| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222524035
Identifier: 222524035
GI number: 222524035
Start: 935677
End: 940977
Strand: Direct
Name: 222524035
Synonym: Chy400_0750
Alternate gene names: NA
Gene position: 935677-940977 (Clockwise)
Preceding gene: 222524034
Following gene: 222524036
Centisome position: 17.76
GC content: 60.46
Gene sequence:
>5301_bases ATGGCGACTATTAGCCTGCAAGACGCCTATACACAAGCCAGAACATTTCTCGAGGCGAACCAGATCGAGCAGGCAATCGG CCTGATCCAGCATATCCTTGAACACCATCCAGACAACCTGGAAGCTCAACGACTTTTAGGTGAGGCATATCTGGCAAAAC GCGATTTGCCTGCGGCAACGGCAACGTTTGAACAGGTCTTACAGGTTGACCCCGAAAATATTCCGGCCCACGTCGGTCTG GGAATGGCGTATGAATGGCAGGGTCGGCTGGATAAGGCGATTGCCGAGTTCGAGCAGGCACTGGAGATCCGTCCTGATAT GCCCGAACTACGTGCCCAGTTGGTACGTCTCTACACCGAAGCCTGGGGCAGCGAGCATGCCGCTCTCCGCCTGAGCCGTC CTGGTCTTGCCCGCCTGTATGCCCGTGGTCATATGTTGCCACAGGCTATCCACGAATTTCGACAGGTTATTGCTGAGCAT CCTGACCGGCTCGATGCCTGGGTTGGTCTGATTGAAGCACTCTGGCGAGACGGTCAACTGGATGAAGCAGCTACCGTGTG TCGGGATGCGTTGAAGCAACAACCCCATCTGCTCAAGGCAAATCTGATCCTCGGCGGAATATTGCTATTAGATGGCGATC AGCGCGGGCTTGATTACTGGCGGGTTGCGCAACGTATTGATCCCTACCAGACAGTCGCAAAACTTCTGTTTGACACGCTG CCGGTCGGTATACCAACACCTGACGTTTCCCTGCCGGCATGGGACGAGGCCGAATGGCAGGCGCGACGCGCAGCTTCAGT GGCAGCGGAGCAACCTGCATCGACGCCGGCGGACGATTTCTTTGCCGAGACAGGCTGGTTGACACCGGCAGCCAGCCCGG TGGCAGCCGCAGTAGCTGCCACTTCAGACGATGATCTGCTGGCTATGCTGCTCTTTTCGCCACCAGCAGCAACCAGTGTG 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Upstream 100 bases:
>100_bases TGCAAGCGGCGAATATCATTCGCATTGCTCTGGCGTTCCCTCAACGCATGATGTTTCACTTTCCGGCGGCGCCAACAGTA ATGATGTGGGAGGATTCAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGAGGTATCCGTCTTTCTTATGTAGAGAAAGCAGACTCCGCGATGGCACCACAAGAAAGGTTTAGCATGCGCCGCATCG TAGAAGATCTCATTCGGGTC
Product: tetratricopeptide repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Peptidase S1 And S6 Chymotrypsin/Hap; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein; Tetratricopeptide TPR_2 Repeat Protein
Number of amino acids: Translated: 1766; Mature: 1765
Protein sequence:
>1766_residues MATISLQDAYTQARTFLEANQIEQAIGLIQHILEHHPDNLEAQRLLGEAYLAKRDLPAATATFEQVLQVDPENIPAHVGL GMAYEWQGRLDKAIAEFEQALEIRPDMPELRAQLVRLYTEAWGSEHAALRLSRPGLARLYARGHMLPQAIHEFRQVIAEH PDRLDAWVGLIEALWRDGQLDEAATVCRDALKQQPHLLKANLILGGILLLDGDQRGLDYWRVAQRIDPYQTVAKLLFDTL PVGIPTPDVSLPAWDEAEWQARRAASVAAEQPASTPADDFFAETGWLTPAASPVAAAVAATSDDDLLAMLLFSPPAATSV AEPTQPPAERDEFDFDLDLPLSSATPTGLTLDEIGVGVTETTPASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAE PELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLS PEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGRSTTTGGADTFADELSGLQPFSLDDLDFGATSASDELP ATLQPFSLDDLALDDAVSASPEAHTESIEPGIYSWQEPSARGGGIKLPQEPEQGGPSIFSKLVERAASLPPVEEPPLSPV ELTETDVAAYFSNDDVSLREDDDTPERLTGTFRIPKASIDESLAPTGAVRALSEKSEPVNLPKEPELTPFSLEELGLSPE EIAQLEAAQQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQ QQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQFEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAE PELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQQSQPATPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQSQPATPAEPELTPFS LEELGLSPEEIAQLEAAQQPATTSETMVFTDEPIDSLLSSTGSTDDVFAHLDTASAEPSFELPGVEPFSLDEFADLEPFS FEDIESGATTSSELGLSPDEIDSISLGNFETVVLSDDEEPMIDTGDPDLNRLIKLGHRQGYVDLTDIIAVVKDPEQEADR IEQIGWSLYRAGIQIRDGDEIIDMEAELNEEEPAPATSSATADLTPFDEEPALAQPSAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQL EAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQ PAASAEPELPPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPEL TPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELG LSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQL EAAQQAASPSGTGAAEDDLFDFSIAETAPVAKAVRTAPRVEEPPPPPAPEDTGFVPEPLEALDDIWNAPPEPMTSEPARV VLPPLSERPKAQPMLRTPTREERRSVAPTRDDLRFARREALTSGRGRSARAPIRPRAPEDFIPTGNATIDDYLRQLSTNP ANHSLAFTIARLCAQTGQAELMAVIYRRLLKHTTLLDRMAEELEDLINTIEDTPVLRQLYRILGDVYSRQGRLEEAIATY SVTFAE
Sequences:
>Translated_1766_residues MATISLQDAYTQARTFLEANQIEQAIGLIQHILEHHPDNLEAQRLLGEAYLAKRDLPAATATFEQVLQVDPENIPAHVGL GMAYEWQGRLDKAIAEFEQALEIRPDMPELRAQLVRLYTEAWGSEHAALRLSRPGLARLYARGHMLPQAIHEFRQVIAEH PDRLDAWVGLIEALWRDGQLDEAATVCRDALKQQPHLLKANLILGGILLLDGDQRGLDYWRVAQRIDPYQTVAKLLFDTL PVGIPTPDVSLPAWDEAEWQARRAASVAAEQPASTPADDFFAETGWLTPAASPVAAAVAATSDDDLLAMLLFSPPAATSV AEPTQPPAERDEFDFDLDLPLSSATPTGLTLDEIGVGVTETTPASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAE PELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLS PEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGRSTTTGGADTFADELSGLQPFSLDDLDFGATSASDELP ATLQPFSLDDLALDDAVSASPEAHTESIEPGIYSWQEPSARGGGIKLPQEPEQGGPSIFSKLVERAASLPPVEEPPLSPV ELTETDVAAYFSNDDVSLREDDDTPERLTGTFRIPKASIDESLAPTGAVRALSEKSEPVNLPKEPELTPFSLEELGLSPE EIAQLEAAQQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQ QQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQFEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAE PELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQQSQPATPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQSQPATPAEPELTPFS LEELGLSPEEIAQLEAAQQPATTSETMVFTDEPIDSLLSSTGSTDDVFAHLDTASAEPSFELPGVEPFSLDEFADLEPFS FEDIESGATTSSELGLSPDEIDSISLGNFETVVLSDDEEPMIDTGDPDLNRLIKLGHRQGYVDLTDIIAVVKDPEQEADR IEQIGWSLYRAGIQIRDGDEIIDMEAELNEEEPAPATSSATADLTPFDEEPALAQPSAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQL EAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQ PAASAEPELPPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPEL TPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELG LSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQL EAAQQAASPSGTGAAEDDLFDFSIAETAPVAKAVRTAPRVEEPPPPPAPEDTGFVPEPLEALDDIWNAPPEPMTSEPARV VLPPLSERPKAQPMLRTPTREERRSVAPTRDDLRFARREALTSGRGRSARAPIRPRAPEDFIPTGNATIDDYLRQLSTNP ANHSLAFTIARLCAQTGQAELMAVIYRRLLKHTTLLDRMAEELEDLINTIEDTPVLRQLYRILGDVYSRQGRLEEAIATY SVTFAE >Mature_1765_residues ATISLQDAYTQARTFLEANQIEQAIGLIQHILEHHPDNLEAQRLLGEAYLAKRDLPAATATFEQVLQVDPENIPAHVGLG MAYEWQGRLDKAIAEFEQALEIRPDMPELRAQLVRLYTEAWGSEHAALRLSRPGLARLYARGHMLPQAIHEFRQVIAEHP