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The map label for this gene is 225630561

Identifier: 225630561

GI number: 225630561

Start: 889463

End: 892027

Strand: Reverse

Name: 225630561

Synonym: WRi_008220

Alternate gene names: NA

Gene position: 892027-889463 (Counterclockwise)

Preceding gene: 225630562

Following gene: 225630560

Centisome position: 61.69

GC content: 37.89

Gene sequence:

>2565_bases
ATGTTTAAGACTAAGCTGTCATTGCTATTAATTGCGATATTTTTACTAAATATAGACTTTTTACTCTCATATCCAGTGCT
TGCAGATGGAGTAAGTGGTACTGACAAGACAGAATTTGTTAGCAGATTTAATTCCATTGGCAGTTTTAGTCGTGCCTCTA
ATCCTGATTGTGGAGCGTTTAAAACAGCTGCAGCACTTGCTGGAATAGCGATTGCTGTTGGTGCAATATTTACTGGCATT
GTTTTGATCGTTTCTTCTGCTGGTTTGTTTACCGCTCTTGTTATTGTTGGAATGATAGCTGCAATTGTTGGAGTCTGGAA
AGCGATAGGAGGGCTTGTTGTTTGTGAACATAGTTTTGTTAAACACCCAGTTGCACGTGATCATGATGGAAAATACAAAA
ATTTTAAATTAGAAGACACAGGTTATAGTGGCTGCACCAATGAAAATTACCAAACAGAAGAGGAATATTTTTCTTGTTTG
CAAAATAAAGCTCGGGAAGACGTGAACAAAAAAGATTATGACGGGAAAAGAGCAGAAAAAGAAGCCTTAAATTCTAACGT
TCAGGAGAGTACAGAGAGTTATTACTGGCCAAAAAATGGTGTGCAATACAGTGAATATATAGAAGTATGTCATCGAAACC
CTTTAACTTTTGGTAATCTTTTTAATAAGGTAGACTTTAATTCCAGAGGAAAACCTGGATACATAGACTTTGATGTCAGG
GAGAAAGACACTGGATACGTAGATGGGTCATGGTCCTCGAAGGTTGATGGTGGTCTGGAATGTAGAGTTCTCAAAGCAGG
ACAGAGCGAACCCATACATGGAGCTACATTCAAAGCAGTGAGAAAAATGGGCAGATTGTGTGTGGAGTTAGCAAGTGTGA
AAATGCTTGGTATCGAAATGACTCCTTGGCCGCAAGGGGTTGATATGGGGTGCACGGAATTGCCACCTGACCCACTTGCT
CCTATGTGTGAAAAATCTGTGATGATATTCAAAAATAAAGATGGTACAGGAGAGGAAAAAGTTCCTATTGGTAATAATGA
TGACTATAAAACTATTATCAGATCTAAAGAAAAAAGACTCAACGGACAAGGGGGGAAAATTTTTGTAGGTTATGATAATG
CTGGCTGTTTTAGCTCGTATGTTTCTGAAGCTTGTTATAACCAGGCAGGGAGTAAATCATTAGCTCCTATTCCCGTAACT
TCTATGATAGTGCAATGCATTAAGGAATCGTTAGATAATTTAGTTGCAGGTAAAGGTGCACCAAATGGTGAGAGTTTTAT
ATCTGTAGCACAGAAAAGGCTGAAAAACACTGTAACTGCTGTTTTAGTTTTAGCTTTAATACTGTTCTCTATAAAAGCCA
TGTCTGGTGGAGTTCAGAGGCCTCAAGAAATGTATATGTTGATCATAAAATTCGCTTTAGTGATTTACTTCACAACAGGC
AGTACCATGTCTCATTATTATGGAGAATTAACTCGTCTCTCAAATGGTTTGTCAGAGATAGTGCTAAAAGCATCATCTGA
AAGTAAAGGCATATGTAATTATAAAGCAGGTACAGATTATGAATATACTCGTGCAGGAAAGAGGGTATCTTACAGTTATC
TTGCACCTTGGGATAGGCTTGATTGTAGAATTTTATTTTATTTAGGTGCCCCTTTAGATGGAATTGGTGGCAAAATTGGT
ACTGGAGGTGTTGCAACGTTAGCAGTCTTGCTTGGTGCTGCTCCTGTCTTATTAGTTGCAGGTTCGGTAATCGGTATTAT
TTTTGCTGGTGGACAAATTTTAGTAGCTCTTGTCTGTATATTTATGGCCGTTCTGATGATGATGGTTATTTTGTGGCTGT
GCTATGTATTTATTTTATCTCTAGTTGCTTTAAGTGTAATCATCATTTTATCACCTTTGTTCATTCCTATGGTTTTATTC
CAACACACCAAAGGATATTTTGAAGGCTGGGTGAAAGAGTTGATTACCTATAGCTTATACCCGGTTATCCTTTTTGCGTT
TTTGTCCTTTATGTTCATAGCATGTGATAAAATCTATTTTAAAAATTTAAATTTTGAACTGGACGAGTCATATAAAAATG
AACAACCGGACAAGTCATATGAAAAGAAACAAGCAGAAATCTCATATAGTAAGAAAAAACAGTGGTTTAAATTGAAAGAT
GGGGAATGTGATAAAAATGAAACTACTCTTGCATGTATGATGCAAAATTATAGCTTTAAAAAGAGCAGCATACTTGGTCT
ATTCGACTTTACATACATGGAGTTTGGCAGCTCTCTCATCGGAGAATTATTAAAATTGTGTTTAGTATTATTCCTCTTTT
ACCACTTTTTAAACATTCTTCCTGGCATGGCTGCTGAACTTGCTGGTAACCATAGAGCAGCACTTGGCTCAGGTCAGACA
CCTGGACAAATAGTGGGCAAAGCTTTATCTGCTGCCAAAGCTGCTGCTGGGGGTGTTGCTGGAGTTGCTGGTGCTGCTGC
TAAGAAGTTGAGTGGTGGAGACAAGAGTAAATCTCGAGGTTCTGGTTCTAGTAGCTCCGAGAGTGTTAACAAAAGCACTG
AATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCGGACGTGCAGAAAGTGTTCTATTGTTACACGATATATTAAATGAAGTTGGGGACAACCCAAAAGTATGGTTGCCTAT
ATTTTATCAGAAGGTAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTGGATTTATGCTAAAATTTTTGCTGATAATACCGTTTTTTTTTCTGTCAGGCTGCGGGGAACATCACTGTATTAAGCC
AGAAAATTTATCAGGTTTGC

Product: Type IV secretion system protein VirB6, putative

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 854; Mature: 854

Protein sequence:

>854_residues
MFKTKLSLLLIAIFLLNIDFLLSYPVLADGVSGTDKTEFVSRFNSIGSFSRASNPDCGAFKTAAALAGIAIAVGAIFTGI
VLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFVKHPVARDHDGKYKNFKLEDTGYSGCTNENYQTEEEYFSCL
QNKAREDVNKKDYDGKRAEKEALNSNVQESTESYYWPKNGVQYSEYIEVCHRNPLTFGNLFNKVDFNSRGKPGYIDFDVR
EKDTGYVDGSWSSKVDGGLECRVLKAGQSEPIHGATFKAVRKMGRLCVELASVKMLGIEMTPWPQGVDMGCTELPPDPLA
PMCEKSVMIFKNKDGTGEEKVPIGNNDDYKTIIRSKEKRLNGQGGKIFVGYDNAGCFSSYVSEACYNQAGSKSLAPIPVT
SMIVQCIKESLDNLVAGKGAPNGESFISVAQKRLKNTVTAVLVLALILFSIKAMSGGVQRPQEMYMLIIKFALVIYFTTG
STMSHYYGELTRLSNGLSEIVLKASSESKGICNYKAGTDYEYTRAGKRVSYSYLAPWDRLDCRILFYLGAPLDGIGGKIG
TGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCIFMAVLMMMVILWLCYVFILSLVALSVIIILSPLFIPMVLF
QHTKGYFEGWVKELITYSLYPVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFELDESYKNEQPDKSYEKKQAEISYSKKKQWFKLKD
GECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFTYMEFGSSLIGELLKLCLVLFLFYHFLNILPGMAAELAGNHRAALGSGQT
PGQIVGKALSAAKAAAGGVAGVAGAAAKKLSGGDKSKSRGSGSSSSESVNKSTE

Sequences:

>Translated_854_residues
MFKTKLSLLLIAIFLLNIDFLLSYPVLADGVSGTDKTEFVSRFNSIGSFSRASNPDCGAFKTAAALAGIAIAVGAIFTGI
VLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFVKHPVARDHDGKYKNFKLEDTGYSGCTNENYQTEEEYFSCL
QNKAREDVNKKDYDGKRAEKEALNSNVQESTESYYWPKNGVQYSEYIEVCHRNPLTFGNLFNKVDFNSRGKPGYIDFDVR
EKDTGYVDGSWSSKVDGGLECRVLKAGQSEPIHGATFKAVRKMGRLCVELASVKMLGIEMTPWPQGVDMGCTELPPDPLA
PMCEKSVMIFKNKDGTGEEKVPIGNNDDYKTIIRSKEKRLNGQGGKIFVGYDNAGCFSSYVSEACYNQAGSKSLAPIPVT
SMIVQCIKESLDNLVAGKGAPNGESFISVAQKRLKNTVTAVLVLALILFSIKAMSGGVQRPQEMYMLIIKFALVIYFTTG
STMSHYYGELTRLSNGLSEIVLKASSESKGICNYKAGTDYEYTRAGKRVSYSYLAPWDRLDCRILFYLGAPLDGIGGKIG
TGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCIFMAVLMMMVILWLCYVFILSLVALSVIIILSPLFIPMVLF
QHTKGYFEGWVKELITYSLYPVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFELDESYKNEQPDKSYEKKQAEISYSKKKQWFKLKD
GECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFTYMEFGSSLIGELLKLCLVLFLFYHFLNILPGMAAELAGNHRAALGSGQT
PGQIVGKALSAAKAAAGGVAGVAGAAAKKLSGGDKSKSRGSGSSSSESVNKSTE
>Mature_854_residues
MFKTKLSLLLIAIFLLNIDFLLSYPVLADGVSGTDKTEFVSRFNSIGSFSRASNPDCGAFKTAAALAGIAIAVGAIFTGI
VLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFVKHPVARDHDGKYKNFKLEDTGYSGCTNENYQTEEEYFSCL
QNKAREDVNKKDYDGKRAEKEALNSNVQESTESYYWPKNGVQYSEYIEVCHRNPLTFGNLFNKVDFNSRGKPGYIDFDVR
EKDTGYVDGSWSSKVDGGLECRVLKAGQSEPIHGATFKAVRKMGRLCVELASVKMLGIEMTPWPQGVDMGCTELPPDPLA
PMCEKSVMIFKNKDGTGEEKVPIGNNDDYKTIIRSKEKRLNGQGGKIFVGYDNAGCFSSYVSEACYNQAGSKSLAPIPVT
SMIVQCIKESLDNLVAGKGAPNGESFISVAQKRLKNTVTAVLVLALILFSIKAMSGGVQRPQEMYMLIIKFALVIYFTTG
STMSHYYGELTRLSNGLSEIVLKASSESKGICNYKAGTDYEYTRAGKRVSYSYLAPWDRLDCRILFYLGAPLDGIGGKIG
TGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCIFMAVLMMMVILWLCYVFILSLVALSVIIILSPLFIPMVLF
QHTKGYFEGWVKELITYSLYPVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFELDESYKNEQPDKSYEKKQAEISYSKKKQWFKLKD
GECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFTYMEFGSSLIGELLKLCLVLFLFYHFLNILPGMAAELAGNHRAALGSGQT
PGQIVGKALSAAKAAAGGVAGVAGAAAKKLSGGDKSKSRGSGSSSSESVNKSTE

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92988; Mature: 92988

Theoretical pI: Translated: 8.32; Mature: 8.32

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKTKLSLLLIAIFLLNIDFLLSYPVLADGVSGTDKTEFVSRFNSIGSFSRASNPDCGAF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
KTAAALAGIAIAVGAIFTGIVLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECHHHH
KHPVARDHDGKYKNFKLEDTGYSGCTNENYQTEEEYFSCLQNKAREDVNKKDYDGKRAEK
HCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
EALNSNVQESTESYYWPKNGVQYSEYIEVCHRNPLTFGNLFNKVDFNSRGKPGYIDFDVR
HHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
EKDTGYVDGSWSSKVDGGLECRVLKAGQSEPIHGATFKAVRKMGRLCVELASVKMLGIEM
CCCCCEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TPWPQGVDMGCTELPPDPLAPMCEKSVMIFKNKDGTGEEKVPIGNNDDYKTIIRSKEKRL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
NGQGGKIFVGYDNAGCFSSYVSEACYNQAGSKSLAPIPVTSMIVQCIKESLDNLVAGKGA
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNGESFISVAQKRLKNTVTAVLVLALILFSIKAMSGGVQRPQEMYMLIIKFALVIYFTTG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STMSHYYGELTRLSNGLSEIVLKASSESKGICNYKAGTDYEYTRAGKRVSYSYLAPWDRL
CHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCCEECCCCCCCHHHHCCCCEEEHHCCCCCCC
DCRILFYLGAPLDGIGGKIGTGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCI
CEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FMAVLMMMVILWLCYVFILSLVALSVIIILSPLFIPMVLFQHTKGYFEGWVKELITYSLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFELDESYKNEQPDKSYEKKQAEISYSKKKQWFKLKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCC
GECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFTYMEFGSSLIGELLKLCLVLFLFYHFLNIL
CCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PGMAAELAGNHRAALGSGQTPGQIVGKALSAAKAAAGGVAGVAGAAAKKLSGGDKSKSRG
CCHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
SGSSSSESVNKSTE
CCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKTKLSLLLIAIFLLNIDFLLSYPVLADGVSGTDKTEFVSRFNSIGSFSRASNPDCGAF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
KTAAALAGIAIAVGAIFTGIVLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFV
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KHPVARDHDGKYKNFKLEDTGYSGCTNENYQTEEEYFSCLQNKAREDVNKKDYDGKRAEK
HCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
EALNSNVQESTESYYWPKNGVQYSEYIEVCHRNPLTFGNLFNKVDFNSRGKPGYIDFDVR
HHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
EKDTGYVDGSWSSKVDGGLECRVLKAGQSEPIHGATFKAVRKMGRLCVELASVKMLGIEM
CCCCCEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TPWPQGVDMGCTELPPDPLAPMCEKSVMIFKNKDGTGEEKVPIGNNDDYKTIIRSKEKRL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
NGQGGKIFVGYDNAGCFSSYVSEACYNQAGSKSLAPIPVTSMIVQCIKESLDNLVAGKGA
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNGESFISVAQKRLKNTVTAVLVLALILFSIKAMSGGVQRPQEMYMLIIKFALVIYFTTG
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DCRILFYLGAPLDGIGGKIGTGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCI
CEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FMAVLMMMVILWLCYVFILSLVALSVIIILSPLFIPMVLFQHTKGYFEGWVKELITYSLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFELDESYKNEQPDKSYEKKQAEISYSKKKQWFKLKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCC
GECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFTYMEFGSSLIGELLKLCLVLFLFYHFLNIL
CCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PGMAAELAGNHRAALGSGQTPGQIVGKALSAAKAAAGGVAGVAGAAAKKLSGGDKSKSRG
CCHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
SGSSSSESVNKSTE
CCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA