Definition Wolbachia sp. wRi, complete genome.
Accession NC_012416
Length 1,445,873

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The map label for this gene is 225630768

Identifier: 225630768

GI number: 225630768

Start: 1151083

End: 1152909

Strand: Direct

Name: 225630768

Synonym: WRi_010640

Alternate gene names: NA

Gene position: 1151083-1152909 (Clockwise)

Preceding gene: 225630767

Following gene: 225630769

Centisome position: 79.61

GC content: 33.39

Gene sequence:

>1827_bases
ATGCCAAACATAATTGCGCCTGTATTAATAACAAAATTTAATATAAGCATTGCAGATTTAGGGCAATTTAATGGTCTCTA
CTATGTGGGATTTAAACTAGTTCATATCCCTGTTGGTCTTTGTTTTGATAGATTCGGTCCAAAAATTGTTTTACCTATTT
GTGCTGTCTTGGTATCTATTGGAACATTACCTCTTGTGTGCTTTGATGAGTGGTATTATTCAGTATTAGGTAGAATAATT
GTTGGGATTGGCTCGTCTGCGTCAGTAATAGGAGTATTTAAAGTTGCCAGTATGTATTTTTCGCGAGAAAAATCAGCAAA
AATGGCAAGCATATCTGTTATTATAGGGCTATTAGGGGCAATATATGGTAGTCTACCAATAGAACTTTTGCTTGATGAGT
TTGGTTGGAATTATGTAATTTATATTCTTTCAGGGTTTGGTTTCTTACTCGCTTTATCTTTATTTTTAGTTATTCCTTAC
AATGCTTACAACTTTCGAAAAGAAAAAATTAGCATGAAGGATCTAAAAACTGTGCTTTTCAATAAATATATCATTCTAAT
TAGTTTTTTTGGTGGCTTAATGGTAGGTCCACTAGAAGGTTTCGCTGATGCTTGGACAAAAGCTTTTTTATGTGAGGTAT
ATCAAATGGCCGGTGATCTAGCGTCTTCAATTTCTTCTGTTATATATGTAGGATTTGCAGCTGGATTGCTCTCTTTTGCT
CACATATTAGAAAAATATCCAAATAGACATTATGAAGTTATTATTGTCTGTTCCTTTGCAATGATTGCTAGTTTCCTTTT
ACTTTTTACACAGGCTGGCGGATTGTATATTGTATTGCCTGCACTTCTTGTTATAGGTTTCGCTTCTGGATATCAAATAG
TAACACTGTACAAAGCATTAAGTTATGTAAATAATAACTTAATAGGATTAACTACAGCTGTGTCAAATATGATAGTCATG
GTTTTTGGCTATTTTTTTCACACTGGGATCGCAAAAATAATAGATTTGTGTTGGGATAGGACAGTGATACAAGGGGCAAT
ATATGGTGGTCTACCAATAGAACTTTTGCTTGATGAGTTTGGTTGGAATTATGTAATTTATATTCTTTCAGGGTTTGGTT
TCTTACTCGCTTTATCTTTATTTTTAGTTATTCCTTACAATGCTTACAACTTTCGAAAAGAAAAAATTAGCATGAAGGAT
CTAAAAACTGTGCTTTTCAATAAATATATCATTCTAATTAGTTTTTTTGGTGGCTTAATGGTAGGTCCACTAGAAGGTTT
CGCTGATGCTTGGACAAAAGCTTTTTTATGTGAGGTATATCAAATGGCCGGTGATCTAGCGTCTTCAATTTCTTCTGTTA
TATATGTAGGATTTGCAGCTGGATTGCTCTCTTTTGCTCACATATTAGAAAAATATCCAAATAGACATTATGAAGTTATT
ATTGTCTGTTCCTTTGCAATGATTGCTAGTTTCCTTTTACTTTTTACACAGGCTGGCGGATTGTATATTGTATTGCCTGC
ACTTCTTGTTATAGGTTTCGCTTCTGGATATCAAATAGTAACACTGTACAAAGCATTAAGTTATGTAAATAATAACTTAA
TAGGATTAACTACAGCTGTGTCAAATATGATAGTCATGGTTTTTGGCTATTTTTTTCACACTGGGATCGCAAAAATAATA
GATTTGTGTTGGGATAGGACAGTGATACAAGGAAATCCTGTGTATAGTGCTGAATTGCTGATAAAAGCAACATCTATTAT
TCCTGTATGTTTGCTGATAGCTGTTTTTGGGCTCTTATGGTTAAAAAAGCAGGATAAGCAGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTTGATTTTATTATGCAATTTGGAGAATTTTTATGACTTTTTTGTTGACTAACAAGACGGTATCTTTTCTATGCAT
ACCAGTATGTGTTACGTGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTGCTTGTGCATCTTAAAATTAAAGCGAGGTTTGATCTATGATGAGTGTTTTAAAAAAAATCTGTGGCTCTAAAAATA
GTTTAAAGTCTTTTGATAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease; Facilitator Superfamily Transporter; Facilitator Transporter; Facilitator Family Transporter Transporter; Sugar Phosphate Permease; Facilitator Superfamily Protein; NasA Protein; Bicyclomycin Resistance Protein; Facilitator Membrane Proteins; Intraphagosomal Amino Acid Transporter Family Protein; Transporter MFS Superfamily; Facilitator Superfamily Permease

Number of amino acids: Translated: 608; Mature: 607

Protein sequence:

>608_residues
MPNIIAPVLITKFNISIADLGQFNGLYYVGFKLVHIPVGLCFDRFGPKIVLPICAVLVSIGTLPLVCFDEWYYSVLGRII
VGIGSSASVIGVFKVASMYFSREKSAKMASISVIIGLLGAIYGSLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPY
NAYNFRKEKISMKDLKTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFA
HILEKYPNRHYEVIIVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVM
VFGYFFHTGIAKIIDLCWDRTVIQGAIYGGLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYNAYNFRKEKISMKD
LKTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFAHILEKYPNRHYEVI
IVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVMVFGYFFHTGIAKII
DLCWDRTVIQGNPVYSAELLIKATSIIPVCLLIAVFGLLWLKKQDKQS

Sequences:

>Translated_608_residues
MPNIIAPVLITKFNISIADLGQFNGLYYVGFKLVHIPVGLCFDRFGPKIVLPICAVLVSIGTLPLVCFDEWYYSVLGRII
VGIGSSASVIGVFKVASMYFSREKSAKMASISVIIGLLGAIYGSLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPY
NAYNFRKEKISMKDLKTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFA
HILEKYPNRHYEVIIVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVM
VFGYFFHTGIAKIIDLCWDRTVIQGAIYGGLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYNAYNFRKEKISMKD
LKTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFAHILEKYPNRHYEVI
IVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVMVFGYFFHTGIAKII
DLCWDRTVIQGNPVYSAELLIKATSIIPVCLLIAVFGLLWLKKQDKQS
>Mature_607_residues
PNIIAPVLITKFNISIADLGQFNGLYYVGFKLVHIPVGLCFDRFGPKIVLPICAVLVSIGTLPLVCFDEWYYSVLGRIIV
GIGSSASVIGVFKVASMYFSREKSAKMASISVIIGLLGAIYGSLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYN
AYNFRKEKISMKDLKTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFAH
ILEKYPNRHYEVIIVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVMV
FGYFFHTGIAKIIDLCWDRTVIQGAIYGGLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYNAYNFRKEKISMKDL
KTVLFNKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFAHILEKYPNRHYEVII
VCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAVSNMIVMVFGYFFHTGIAKIID
LCWDRTVIQGNPVYSAELLIKATSIIPVCLLIAVFGLLWLKKQDKQS

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67145; Mature: 67014

Theoretical pI: Translated: 8.20; Mature: 8.20

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
PNIIAPVLITKFNISIADLGQFNGLYYVGFKLVHIPVGLCFDRFGPKIVLPICAVLVSI
CCCHHHHHHHEECCCHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHH
GTLPLVCFDEWYYSVLGRIIVGIGSSASVIGVFKVASMYFSREKSAKMASISVIIGLLGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYGSLPIELLLDEFGWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYNAYNFRKEKISMKDLKTVLF
HHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHH
NKYIILISFFGGLMVGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFA
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HILEKYPNRHYEVIIVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKAL
HHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
SYVNNNLIGLTTAVSNMIVMVFGYFFHTGIAKIIDLCWDRTVIQGAIYGGLPIELLLDEF
HHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHC
GWNYVIYILSGFGFLLALSLFLVIPYNAYNFRKEKISMKDLKTVLFNKYIILISFFGGLM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGPLEGFADAWTKAFLCEVYQMAGDLASSISSVIYVGFAAGLLSFAHILEKYPNRHYEVI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
IVCSFAMIASFLLLFTQAGGLYIVLPALLVIGFASGYQIVTLYKALSYVNNNLIGLTTAV
EEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHH
SNMIVMVFGYFFHTGIAKIIDLCWDRTVIQGNPVYSAELLIKATSIIPVCLLIAVFGLLW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKKQDKQS
HHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA