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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 23099388

GI number: 23099388

Start: 1960767

End: 1962395

Strand: Reverse

Name: yjbB [H]

Synonym: OB1933

Alternate gene names: 23099388

Gene position: 1962395-1960767 (Counterclockwise)

Preceding gene: 23099389

Following gene: 23099387

Centisome position: 54.05

GC content: 34.32

Gene sequence:

>1629_bases
GTGGAAATCGATGTACAAAAACTTATAATTGAATTTATCGGTGGGTTAGGAATATTCCTATTAGGTATTAAATATATGGG
TGATGGCTTGCAAAAATCGGCTGGGGATCGCCTTCGTAACATACTTGACCGGTTTACAAGCAATCCGTTCTTAGGAGTAC
TTGCTGGTATGATTGTAACTATACTTATCCAAAGTAGTTCTGGAACAACCGTATTAACTGTTGGACTAGTAAATGCCGGT
TTTATGACTCTAAGACAAGCAATTGGAGTTATAATGGGTGCCAATATAGGTACGACAGTAACTGCATTCATTATCGGTAT
CGATTTAGGTGAATATGCATTACTAATAATGGCTCTTGGTGCATTCTTATTATTCTTCTTTAAGAAACCAATTGTTAATG
CTGTGGGACAAGCTGTATTTGGTTTTGGTTCCCTATTCTTTGGTTTAGAATTAATGAGTAGTGGAATGTCCCCACTTCGC
TCTTTAGAAGCGTTTCATGAACTTACATTATCAATGAGTGATACTCCAATCTTAGGAGTAGTTATAGGAACAGTATTTAC
ATTAATTGTTCAAAGTTCATCTGCAACAATTGGGATTTTACAAGGATTATATTCTGAAGGTGCAATTGAATTAGGAGCAG
CCTTACCAGTCTTATTTGGGGATAACTTAGGAACAACTATAACTGCAATTATTGCTAGTATTGGTGCTTCAGTAGCTGCT
AAAAGAGCTGCATTAACTCATGTTACGTTTAACTTAATAGGGGCAACGATTTTCCTATTACTATTAATACCATTTACTAA
TTATGTGGCATTTTTACAAGATTGGCTAAATTTAAATCCTGAAATGACAATTGCATTTGGACATGGTAGCTTTAACATTG
CTAATACAGTGCTACAATTTCCATTTATTGCAGCTCTAGCATGGTTTGTAACAAAACTCATACCTGGCGATGACACAATT
ATTGAATATAAGCCAAAACACTTAGATCCAATATTTATCCAGCAGTCCTCTTCTTTAGCATTGGATCAAGCTAAAGCTGA
AGTTGTGAGAATGGGTGGATATGCTCATAAAGGTCTTGAAGAAACACATTCATATGTGACAACTCAAAATGAAAAGAATT
CGGAAATGGCGTTACAAATTGAAGGTGCTTTAAATAATCTAGATAGAAAAATTACGGACTATTTGGTTGAAATTGCATCA
ACATCTTTATCAGAAGTTGAAAGTGCCGAACACACAGCTCTAATGAATACAGTACGAGATATTGAACGTATTGGTGACCA
CTTTGAAAATATTGTTGAATTAATTGATTACAAAATGTCAAACAAAGTAATTCTAACAGATCAAGCTATGGAAAATTTAA
ATAACATGTTTGATCTTACTGCAATGACAGTAAAACAAGCAATTGAATCATTAGAATCAAAAGACAGAGAAGCAGCTCTT
GAAGTTATTCAAAAGGAAGATCAAATTGATAAAATGGAGCGGAAATTCCGTAAAAGTCATATCATACGTATGAATGAAGG
TCTATGTAATGGTTCAGCAGGGATTGTCTTTGTAGATATTATAAGTAATCTAGAAAGAATTGGTGATCATGCAGTGAATA
TTGCAGAAAATGTATTAGGCGAGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCAAAAGTACCTTTACAAACGGTATAATATCATCAATAATGGATAAGGCACAAAATTCTACAAGATATAACATAGGCCT
CAGAAGGGATGAAGTAACAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAAATCGTAGGGAGGTAAAACTTCTCTACGATTTTTTTGTGGGAAATAAATGTAATATAAATAATTTAATTTGCAG
ATGCTCTTGATGATTAATGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 542; Mature: 542

Protein sequence:

>542_residues
MEIDVQKLIIEFIGGLGIFLLGIKYMGDGLQKSAGDRLRNILDRFTSNPFLGVLAGMIVTILIQSSSGTTVLTVGLVNAG
FMTLRQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYALLIMALGAFLLFFFKKPIVNAVGQAVFGFGSLFFGLELMSSGMSPLR
SLEAFHELTLSMSDTPILGVVIGTVFTLIVQSSSATIGILQGLYSEGAIELGAALPVLFGDNLGTTITAIIASIGASVAA
KRAALTHVTFNLIGATIFLLLLIPFTNYVAFLQDWLNLNPEMTIAFGHGSFNIANTVLQFPFIAALAWFVTKLIPGDDTI
IEYKPKHLDPIFIQQSSSLALDQAKAEVVRMGGYAHKGLEETHSYVTTQNEKNSEMALQIEGALNNLDRKITDYLVEIAS
TSLSEVESAEHTALMNTVRDIERIGDHFENIVELIDYKMSNKVILTDQAMENLNNMFDLTAMTVKQAIESLESKDREAAL
EVIQKEDQIDKMERKFRKSHIIRMNEGLCNGSAGIVFVDIISNLERIGDHAVNIAENVLGEQ

Sequences:

>Translated_542_residues
MEIDVQKLIIEFIGGLGIFLLGIKYMGDGLQKSAGDRLRNILDRFTSNPFLGVLAGMIVTILIQSSSGTTVLTVGLVNAG
FMTLRQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYALLIMALGAFLLFFFKKPIVNAVGQAVFGFGSLFFGLELMSSGMSPLR
SLEAFHELTLSMSDTPILGVVIGTVFTLIVQSSSATIGILQGLYSEGAIELGAALPVLFGDNLGTTITAIIASIGASVAA
KRAALTHVTFNLIGATIFLLLLIPFTNYVAFLQDWLNLNPEMTIAFGHGSFNIANTVLQFPFIAALAWFVTKLIPGDDTI
IEYKPKHLDPIFIQQSSSLALDQAKAEVVRMGGYAHKGLEETHSYVTTQNEKNSEMALQIEGALNNLDRKITDYLVEIAS
TSLSEVESAEHTALMNTVRDIERIGDHFENIVELIDYKMSNKVILTDQAMENLNNMFDLTAMTVKQAIESLESKDREAAL
EVIQKEDQIDKMERKFRKSHIIRMNEGLCNGSAGIVFVDIISNLERIGDHAVNIAENVLGEQ
>Mature_542_residues
MEIDVQKLIIEFIGGLGIFLLGIKYMGDGLQKSAGDRLRNILDRFTSNPFLGVLAGMIVTILIQSSSGTTVLTVGLVNAG
FMTLRQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYALLIMALGAFLLFFFKKPIVNAVGQAVFGFGSLFFGLELMSSGMSPLR
SLEAFHELTLSMSDTPILGVVIGTVFTLIVQSSSATIGILQGLYSEGAIELGAALPVLFGDNLGTTITAIIASIGASVAA
KRAALTHVTFNLIGATIFLLLLIPFTNYVAFLQDWLNLNPEMTIAFGHGSFNIANTVLQFPFIAALAWFVTKLIPGDDTI
IEYKPKHLDPIFIQQSSSLALDQAKAEVVRMGGYAHKGLEETHSYVTTQNEKNSEMALQIEGALNNLDRKITDYLVEIAS
TSLSEVESAEHTALMNTVRDIERIGDHFENIVELIDYKMSNKVILTDQAMENLNNMFDLTAMTVKQAIESLESKDREAAL
EVIQKEDQIDKMERKFRKSHIIRMNEGLCNGSAGIVFVDIISNLERIGDHAVNIAENVLGEQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=538, Percent_Identity=23.4200743494424, Blast_Score=149, Evalue=4e-37,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58899; Mature: 58899

Theoretical pI: Translated: 4.61; Mature: 4.61

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEIDVQKLIIEFIGGLGIFLLGIKYMGDGLQKSAGDRLRNILDRFTSNPFLGVLAGMIVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ILIQSSSGTTVLTVGLVNAGFMTLRQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYALLIMALG
HHEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFLLFFFKKPIVNAVGQAVFGFGSLFFGLELMSSGMSPLRSLEAFHELTLSMSDTPILGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VIGTVFTLIVQSSSATIGILQGLYSEGAIELGAALPVLFGDNLGTTITAIIASIGASVAA
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRAALTHVTFNLIGATIFLLLLIPFTNYVAFLQDWLNLNPEMTIAFGHGSFNIANTVLQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH
PFIAALAWFVTKLIPGDDTIIEYKPKHLDPIFIQQSSSLALDQAKAEVVRMGGYAHKGLE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHH
ETHSYVTTQNEKNSEMALQIEGALNNLDRKITDYLVEIASTSLSEVESAEHTALMNTVRD
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IERIGDHFENIVELIDYKMSNKVILTDQAMENLNNMFDLTAMTVKQAIESLESKDREAAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EVIQKEDQIDKMERKFRKSHIIRMNEGLCNGSAGIVFVDIISNLERIGDHAVNIAENVLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EQ
CC
>Mature Secondary Structure
MEIDVQKLIIEFIGGLGIFLLGIKYMGDGLQKSAGDRLRNILDRFTSNPFLGVLAGMIVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ILIQSSSGTTVLTVGLVNAGFMTLRQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYALLIMALG
HHEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFLLFFFKKPIVNAVGQAVFGFGSLFFGLELMSSGMSPLRSLEAFHELTLSMSDTPILGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VIGTVFTLIVQSSSATIGILQGLYSEGAIELGAALPVLFGDNLGTTITAIIASIGASVAA
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRAALTHVTFNLIGATIFLLLLIPFTNYVAFLQDWLNLNPEMTIAFGHGSFNIANTVLQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH
PFIAALAWFVTKLIPGDDTIIEYKPKHLDPIFIQQSSSLALDQAKAEVVRMGGYAHKGLE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHH
ETHSYVTTQNEKNSEMALQIEGALNNLDRKITDYLVEIASTSLSEVESAEHTALMNTVRD
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IERIGDHFENIVELIDYKMSNKVILTDQAMENLNNMFDLTAMTVKQAIESLESKDREAAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EVIQKEDQIDKMERKFRKSHIIRMNEGLCNGSAGIVFVDIISNLERIGDHAVNIAENVLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EQ
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]