Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

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The map label for this gene is 220932595

Identifier: 220932595

GI number: 220932595

Start: 1879627

End: 1881996

Strand: Reverse

Name: 220932595

Synonym: Hore_17590

Alternate gene names: NA

Gene position: 1881996-1879627 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932596

Following gene: 220932594

Centisome position: 73.0

GC content: 39.24

Gene sequence:

>2370_bases
ATGGGAGTGGAGGATATGTTTATACTAAAAACCGATTTCAGAAAAGACCTGCTAGTTCTATTTATAATTACTGTACTTAT
TGGTACCATTCTTGTACTTACCGGAGGATATATTACCAAAAATTATTTTTCCCACATGGTCAGTGGTGTAATCGGGGAAT
ATGGTGAGTATGACCTCCTGTTTATCCTGTCCGGGGATAAAGAAAATATTGCCCTGGAACAGATAAAAAAAGTTGTTGAT
TCGACCCTGCCGGGCTCTGTTTTAAAGGCAGGTCCCCGGGTGGCCGGGAGTAGTAATTACCTCCTTAAAATACCGGAAGA
GTTTAAAAAAGAGGAGGTTTACTCCAGGATATACACATACTTTTCCGACATTCCCGGGATTATGAGTAAAAATATAATAA
CAGAACCGCGGCTTTCAATCAGGGGTTTCAGGGGAGAAACCCTCCCTGTTATCAGGCCCCGGATAGAGAAAATAGAAGGT
ATTGATTTTCTTTATCCCATCGGGAATGGGATTGACGTAATTGTTAAAAGTCCGGAACTGGTTCCCCGGGTTAAAGAACA
AATTAATCGTATCCTGGGAGAATATAAACTCCTTGAGATTCGTTATCCCTTAAACCAGCATCCCGAGGACATGGAAAAGA
AAAAGAAAAAGATAATAGGTAAAATCAAAGACGAAATAGATGGGATTAAGGTATATGATGTTACCGGTACTGTTAGTTCT
GACCGGGTTTCTCTTTTAAATAGTTTAAAGCAGATGAAAGATTTCCTCTTGTCATATGCTACTACTGTTATTATTTCTGA
AGTGGAAGATAGTTCCCGCTACTCTGTCGGGGGGATCTTAACTGCCCGGAATAAAGATGGAGAAAAGATTCTTTTAAAGA
TTATCAATAATAAAGATAATCGTATTACCTGTCTGGTCCAGAATGGGAGCCTTGCTGCTGACAAAAGTAGTTTAAAGGTT
TATTATCATAATAGTGAAAATGGGATTACTTATATTGGTCAGGGTAGGATTAATAACCCCAGACAGGATCTGGCTGAAGC
CCTGGAAAGCCTTAATGAAATTACCCCGAGGCTAAATTCGTTTCTGGAGCAGAGTGAAGAGTTAATAACCCACAGTGATC
GTATCGGTAAAGACCTGAAGAATATTAATGAAGGCCTGGCCCGGGTTGAAGAAACCAGTCGTAAACTCAATAAAACCCTG
GATGAATGGAGAAAAGAAGGATTGACCGTTTTTCTTTATGACCTGCTTGCCGTTCTTGACGATATTGAGAGAAATATAGG
TGACCTTGAAAATATTAAAACCGAACTTATAACTACCAGTAACCAGTTAAAGGAGATAGCGGGCCTGATTGAAGAAAAAC
TTGTTTTTGTTCCCAGGAATAATCTATATAATGAACTTAATGATTTAAAAAACCTCTTTCTTAAGCTTTCTACCACCCTG
GATCAAAATTACGATTTAATCTCTAGGCAGATAGACGGAAATAATTCGATGGTGGCTTCAATAGATACCTGGCAGGATAA
AATAAAGTCATTACTGAAGGTTGAGAATACCCTGAATGATAATGTAAATTATGATGATATCGGTGAGATTGCCAGTAAAA
TAGAAGAATCAGCCCGGGTTATTGATACTGCAAATATAGAGAATAACCTGACATCTGTCCGGGATTTAATGGTTGAGTTA
AAAAACGGCCAGATCCCTGTAATTATGGAACAGCTGACCTATATTCAAAATTCCTTACCGGAGATGGAGGATAAGGAGAT
TGTCGAAACAATAGAGTTAATCGATAGTTACCTGGCCGGGCAGGTGATACCCGGAGACCAGATTCAGCTTTTAGTCAGTG
GTAATTATAAAAACCAGGAATTGAGGGAAGAGGTAAAGGGTATAGTTAATAATCCCTCGGTAAGCTTTTTCGAAATGGAA
TCAGGTATTTTACAGCCCAATCCCCGGGGAGAGTTATTTAGGATATTAAGCCAGGTTAAGGCTGTTATTTCAACAATAAT
AGCTTTGATTTTTACCCTCCTGGTAATGATGCTTGACCAGACCCTGATAGTCAGTGTAATTAAATTAAATGGAGGACGGG
GATATGTCTACAGTTTTGTTGTTGGTGGACTTACCTTTAGCCTGATCTGCCTTTTGAGCAGGATCAATTTCCCCTACCTT
AACTTTAATATTGAGTTTTTGATAGGTGGGGTTATCGGGCTAATAATGGCCCTTCTCTCCGGGATGTTAAACCCGGTAAA
AAAAGAAGAGTGGGAAGCGGGTAAGGCCCTCGGCTTTTCTCCAGCCGGGATTATGCATGAAATAATTATTCCGTCGGGTA
AACCGGGTTTACTATATTTATTAAACCTCCCTAAAATGATATTTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGCTAAAAATAACCTCCGAATAGATACAACCAATATCCATAAATTGGTTGCTGGATAACATTTACACTCCCTTCCATAG
GATGGTATAATAGGGTTTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTATTTTGTTTCCGGTTCACAATAATTATCAGGTCTTTCTTAATTGGTTTTTTATGGCCGTCAAACTGGCTGACGAAT
TTGAAAACCGCTTAAAATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 789; Mature: 788

Protein sequence:

>789_residues
MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVD
STLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEG
IDFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS
DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKV
YYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTL
DEWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL
DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVEL
KNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEME
SGILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL
NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK

Sequences:

>Translated_789_residues
MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVD
STLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEG
IDFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS
DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKV
YYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTL
DEWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL
DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVEL
KNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEME
SGILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL
NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK
>Mature_788_residues
GVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLLFILSGDKENIALEQIKKVVDS
TLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTYFSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGI
DFLYPIGNGIDVIVKSPELVPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSSD
RVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDNRITCLVQNGSLAADKSSLKVY
YHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNSFLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLD
EWRKEGLTVFLYDLLAVLDDIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTLD
QNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARVIDTANIENNLTSVRDLMVELK
NGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAGQVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEMES
GILQPNPRGELFRILSQVKAVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYLN
FNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYLLNLPKMIFK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88780; Mature: 88649

Theoretical pI: Translated: 4.89; Mature: 4.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLL
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
FILSGDKENIALEQIKKVVDSTLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTY
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
FSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGIDFLYPIGNGIDVIVKSPEL
HHHCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCHH
VPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS
HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCH
DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCC
RITCLVQNGSLAADKSSLKVYYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNS
EEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLDEWRKEGLTVFLYDLLAVLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHH
DIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL
HHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DQNYDLISRQIDGNNSMVASIDTWQDKIKSLLKVENTLNDNVNYDDIGEIASKIEESARV
CCCHHHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IDTANIENNLTSVRDLMVELKNGQIPVIMEQLTYIQNSLPEMEDKEIVETIELIDSYLAG
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
QVIPGDQIQLLVSGNYKNQELREEVKGIVNNPSVSFFEMESGILQPNPRGELFRILSQVK
CCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AVISTIIALIFTLLVMMLDQTLIVSVIKLNGGRGYVYSFVVGGLTFSLICLLSRINFPYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
NFNIEFLIGGVIGLIMALLSGMLNPVKKEEWEAGKALGFSPAGIMHEIIIPSGKPGLLYL
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LNLPKMIFK
ECCHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GVEDMFILKTDFRKDLLVLFIITVLIGTILVLTGGYITKNYFSHMVSGVIGEYGEYDLL
CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
FILSGDKENIALEQIKKVVDSTLPGSVLKAGPRVAGSSNYLLKIPEEFKKEEVYSRIYTY
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
FSDIPGIMSKNIITEPRLSIRGFRGETLPVIRPRIEKIEGIDFLYPIGNGIDVIVKSPEL
HHHCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCHH
VPRVKEQINRILGEYKLLEIRYPLNQHPEDMEKKKKKIIGKIKDEIDGIKVYDVTGTVSS
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DRVSLLNSLKQMKDFLLSYATTVIISEVEDSSRYSVGGILTARNKDGEKILLKIINNKDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCC
RITCLVQNGSLAADKSSLKVYYHNSENGITYIGQGRINNPRQDLAEALESLNEITPRLNS
EEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLEQSEELITHSDRIGKDLKNINEGLARVEETSRKLNKTLDEWRKEGLTVFLYDLLAVLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHH
DIERNIGDLENIKTELITTSNQLKEIAGLIEEKLVFVPRNNLYNELNDLKNLFLKLSTTL
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EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LNLPKMIFK
ECCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA