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The map label for this gene is ywcA [H]

Identifier: 23099098

GI number: 23099098

Start: 1683698

End: 1685200

Strand: Reverse

Name: ywcA [H]

Synonym: OB1643

Alternate gene names: 23099098

Gene position: 1685200-1683698 (Counterclockwise)

Preceding gene: 23099099

Following gene: 23099097

Centisome position: 46.42

GC content: 34.93

Gene sequence:

>1503_bases
ATGAATCTCACTTATTTCATTTTCTTTTTAGCTATTGTTGCAGGCACATTAATCATGACGCATTGGGCAGCAGAGCGAAG
TAAAACTACAGAACAATTTTATATTGCTAGTGGTAGTTTAACAGGATTTCAAAATGGACTAGCTATTGCTGGAGATTATA
TAAGTTCTGCTTCCTTTTTAGGTATTATTGGATTGATCGCCTACTACGGATTTGATGGTTTTTTATATGCAACTGGCTTC
CTTGTTTCCTACATTATTTTACTTCTACTAATTGCTGAGCCCGTACATAACTTGGGTACATATTCCGTTGGCGATGTAGT
AGCTTCACGATTTTCAGGAAGAAATATGCGGTTGTTTGTGGCAACTACTGGGATTATCATTTCGATCTTATATTTAATTC
CACAATTAGTAGCTTCTGGTTTATTAATACGATTGTTATTAGGAGTAGATTATATTTCTTCGGTTTGGATTATTGGTATT
CTCATGACTATTTATGTTGTGTTTGGGGGTATGGTTGCAACCTCATGGGTACAAATTATAAAAACGGTGCTCCTAATGTC
GGGTACATTGATGTTATTGTTTATTTTATTATCATGGATTAATTGGGATATCTCATTTTTAATAAATCAAGCATCCGTTA
ATAGTCCACTTGGTGAGGATTTTTTCTCACCTGGTAATTTACTACATAACAATATTGAAATGTTTTCTCTTGCGTTAACT
TTAATTTTGGGCACTTCTGGTCTTCCCCATATTTTAATACGTTTTCTTACCGTAAGAAATGCTAAAAATGCTCGTCTCTC
AGCAATTTCGGCGACTTGGTTAATAGGCTGTTTTTACTTAATGACATTAATTTTAGGAATTGGTGCCATTAGTCTTGTTA
GTTGGGACGCATTGACACAGTCGGATTCAACAGGAAATTTAACTGTGTTCTTATTAGCAGATGTGTTAGGCGGAGATTTT
CTTGTAGCTTTTGTTATGGCAATTGCATTTGCAACCATTATTGCAGTTGTTACGGGACTTATTTTTGCAGCCACTTCTTC
TTTTGCACATGATATTTACGTCCATTATTTGAATAAACAAGATGCCAGTGAAAAGAAAAAATTACTCGTCGCTCGATCAA
CAGCAGTAATTATCGGGGTTATTTCTATAGGACTTTCAATTAGCTTGGAAACTACAAACGTCGCATATTTAGTATCTTTA
ACTTTTTCGCTTGCTGCTTCTACGATATTTCCTTTATTAATTTTCACCTTTTATTGGAAGCGTTTCACAAAAATCGGAGC
CTATGTTGGATTATTTTCTGGGTTGATTATTTCTGGAGCATTATTTCTCTTCGGTCCTGAGGGAGCTAATTTAATTCGCC
TTAATAACCCTGGAATTGTTGCGATACCAATTGGATTTTTAGCTTGTATTGTTGGTTCTTTTCTAGACTCAAATGGTGAT
CGTGGAAATTATCAAGAAATGTTAATAAGGATTCACACCAGGATTGGAGTGAATAAATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTTTTTCCCACTTACTTGGATCATTGGTTGGCTTTATTGGAGAAGGATGAATAAATAGACATAAAGCTAAATTCAATA
TCCTTTAAAGGAGCCTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAACTAACGATAGTCTTATTCCAACGTATTGGTTTGTTATTATTAATGGCTTTTATCTTAACGAGAATACCTCGATTT
CGTTCATTGCTAGATAAAGA

Product: Na(+):solute symporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 500; Mature: 500

Protein sequence:

>500_residues
MNLTYFIFFLAIVAGTLIMTHWAAERSKTTEQFYIASGSLTGFQNGLAIAGDYISSASFLGIIGLIAYYGFDGFLYATGF
LVSYIILLLLIAEPVHNLGTYSVGDVVASRFSGRNMRLFVATTGIIISILYLIPQLVASGLLIRLLLGVDYISSVWIIGI
LMTIYVVFGGMVATSWVQIIKTVLLMSGTLMLLFILLSWINWDISFLINQASVNSPLGEDFFSPGNLLHNNIEMFSLALT
LILGTSGLPHILIRFLTVRNAKNARLSAISATWLIGCFYLMTLILGIGAISLVSWDALTQSDSTGNLTVFLLADVLGGDF
LVAFVMAIAFATIIAVVTGLIFAATSSFAHDIYVHYLNKQDASEKKKLLVARSTAVIIGVISIGLSISLETTNVAYLVSL
TFSLAASTIFPLLIFTFYWKRFTKIGAYVGLFSGLIISGALFLFGPEGANLIRLNNPGIVAIPIGFLACIVGSFLDSNGD
RGNYQEMLIRIHTRIGVNKS

Sequences:

>Translated_500_residues
MNLTYFIFFLAIVAGTLIMTHWAAERSKTTEQFYIASGSLTGFQNGLAIAGDYISSASFLGIIGLIAYYGFDGFLYATGF
LVSYIILLLLIAEPVHNLGTYSVGDVVASRFSGRNMRLFVATTGIIISILYLIPQLVASGLLIRLLLGVDYISSVWIIGI
LMTIYVVFGGMVATSWVQIIKTVLLMSGTLMLLFILLSWINWDISFLINQASVNSPLGEDFFSPGNLLHNNIEMFSLALT
LILGTSGLPHILIRFLTVRNAKNARLSAISATWLIGCFYLMTLILGIGAISLVSWDALTQSDSTGNLTVFLLADVLGGDF
LVAFVMAIAFATIIAVVTGLIFAATSSFAHDIYVHYLNKQDASEKKKLLVARSTAVIIGVISIGLSISLETTNVAYLVSL
TFSLAASTIFPLLIFTFYWKRFTKIGAYVGLFSGLIISGALFLFGPEGANLIRLNNPGIVAIPIGFLACIVGSFLDSNGD
RGNYQEMLIRIHTRIGVNKS
>Mature_500_residues
MNLTYFIFFLAIVAGTLIMTHWAAERSKTTEQFYIASGSLTGFQNGLAIAGDYISSASFLGIIGLIAYYGFDGFLYATGF
LVSYIILLLLIAEPVHNLGTYSVGDVVASRFSGRNMRLFVATTGIIISILYLIPQLVASGLLIRLLLGVDYISSVWIIGI
LMTIYVVFGGMVATSWVQIIKTVLLMSGTLMLLFILLSWINWDISFLINQASVNSPLGEDFFSPGNLLHNNIEMFSLALT
LILGTSGLPHILIRFLTVRNAKNARLSAISATWLIGCFYLMTLILGIGAISLVSWDALTQSDSTGNLTVFLLADVLGGDF
LVAFVMAIAFATIIAVVTGLIFAATSSFAHDIYVHYLNKQDASEKKKLLVARSTAVIIGVISIGLSISLETTNVAYLVSL
TFSLAASTIFPLLIFTFYWKRFTKIGAYVGLFSGLIISGALFLFGPEGANLIRLNNPGIVAIPIGFLACIVGSFLDSNGD
RGNYQEMLIRIHTRIGVNKS

Specific function: Unknown

COG id: COG4147

COG function: function code R; Predicted symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI310128183, Length=316, Percent_Identity=26.8987341772152, Blast_Score=80, Evalue=4e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1790503, Length=516, Percent_Identity=40.1162790697674, Blast_Score=364, Evalue=1e-102,
Organism=Escherichia coli, GI1787251, Length=439, Percent_Identity=21.8678815489749, Blast_Score=69, Evalue=9e-13,
Organism=Escherichia coli, GI87082237, Length=439, Percent_Identity=22.3234624145786, Blast_Score=62, Evalue=8e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001734
- InterPro:   IPR018212
- InterPro:   IPR019900 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54182; Mature: 54182

Theoretical pI: Translated: 8.17; Mature: 8.17

Prosite motif: PS00456 NA_SOLUT_SYMP_1 ; PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLTYFIFFLAIVAGTLIMTHWAAERSKTTEQFYIASGSLTGFQNGLAIAGDYISSASFL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHH
GIIGLIAYYGFDGFLYATGFLVSYIILLLLIAEPVHNLGTYSVGDVVASRFSGRNMRLFV
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
ATTGIIISILYLIPQLVASGLLIRLLLGVDYISSVWIIGILMTIYVVFGGMVATSWVQII
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTVLLMSGTLMLLFILLSWINWDISFLINQASVNSPLGEDFFSPGNLLHNNIEMFSLALT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LILGTSGLPHILIRFLTVRNAKNARLSAISATWLIGCFYLMTLILGIGAISLVSWDALTQ
HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SDSTGNLTVFLLADVLGGDFLVAFVMAIAFATIIAVVTGLIFAATSSFAHDIYVHYLNKQ
CCCCCCEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
DASEKKKLLVARSTAVIIGVISIGLSISLETTNVAYLVSLTFSLAASTIFPLLIFTFYWK
CCHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFTKIGAYVGLFSGLIISGALFLFGPEGANLIRLNNPGIVAIPIGFLACIVGSFLDSNGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RGNYQEMLIRIHTRIGVNKS
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLTYFIFFLAIVAGTLIMTHWAAERSKTTEQFYIASGSLTGFQNGLAIAGDYISSASFL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHH
GIIGLIAYYGFDGFLYATGFLVSYIILLLLIAEPVHNLGTYSVGDVVASRFSGRNMRLFV
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
ATTGIIISILYLIPQLVASGLLIRLLLGVDYISSVWIIGILMTIYVVFGGMVATSWVQII
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTVLLMSGTLMLLFILLSWINWDISFLINQASVNSPLGEDFFSPGNLLHNNIEMFSLALT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LILGTSGLPHILIRFLTVRNAKNARLSAISATWLIGCFYLMTLILGIGAISLVSWDALTQ
HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SDSTGNLTVFLLADVLGGDFLVAFVMAIAFATIIAVVTGLIFAATSSFAHDIYVHYLNKQ
CCCCCCEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
DASEKKKLLVARSTAVIIGVISIGLSISLETTNVAYLVSLTFSLAASTIFPLLIFTFYWK
CCHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFTKIGAYVGLFSGLIISGALFLFGPEGANLIRLNNPGIVAIPIGFLACIVGSFLDSNGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RGNYQEMLIRIHTRIGVNKS
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7934828; 9384377 [H]