| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222524328
Identifier: 222524328
GI number: 222524328
Start: 1334515
End: 1336278
Strand: Direct
Name: 222524328
Synonym: Chy400_1051
Alternate gene names: NA
Gene position: 1334515-1336278 (Clockwise)
Preceding gene: 222524327
Following gene: 222524330
Centisome position: 25.33
GC content: 57.48
Gene sequence:
>1764_bases GTGATCACATTACCGTTCGGCCTGTTTCGGCGACGACGCTTAACTACCGACCAACAGGACAGGCTGCTCAACGAACTCGA TGCCCTGCTGCAACAGATCGATACCGCCCTTGATCAGTTTGGCGCCGATGTTGAAGCAAGCGACCGCAATGCCCTTGCCG GCAGCCGAACCAGTTTACGTGAGCTGTTTTTGATCGTGGTAGCCGGCGAATTTAACTCCGGCAAATCAACCTTTCTCAAT GCCCTGCTCGGTGCCCAGGTGCTGCCTGAAGGGGTGACACCAACGACAGACGCTATCACACTGCTGAAATACGGGTCGGA GCCATTCGATGAGCTGGTCGAACCCGGTCTCCGCATTCATCACTATCCCGCCGAGATGCTGCGTCAGCTTACGGTGGTGG ATACACCCGGCACCAATGCGGTCATCCGGCACCACGAACGTCTCACCCGCGACTTTATTCCACGGGCCGATCTGGTGATT TTCCTCACCTCGGCAGATCGCCCCTTTACCGAAAGCGAGCGCGCCTTTCTCGAATTGATTAAGGACTGGGGCAAAAAGAT TGTCGTGGTGATCAACAAGATTGACATCTTGACGCAAGCCGAGCAAGAACAAGTTGCCCAGTTTGTTCGCGACCACGTCA ATCGCGTGTTAGAACACTCGCCAGAGCTGTTCCTGGTTTCGGCCCGGCGTGCCCTGCAAGCCCGCCAGCAAACCGACGAC TCGGTCGAGCAGTGGCAGGCCAGCGGGATGGCGGCCTTTGAGCACTTTGTGGTTGACACGCTTGACGAAGAGACCCGCCT GCGGCTCAAACTCCTCTCACCACTGGGTGTAGCCCGCCGGATCACCGGTAAATATCTCGCGGCCACCGAAGCGCGACTGG CTACGCTCAGCGACGACATTCAGGCGATTGACCAGATCGAGCGGCAGCTTGCCTTCTTCGGGGATGAGTTGAAACAGGAC GCGGAATACCATCTGAACGAGATTGATCAGGTCTTGACGACCTTGCAAGCGCGTGGGGAACAATTCTGCGACGAGACCAT TCGCCTGAGTCGGATTCGCGAATTGATCGACGGCAATCGCCTGCGTGCCGCCTTCGAGCAAGAGGTGATTGGTGATACGT ACCAGCAGATTGACCAACGCATCCAGAAGCTGATCGACTGGCTGGTTGAAAAGAACCTGCGCCTGCAACAGAGCGTTGAT GAGTTCATTCAACGGCGGGCACTAGCCCATCGCGATCACATGCTGGGTGAAGTGGGAGGAAGCTTCGCCTACAACCGCCA GGCCCTTCTGGAAAATATCAGTCAGGCTGCCCAGAACGCCATTGCCGGCTACAACCGCCAGACCGAAGCCCAACAACTGG CAGGTGAAGTCCAGTCATCGGTTGCGGCGACTGCCATCACCGGGCTGGGTGCGGTAGGTCTGGGCGCGACACTGGTTGCG GTGTTTCACACCGTGTTACTCGATTTTACCGGTATTCTGGCCGCTTTGACGGTGGCCGGCCTGGGACTGGCAATTCTTCC GGCCAAACGGCGACAGGCAAAAGAGAGCCTGCGCAAGAAGATCGACGAGGTACGCGCCCAACTGCGCACCGAACTACGTC AGCAGATCGAGCGGGAGAGCGAGCACACGCTCCGCCAGATTCGCGAGCGGAATGCACCGTTTGTCCGCTTTGTCCGTGCC CAGCAAGAGCATCTGGTCGGCTTGCAACGCACTTTTTCCGATTTGACCGTCGCTATCGAAAAGTTCAGCAAGCAGGTTGA ATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TACGGCATCGCTGGACTGGCGTTAGCATTAGCCGCATTGGCCGTGGTTGCCCGCAATCTGGGTGTATAATCGGCCCGCTG AATAGTGTGCGAGGACTGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases CAATGGTCAAGCGATAGCCAAGTCTTGTATCAAATCAAGTTACCATCTATGCTGTGCGCAGGCCACGGCGGCTGACTACC AGAATGCACAGCACGACGTT
Product: Dynamin family protein
Products: NA
Alternate protein names: ORF6 [H]
Number of amino acids: Translated: 587; Mature: 587
Protein sequence:
>587_residues MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE
Sequences:
>Translated_587_residues MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE >Mature_587_residues MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE
Specific function: Unknown
COG id: COG0699
COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.genitalium MG148 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001401 [H]
Pfam domain/function: PF00350 Dynamin_N [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66260; Mature: 66260
Theoretical pI: Translated: 5.69; Mature: 5.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLR CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH ELFLIVVAGEFNSGKSTFLNALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIH HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEE HYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVIFLTSADRPFTESERAFLELI CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH KDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD HHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCH SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAIDQIERQLAFFGDELKQDAEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH LRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVDEFIQRRALAHRDHMLGEVGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHTLRQIRERNAPFVRFVRAQQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLR CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH ELFLIVVAGEFNSGKSTFLNALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIH HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEE HYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVIFLTSADRPFTESERAFLELI CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH KDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD HHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCH SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAIDQIERQLAFFGDELKQDAEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH LRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVDEFIQRRALAHRDHMLGEVGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHTLRQIRERNAPFVRFVRAQQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8920183 [H]