Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

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The map label for this gene is 220933113

Identifier: 220933113

GI number: 220933113

Start: 2490392

End: 2491690

Strand: Reverse

Name: 220933113

Synonym: Hore_22810

Alternate gene names: NA

Gene position: 2491690-2490392 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220933114

Following gene: 220933112

Centisome position: 96.65

GC content: 23.4

Gene sequence:

>1299_bases
ATGAGATTTAAAATGGCAAATATTAGTTTAAAGTTATTATTACTATTTTTTTTGTTAGCTCCATTTCATGGTGTTATAAA
AGTTATAAATCATAATACTCTTAATAAACCTATATTAAATGTGTGGAAAGAAGTATTGTTTATTTTTATCTTAGCTCTAT
CTATTTTATATTTAATCAAAAAGAAAAAAATACATATTACTAATTTTGGGGGAAAAATTATAATTATAATTTATTTACTT
GTATTTAATCTAATCTTAAATCTATATTTTGGAATTGTAAATAAAAATATTGTAATAATACAGTGGTTATGGGGAGTAAA
AGTAACTTTTTTTTATGGGTTAATAATATTTATAGTAATTATACATGATATTAATTGGCAAAAATTTATTAATAAAATTA
TTAATATTCTTTCATTTTTAGCTCTTTTTATTATTGGTTTTGCTTTATTACAGTTTTTTTTAGGCACAGAATTTATTTCC
AGTATAAATTTTGTGGCAGATGGAATGAAAACAAATTTAATCCGTTCTGGTAATATTCGAGCTTCTTCTATTTTCAGACA
ACCTGTAACTTTCGGTATGTTTTGCCTTATATTATTAAGTTTTAACATATTAAAAAAAGGTTTTATGCCCAACATAGTTT
CTATTATGTCAATTATAGGCATATTAATATCTACTTCTAGAACTAGTATATTGGCTTTAGTAGTTATGTTGTTTTATTGT
TTATTACTTAAAAGAAAAAAATATAATATTTTTCTAAAACTTTCTTTAATTATTCCTTTGGTTATTGTATTTGCATTAAA
TATAATAGTACCTTATATTGAAAATAATTTACTTAGTAGTAATATTGGAGTGTTAAGAACATATTTGTATACTAATACTT
TTTTTGTTAGGATTAATAAGTGGAAGACGCTAATGACATCATGGGTAAAGAGTAAAGGAATTGTTCATATTTTTATTGGG
AAAGGATGGGGTTATCTAGGTGGGGGGCAGCACATTTTTAAATTTATTCAAGGAAATCCCAGTGTTCCATATGATCCTGT
CGATAATCTTTATTTGTTTCTTTTAATAAATAGTGGAATTGTGGGATTAATATTATTTATTTCAATTATTATAATGTGTA
TGAGAAAAGCCCTTATGATGATGCAATTTAGTAGTGAAGTGAATTATGATTTTTTGAATAGTGTGCTACTTTTTTTGTCA
ACTTTCCTTATTATTGGAGTGTTTATTACAGGTATAGAGTCATTTATATTTCAAATTTATTTATATTTGATTATAGGAAG
TTTGATGAAATATTCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTGATACTTATAATATTGATAAAGTTATTCAAAATTATTTGAAGTTAATAAAATACAATTCATTATAAAAAGTTGGAAA
AAATTTAGGGTGAAAAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTTAAAGGAACCTCTAAAGTGTAAAATACCTATGATTTTTAAGCAAATTGTAAATTTAATTTATAAAAAAAGGATAAAA
CAAAGGATGAAATGAAAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432

Protein sequence:

>432_residues
MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL
VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS
SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC
LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG
KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS
TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS

Sequences:

>Translated_432_residues
MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL
VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS
SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC
LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG
KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS
TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS
>Mature_432_residues
MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIKKKKIHITNFGGKIIIIIYLL
VFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVIIHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFIS
SINFVADGMKTNLIRSGNIRASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC
LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINKWKTLMTSWVKSKGIVHIFIG
KGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGIVGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLS
TFLIIGVFITGIESFIFQIYLYLIIGSLMKYS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49661; Mature: 49661

Theoretical pI: Translated: 10.62; Mature: 10.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIK
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKKIHITNFGGKIIIIIYLLVFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVI
HCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFISSINFVADGMKTNLIRSGNIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEECCCCC
ASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINK
HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHCEEEEEEHH
WKTLMTSWVKSKGIVHIFIGKGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGI
HHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEHHHCCH
VGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLSTFLIIGVFITGIESFIFQIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYLIIGSLMKYS
HHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRFKMANISLKLLLLFFLLAPFHGVIKVINHNTLNKPILNVWKEVLFIFILALSILYLIK
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKKIHITNFGGKIIIIIYLLVFNLILNLYFGIVNKNIVIIQWLWGVKVTFFYGLIIFIVI
HCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHDINWQKFINKIINILSFLALFIIGFALLQFFLGTEFISSINFVADGMKTNLIRSGNIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEECCCCC
ASSIFRQPVTFGMFCLILLSFNILKKGFMPNIVSIMSIIGILISTSRTSILALVVMLFYC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLKRKKYNIFLKLSLIIPLVIVFALNIIVPYIENNLLSSNIGVLRTYLYTNTFFVRINK
HHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHCEEEEEEHH
WKTLMTSWVKSKGIVHIFIGKGWGYLGGGQHIFKFIQGNPSVPYDPVDNLYLFLLINSGI
HHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEHHHCCH
VGLILFISIIIMCMRKALMMMQFSSEVNYDFLNSVLLFLSTFLIIGVFITGIESFIFQIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYLIIGSLMKYS
HHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA