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The map label for this gene is 220932358

Identifier: 220932358

GI number: 220932358

Start: 1626098

End: 1628566

Strand: Reverse

Name: 220932358

Synonym: Hore_15220

Alternate gene names: NA

Gene position: 1628566-1626098 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932359

Following gene: 220932357

Centisome position: 63.17

GC content: 25.72

Gene sequence:

>2469_bases
TTGGAAAAATTATTTTCACACTATTCTTCAAATAAAAAAAGAGAGTTAGAAGTTCATTTGAAAAATGTAGCAGAAGGCTG
TAAAAATATTATCTTAAACAAGCGGTTAGACTTATCTATAATATCCAAAGATGAACTTACTGATATAGCTTTTTTAATTG
GAGCAGTCCATGATTTTGGAAAGTCAACTACTTTTTTTCAAAATTATTTAGTCCATGGTGAGGAAAATATTTTTTCTCAC
CATGGTTTAATATCAGCGATATTGGCCTATATTTTACTCAAGAAAAAATACACCAGGTTAATGGCAATGATAGGTTATAT
GGTTGTTAAAAGACATCATGGGAACCTGGAATCCCCTGTAGAAGATTGTGGTGAGACTTTCTATCATATAAAAATGCAAA
TTAATGATATAAAACAAAATACATATAATCATGTAAAAAATATTTATGATAATAATATATTAAAAGATACAGAATATTGC
TTTGAAGAGTTATTTAGTGAATTAGAAGAATTTGTTGTGGAAGTAGATGATATTTCTGAATTATTTAGAGAAATAGTTAT
TGAAGACAAGTATAAGAATGAAGACAAGGCTATTGAATTATTTTTAGTAACTAATTTGCTTTATTCAATATTAATTGATA
CTGACAAAAAGGATGCTGCGAGTTTAAATAATGATTATTTTAAAGGAGCGACAGAAGAATATATAAATGTGCAAAAGTAT
ATTAATAAAAAAAGGAAAGAGCAACCAAAAAAATATAATCCTGGATTACCTATTAATAAAGCAAGAAATAGTTTTTTTCA
AGATGTTACAAATCATTCACAAATAAAAGATACAAATTTTTTATATAGTTTAACTGCTCCTACAGGTATTGGTAAGACAT
TTGCATCATTTGCATTTGCAAACAAATTAAGGGAACTTTCCGCTTACGGGAAAAGAATTATTTATTGTCTACCGTATACA
TCTATTATTGACCAAAATTTTAATGAGTTCGAGAAAATAATTAATTTTAACCTTAAAGAAGTTTACAAAAAAAATCCTTC
AAAGTATTTATTAAAACATCATTATCTCACACCTCTTGAACTTAAAAAAAATATTGACTTAGAAAAAGACAGCAGGATAA
GTAGAGATTTAGAGAAATACCTTGATGACAGATTATTATTAGAATCATGGGAATCTGGTAATATTGTTACAACTTTTGTG
CAATTACTGGAAAGCATTATTGGAAATAAAAATAGTTACTTAAAAAAGTTTCATAATATCGTTAACTCAGTAGTTATACT
GGATGAAGTCCAAAATATTCCTGTAGAATATTATCATGTAGTTGGAAAAGTATTAAAAATTCTTGGCAAAAATTTTAATA
CTCATATTTTACTTATGACAGCTACACAACCTGAAATAATTTATGGAAATGACGTTGTTAATCTGGTAAATGAAAAGAAG
TATAATGAAATGAACGTATTTGATAGAGTTAATCTTAAAATTATAGATAAACTAAATCCTTATAATATTGAAGATTTTTT
GGGATATCTTGAATTAAATTTTAACAGTAAAACCGGTTTAATAGTCTGTAATACTATTAGTTCTGCATTAGATATATATA
AATATGTCGATGAGTTATTTACTTCAAAAGGCTATCACGTTTACTCATTAACTACTAATCTAACACCAATTGATAGACTT
GAAAAAATAGATGAAATTAATATGAAGATTGATAAAGGGGAAAAAATAATAGTTGTATCAACTCAATTAATAGAAGCAGG
AGTTGATCTGAGTTTTGAAGAGGTTTTCAGGGATTTTGCACCATTAGATTCTATTATACAGGTTGCTGGTCGTTGTAATA
GGAGTGGGGAGTTGCCACAAAAAGGCAAAGTAAATATCATTATGTTAAAAAATGATAAGGAAGAAATGTACTGTAATAAA
GTATATGATAAAGTATTACTTGATATATGCAGAGAAGTTTTAAGTGAGAAAAAGTCATTTATTGATATGAGTAAAAATTA
TTTTTCGAGAATTAGGGAAAGTTATTTAAGGCAAAGTGATAAATTAATGAATGCAATTTGTAATTTAAATTATAGTAAAG
AAAAAGTTGACCAGGATCCTATTTCAAAATTTAAAATAGTAAAAGAACAGGGAGGTAAAGATAACATAATTATTTGTAAA
AATAAAGATATAGAAAATAAGATAGAAGAACTTAAAGAAATATATGAAGAAATTAAGTTGAGTTATAATGATAGAAAAAA
ATTAAATAGGTTAATTGCCAAAAAAGAAATATTAAACAAAGAATTAGCCCTATATAAAATTAATGTTTATACTAACCAAT
TAAAAGAATACGAAAAACACTATATAATAAAGAAATTTAGATTTATCAAGTATGTCAGTTATGAGGATCAGAAAAAGTAT
TTGTATGATGATAATATTGGTTTTCTTAAAGAACCTAAAAAAAAGTTTGAATCAACTATGTTTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTATGAAGAAAATGGAGCAAATATAAATGGGTCTTTTTATGAAGTAATAAAATTAAAAGATGATTATATAAGTTTTTAT
ACTCCAGTGAGGTGACTGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATATGGTTTAGTTTGAGGTGATAGATTGATGCAGTTGGTTATCAACACATACGGTAGTTACCTTCATGTAAAACAAA
AATCGTTTGAAATAAAGACT

Product: CRISPR-associated helicase Cas3

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 822; Mature: 822

Protein sequence:

>822_residues
MEKLFSHYSSNKKRELEVHLKNVAEGCKNIILNKRLDLSIISKDELTDIAFLIGAVHDFGKSTTFFQNYLVHGEENIFSH
HGLISAILAYILLKKKYTRLMAMIGYMVVKRHHGNLESPVEDCGETFYHIKMQINDIKQNTYNHVKNIYDNNILKDTEYC
FEELFSELEEFVVEVDDISELFREIVIEDKYKNEDKAIELFLVTNLLYSILIDTDKKDAASLNNDYFKGATEEYINVQKY
INKKRKEQPKKYNPGLPINKARNSFFQDVTNHSQIKDTNFLYSLTAPTGIGKTFASFAFANKLRELSAYGKRIIYCLPYT
SIIDQNFNEFEKIINFNLKEVYKKNPSKYLLKHHYLTPLELKKNIDLEKDSRISRDLEKYLDDRLLLESWESGNIVTTFV
QLLESIIGNKNSYLKKFHNIVNSVVILDEVQNIPVEYYHVVGKVLKILGKNFNTHILLMTATQPEIIYGNDVVNLVNEKK
YNEMNVFDRVNLKIIDKLNPYNIEDFLGYLELNFNSKTGLIVCNTISSALDIYKYVDELFTSKGYHVYSLTTNLTPIDRL
EKIDEINMKIDKGEKIIVVSTQLIEAGVDLSFEEVFRDFAPLDSIIQVAGRCNRSGELPQKGKVNIIMLKNDKEEMYCNK
VYDKVLLDICREVLSEKKSFIDMSKNYFSRIRESYLRQSDKLMNAICNLNYSKEKVDQDPISKFKIVKEQGGKDNIIICK
NKDIENKIEELKEIYEEIKLSYNDRKKLNRLIAKKEILNKELALYKINVYTNQLKEYEKHYIIKKFRFIKYVSYEDQKKY
LYDDNIGFLKEPKKKFESTMFA

Sequences:

>Translated_822_residues
MEKLFSHYSSNKKRELEVHLKNVAEGCKNIILNKRLDLSIISKDELTDIAFLIGAVHDFGKSTTFFQNYLVHGEENIFSH
HGLISAILAYILLKKKYTRLMAMIGYMVVKRHHGNLESPVEDCGETFYHIKMQINDIKQNTYNHVKNIYDNNILKDTEYC
FEELFSELEEFVVEVDDISELFREIVIEDKYKNEDKAIELFLVTNLLYSILIDTDKKDAASLNNDYFKGATEEYINVQKY
INKKRKEQPKKYNPGLPINKARNSFFQDVTNHSQIKDTNFLYSLTAPTGIGKTFASFAFANKLRELSAYGKRIIYCLPYT
SIIDQNFNEFEKIINFNLKEVYKKNPSKYLLKHHYLTPLELKKNIDLEKDSRISRDLEKYLDDRLLLESWESGNIVTTFV
QLLESIIGNKNSYLKKFHNIVNSVVILDEVQNIPVEYYHVVGKVLKILGKNFNTHILLMTATQPEIIYGNDVVNLVNEKK
YNEMNVFDRVNLKIIDKLNPYNIEDFLGYLELNFNSKTGLIVCNTISSALDIYKYVDELFTSKGYHVYSLTTNLTPIDRL
EKIDEINMKIDKGEKIIVVSTQLIEAGVDLSFEEVFRDFAPLDSIIQVAGRCNRSGELPQKGKVNIIMLKNDKEEMYCNK
VYDKVLLDICREVLSEKKSFIDMSKNYFSRIRESYLRQSDKLMNAICNLNYSKEKVDQDPISKFKIVKEQGGKDNIIICK
NKDIENKIEELKEIYEEIKLSYNDRKKLNRLIAKKEILNKELALYKINVYTNQLKEYEKHYIIKKFRFIKYVSYEDQKKY
LYDDNIGFLKEPKKKFESTMFA
>Mature_822_residues
MEKLFSHYSSNKKRELEVHLKNVAEGCKNIILNKRLDLSIISKDELTDIAFLIGAVHDFGKSTTFFQNYLVHGEENIFSH
HGLISAILAYILLKKKYTRLMAMIGYMVVKRHHGNLESPVEDCGETFYHIKMQINDIKQNTYNHVKNIYDNNILKDTEYC
FEELFSELEEFVVEVDDISELFREIVIEDKYKNEDKAIELFLVTNLLYSILIDTDKKDAASLNNDYFKGATEEYINVQKY
INKKRKEQPKKYNPGLPINKARNSFFQDVTNHSQIKDTNFLYSLTAPTGIGKTFASFAFANKLRELSAYGKRIIYCLPYT
SIIDQNFNEFEKIINFNLKEVYKKNPSKYLLKHHYLTPLELKKNIDLEKDSRISRDLEKYLDDRLLLESWESGNIVTTFV
QLLESIIGNKNSYLKKFHNIVNSVVILDEVQNIPVEYYHVVGKVLKILGKNFNTHILLMTATQPEIIYGNDVVNLVNEKK
YNEMNVFDRVNLKIIDKLNPYNIEDFLGYLELNFNSKTGLIVCNTISSALDIYKYVDELFTSKGYHVYSLTTNLTPIDRL
EKIDEINMKIDKGEKIIVVSTQLIEAGVDLSFEEVFRDFAPLDSIIQVAGRCNRSGELPQKGKVNIIMLKNDKEEMYCNK
VYDKVLLDICREVLSEKKSFIDMSKNYFSRIRESYLRQSDKLMNAICNLNYSKEKVDQDPISKFKIVKEQGGKDNIIICK
NKDIENKIEELKEIYEEIKLSYNDRKKLNRLIAKKEILNKELALYKINVYTNQLKEYEKHYIIKKFRFIKYVSYEDQKKY
LYDDNIGFLKEPKKKFESTMFA

Specific function: Unknown

COG id: COG1203

COG function: function code R; Predicted helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 helicase C-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR011545
- InterPro:   IPR001650
- InterPro:   IPR006474
- InterPro:   IPR014021 [H]

Pfam domain/function: PF00270 DEAD; PF00271 Helicase_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96359; Mature: 96359

Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKLFSHYSSNKKRELEVHLKNVAEGCKNIILNKRLDLSIISKDELTDIAFLIGAVHDFG
CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSTTFFQNYLVHGEENIFSHHGLISAILAYILLKKKYTRLMAMIGYMVVKRHHGNLESPV
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
EDCGETFYHIKMQINDIKQNTYNHVKNIYDNNILKDTEYCFEELFSELEEFVVEVDDISE
HHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFREIVIEDKYKNEDKAIELFLVTNLLYSILIDTDKKDAASLNNDYFKGATEEYINVQKY
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
INKKRKEQPKKYNPGLPINKARNSFFQDVTNHSQIKDTNFLYSLTAPTGIGKTFASFAFA
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
NKLRELSAYGKRIIYCLPYTSIIDQNFNEFEKIINFNLKEVYKKNPSKYLLKHHYLTPLE
HHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHH
LKKNIDLEKDSRISRDLEKYLDDRLLLESWESGNIVTTFVQLLESIIGNKNSYLKKFHNI
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VNSVVILDEVQNIPVEYYHVVGKVLKILGKNFNTHILLMTATQPEIIYGNDVVNLVNEKK
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEECCHHHHHHHHCC
YNEMNVFDRVNLKIIDKLNPYNIEDFLGYLELNFNSKTGLIVCNTISSALDIYKYVDELF
CCCCCHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSKGYHVYSLTTNLTPIDRLEKIDEINMKIDKGEKIIVVSTQLIEAGVDLSFEEVFRDFA
CCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC
PLDSIIQVAGRCNRSGELPQKGKVNIIMLKNDKEEMYCNKVYDKVLLDICREVLSEKKSF
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDMSKNYFSRIRESYLRQSDKLMNAICNLNYSKEKVDQDPISKFKIVKEQGGKDNIIICK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC
NKDIENKIEELKEIYEEIKLSYNDRKKLNRLIAKKEILNKELALYKINVYTNQLKEYEKH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
YIIKKFRFIKYVSYEDQKKYLYDDNIGFLKEPKKKFESTMFA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEKLFSHYSSNKKRELEVHLKNVAEGCKNIILNKRLDLSIISKDELTDIAFLIGAVHDFG
CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSTTFFQNYLVHGEENIFSHHGLISAILAYILLKKKYTRLMAMIGYMVVKRHHGNLESPV
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
EDCGETFYHIKMQINDIKQNTYNHVKNIYDNNILKDTEYCFEELFSELEEFVVEVDDISE
HHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFREIVIEDKYKNEDKAIELFLVTNLLYSILIDTDKKDAASLNNDYFKGATEEYINVQKY
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
INKKRKEQPKKYNPGLPINKARNSFFQDVTNHSQIKDTNFLYSLTAPTGIGKTFASFAFA
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
NKLRELSAYGKRIIYCLPYTSIIDQNFNEFEKIINFNLKEVYKKNPSKYLLKHHYLTPLE
HHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHH
LKKNIDLEKDSRISRDLEKYLDDRLLLESWESGNIVTTFVQLLESIIGNKNSYLKKFHNI
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VNSVVILDEVQNIPVEYYHVVGKVLKILGKNFNTHILLMTATQPEIIYGNDVVNLVNEKK
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEECCHHHHHHHHCC
YNEMNVFDRVNLKIIDKLNPYNIEDFLGYLELNFNSKTGLIVCNTISSALDIYKYVDELF
CCCCCHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSKGYHVYSLTTNLTPIDRLEKIDEINMKIDKGEKIIVVSTQLIEAGVDLSFEEVFRDFA
CCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC
PLDSIIQVAGRCNRSGELPQKGKVNIIMLKNDKEEMYCNKVYDKVLLDICREVLSEKKSF
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDMSKNYFSRIRESYLRQSDKLMNAICNLNYSKEKVDQDPISKFKIVKEQGGKDNIIICK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC
NKDIENKIEELKEIYEEIKLSYNDRKKLNRLIAKKEILNKELALYKINVYTNQLKEYEKH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
YIIKKFRFIKYVSYEDQKKYLYDDNIGFLKEPKKKFESTMFA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]