| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is 23098715
Identifier: 23098715
GI number: 23098715
Start: 1305761
End: 1307140
Strand: Reverse
Name: 23098715
Synonym: OB1260
Alternate gene names: NA
Gene position: 1307140-1305761 (Counterclockwise)
Preceding gene: 23098716
Following gene: 23098714
Centisome position: 36.0
GC content: 34.49
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CGCTTATTTTTGTTTCAACCAAAAATTTTGATATATCATTTTCACGAGGTGAACAGCAGTGTATGTAGAACAACTTATAG AAAAATTAGGAATGGATAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORF A [H]
Number of amino acids: Translated: 459; Mature: 458
Protein sequence:
>459_residues MSNQVENLSNNTPQSEEKIDKNGLMKFLLPSLFGVFIFLFPIFDGETFNIPLGIITEFIINALTNWLPAIVTYTMVISTL FTVIQAIFKPAFIEKSALFKSLFNVSIFWTTLRVLGTIFAIMTFYNIGIAGIYSELTGQVMFGLLTSLIVWFFVASFLMP YLINFGVMEFIGSILRNVIKPLFTLPGRSAIDLLASWIGNVNVGVVITREQYENGFYTGREAAAIATCFSTVSLPFCLVI AGMLNVDHMFPVFYLTIVIAGVVSAMIIPRIPPISKIPNKYYTENHFQEDVPENMSKFKWGLLQAVKRAKSAGSFKDQLK QGNEIFLGIAFVLLPQVMAIGTLALVVAEFTSFFQVISQPIVPLLELMQLPEAAAAAPATIIGFIDMFLPAVLASGIEAE ITRFVIGALSLVQIIYLTEMGTLLLISKIPVKAWHLFVIFLQRTIISLPIIVLIAHMIY
Sequences:
>Translated_459_residues MSNQVENLSNNTPQSEEKIDKNGLMKFLLPSLFGVFIFLFPIFDGETFNIPLGIITEFIINALTNWLPAIVTYTMVISTL FTVIQAIFKPAFIEKSALFKSLFNVSIFWTTLRVLGTIFAIMTFYNIGIAGIYSELTGQVMFGLLTSLIVWFFVASFLMP YLINFGVMEFIGSILRNVIKPLFTLPGRSAIDLLASWIGNVNVGVVITREQYENGFYTGREAAAIATCFSTVSLPFCLVI AGMLNVDHMFPVFYLTIVIAGVVSAMIIPRIPPISKIPNKYYTENHFQEDVPENMSKFKWGLLQAVKRAKSAGSFKDQLK QGNEIFLGIAFVLLPQVMAIGTLALVVAEFTSFFQVISQPIVPLLELMQLPEAAAAAPATIIGFIDMFLPAVLASGIEAE ITRFVIGALSLVQIIYLTEMGTLLLISKIPVKAWHLFVIFLQRTIISLPIIVLIAHMIY >Mature_458_residues SNQVENLSNNTPQSEEKIDKNGLMKFLLPSLFGVFIFLFPIFDGETFNIPLGIITEFIINALTNWLPAIVTYTMVISTLF TVIQAIFKPAFIEKSALFKSLFNVSIFWTTLRVLGTIFAIMTFYNIGIAGIYSELTGQVMFGLLTSLIVWFFVASFLMPY LINFGVMEFIGSILRNVIKPLFTLPGRSAIDLLASWIGNVNVGVVITREQYENGFYTGREAAAIATCFSTVSLPFCLVIA GMLNVDHMFPVFYLTIVIAGVVSAMIIPRIPPISKIPNKYYTENHFQEDVPENMSKFKWGLLQAVKRAKSAGSFKDQLKQ GNEIFLGIAFVLLPQVMAIGTLALVVAEFTSFFQVISQPIVPLLELMQLPEAAAAAPATIIGFIDMFLPAVLASGIEAEI TRFVIGALSLVQIIYLTEMGTLLLISKIPVKAWHLFVIFLQRTIISLPIIVLIAHMIY
Specific function: Unknown
COG id: COG3314
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011642 [H]
Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50966; Mature: 50834
Theoretical pI: Translated: 6.53; Mature: 6.53
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNQVENLSNNTPQSEEKIDKNGLMKFLLPSLFGVFIFLFPIFDGETFNIPLGIITEFII CCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHH NALTNWLPAIVTYTMVISTLFTVIQAIFKPAFIEKSALFKSLFNVSIFWTTLRVLGTIFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMTFYNIGIAGIYSELTGQVMFGLLTSLIVWFFVASFLMPYLINFGVMEFIGSILRNVIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLFTLPGRSAIDLLASWIGNVNVGVVITREQYENGFYTGREAAAIATCFSTVSLPFCLVI HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGMLNVDHMFPVFYLTIVIAGVVSAMIIPRIPPISKIPNKYYTENHFQEDVPENMSKFKW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLLQAVKRAKSAGSFKDQLKQGNEIFLGIAFVLLPQVMAIGTLALVVAEFTSFFQVISQP HHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVPLLELMQLPEAAAAAPATIIGFIDMFLPAVLASGIEAEITRFVIGALSLVQIIYLTEM HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GTLLLISKIPVKAWHLFVIFLQRTIISLPIIVLIAHMIY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure SNQVENLSNNTPQSEEKIDKNGLMKFLLPSLFGVFIFLFPIFDGETFNIPLGIITEFII CCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHH NALTNWLPAIVTYTMVISTLFTVIQAIFKPAFIEKSALFKSLFNVSIFWTTLRVLGTIFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMTFYNIGIAGIYSELTGQVMFGLLTSLIVWFFVASFLMPYLINFGVMEFIGSILRNVIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLFTLPGRSAIDLLASWIGNVNVGVVITREQYENGFYTGREAAAIATCFSTVSLPFCLVI HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGMLNVDHMFPVFYLTIVIAGVVSAMIIPRIPPISKIPNKYYTENHFQEDVPENMSKFKW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLLQAVKRAKSAGSFKDQLKQGNEIFLGIAFVLLPQVMAIGTLALVVAEFTSFFQVISQP HHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVPLLELMQLPEAAAAAPATIIGFIDMFLPAVLASGIEAEITRFVIGALSLVQIIYLTEM HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GTLLLISKIPVKAWHLFVIFLQRTIISLPIIVLIAHMIY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA