| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is 220932595
Identifier: 220932595
GI number: 220932595
Start: 1879627
End: 1881996
Strand: Reverse
Name: 220932595
Synonym: Hore_17590
Alternate gene names: NA
Gene position: 1881996-1879627 (Counterclockwise)
Preceding gene: 220932596
Following gene: 220932594
Centisome position: 73.0
GC content: 39.24
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGCTATTTTGTTTCCGGTTCACAATAATTATCAGGTCTTTCTTAATTGGTTTTTTATGGCCGTCAAACTGGCTGACGAAT TTGAAAACCGCTTAAAATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 789; Mature: 788
Protein sequence:
>789_residues MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVD STLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEG IDFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKV YYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTL DEWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVEL KNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEME SGILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK
Sequences:
>Translated_789_residues MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVD STLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEG IDFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKV YYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTL DEWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVEL KNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEME SGILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK >Mature_788_residues GVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVDS TLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGI DFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSSD RVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKVY YHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLD EWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTLD QNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVELK NGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEMES GILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYLN FNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88780; Mature: 88649
Theoretical pI: Translated: 4.89; Mature: 4.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLL CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE FILSGDKENIALEQIKKVVDSTLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTY EEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH FSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGIDFLYPIGNGIDVIVKSPEL HHHCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCHH VPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCH DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCC RITCLVQNGSLAADKSSLKVYYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNS EEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLDEWRKEGLTVFLYDLLAVLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHH DIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL HHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARV CCCHHHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IDTANIENNLTSVRDLMVELKNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAG HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC QVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEMESGILQPNPRGELFRILSQVK CCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH AVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYL EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEE LNLPKMIFK ECCHHHHCC >Mature Secondary Structure GVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLL CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE FILSGDKENIALEQIKKVVDSTLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTY EEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH FSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGIDFLYPIGNGIDVIVKSPEL HHHCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCHH VPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCH DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCC RITCLVQNGSLAADKSSLKVYYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNS EEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLDEWRKEGLTVFLYDLLAVLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHH DIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL HHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARV CCCHHHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IDTANIENNLTSVRDLMVELKNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAG HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC QVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEMESGILQPNPRGELFRILSQVK CCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH AVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYL EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEE LNLPKMIFK ECCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA