Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

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The map label for this gene is 227828804

Identifier: 227828804

GI number: 227828804

Start: 2397726

End: 2398979

Strand: Direct

Name: 227828804

Synonym: M1425_2578

Alternate gene names: NA

Gene position: 2397726-2398979 (Clockwise)

Preceding gene: 227828801

Following gene: 227828805

Centisome position: 91.91

GC content: 35.09

Gene sequence:

>1254_bases
ATGATTAAGTATAAGGATACCAGATGGATGTATCTAGTGATACCTTATAATGCTTCAATAGGTCCTTTATCCACGTTAGT
AACATTACAGATTCTTTCGCTTGGAGGGAATGCAATTGACGTAGCATACGCTATCTCCTTAAGTAACGCTGTTCTAATTC
CAGCTTCAATAATATGGGGATTCCTAGCTGACAAGATGGATAGAAAGAAACAAATATTGCTAAGCTTAGCTGGAGTTTCA
ATTCCCCTTATTGTAATGCCCTTCATGAAAAGTATCTCATTAATTACCTTAAATTACGCTTTAATTACATTTATGAGCAC
TGCGTCAACAACACCATTCAATTTACTAATAATGGAGTCCGCTGAGAAAAAACACTGGGGCTCTCTCTTCTCAAGATTCT
CTTTATTCTCCTCTATAGGTGTCTTGCTAGGATTGGTTGTTTCGACTTTTCTAGTAATTCTCTTAAGAATTGACCAAATA
GAGGAAATACTGGGATTTTCAGTACTGGCTACGTTAATTGCAAGCGTAAAAATACTACCTAAACCCATAATTACATTTGA
AAGGGCAGCTATTATACACAATAAGGAATCGTTTTTGACTAGAATGAGACACTTGCCAATGATGTTCCTTCATCTACCTA
ATATTCATCACTTTAAAATGTTTTCCGTGAGTAGATTATTTAGGAAACCCATTAATTACATTCCTCTACTTTACTTAGGA
ATAGTGTTATTTTACATAAGCAGCGGAATATTCAATACTGTATATCCAGCAGGTTTGTACGTGAAGGGATTAAATAAATC
TGAAGTGTTGGCTGTAATAAGCGTTGGTATGATATTTCAAATTTTAGGATTTAGGATATCCTCAACGTTACTGGAGAATA
AAGATGAGAAAGGATTAGCATACATTTCACTTATCCTGAGAGGTGTGTCATACGTTTTACTTGGTATATTTGCCCAACTA
TTTTTAGGTATTCCAATATTAATCTCTGGGTTAATATTCTATCCATTGGCAGCCGGAATTGCCTATGCAGTATTTTACTC
CTCATCTACTACCTTAATATTCAAAATTGTTGGGGAGAGAAGGCAAGGAACTGGACTTGGAGTTTATAGTACAGTAGTAG
GGATATCATTATTTGTGGGGTCACTTTTATCTGGTTATATCACGCACTATATTAGTTACGGTATAGATTTTATAGTTGCA
GGGATTATACTCTTAATTGCTTCATGGATATTTAGATATCTGGAGGAAGGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTTTCATATTTAAAAAATTTAAACTTATACAAGGATCTACTTTTCGTTAAACTTTACAATAAAACTTTTAAACATTA
CATTGTGGCTAAAACAAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTATCTTAATTTTTATTAAAAATAGACTAATATTTAAACTTTATGACATTTTATCGACGTAAACTTTAGGACGATTTT
ATATGTTATTTTGTTAAACT

Product: major facilitator superfamily MFS_1

Products: NA

Alternate protein names: Permease Facilitator Superfamily; Facilitator Superfamily Permease; Facilitator Superfamily Protein; Transporter Facilitator Family

Number of amino acids: Translated: 417; Mature: 417

Protein sequence:

>417_residues
MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS
IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI
EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG
IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL
FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA
GIILLIASWIFRYLEEG

Sequences:

>Translated_417_residues
MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS
IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI
EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG
IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL
FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA
GIILLIASWIFRYLEEG
>Mature_417_residues
MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWGFLADKMDRKKQILLSLAGVS
IPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMESAEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQI
EEILGFSVLATLIASVKILPKPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG
IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLAYISLILRGVSYVLLGIFAQL
FLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGERRQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVA
GIILLIASWIFRYLEEG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46230; Mature: 46230

Theoretical pI: Translated: 10.04; Mature: 10.04

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWG
CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHEEEEECCCCEEHHHHHHHH
FLADKMDRKKQILLSLAGVSIPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMES
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEC
AEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQIEEILGFSVLATLIASVKILP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLA
HHHHHHHCCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
YISLILRGVSYVLLGIFAQLFLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCC
RQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVAGIILLIASWIFRYLEEG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIKYKDTRWMYLVIPYNASIGPLSTLVTLQILSLGGNAIDVAYAISLSNAVLIPASIIWG
CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHEEEEECCCCEEHHHHHHHH
FLADKMDRKKQILLSLAGVSIPLIVMPFMKSISLITLNYALITFMSTASTTPFNLLIMES
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEC
AEKKHWGSLFSRFSLFSSIGVLLGLVVSTFLVILLRIDQIEEILGFSVLATLIASVKILP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KPIITFERAAIIHNKESFLTRMRHLPMMFLHLPNIHHFKMFSVSRLFRKPINYIPLLYLG
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IVLFYISSGIFNTVYPAGLYVKGLNKSEVLAVISVGMIFQILGFRISSTLLENKDEKGLA
HHHHHHHCCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
YISLILRGVSYVLLGIFAQLFLGIPILISGLIFYPLAAGIAYAVFYSSSTTLIFKIVGER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCC
RQGTGLGVYSTVVGISLFVGSLLSGYITHYISYGIDFIVAGIILLIASWIFRYLEEG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA