| Definition | Exiguobacterium sp. AT1b, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012673 |
| Length | 2,999,895 |
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The map label for this gene is 229918303
Identifier: 229918303
GI number: 229918303
Start: 2550315
End: 2554352
Strand: Direct
Name: 229918303
Synonym: EAT1b_2587
Alternate gene names: NA
Gene position: 2550315-2554352 (Clockwise)
Preceding gene: 229918302
Following gene: 229918311
Centisome position: 85.01
GC content: 35.51
Gene sequence:
>4038_bases ATGTCAAACCAATTTTATGAGTATGTAACGAAAAAAATAAATGGCCATTTTTTAGTAAATACGCCTAAGCCTGGAGATAA GTATTATTTGCAACTCGAAGAAGAGGGCCATGTTCAATATTTAAAGGAATATCTCGAGAAGGAAGCAAAAGATCAGGTTA AAGCTTTTGAATATAAATTAAACGGAGTTACTGAATATGAAACGTTTACGATTGACTACGGGACAAGTGAGTTAATCATT GCTACTCAAAGCGAAGGAATTCAACCTGACTTCTTCGTTAAACTTCGAAATTTAGTTAGTGAACAAGAAGCTGAAGGTTT AAATCGCTCATTGCTTGTTATTTATCACGGGCAACTTGATAGTATTGATGGTGGTGGAGCAAATCTTCAAAAAGAAGGAA TGCCGTTAAATCCTCAAAAGATTTTAGAAGAACTTAAGCATGAATTGAAGCAGATGTCGGACAATAAAGGCGCATTGGTT GAAGTGATTAATTTTCACTTGAAGGAAATCGAAGAAGAGTTCAACTCATTTAAAGGAGTATCATTCTTTGATTTTGAAGA AATTCTTTCTCTCATGCAAAAAACAGAACTTTCAAAGAAAGATTTTCTAAAGTTAAGGTTCTTCCACGACCAGGAGCTTG ATTCGTTTATCCAAACGTCATCCAAAAAAGAGATTCGTGAACGACTTCGTGAGAACCGAGATTTATATGAATTTGTACAA GAGAGTCATTTTAATGAAACGACTGAGGCGCAATTGCCGAAAAAGTTTAACGAGCAAGGTGTCAATAAACTTAAACATGA TCATTGGAATGAATTAACATTGCAAGAAGTAATTAAACTCAAAGCAGAAAAGAATAAAAAAGTATTTGAGCTTGATGAAG TTACAAAAGTTAATGAGCATTCCTCGGTAGTGGTTTGGGATCGGCCACATAAAATGACAAAGACAGGAAAACGCATACGT TACATTGCAATTTTTAATCCTTCTCATGAAAGAGAAATTAATCTAAAGTTTAAATATCTTATTGAGGGTAAGGGTGTTCG GAAAAGCTTAGAACAGTCGCAAGTCAAAATTGAGTATTGTAATCCTTTACTTGAAGTAAATTCAAATGTGAAGACAAACA ATCTTTATTTGACACTAACTTCAAATCAAGTTCAAAATACTGCGCAATGTACTGTAAAGTACAAAGTAAAAAATGAAAGT ACATTATATTCAGAACTAAATATTATGATTTTCCCATTCTCTAATGAAGTTCTTAAGGATTATGCGGGAACTTATGAAGT GAAGCGTTTAACTGGGAACGGTACCGAGTATTTGACACTAGGCAATAAAGAAGGTGAATTACGTTTAGGTGACGGCTCAC AAGAACCAATTTACCAAGATCAAGCTCTCGTTAAAGTATCCGAGGAGCCTAATATTACGTATCACTTTGATCAGGATTTG TTTGAAGACGATCAGTTTATGCAGCTAGTTGTTGGAGAGTCGCAACCGATTAATATTAAATTAAGTGTCGATGCATCAAA ACCGCATCCGATTCCGAATATACGGTTGTATAAAGAAAAACGTGAGAAGCGAGCATCAATTGTACTGAGTGCGGATGAGA AATTGATTTTGAAGAATCAAATTTACTATCCCCAAAACGAGTATAAAGACTTCTTGGACTACGAAATGGAATGGGTCAAT CAAAGTATGCAAACTGCTGTTCTTTCGGCAGGCGTCCTCAGTCCTATTGAATTGGAGTTTAAAGCATATTATGAATTAAG AGAAGCGTATAATCTGTTCTTAAACCACTTCAAAATTAAAAAAACTGTACCCATGTTGGCTTATTGGGATGATGAATACA AACGAGTTGCTTTAAATTATGTTCAAGCGTATGTAAAAGCGATTGAATCGATTCAAGAAGCAGATCGATTGTTTGAAGTG GGGCATTCAATCTTAAAATTAGGTGTCTTATATAATCAAAAAGAGCAAATTGTTTACTTTACTCCATTCCATCCGATTAA TGTTGCATTTCAATTAGAACTTAATACGCAACTTGGAGAAGAAGAGATCTCGGAAAGTGTACTGAAACGTCTACGAGCCG ATGCATTAGCCCCATATCTATGGTTTGAAGGTAAAACTTACAAGGCAGAATCCCAATCAGATTTGCCAGAGTGGATGGTG TATCGAGTAAAAGAAGAGGTTGTCGTGGCTGAAGCAGACCGCTTTTTATCTGAAGTAGTCAAAGAAAAGCTAAATCAGTT TGTCGATCATTTTACGTCACTCTTTAATCAGACAAATCAAATCGCTAGAGCACCACTTTATTTAAATGTAATTGAAATTC GTAATGATGAGATGGTACTGAAAGGTATAGTTGAATGGATGTTCCGTCAATTAAAGAATAGTTATGAGAAAAATCGAGAT ATAGTAATCCCCGTAGAAGTGAAACTTTATTCTGATTCAGGTCGATATCGAAGTGCTTTCGATCAATTTGCTGCAAAAGA TTTCATGGAAGATGACTGGGAACAGTTCGAATATCTGTACGCACTCATTCCGAAAAACTTCATTCTCTCCCCGCAAGAAG TAGCGGAGAAAATTCAGTCGCTGATTAATCACTACCACATTCAAAATAAATCTTCTAATGATTTTGAATATGCTCATATT AGTTTCTATAAGATGAGTGGTGAAGAACAAGTAATCACAGACAAAATGGAGTATATCAAGAGTGGTAATGCCATGAATGG TTTGTATTCGACACTTGCACCGACAGTCAAAGATGGTCAGTTTAGTATGGGGTTTGGTCTTCGAGGTTATGCAATTGAGG AAGAAGACTTGTTATTACGATGTGCCAAATCATTTAATGAATTGAACGTACACATGAAAGATAACGGGAGTAGCTCATTT GCACATGGCGTAACAGCACTAGCTAGTATTACAGATGCACGCGATAGTTATAAGTTACAAAATATCTATGAAAGTTCACA CTGGGTTACATTAATCGAACCTACTGTCGACTTAGGCTATTTTTCTTCTAAGCAAGGAAACCCGGATAATGAATTAATTA TCATTCATTATAATGATCAATCTTCTTCTTACCGATATGATGCTATTACAGTTACGAAGAAAACAGCACAATATCAGGCA GTGATTAAAGATTACTTGAATCATGAAAAACCGGATTTGAATACAGATGAGAGTATTAAAGAAATCATTCAAACGTTCAA TGTGATCAACGGAGAATGGCTACTTTCAATGATTCAACAAGGTTTAAGTAATGAAACAGCTCGTAACGTGCATAAGAGTC GTGAAAAATTCAGCTTATTGGCAGCCGTTAAATATTCATTGGCGATGTTTTCAACCGATGATATTACTTGGGTCCCAATC TCTCTTGAGGAAATTTTACGAGTGGCGAAAGCAATTGGGTTAAACCACGCGAATTCACCTTTCACTGTGAAAGCGTTAGG TAAGTCAGGTAGTTACTCAGATGATTTACTGTTGATTGGGATGCAGGAAACGGACGGTAAGTTAAAAATGCACTTCTATC CAATTGAAGTAAAAATCGGTAGAAACTTGAGTAATGTCATAGATAAAGCAAGAAACCAAGTTGTTCGAACGAAAGCTCTC TTTGATTTAGAATTAGGTGTGGGGGAAGCAGAAACTACATTCTCTCAACAATACTATCGTATGTTCTTTGCACATCTTTT CTTAGCAAATGCTAAAAAACTATTTGAAGGAAAGTTGTGGAGCGAGAGAAAACAAAATTATGACTTTGAACAGGAAAGAC TTTCCGTTATCGAAAGACTGATGAAGGGCGATTATGAAATTTCGAATGAATTAACCGAGTACTTTAATAAAGGTGTTGTC GTTTCATTTAGAACAGAAGAAACAACTTCGTCTATTGAACGCGTTGAAGACGATATTCTGTTGCTTAATTTACCAGAGCA GTATGGTATAAGTGGTGGATCGTATTCGATTGAAGAAATCCGACAATCTATTGTAGATGGGAAAAAGGATATTCCAAGAG AAGAAATGCTTGAATCCTTCAAAATTAATAATATTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAGGCATCAACTTTGATAACGAATCATCAACTGCCCTTTTACAACTTCTAGAAAAAATTAATGTTATCGATAAGAAGAG CGATAGTGGGGAGGCGCAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTTAAAACGACCGGCTTAAATTTAATTTAAGCCGGTCGTTTACTTACAGTTCTTTGAAAATCTCTAAGTCTTTTAGTTC AATGTTTGACGATAGTGAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1345; Mature: 1344
Protein sequence:
>1345_residues MSNQFYEYVTKKINGHFLVNTPKPGDKYYLQLEEEGHVQYLKEYLEKEAKDQVKAFEYKLNGVTEYETFTIDYGTSELII ATQSEGIQPDFFVKLRNLVSEQEAEGLNRSLLVIYHGQLDSIDGGGANLQKEGMPLNPQKILEELKHELKQMSDNKGALV EVINFHLKEIEEEFNSFKGVSFFDFEEILSLMQKTELSKKDFLKLRFFHDQELDSFIQTSSKKEIRERLRENRDLYEFVQ ESHFNETTEAQLPKKFNEQGVNKLKHDHWNELTLQEVIKLKAEKNKKVFELDEVTKVNEHSSVVVWDRPHKMTKTGKRIR YIAIFNPSHEREINLKFKYLIEGKGVRKSLEQSQVKIEYCNPLLEVNSNVKTNNLYLTLTSNQVQNTAQCTVKYKVKNES TLYSELNIMIFPFSNEVLKDYAGTYEVKRLTGNGTEYLTLGNKEGELRLGDGSQEPIYQDQALVKVSEEPNITYHFDQDL FEDDQFMQLVVGESQPINIKLSVDASKPHPIPNIRLYKEKREKRASIVLSADEKLILKNQIYYPQNEYKDFLDYEMEWVN QSMQTAVLSAGVLSPIELEFKAYYELREAYNLFLNHFKIKKTVPMLAYWDDEYKRVALNYVQAYVKAIESIQEADRLFEV GHSILKLGVLYNQKEQIVYFTPFHPINVAFQLELNTQLGEEEISESVLKRLRADALAPYLWFEGKTYKAESQSDLPEWMV YRVKEEVVVAEADRFLSEVVKEKLNQFVDHFTSLFNQTNQIARAPLYLNVIEIRNDEMVLKGIVEWMFRQLKNSYEKNRD IVIPVEVKLYSDSGRYRSAFDQFAAKDFMEDDWEQFEYLYALIPKNFILSPQEVAEKIQSLINHYHIQNKSSNDFEYAHI SFYKMSGEEQVITDKMEYIKSGNAMNGLYSTLAPTVKDGQFSMGFGLRGYAIEEEDLLLRCAKSFNELNVHMKDNGSSSF AHGVTALASITDARDSYKLQNIYESSHWVTLIEPTVDLGYFSSKQGNPDNELIIIHYNDQSSSYRYDAITVTKKTAQYQA VIKDYLNHEKPDLNTDESIKEIIQTFNVINGEWLLSMIQQGLSNETARNVHKSREKFSLLAAVKYSLAMFSTDDITWVPI SLEEILRVAKAIGLNHANSPFTVKALGKSGSYSDDLLLIGMQETDGKLKMHFYPIEVKIGRNLSNVIDKARNQVVRTKAL FDLELGVGEAETTFSQQYYRMFFAHLFLANAKKLFEGKLWSERKQNYDFEQERLSVIERLMKGDYEISNELTEYFNKGVV VSFRTEETTSSIERVEDDILLLNLPEQYGISGGSYSIEEIRQSIVDGKKDIPREEMLESFKINNI
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 156172; Mature: 156040
Theoretical pI: Translated: 5.06; Mature: 5.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNQFYEYVTKKINGHFLVNTPKPGDKYYLQLEEEGHVQYLKEYLEKEAKDQVKAFEYKL CCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE NGVTEYETFTIDYGTSELIIATQSEGIQPDFFVKLRNLVSEQEAEGLNRSLLVIYHGQLD CCEEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCC SIDGGGANLQKEGMPLNPQKILEELKHELKQMSDNKGALVEVINFHLKEIEEEFNSFKGV CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SFFDFEEILSLMQKTELSKKDFLKLRFFHDQELDSFIQTSSKKEIRERLRENRDLYEFVQ CEECHHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHH ESHFNETTEAQLPKKFNEQGVNKLKHDHWNELTLQEVIKLKAEKNKKVFELDEVTKVNEH HHCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHCCCCC SSVVVWDRPHKMTKTGKRIRYIAIFNPSHEREINLKFKYLIEGKGVRKSLEQSQVKIEYC CEEEEECCCCCHHCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHCEEEECC NPLLEVNSNVKTNNLYLTLTSNQVQNTAQCTVKYKVKNESTLYSELNIMIFPFSNEVLKD CCHHHCCCCEEECEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECEEEEEECCHHHHHH YAGTYEVKRLTGNGTEYLTLGNKEGELRLGDGSQEPIYQDQALVKVSEEPNITYHFDQDL 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PDB accession: NA
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References: NA