| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is ytgP [H]
Identifier: 23099755
GI number: 23099755
Start: 2344769
End: 2346388
Strand: Reverse
Name: ytgP [H]
Synonym: OB2300
Alternate gene names: 23099755
Gene position: 2346388-2344769 (Counterclockwise)
Preceding gene: 23099759
Following gene: 23099754
Centisome position: 64.63
GC content: 34.94
Gene sequence:
>1620_bases ATGTCAAAAATGGTACGTGGAACGATGCTTCTATCGGGGGCATCGTTTTTATCCAAATTCTTAGGAATGATTTATGTTAT TCCATTTTATTATATTGTTGGTGATGCAGGCGGGACTTTATTTACCTATGCTTACACACCTTATAGTATATTTATTAGCC TATCTACTGTAGGTATACCACTTGCAGTGTCAAAATTTGTATCTAAATATAATTCATTAGGTGACTATGAAACCGGTATG CGAATGTTTAAGGCAGGAAGTACATTAATGTTATTTACCGGACTTATGGCATTTATTATTATGTTCTCAACTGCTGACTG GATAGCTAGTTTGCAAATTAGAGGAGATAATGCAGCCATTACATCTGATGATGTTGCATTCGTAATACGTATGGTTAGTT TCGCTTTAATTATAATTCCTGCGATGAGTATAGTTCGTGGGTTTTTCCAAGGTCATCAATCCATGGGACCGACAGCTGTA TCGCAGGTAATTGAACAAATTGTTCGCATTCTATTTATTTTGAGTGGGTCATTCGTAATCGTTTACGTATTGAACGGTTC TAGAACAACAGCTGTTGGATTCTCTGCATTTGCTGCATTATTGGGAGCACTTGCTTCATGTGTTGTATTGTTTTTGTATT GGAAAAAAAGAAAAACACATTTACGAAAACAAATCGAAACACAACGGTATACGTATGATTTCAAAACAAATGATTTATTT AAAGAGCTTTTTCGATATGCAGGTCCATTTGTTTTAGTCGGGTTAGCTATACCGTTATATCAGTTAGTTGATCAGTTTAC TTTTGAACCAGCAATGAACGCAAGTGGAAGAGGAGAAGATGAATGGATACTAGCTTCTTCTGTAATTATGAACTATGGTC ATAAAATAATCATTATTCCAATGACAATTGCAACAGGTTTATCATTAGCAATGTTGCCTTCACTTACAGAAGCTTATACG AATAATAATCGAGAAACGTATACAAAGCTTTTAAATCAAGCCTTACAAGTCATTCTTGTATTAGTTGTGCCTGCTTCAGC AGGAATAGCAATGTTAGCTAGTGAAATTTATGGTTCGTTATTTACAATGGATGATCTAGGAGCAAGAGCAGAATTAATGG CTTGGTATGCACCAGTAGCCTTGTTATTTGGATTTATAACCGTAACTGCTGGAATGTTACAAGGTATCGATCAGCAGAAT TATGCGGTAATTAGTCTACTTACGGGACTATTTGTAAAAATACTTTTAAATAGTCAACTTATTCATATGTTCGGTGGAAA GGGTGCCATATTTGGTACAGCACTAGCCGCATTAATCGCAGTAATGATGAATTTATGGAGATTGAAAACGACCATTGATT TTTCGTTTAAACAAACGATAAAACGAACGATGCTTATTACAATATTTACTGCAATTATGTGTGTGGTAATCTTAACGTTA AAAGTAGTTTTTGGTATTTTCTTACCGTTCCAAGAAGAGAGATGGGCTGCAATTATTATGCTAATAATTGGAGTAACAGT TGGTGGCGGAGTCTACCTACTATTAGCTTATAAATCAACATTATTAGATCATGTGTTTGATGGAAAAGTACCGTTGCTTG GCAAATTTATGAAAAGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAGAAAGCTGTTTAAAAGTATGATAAAATTAATAAGGATTGAAATACATAGAAATGAAATATTTAACGAGTGAATCGTA ATTGTGGGTGAACTATTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAGAGAATGATGCGTCTAGATAAATTACTCTCTAACATGGGAGTTGGTTCTCGGAAAGAAGTGAAACAACTCCTAAAA TCAAAGCGAATAACAGTTAA
Product: spore cortex protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 539; Mature: 538
Protein sequence:
>539_residues MSKMVRGTMLLSGASFLSKFLGMIYVIPFYYIVGDAGGTLFTYAYTPYSIFISLSTVGIPLAVSKFVSKYNSLGDYETGM RMFKAGSTLMLFTGLMAFIIMFSTADWIASLQIRGDNAAITSDDVAFVIRMVSFALIIIPAMSIVRGFFQGHQSMGPTAV SQVIEQIVRILFILSGSFVIVYVLNGSRTTAVGFSAFAALLGALASCVVLFLYWKKRKTHLRKQIETQRYTYDFKTNDLF KELFRYAGPFVLVGLAIPLYQLVDQFTFEPAMNASGRGEDEWILASSVIMNYGHKIIIIPMTIATGLSLAMLPSLTEAYT NNNRETYTKLLNQALQVILVLVVPASAGIAMLASEIYGSLFTMDDLGARAELMAWYAPVALLFGFITVTAGMLQGIDQQN YAVISLLTGLFVKILLNSQLIHMFGGKGAIFGTALAALIAVMMNLWRLKTTIDFSFKQTIKRTMLITIFTAIMCVVILTL KVVFGIFLPFQEERWAAIIMLIIGVTVGGGVYLLLAYKSTLLDHVFDGKVPLLGKFMKR
Sequences:
>Translated_539_residues MSKMVRGTMLLSGASFLSKFLGMIYVIPFYYIVGDAGGTLFTYAYTPYSIFISLSTVGIPLAVSKFVSKYNSLGDYETGM RMFKAGSTLMLFTGLMAFIIMFSTADWIASLQIRGDNAAITSDDVAFVIRMVSFALIIIPAMSIVRGFFQGHQSMGPTAV SQVIEQIVRILFILSGSFVIVYVLNGSRTTAVGFSAFAALLGALASCVVLFLYWKKRKTHLRKQIETQRYTYDFKTNDLF KELFRYAGPFVLVGLAIPLYQLVDQFTFEPAMNASGRGEDEWILASSVIMNYGHKIIIIPMTIATGLSLAMLPSLTEAYT NNNRETYTKLLNQALQVILVLVVPASAGIAMLASEIYGSLFTMDDLGARAELMAWYAPVALLFGFITVTAGMLQGIDQQN YAVISLLTGLFVKILLNSQLIHMFGGKGAIFGTALAALIAVMMNLWRLKTTIDFSFKQTIKRTMLITIFTAIMCVVILTL KVVFGIFLPFQEERWAAIIMLIIGVTVGGGVYLLLAYKSTLLDHVFDGKVPLLGKFMKR >Mature_538_residues SKMVRGTMLLSGASFLSKFLGMIYVIPFYYIVGDAGGTLFTYAYTPYSIFISLSTVGIPLAVSKFVSKYNSLGDYETGMR MFKAGSTLMLFTGLMAFIIMFSTADWIASLQIRGDNAAITSDDVAFVIRMVSFALIIIPAMSIVRGFFQGHQSMGPTAVS QVIEQIVRILFILSGSFVIVYVLNGSRTTAVGFSAFAALLGALASCVVLFLYWKKRKTHLRKQIETQRYTYDFKTNDLFK ELFRYAGPFVLVGLAIPLYQLVDQFTFEPAMNASGRGEDEWILASSVIMNYGHKIIIIPMTIATGLSLAMLPSLTEAYTN NNRETYTKLLNQALQVILVLVVPASAGIAMLASEIYGSLFTMDDLGARAELMAWYAPVALLFGFITVTAGMLQGIDQQNY AVISLLTGLFVKILLNSQLIHMFGGKGAIFGTALAALIAVMMNLWRLKTTIDFSFKQTIKRTMLITIFTAIMCVVILTLK VVFGIFLPFQEERWAAIIMLIIGVTVGGGVYLLLAYKSTLLDHVFDGKVPLLGKFMKR
Specific function: May play a role in cell division, although it is not essential for growth [H]
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Note=Localizes at the septum [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002797 [H]
Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59444; Mature: 59313
Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 5.0 %Met (Translated Protein) 5.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 4.8 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKMVRGTMLLSGASFLSKFLGMIYVIPFYYIVGDAGGTLFTYAYTPYSIFISLSTVGIP CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEEEHHHCCHH LAVSKFVSKYNSLGDYETGMRMFKAGSTLMLFTGLMAFIIMFSTADWIASLQIRGDNAAI HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCC TSDDVAFVIRMVSFALIIIPAMSIVRGFFQGHQSMGPTAVSQVIEQIVRILFILSGSFVI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE VYVLNGSRTTAVGFSAFAALLGALASCVVLFLYWKKRKTHLRKQIETQRYTYDFKTNDLF EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHH KELFRYAGPFVLVGLAIPLYQLVDQFTFEPAMNASGRGEDEWILASSVIMNYGHKIIIIP HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEE MTIATGLSLAMLPSLTEAYTNNNRETYTKLLNQALQVILVLVVPASAGIAMLASEIYGSL EHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH FTMDDLGARAELMAWYAPVALLFGFITVTAGMLQGIDQQNYAVISLLTGLFVKILLNSQL CCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH IHMFGGKGAIFGTALAALIAVMMNLWRLKTTIDFSFKQTIKRTMLITIFTAIMCVVILTL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVVFGIFLPFQEERWAAIIMLIIGVTVGGGVYLLLAYKSTLLDHVFDGKVPLLGKFMKR HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SKMVRGTMLLSGASFLSKFLGMIYVIPFYYIVGDAGGTLFTYAYTPYSIFISLSTVGIP CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEEEHHHCCHH LAVSKFVSKYNSLGDYETGMRMFKAGSTLMLFTGLMAFIIMFSTADWIASLQIRGDNAAI HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCC TSDDVAFVIRMVSFALIIIPAMSIVRGFFQGHQSMGPTAVSQVIEQIVRILFILSGSFVI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE VYVLNGSRTTAVGFSAFAALLGALASCVVLFLYWKKRKTHLRKQIETQRYTYDFKTNDLF EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHH KELFRYAGPFVLVGLAIPLYQLVDQFTFEPAMNASGRGEDEWILASSVIMNYGHKIIIIP HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEE MTIATGLSLAMLPSLTEAYTNNNRETYTKLLNQALQVILVLVVPASAGIAMLASEIYGSL EHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH FTMDDLGARAELMAWYAPVALLFGFITVTAGMLQGIDQQNYAVISLLTGLFVKILLNSQL CCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH IHMFGGKGAIFGTALAALIAVMMNLWRLKTTIDFSFKQTIKRTMLITIFTAIMCVVILTL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVVFGIFLPFQEERWAAIIMLIIGVTVGGGVYLLLAYKSTLLDHVFDGKVPLLGKFMKR HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377 [H]