| Definition | Bacillus cereus Q1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011969 |
| Length | 5,214,195 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 222094155
GI number: 222094155
Start: 442853
End: 445798
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: BCQ_0448
Alternate gene names: 222094155
Gene position: 442853-445798 (Clockwise)
Preceding gene: 222094154
Following gene: 222094156
Centisome position: 8.49
GC content: 34.76
Gene sequence:
>2946_bases ATGAAACAAATTTGGCGTATTTATAAGACTGATTTACGGAATGTAGCTAAACATTGGGCTGCAATTGTTATTGTTGTAGG GTTAATGATTTTACCATCGTTATATGCATGGTTTAACATTAAAGCTTCTTGGGATCCATATGGAAATACAAAAGAAGTTC CCATTGCAGTTTCTAACCAAGATGCAGGCTCTAATTTAAGAGGGAAAGATATCAATATCGGGGACGAGATTGTAGATTCT CTTAAGAAAAACAAAAATCTTGGTTGGAAATTTGTAGATGAAAAACAAGCAATTTATGGAGTGGAACGCGGGGATTACTA TGCAAGCATTACAATTCCAAAAGACTTCTCTGAAAAAATTGCAACTGTTCTGGATGAAAATCCACAGAAACCAGAACTTG ATTACTATGTAAATGAAAAGGTAAATGCGATTGCACCGAAGATTACAGCAAAAGGTGCATCAGGTATTACAGAAGAAATT AGTAAAAACTTTGTTAAAACAGCGAACGGTGAGATTTTTAAAATCTTCAATGACCTTGGAATCGATTTAGAAACAAACTT ACCAAGTATTGAGAAAGTAAAAGATCTTGTATTTAAGTTAGAAGCGCAGTTCCCAGAAATGAATACACTTATGGATAAGG CGTTAGATGATGCGACTCGAGCAGAGGATGTCGTGAAAGTAGCGCAGAAAGAATTGCCGGTTGTAGAGAGTGTTATTAAT GATGGTCAGGATACACTTAAGAGCTTAGATGCATTCTTTGCGAGAAATGATGAAACATTGAATCGTGCCCCGGGAACTAT TAAGAATAATTTAATTGCAATGCAAACAGGTTTGAATGGTGCGGCGGCAATTACGGATTTCTTAAAAAATCCATCTGTTG ATTTCAATCTGGCACTTCCAGATCCATCTAAACTTCCAGAGTTACCAAATGTAACTATCCCGCAAATACCAGCGCTTCCA GAATTACCGCAAGTGAATGGTGAGGGATATAAAAACATTGCTAAAAATATTAATCAAACTGTAAATAATGTTTTTAGCTC AATACGTGTTGGAACAACTTATGCACAAGGTGTTATAAACGGGTTGCAAAATGGTAATTTCGACCCGGAAAAAGCGAAAC AAGATCTTAATAAGGTTTCTGAGAATCTTCAAGATCGTGCGGATAGTGTTTCATATGTAATTGATGTCTTTACTAAATTT AAAGAGTCGGCATCAACTGATTTTGGAAAAGAATTCTTCCAAAAGAGAATAGAAAGATTAACAAGCCTTAAATCAGCTAT CGAAAATGCAAATGGGGGCGTTAAAGATATTGCCAATATTATTGGTACAGGGCAAGAAGTGAAACAAGACGTAAGAGATG CTGCTAATAAAAAGTTAGACGCAATAAATAACTTGGTAAATCAAGCAGAAACAGATTATAATGCAACGTTCGTAGCGGAT TTTGAAAAAGCAGTAAGCACAGCTGAACAATTAAAAAACAAGGCTGAAGGTGTAAAAGAAGATGCTCAGCAACTGAGAGG AAATTTAAATCAAGATATAAACAAAGCTAATGAGATTTTAAACAATGGTAGAGAAGCTTATGATAAGGCTGTAAATGATT ATAGCAGATTAAAAACGGAGCTTGGCAAAGCAAGAGAAGACTTGAATAATAAAGGGATTAACGGATTAGATTCTACAAAA GTAGCTTTAAATGATATAAGAGGAGAGTTACAAGCTGGAAAGAATTTAGTTAATGATATGATTCCTGTTATGGAAAATAC GAATAAAGTTTTAGCGGATGTAAATAGTGATAAGAACACGAATAACATGATTTCTAAATTGAATAAATTAAAAGATGGTT TACAAAAAGCAATCGATTTAACTGATAAAGGAATTGACGCTATTAATAAAGGTCAAAAGCCAGCAGCAGATGTTATTGAA AGTATTAACGCAGTATCTAAAAGTACTTCGGCCCAAATAAGTGACATCTTAGCTAAATACGATTCAGAAATCGTTCCAAA CTTTAATGAAGCAATTGCTCGTACAAAAGAGATGTCTAAAAACACATCTCAAATTTTAAAAGAAGCAGACAAAAAGCTTC CAGATGTTAAAAAAATACTAGAAGATTCATCAAAAGGCTTAGTAGATGGTAAAAAGAAATTAACAGACATTAAAGCTGAA ATGCCAGCTACTGAGAAAAAGATTAAAGAATTGGCAGATAAAATTCGTGATTTTGAATCTGAAGAGGATTTAAAAGACAT CATACGCTTATTGAAAAACGATGTTGAGAAGCAAAGTGACTACTTTGCGAATCCAGTAAATTTAAAAGAGAATAAATTAT TTGCGATGCCGAACTACGGTTCAGCGATGTCACCATTCTATACAGTGCTTGCATTATGGGTAGGCGCATTATTAATGGTT TCATTATTAACAGTAGAAGTACATGAAGAGGGCGCGAATTATAAGAGCCATGAAATTTACTTCGGACGTTTATTAACATT CTTAACGATAGGTCTTTCACAAGCGTTTATCGTATCGATGGGAGATATATTCTTACTCGGTACGTACGTAGTCGATAAAT TCTGGTTTGTATTATTTAGTTTATTTATTGGTGGGGTCTTCGTTTGTATCGTATACTCACTCGTTTCTATTTTTGGAAAC GTTGGGAAATCGATGGCGATCATTTTACTTGTACTGCAAGTAGCAGGATCGGGCGGAACATTCCCAATTCAAATGACACC GAAATTCTTCCAAGCAATTTATCCGTTCTTACCGTTCACATATGCAATTAGTGCAATTCGTGAAACAGTAGGCGGAATGC TGTGGGATATTGTAACGCGAGATTTACTTGTATTAAGTGCTTTCGTAGTAGTTATGATTGTAGCTGCGTTATTATTGAAA ACACCAATTAACAAATCGAGCGAAAAATTCGTTGAGAACGCAAAAGGAAGTAAAATCATTCACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCGTTTTTGGTTAATCCACGATGTAGAAAGTGATATAATTGCAAAATGTATGTATCATTTTCTAAAGAAGGAAAAATAT ATAATTAGGTGATAACTTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases CATAAAAGGTTCCTACCGATAGAGGTAGGAACCTTTTTGTTTAATCAAATTTTAATTTCTTTAATGCTTCTGTTTAGTGA TTCTTAAACGAGTCATGTCA
Product: phage infection protein-like membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 981; Mature: 981
Protein sequence:
>981_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDVVKVAQKELPVVESVIN DGQDTLKSLDAFFARNDETLNRAPGTIKNNLIAMQTGLNGAAAITDFLKNPSVDFNLALPDPSKLPELPNVTIPQIPALP ELPQVNGEGYKNIAKNINQTVNNVFSSIRVGTTYAQGVINGLQNGNFDPEKAKQDLNKVSENLQDRADSVSYVIDVFTKF KESASTDFGKEFFQKRIERLTSLKSAIENANGGVKDIANIIGTGQEVKQDVRDAANKKLDAINNLVNQAETDYNATFVAD FEKAVSTAEQLKNKAEGVKEDAQQLRGNLNQDINKANEILNNGREAYDKAVNDYSRLKTELGKAREDLNNKGINGLDSTK VALNDIRGELQAGKNLVNDMIPVMENTNKVLADVNSDKNTNNMISKLNKLKDGLQKAIDLTDKGIDAINKGQKPAADVIE SINAVSKSTSAQISDILAKYDSEIVPNFNEAIARTKEMSKNTSQILKEADKKLPDVKKILEDSSKGLVDGKKKLTDIKAE MPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMV SLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGN VGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPKFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLK TPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Sequences:
>Translated_981_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDVVKVAQKELPVVESVIN DGQDTLKSLDAFFARNDETLNRAPGTIKNNLIAMQTGLNGAAAITDFLKNPSVDFNLALPDPSKLPELPNVTIPQIPALP ELPQVNGEGYKNIAKNINQTVNNVFSSIRVGTTYAQGVINGLQNGNFDPEKAKQDLNKVSENLQDRADSVSYVIDVFTKF KESASTDFGKEFFQKRIERLTSLKSAIENANGGVKDIANIIGTGQEVKQDVRDAANKKLDAINNLVNQAETDYNATFVAD FEKAVSTAEQLKNKAEGVKEDAQQLRGNLNQDINKANEILNNGREAYDKAVNDYSRLKTELGKAREDLNNKGINGLDSTK VALNDIRGELQAGKNLVNDMIPVMENTNKVLADVNSDKNTNNMISKLNKLKDGLQKAIDLTDKGIDAINKGQKPAADVIE SINAVSKSTSAQISDILAKYDSEIVPNFNEAIARTKEMSKNTSQILKEADKKLPDVKKILEDSSKGLVDGKKKLTDIKAE MPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMV SLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGN VGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPKFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLK TPINKSSEKFVENAKGSKIIH >Mature_981_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDVVKVAQKELPVVESVIN DGQDTLKSLDAFFARNDETLNRAPGTIKNNLIAMQTGLNGAAAITDFLKNPSVDFNLALPDPSKLPELPNVTIPQIPALP ELPQVNGEGYKNIAKNINQTVNNVFSSIRVGTTYAQGVINGLQNGNFDPEKAKQDLNKVSENLQDRADSVSYVIDVFTKF KESASTDFGKEFFQKRIERLTSLKSAIENANGGVKDIANIIGTGQEVKQDVRDAANKKLDAINNLVNQAETDYNATFVAD FEKAVSTAEQLKNKAEGVKEDAQQLRGNLNQDINKANEILNNGREAYDKAVNDYSRLKTELGKAREDLNNKGINGLDSTK VALNDIRGELQAGKNLVNDMIPVMENTNKVLADVNSDKNTNNMISKLNKLKDGLQKAIDLTDKGIDAINKGQKPAADVIE SINAVSKSTSAQISDILAKYDSEIVPNFNEAIARTKEMSKNTSQILKEADKKLPDVKKILEDSSKGLVDGKKKLTDIKAE MPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMV SLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGN VGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPKFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLK TPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108463; Mature: 108463
Theoretical pI: Translated: 5.24; Mature: 5.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC DAGSNLRGKDINIGDEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLG HHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDVVKVAQKELPVVESVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQDTLKSLDAFFARNDETLNRAPGTIKNNLIAMQTGLNGAAAITDFLKNPSVDFNLALP CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC DPSKLPELPNVTIPQIPALPELPQVNGEGYKNIAKNINQTVNNVFSSIRVGTTYAQGVIN CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH GLQNGNFDPEKAKQDLNKVSENLQDRADSVSYVIDVFTKFKESASTDFGKEFFQKRIERL HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TSLKSAIENANGGVKDIANIIGTGQEVKQDVRDAANKKLDAINNLVNQAETDYNATFVAD HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH FEKAVSTAEQLKNKAEGVKEDAQQLRGNLNQDINKANEILNNGREAYDKAVNDYSRLKTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LGKAREDLNNKGINGLDSTKVALNDIRGELQAGKNLVNDMIPVMENTNKVLADVNSDKNT HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCH NNMISKLNKLKDGLQKAIDLTDKGIDAINKGQKPAADVIESINAVSKSTSAQISDILAKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSEIVPNFNEAIARTKEMSKNTSQILKEADKKLPDVKKILEDSSKGLVDGKKKLTDIKAE CCHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH MPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYG CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCC SAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FPIQMTPKFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLK EEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPINKSSEKFVENAKGSKIIH CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC DAGSNLRGKDINIGDEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLG HHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDVVKVAQKELPVVESVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQDTLKSLDAFFARNDETLNRAPGTIKNNLIAMQTGLNGAAAITDFLKNPSVDFNLALP CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC DPSKLPELPNVTIPQIPALPELPQVNGEGYKNIAKNINQTVNNVFSSIRVGTTYAQGVIN CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH GLQNGNFDPEKAKQDLNKVSENLQDRADSVSYVIDVFTKFKESASTDFGKEFFQKRIERL HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TSLKSAIENANGGVKDIANIIGTGQEVKQDVRDAANKKLDAINNLVNQAETDYNATFVAD HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH FEKAVSTAEQLKNKAEGVKEDAQQLRGNLNQDINKANEILNNGREAYDKAVNDYSRLKTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LGKAREDLNNKGINGLDSTKVALNDIRGELQAGKNLVNDMIPVMENTNKVLADVNSDKNT HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCH NNMISKLNKLKDGLQKAIDLTDKGIDAINKGQKPAADVIESINAVSKSTSAQISDILAKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSEIVPNFNEAIARTKEMSKNTSQILKEADKKLPDVKKILEDSSKGLVDGKKKLTDIKAE CCHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH MPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYG CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCC SAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FPIQMTPKFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLK EEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPINKSSEKFVENAKGSKIIH CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]