Definition Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome.
Accession NC_012032
Length 5,268,950

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The map label for this gene is 222524328

Identifier: 222524328

GI number: 222524328

Start: 1334515

End: 1336278

Strand: Direct

Name: 222524328

Synonym: Chy400_1051

Alternate gene names: NA

Gene position: 1334515-1336278 (Clockwise)

Preceding gene: 222524327

Following gene: 222524330

Centisome position: 25.33

GC content: 57.48

Gene sequence:

>1764_bases
GTGATCACATTACCGTTCGGCCTGTTTCGGCGACGACGCTTAACTACCGACCAACAGGACAGGCTGCTCAACGAACTCGA
TGCCCTGCTGCAACAGATCGATACCGCCCTTGATCAGTTTGGCGCCGATGTTGAAGCAAGCGACCGCAATGCCCTTGCCG
GCAGCCGAACCAGTTTACGTGAGCTGTTTTTGATCGTGGTAGCCGGCGAATTTAACTCCGGCAAATCAACCTTTCTCAAT
GCCCTGCTCGGTGCCCAGGTGCTGCCTGAAGGGGTGACACCAACGACAGACGCTATCACACTGCTGAAATACGGGTCGGA
GCCATTCGATGAGCTGGTCGAACCCGGTCTCCGCATTCATCACTATCCCGCCGAGATGCTGCGTCAGCTTACGGTGGTGG
ATACACCCGGCACCAATGCGGTCATCCGGCACCACGAACGTCTCACCCGCGACTTTATTCCACGGGCCGATCTGGTGATT
TTCCTCACCTCGGCAGATCGCCCCTTTACCGAAAGCGAGCGCGCCTTTCTCGAATTGATTAAGGACTGGGGCAAAAAGAT
TGTCGTGGTGATCAACAAGATTGACATCTTGACGCAAGCCGAGCAAGAACAAGTTGCCCAGTTTGTTCGCGACCACGTCA
ATCGCGTGTTAGAACACTCGCCAGAGCTGTTCCTGGTTTCGGCCCGGCGTGCCCTGCAAGCCCGCCAGCAAACCGACGAC
TCGGTCGAGCAGTGGCAGGCCAGCGGGATGGCGGCCTTTGAGCACTTTGTGGTTGACACGCTTGACGAAGAGACCCGCCT
GCGGCTCAAACTCCTCTCACCACTGGGTGTAGCCCGCCGGATCACCGGTAAATATCTCGCGGCCACCGAAGCGCGACTGG
CTACGCTCAGCGACGACATTCAGGCGATTGACCAGATCGAGCGGCAGCTTGCCTTCTTCGGGGATGAGTTGAAACAGGAC
GCGGAATACCATCTGAACGAGATTGATCAGGTCTTGACGACCTTGCAAGCGCGTGGGGAACAATTCTGCGACGAGACCAT
TCGCCTGAGTCGGATTCGCGAATTGATCGACGGCAATCGCCTGCGTGCCGCCTTCGAGCAAGAGGTGATTGGTGATACGT
ACCAGCAGATTGACCAACGCATCCAGAAGCTGATCGACTGGCTGGTTGAAAAGAACCTGCGCCTGCAACAGAGCGTTGAT
GAGTTCATTCAACGGCGGGCACTAGCCCATCGCGATCACATGCTGGGTGAAGTGGGAGGAAGCTTCGCCTACAACCGCCA
GGCCCTTCTGGAAAATATCAGTCAGGCTGCCCAGAACGCCATTGCCGGCTACAACCGCCAGACCGAAGCCCAACAACTGG
CAGGTGAAGTCCAGTCATCGGTTGCGGCGACTGCCATCACCGGGCTGGGTGCGGTAGGTCTGGGCGCGACACTGGTTGCG
GTGTTTCACACCGTGTTACTCGATTTTACCGGTATTCTGGCCGCTTTGACGGTGGCCGGCCTGGGACTGGCAATTCTTCC
GGCCAAACGGCGACAGGCAAAAGAGAGCCTGCGCAAGAAGATCGACGAGGTACGCGCCCAACTGCGCACCGAACTACGTC
AGCAGATCGAGCGGGAGAGCGAGCACACGCTCCGCCAGATTCGCGAGCGGAATGCACCGTTTGTCCGCTTTGTCCGTGCC
CAGCAAGAGCATCTGGTCGGCTTGCAACGCACTTTTTCCGATTTGACCGTCGCTATCGAAAAGTTCAGCAAGCAGGTTGA
ATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACGGCATCGCTGGACTGGCGTTAGCATTAGCCGCATTGGCCGTGGTTGCCCGCAATCTGGGTGTATAATCGGCCCGCTG
AATAGTGTGCGAGGACTGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATGGTCAAGCGATAGCCAAGTCTTGTATCAAATCAAGTTACCATCTATGCTGTGCGCAGGCCACGGCGGCTGACTACC
AGAATGCACAGCACGACGTT

Product: Dynamin family protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF6 [H]

Number of amino acids: Translated: 587; Mature: 587

Protein sequence:

>587_residues
MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN
ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI
FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD
SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD
AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD
EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA
VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA
QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE

Sequences:

>Translated_587_residues
MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN
ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI
FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD
SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD
AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD
EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA
VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA
QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE
>Mature_587_residues
MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLRELFLIVVAGEFNSGKSTFLN
ALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIHHYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVI
FLTSADRPFTESERAFLELIKDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD
SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDIQAIDQIERQLAFFGDELKQD
AEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNRLRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVD
EFIQRRALAHRDHMLGEVGGSFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA
VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERESEHTLRQIRERNAPFVRFVRA
QQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG148 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001401 [H]

Pfam domain/function: PF00350 Dynamin_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66260; Mature: 66260

Theoretical pI: Translated: 5.69; Mature: 5.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
0.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
0.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLR
CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
ELFLIVVAGEFNSGKSTFLNALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIH
HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEE
HYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVIFLTSADRPFTESERAFLELI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
KDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD
HHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCH
SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAIDQIERQLAFFGDELKQDAEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVDEFIQRRALAHRDHMLGEVGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHTLRQIRERNAPFVRFVRAQQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MITLPFGLFRRRRLTTDQQDRLLNELDALLQQIDTALDQFGADVEASDRNALAGSRTSLR
CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
ELFLIVVAGEFNSGKSTFLNALLGAQVLPEGVTPTTDAITLLKYGSEPFDELVEPGLRIH
HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEE
HYPAEMLRQLTVVDTPGTNAVIRHHERLTRDFIPRADLVIFLTSADRPFTESERAFLELI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
KDWGKKIVVVINKIDILTQAEQEQVAQFVRDHVNRVLEHSPELFLVSARRALQARQQTDD
HHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCH
SVEQWQASGMAAFEHFVVDTLDEETRLRLKLLSPLGVARRITGKYLAATEARLATLSDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAIDQIERQLAFFGDELKQDAEYHLNEIDQVLTTLQARGEQFCDETIRLSRIRELIDGNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LRAAFEQEVIGDTYQQIDQRIQKLIDWLVEKNLRLQQSVDEFIQRRALAHRDHMLGEVGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SFAYNRQALLENISQAAQNAIAGYNRQTEAQQLAGEVQSSVAATAITGLGAVGLGATLVA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFHTVLLDFTGILAALTVAGLGLAILPAKRRQAKESLRKKIDEVRAQLRTELRQQIERES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHTLRQIRERNAPFVRFVRAQQEHLVGLQRTFSDLTVAIEKFSKQVE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8920183 [H]