| Definition | Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012588 |
| Length | 2,608,832 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 227827390
Identifier: 227827390
GI number: 227827390
Start: 1054920
End: 1056179
Strand: Direct
Name: 227827390
Synonym: M1425_1109
Alternate gene names: NA
Gene position: 1054920-1056179 (Clockwise)
Preceding gene: 227827388
Following gene: 227827396
Centisome position: 40.44
GC content: 34.68
Gene sequence:
>1260_bases ATGAGCATTTCAACAGTAGATCCACTTGAGGAAATATTAAAACCAGAAAACTTAAGTAGATTGTCCAAGATAGTCGACGC GTTACCCACAATAGAGAAATTAACTGATAAGATAACGGAGATGGATAAGAAAGGGCAAGTGGACTTCTTACTTTCATTAT TTGATCAAACAGTTTCCATACTTGATGCAGTACAAAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATATCCTTCGGAATGGACCAA CTACCAAAAATACAAGCAATATGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAGCTTTACAGTTATTATCACAGATAGA CTTAGACTCTACACTTACAGCGTTAGAGAAATTATCTCCCGTAATAAAGAAGTTAACAGATGAAAAAGCGTTAAAGATAC TTGATCAAATAGACTATGACTCTTTAATAGATAGTACTTCGAAATTAGTACCAATTCTTACGAAACTTGCAAATGAGAAG ACTGTTAAGACTATTGAAGCCTTAGATATCGATATGTTGCTTAACCTAGCGTCGAAGATGGCTCCTACACTAAATAAACT TGCATCATTAATGGATCAGATGTCTAGCAAAGGTCAAATTGACATGTTAGTTAACTTAATGGAACAAGGAATATCACTAC TTGATGCAGTACAAAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATATCCTTCGGAATGGACCAACTACCAAAAATACAAGCAATA TGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAACTCTAAATTTAATACAAAGTTTAGATCTGGATGCTATGTTTAACGC ATTAGAAGCCTTAACACCGATCATGAAACAACTAACAAGCGATAAGGCAATAAAGATCATTCAGCAATTTGATATTGCGT CTTCACTTAGTGCCCTAGAAGCAGCAATGCCACTATTAAAGAAACTAACAGATGAAAAGACTGTTAAAATAATATCGCAA GTAGACGTTAATTCATTACTTATGTTAACAAATAAGTTGGTTGAAATGCAGAAGTCTGGTAGTTTAGATAGACTAATGCA ACTATTAGAGATAATGTCTGATCCACAATTCGTTAACGGACTAGTTATGGTCATGGATAAGTTCTCTAAGGCGTTCAAAG CTTGGGTTAATGATGTGCCAAACGTAAGGCCAGTTGGAACTATGGGATTATTGAGAATTACAAGCGATAAAGACGTTAGC TATACTTTAGGATTAATGCTTGAATTAGCTAAAGAAATCGGAAAGAATTTTAAATCTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAGTATTTCTTTTAATTTTCCAAATGCACTTGGTGAGATAACTGCAAACATATTAAATATATATAAACATGCCGGATTAA TTAATTTAGGGTATAGTAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAATTTTTTCTATTCTTTTTATCTCTCCTATATCCTTAGAAAATGTAAGTGGTTCATAAGAAGTTCTTCTACCTACTA ATCCTTCTAAAAATGAAACC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 418
Protein sequence:
>419_residues MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEK TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ VDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVS YTLGLMLELAKEIGKNFKS
Sequences:
>Translated_419_residues MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEK TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ VDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVS YTLGLMLELAKEIGKNFKS >Mature_418_residues SISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQL PKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSPVIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKT VKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIW PILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQV DVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNGLVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSY TLGLMLELAKEIGKNFKS
Specific function: Unknown
COG id: COG2427
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46589; Mature: 46458
Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 5.0 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 4.8 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI CCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSP HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH VIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKTVKTIEALDIDMLLNLASKM HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH APTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAMPLLKKLTDEKTVKIISQVDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSYTLGLMLELAKEIGKNFKS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure SISTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKLTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI CCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDLDSTLTALEKLSP HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH VIKKLTDEKALKILDQIDYDSLIDSTSKLVPILTKLANEKTVKTIEALDIDMLLNLASKM HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH APTLNKLASLMDQMSSKGQIDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDAMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASSLSALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAMPLLKKLTDEKTVKIISQVDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIMSDPQFVNG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LVMVMDKFSKAFKAWVNDVPNVRPVGTMGLLRITSDKDVSYTLGLMLELAKEIGKNFKS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA