGGLTINDALSKYTILTIGDGLCSQIPSLL
CCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHH
ISLATGVLVTKASSEGELGDEIIGQLFSMDRVLLMVGAALILLGVTTPLPWYIFIPLGMA
HHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LIIYGRKLSAKAGETAIEESAEQEETEASEIRKPENVVSLLNVDPIELEFGYGIIPLADV
HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEECCC
NQGGDLLDRVVMIRRQIALELGAVVPIIRLRDNIQLNPNQYVIKIKGIQVSEGEILFDHY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEECCCEEEEEEECEEECCCCEEEHHH
MAMNPGYVEEEITGIPTFEPSFHLPAIWITESQRERAESLGYTVVDPPSIIATHLTEVIR
HHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHH
QHIAELLTRQDVQNLINNIKDNNTTLIEELVPKLMGVGEIQKVLQNLLEEGISIRDLVTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
FETLADHAAVTRDPDILTEYVRQALKRAISSKYFLTGEVTNVVTVDPAIEQEIMNSVKNT
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCC
EQGSYLSLDPERSKKIIEALGNELKKLEDMGKNPIVITSPIVRMYFRNLAKDYYKDIIVI
CCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
SYNEVESNVELQSVGMVTA
EECCCCCCCCHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8097015; 9384377 [H]