DRLDAWVGLIEALWRDGQLDEAATVCRDALKQQPHLLKANLILGGILLLDGDQRGLDYWRVAQRIDPYQTVAKLLFDTLP VGIPTPDVSLPAWDEAEWQARRAASVAAEQPASTPADDFFAETGWLTPAASPVAAAVAATSDDDLLAMLLFSPPAATSVA EPTQPPAERDEFDFDLDLPLSSATPTGLTLDEIGVGVTETTPASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEP ELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLSP EEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGRSTTTGGADTFADELSGLQPFSLDDLDFGATSASDELPA TLQPFSLDDLALDDAVSASPEAHTESIEPGIYSWQEPSARGGGIKLPQEPEQGGPSIFSKLVERAASLPPVEEPPLSPVE LTETDVAAYFSNDDVSLREDDDTPERLTGTFRIPKASIDESLAPTGAVRALSEKSEPVNLPKEPELTPFSLEELGLSPEE IAQLEAAQQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQ QAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQFEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEP ELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQQSQPATPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQSQPATPAEPELTPFSL EELGLSPEEIAQLEAAQQPATTSETMVFTDEPIDSLLSSTGSTDDVFAHLDTASAEPSFELPGVEPFSLDEFADLEPFSF EDIESGATTSSELGLSPDEIDSISLGNFETVVLSDDEEPMIDTGDPDLNRLIKLGHRQGYVDLTDIIAVVKDPEQEADRI EQIGWSLYRAGIQIRDGDEIIDMEAELNEEEPAPATSSATADLTPFDEEPALAQPSAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLE AAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQP AASAEPELPPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELT PFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGL SPEEIAQLEAAQQQAQPAAPAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEAAQQQQAQPAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLE AAQQAASPSGTGAAEDDLFDFSIAETAPVAKAVRTAPRVEEPPPPPAPEDTGFVPEPLEALDDIWNAPPEPMTSEPARVV LPPLSERPKAQPMLRTPTREERRSVAPTRDDLRFARREALTSGRGRSARAPIRPRAPEDFIPTGNATIDDYLRQLSTNPA NHSLAFTIARLCAQTGQAELMAVIYRRLLKHTTLLDRMAEELEDLINTIEDTPVLRQLYRILGDVYSRQGRLEEAIATYS VTFAE
Specific function: Unknown
COG id: COG0457
COG function: function code R; FOG: TPR repeat
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 189416; Mature: 189285
Theoretical pI: Translated: 3.60; Mature: 3.60
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MATISLQDAYTQARTFLEANQIEQAIGLIQHILEHHPDNLEAQRLLGEAYLAKRDLPAAT CCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH ATFEQVLQVDPENIPAHVGLGMAYEWQGRLDKAIAEFEQALEIRPDMPELRAQLVRLYTE HHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH AWGSEHAALRLSRPGLARLYARGHMLPQAIHEFRQVIAEHPDRLDAWVGLIEALWRDGQL HHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DEAATVCRDALKQQPHLLKANLILGGILLLDGDQRGLDYWRVAQRIDPYQTVAKLLFDTL HHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC PVGIPTPDVSLPAWDEAEWQARRAASVAAEQPASTPADDFFAETGWLTPAASPVAAAVAA CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHC TSDDDLLAMLLFSPPAATSVAEPTQPPAERDEFDFDLDLPLSSATPTGLTLDEIGVGVTE CCCCCCEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCC TTPASAEPTLQPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQ CCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHH LEGQAPAAAASAEPELTPFSLEELGLSPEEIAQLEGQAPAAAASAEPTLQPFSLEELGLS 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