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The map label for this gene is yvcS [H]

Identifier: 226947500

GI number: 226947500

Start: 318795

End: 320765

Strand: Direct

Name: yvcS [H]

Synonym: CLM_0334

Alternate gene names: 226947500

Gene position: 318795-320765 (Clockwise)

Preceding gene: 226947499

Following gene: 226947501

Centisome position: 7.67

GC content: 24.1

Gene sequence:

>1971_bases
ATGACAATTAATAATATAGCTATTAAAAATATTAAAGGAAACTTAAATAAATATGCTATGTATTATTTGAGTAATGTAAT
AGTCGTAACTATATTTTTTATATTTGCTAATTTTATATATAATCCAGGTGTTAGTAGCGGGAATATTAGTGACAAGACTA
TAAGTGAAGTTGCCAGTAAATTAATGTATTTGTGCGAGTTTGTAATAATAATTTTTACTTTTATATTCTCAAATTACTCA
ATAACTACTTTTTTAAAGTCTAGAGAAAAAGAATTTGGACTTTTATCAATGTTTGGTTTAACTAAAACTCAAATAAGAAG
ATATGTTATGTTTGAAAATATAGCAATTTCAATTATTTCTATTATAACAGGAATTTTCTTTGGAATTTTATTTTCAAAAT
TATTTTTCATGGCCCTGTCTGTAATTTTAGATTTAAATGCAGAAATTCCATTTTTAATATCAAGTAAAGCTGTAAAAATA
ACAATATTAAGTTTTTTAGTAGTTCTTAATCTTATAAGTTTTATTACAAGTTTTAAAATAAAAAATAATAACATTGCAGA
ATTATTAAAAGGTGAAAGAATACCTAAGACAACACCAAAATTTTCCAAAATAAAAGCAATACTAGGAATAGTACTTATAA
TTTCTGGATATATTGTAGGGATATTTTCTGGTACAGCTATTATATCTACAATGATTCCAATACTTATAGTTGTAATAATA
GGAACTAAACTTTTGTTTTCTCAGTTTAGTGTGTTTTTCACAAATAAGCTTCAAAATAATAAGGGCATTTATTATAAAGG
GATAAATTTAATAACCTTATCTCAAATTATATATAAATTAAAAGATAATGCAAAGGTATTGTTTATTACTTCAATACTTA
GTGGAATTACCCTTGCATCAGCTATATCAGTTTATTCTCTACAAAGGGTAAGTTTATCTTCAATGGAAGAGAATTGTCCA
CAGGATATAGGAATCATAGAACAGGGGATAAATTCTCATAAAGTTATAGCTAATGGAAAAGTTGAAGATATATTAAAAAA
ATACAAATTCGATATACAATATAAAAATAAAATAGAATTAATAAAAGCAAAAAATAATGATATGGTAAAAGAAAATAAGA
AAAATCCCTATAATATAAAAATAAATAAAAATGATTTTAATATAATGTCTCAAAATAGCTTTAATGAGCTTGCAAAACAG
TATAATAATAAACCTTTAGACTTGAAAAATGGAGAAGTAGTAATATATACTTACGATTTCACTAATAATCTAGCTAATCT
AAAAACAGAACTTCCTTTTAATCATCAGAAGACCTTAAATTTAAAGATTGACGGTAAAGTAAGTAGCTTTAATATATTAG
ATAATTTAAAAGGTGGAGTTATAAATGCAGATATCAAAAATACTAATACTATAATTGTTAGTGATAGTGATTTTAAAAAG
TTGTGGAATAATGTTTCAGAGCATAATAAACTTATTTATTATGGATATAACATCAAACATAATTTAAAAGCTTCTGGTGC
AGTAACTGAAATAAAAAATGCAGTTACAAAAGGTCAAGAAGCATTCTTTACTGAAAGGGTAATAAGTGCAGCAAGTGTAA
TGCAGCTCTTATCTGTACTTTTATTTATAGGAACCTTTATTGCAATGATATTTTTTATTGCAACAGGAAGTATATTATAT
TTCAAAATGTTTAATGAAGTTCAGAAAGATAAGCAAGATTTTATAGGACTAAAAAAGATAGGTGTTACACAAGAAGAAAT
AAAAAAAATAGTTAGTATTCAAAGTTTTACAATGTTCTTCTTACCACTTACAGTTGCAATCCTTCATGCTGCTTTTGCTG
TAAAATCCGTAGGACTTTTATATACAAAATATTTTATATTTATTGCGGGAATATATCTAGTTTTACAAATAATATATTAT
CTATTTGCTAAATGGATGTATATGAAACAAATTAATAGTTGGAACATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATGGAGGAAATAGGCAAGCATTCTTTAAAGAAATTATGGATTCTCTTTCACTTTTAGGAAGTAGATCAAATAATTATAC
ACTGTAGGAGGAAGATTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATTTTGTAGAAACATGAAAAGCCATCATAAATGAGTGATGGCTTTTATTTATTTTATATTTATAAATCTTTCTTTTAT
GTATATTTATCAATTATATA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 655

Protein sequence:

>656_residues
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKTISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIAISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKI
TILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKGIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCP
QDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSQNSFNELAKQ
YNNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
LWNNVSEHNKLIYYGYNIKHNLKASGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILY
FKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYY
LFAKWMYMKQINSWNI

Sequences:

>Translated_656_residues
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKTISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIAISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKI
TILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKGIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCP
QDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSQNSFNELAKQ
YNNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
LWNNVSEHNKLIYYGYNIKHNLKASGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILY
FKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYY
LFAKWMYMKQINSWNI
>Mature_655_residues
TINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKTISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYSI
TTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIAISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKIT
ILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVIIG
TKLLFSQFSVFFTNKLQNNKGIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCPQ
DIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSQNSFNELAKQY
NNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKKL
WNNVSEHNKLIYYGYNIKHNLKASGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILYF
KMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYL
FAKWMYMKQINSWNI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74340; Mature: 74209

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKTISEVASK
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIAISIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKITILSFLVVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
KNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKGIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQRVSLSSMEENCPQDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCEEECCCEEE
IKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSQNSFNELAKQYNNKPLDLKNGEVVIYTYDF
EEECCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECC
TNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
CCCHHHCEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCHHHH
LWNNVSEHNKLIYYGYNIKHNLKASGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVL
HHHCHHHCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIGTFIAMIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFF
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYLFAKWMYMKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKTISEVASK
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIAISIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKITILSFLVVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
KNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKGIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQRVSLSSMEENCPQDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCEEECCCEEE
IKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSQNSFNELAKQYNNKPLDLKNGEVVIYTYDF
EEECCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECC
TNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
CCCHHHCEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCHHHH
LWNNVSEHNKLIYYGYNIKHNLKASGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVL
HHHCHHHCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIGTFIAMIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFF
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYLFAKWMYMKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]