| Definition | Wolbachia sp. wRi, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012416 |
| Length | 1,445,873 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 225630673
GI number: 225630673
Start: 1033749
End: 1035245
Strand: Direct
Name: mviN [H]
Synonym: WRi_009620
Alternate gene names: 225630673
Gene position: 1033749-1035245 (Clockwise)
Preceding gene: 225630665
Following gene: 225630674
Centisome position: 71.5
GC content: 32.53
Gene sequence:
>1497_bases ATGTTTAAAAGTATTTTCACATTTAGTTTTTTTACGGCTATTTCAAGGATCTCAGGGTTAATAAGAGATGTATTGATTGC TACAGTTATTGGTGCAAACTCTCTTGCAGACATATTTTTTTCTTCGTTTCGCTTTGCCAATCTATTTCGAGCATTTTTTG CAGAAGGAGCGTTCACTACCTCATTCATACCGTTATACTCGACAGAATCATATGATAATAAGAAGGCATTTAATTTTGCA AGTAGTGTAATATCCATTACGTTTATTATCTTAGTAATTTTTTGCCTTATCATGCAAACTTTCTCCCCTTATATGATTCA AATTTTTGCTCCTGGATTTGACCAAAGTAAGTTTACCCTTACTGTTACTTTATCAAGAATTATGATGCCCTACATAATCT TTGTTTCAATTGCATCACTTATTGGTGGAATGCTGCAAGTAAAGCAGCATTTTGCTTCAACAGCTATTGCACCAATCGTT TTGAATCTCTGTTTAATCATCAGTTTGTTTGTGCCTTACGTAAAAACTCCAGCGCACAACCTTTCTATAGCTGTTCTTAT AGGAGGAATTTTCCAGCTACTTTTGATACTATTTAGTGCATACAAGTTAAAGGCAGCTTTTTCTTTTAGCCTTGAATTAA GCAATGAAGTAAGGTTGTTTTTTAAGCGTGTGATACCTGCAATTATCAACAATTGTGTAACTCAAATAAGCTTATGGATT GATACAATAATGGCAAGTTTTATACCAAATGCGGTGTCTTATATATATTATGCCGATAGACTAAATCAACTACCGCAGGG AATAATCGGTACTGCAATTGGTACAGTGCTTCTTCCTCTAATTTCAAAACAGGTGAATAATACTGAAAATATAGTCAAAA TACAGAACAAGGCTCTCAACATAGGATTAATGTTAATTATGCCAACAACTGCTGCCTTTATCATTATTCCCGACATAATT TTACTTACGCTTTTTTCTTACGGCCGGTTTGATCATTATGCAGTGCAGCAAACTGTTCCCACTTTAATAGCATTTTCTCT TTCTTTACCTGCATTTATTATAAATAAAGTATTGCTACCTACATTTTTTGCTAAAGGCAATCTGAAAATACCAACCATAT TTTCGCTAATGTGTCTTGGAATTAATGTAGTGCTAAACCTTTTGTTAATGAACAAGTATCAGCATACGGGGATTGCTATT GCTACTTCCGTTTCCACTTGGATAAACTCCATTCTATTAATTAGTTATTTAACAATAAATAAGATGTATAAGGTTAGCCA AGCGTTATTGTTAAATATCATGAAAATTTTTGTAGCAACGGCAGTCATGTCAATAGCCCTTTATATTTTTAATTCTTTGT TGGCAGGATTATTTTTTGATAAAATGTTGGCTCGTATTGTTTATTTAGCGACTTTAATAGCTTTGAGTGTTATTGTTTAT TTTGGTACTCTTTACTTAACTTTTAGAGGAAGTTTGAATAATTTGAAATATGTATAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ACCAGATCTTTTGCTAAAGGAACAGCAAACGGTGTCATCCCAGTGCTTGACACTGGGATCCAGAAATTTTGTTGATTGTA TGATCTGGAAAACCTTGTTT
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 498; Mature: 498
Protein sequence:
>498_residues MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY FGTLYLTFRGSLNNLKYV
Sequences:
>Translated_498_residues MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY FGTLYLTFRGSLNNLKYV >Mature_498_residues MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFA SSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIV LNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDII LLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAI ATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY FGTLYLTFRGSLNNLKYV
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=498, Percent_Identity=31.1244979919679, Blast_Score=231, Evalue=1e-61,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55461; Mature: 55461
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH SFIPLYSTESYDNKKAFNFASSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTL CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEE TVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIVLNLCLIISLFVPYVKTPAHN EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEHHHHHE IGLMLIMPTTAAFIIIPDIILLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLP EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH TFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAIATSVSTWINSILLISYLTIN HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGTLYLTFRGSLNNLKYV HHHHHHEEECCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH SFIPLYSTESYDNKKAFNFASSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTL CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEE TVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIVLNLCLIISLFVPYVKTPAHN EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEHHHHHE IGLMLIMPTTAAFIIIPDIILLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLP EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH TFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAIATSVSTWINSILLISYLTIN HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGTLYLTFRGSLNNLKYV HHHHHHEEECCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]