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The map label for this gene is 220933096

Identifier: 220933096

GI number: 220933096

Start: 2468058

End: 2469932

Strand: Reverse

Name: 220933096

Synonym: Hore_22640

Alternate gene names: NA

Gene position: 2469932-2468058 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220933097

Following gene: 220933095

Centisome position: 95.8

GC content: 31.79

Gene sequence:

>1875_bases
TTGCAGGAAGTAATACAGTCAAAAAATGTTAAAGGAAGAGTAATAGAATTAGTGGACTGGCTGGATTGTGTTTTTAAAAA
TAGTATTGAGGTCCTGAATGGTATGATTGAACATACCGGGTTTCTTTATGGCCAAATTTCTGACAGGTTACCTTTATTAG
AAGAAAAGGTTGATAATACAGCCAAAGAAATGGAGTCACTCACAGATTTTTTTATTGAAAATAATAGTGAACATAATTTT
AGTAAGGTAACCAGGGTTGTCAATGACTTTAAAACAAAAATTGAACAGGTTTATAGTTCACTTTCAGCTAGAGATGAGAT
ATCGAGCATGCTGGAAGGTTTTTTACTAAATAATAGTAATGATGAGCAGGCCAGAATTTTACAGGTTCTGCAATTAATTA
AGGAGCTAGAGTCTGTTCTTAATCAGCTTCATATATTATCAATTAATGCAAATATTGTTGCCTTTAAATCGGGTAACAAT
GGGGCGGGTTTTAAAGTTATTTCTGATGAGATAAATAACCTGTCACAAAAGATAAAAGATAGATATCGGGTAATTGAGAA
CAATATTAAATCGCTTCATAACTGGCATGGTAATTTTACAACCGGTATTAAACAACTGGTTTCAGAGGAAGAAAAAATTG
CTTTAGATTACCGTAATAAACTTGAAAGTATTTTTAATAATATATTTAATGCCCTTTATGATATATCAGAAAAATTAAAA
GAAGTAACTGATAGTATAAATAAAGCTATCAATCCTGTTTATGATATAATAATTCTTCTTCAGAATCAGGACATTATAAG
ACAGAATGTTGAAAACTTGATTAAAATTATTGGAAAAACAAGGAAGGAAGTAAGTTATTTAAAAAAAGCTGATTTAACAG
ACCCTGTCGAAATAGAAAAAGTATTTGACGTATTAACTTTTTTAACTGATGTATCTGGACTCGGGCAGAAATTGATGGAT
AACATTATAAACCAGTTATATGATTCCCTGTTTGCCATTCAGAACAGGCTTGAAAACATGGAAAAGCGACTCGAAAGGTT
AATGGAGAATAATTCCCCAGACCTTTTTTTTAGTATAAGTGACTTAGAAAGTGGGGGGATGACATCAAAAATAAGTTTTA
TTTTTCACAAACTTATGGATTTTATTCCCCGCCTTAACAGGAAACTATCATGCCTTTTAGAAGAATACCTTAAGCTGGTT
GATGGAAGTAGTGGTTTTTTTAACAATATGGATGGTATTGAGAATGGATTTAATGAGATTATTACTATCAGTGACTGGTT
TTGTAAAATTAAACTCCTGGCGAAAATTGAATTTACTAAAATGGAAAATAGAAATATTTTTACTGGGGCTATAGAAAAAG
CTATTGATGATGTTATTAACACTAGCAACAGGAATAACAGGATATATACAGATTTAAAAAATGAACTGGAAGATGAATAT
GGTCAATTTCTGAATTTAGCAAACGGTAATATAGAGAGTATTAGAAAAGCAATCCAGATTATTGAGGAGTCAGAGGAAGA
ACTTAAGCTTTCAATTAAACTGATTGGCAGTACGGTTGAGGATTTTCGTTCTGCTGTGCTGGTACTGGTGAAAGAAGTTG
CAGAAGTAAATGGAAACATAAAAAATGCTTTTGCCTTGAAAGAAGATGGGCAAAAAATAATTGCTTATTTTAAAGAAGTA
AAAGAAGAGGTGGATAAATTTAAAAATGGGTACCTGATTGGGTTTAAATTAAATAACCAAAAAGGGAGTAATGACAGGTT
AAATGACCTTGTTAATGAATTTACCAGTTATCTGGAAAGAAAAACGGCCAGTGAAGAGCTTTCGGATCTGAATATTGATG
TGGGTAGTGAAGGTGGGGAATTAACTCTGTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAATATATTAATATTTATAGTAAATAGGTTAATTGCATAAAAATGACGGAGCAAGTAAATACTGTTATTTATTACCCT
GAGAGAGGGGTGGTTCTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCTGATAAATGTTTATTTCTTAAATTTAAAAGAACTTTTATTTTCAAAATTGGTTTAGCTTTATAACAGGGTTTAAAAA
AATTGAAAAAAGGGAGGGAG

Product: methyl-accepting chemotaxis sensory transducer

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624

Protein sequence:

>624_residues
MQEVIQSKNVKGRVIELVDWLDCVFKNSIEVLNGMIEHTGFLYGQISDRLPLLEEKVDNTAKEMESLTDFFIENNSEHNF
SKVTRVVNDFKTKIEQVYSSLSARDEISSMLEGFLLNNSNDEQARILQVLQLIKELESVLNQLHILSINANIVAFKSGNN
GAGFKVISDEINNLSQKIKDRYRVIENNIKSLHNWHGNFTTGIKQLVSEEEKIALDYRNKLESIFNNIFNALYDISEKLK
EVTDSINKAINPVYDIIILLQNQDIIRQNVENLIKIIGKTRKEVSYLKKADLTDPVEIEKVFDVLTFLTDVSGLGQKLMD
NIINQLYDSLFAIQNRLENMEKRLERLMENNSPDLFFSISDLESGGMTSKISFIFHKLMDFIPRLNRKLSCLLEEYLKLV
DGSSGFFNNMDGIENGFNEIITISDWFCKIKLLAKIEFTKMENRNIFTGAIEKAIDDVINTSNRNNRIYTDLKNELEDEY
GQFLNLANGNIESIRKAIQIIEESEEELKLSIKLIGSTVEDFRSAVLVLVKEVAEVNGNIKNAFALKEDGQKIIAYFKEV
KEEVDKFKNGYLIGFKLNNQKGSNDRLNDLVNEFTSYLERKTASEELSDLNIDVGSEGGELTLF

Sequences:

>Translated_624_residues
MQEVIQSKNVKGRVIELVDWLDCVFKNSIEVLNGMIEHTGFLYGQISDRLPLLEEKVDNTAKEMESLTDFFIENNSEHNF
SKVTRVVNDFKTKIEQVYSSLSARDEISSMLEGFLLNNSNDEQARILQVLQLIKELESVLNQLHILSINANIVAFKSGNN
GAGFKVISDEINNLSQKIKDRYRVIENNIKSLHNWHGNFTTGIKQLVSEEEKIALDYRNKLESIFNNIFNALYDISEKLK
EVTDSINKAINPVYDIIILLQNQDIIRQNVENLIKIIGKTRKEVSYLKKADLTDPVEIEKVFDVLTFLTDVSGLGQKLMD
NIINQLYDSLFAIQNRLENMEKRLERLMENNSPDLFFSISDLESGGMTSKISFIFHKLMDFIPRLNRKLSCLLEEYLKLV
DGSSGFFNNMDGIENGFNEIITISDWFCKIKLLAKIEFTKMENRNIFTGAIEKAIDDVINTSNRNNRIYTDLKNELEDEY
GQFLNLANGNIESIRKAIQIIEESEEELKLSIKLIGSTVEDFRSAVLVLVKEVAEVNGNIKNAFALKEDGQKIIAYFKEV
KEEVDKFKNGYLIGFKLNNQKGSNDRLNDLVNEFTSYLERKTASEELSDLNIDVGSEGGELTLF
>Mature_624_residues
MQEVIQSKNVKGRVIELVDWLDCVFKNSIEVLNGMIEHTGFLYGQISDRLPLLEEKVDNTAKEMESLTDFFIENNSEHNF
SKVTRVVNDFKTKIEQVYSSLSARDEISSMLEGFLLNNSNDEQARILQVLQLIKELESVLNQLHILSINANIVAFKSGNN
GAGFKVISDEINNLSQKIKDRYRVIENNIKSLHNWHGNFTTGIKQLVSEEEKIALDYRNKLESIFNNIFNALYDISEKLK
EVTDSINKAINPVYDIIILLQNQDIIRQNVENLIKIIGKTRKEVSYLKKADLTDPVEIEKVFDVLTFLTDVSGLGQKLMD
NIINQLYDSLFAIQNRLENMEKRLERLMENNSPDLFFSISDLESGGMTSKISFIFHKLMDFIPRLNRKLSCLLEEYLKLV
DGSSGFFNNMDGIENGFNEIITISDWFCKIKLLAKIEFTKMENRNIFTGAIEKAIDDVINTSNRNNRIYTDLKNELEDEY
GQFLNLANGNIESIRKAIQIIEESEEELKLSIKLIGSTVEDFRSAVLVLVKEVAEVNGNIKNAFALKEDGQKIIAYFKEV
KEEVDKFKNGYLIGFKLNNQKGSNDRLNDLVNEFTSYLERKTASEELSDLNIDVGSEGGELTLF

Specific function: Unknown

COG id: COG0840

COG function: function code NT; Methyl-accepting chemotaxis protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71437; Mature: 71437

Theoretical pI: Translated: 4.63; Mature: 4.63

Prosite motif: PS50111 CHEMOTAXIS_TRANSDUC_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQEVIQSKNVKGRVIELVDWLDCVFKNSIEVLNGMIEHTGFLYGQISDRLPLLEEKVDNT
CCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCHHHHHHHHH
AKEMESLTDFFIENNSEHNFSKVTRVVNDFKTKIEQVYSSLSARDEISSMLEGFLLNNSN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DEQARILQVLQLIKELESVLNQLHILSINANIVAFKSGNNGAGFKVISDEINNLSQKIKD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
RYRVIENNIKSLHNWHGNFTTGIKQLVSEEEKIALDYRNKLESIFNNIFNALYDISEKLK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVTDSINKAINPVYDIIILLQNQDIIRQNVENLIKIIGKTRKEVSYLKKADLTDPVEIEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
VFDVLTFLTDVSGLGQKLMDNIINQLYDSLFAIQNRLENMEKRLERLMENNSPDLFFSIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEC
DLESGGMTSKISFIFHKLMDFIPRLNRKLSCLLEEYLKLVDGSSGFFNNMDGIENGFNEI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCHHHE
ITISDWFCKIKLLAKIEFTKMENRNIFTGAIEKAIDDVINTSNRNNRIYTDLKNELEDEY
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
GQFLNLANGNIESIRKAIQIIEESEEELKLSIKLIGSTVEDFRSAVLVLVKEVAEVNGNI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KNAFALKEDGQKIIAYFKEVKEEVDKFKNGYLIGFKLNNQKGSNDRLNDLVNEFTSYLER
HHHHEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KTASEELSDLNIDVGSEGGELTLF
HHHHHHHHHCCCEECCCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure
MQEVIQSKNVKGRVIELVDWLDCVFKNSIEVLNGMIEHTGFLYGQISDRLPLLEEKVDNT
CCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCHHHHHHHHH
AKEMESLTDFFIENNSEHNFSKVTRVVNDFKTKIEQVYSSLSARDEISSMLEGFLLNNSN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DEQARILQVLQLIKELESVLNQLHILSINANIVAFKSGNNGAGFKVISDEINNLSQKIKD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
RYRVIENNIKSLHNWHGNFTTGIKQLVSEEEKIALDYRNKLESIFNNIFNALYDISEKLK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVTDSINKAINPVYDIIILLQNQDIIRQNVENLIKIIGKTRKEVSYLKKADLTDPVEIEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
VFDVLTFLTDVSGLGQKLMDNIINQLYDSLFAIQNRLENMEKRLERLMENNSPDLFFSIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEC
DLESGGMTSKISFIFHKLMDFIPRLNRKLSCLLEEYLKLVDGSSGFFNNMDGIENGFNEI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCHHHE
ITISDWFCKIKLLAKIEFTKMENRNIFTGAIEKAIDDVINTSNRNNRIYTDLKNELEDEY
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
GQFLNLANGNIESIRKAIQIIEESEEELKLSIKLIGSTVEDFRSAVLVLVKEVAEVNGNI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KNAFALKEDGQKIIAYFKEVKEEVDKFKNGYLIGFKLNNQKGSNDRLNDLVNEFTSYLER
HHHHEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KTASEELSDLNIDVGSEGGELTLF
HHHHHHHHHCCCEECCCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA