Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yjbG [H]

Identifier: 220931661

GI number: 220931661

Start: 878512

End: 880308

Strand: Direct

Name: yjbG [H]

Synonym: Hore_08170

Alternate gene names: 220931661

Gene position: 878512-880308 (Clockwise)

Preceding gene: 220931660

Following gene: 220931663

Centisome position: 34.08

GC content: 35.78

Gene sequence:

>1797_bases
ATGGCTAAAGAATTACCCGAAAGAAATAAAATTGATGATAAGTATAAATGGGATTTGGAGGATATATATAAAACAGATGA
AGAGTGGGAAAAAGATTTTAACAGGGTAAAGGATAAATTAAAGGATATTGCTACATTCCAGGGCAAGCTGGTTAATTCCA
GTCAGAATCTTTTAGACGGGTTAAATTTAATTATGGAGGTAGAAGAAGTAGCCACCAGGCTTTATGCTTATGCCCACATG
AGACAGGACGAGGATACCAGAGACCAGTCTTATCAATCTTTATTTAACCGTGCGCAGAGTCTACATAATGAGCTGGCCAG
TATTACATCCTTCATGGTTCCAGAAATCTTAACCCTGTCCCGGGAGCAAATGAATAAATATCTTGAAGAAAAAGAGGGGT
TAAAACTTTACCGGCATTTACTGGATAATATCCTGCGTCAAAAAGATCATTACCTTTCTGCAAAAGAAGAAAGGCTAATT
GCAATGGCCGGTGAAGTTACCCAGGGTCCCTATAATATTTTTAGTATGATGAATAATGCTGATCTTACCTTTCCTATAAT
TAAAGATGAAAAGGGTGAAGAGGTCAGGGTAACCCATGGCAGGTTCATTGAACTTATGGAAAATAAAAACAGAAGAGTCC
GTAAAGATGCTTTTAAAGCCCTTTACAGTAAATATAATGAATTTATAAATACCTTTGCCAGTACCCTGAATACGGCTGTA
AAAAGCCATATATATTATGCCAGGGTCCGTAAATATAATTCAGCCCTCGAATCTGCCCTTGATGATGATAATGTTCCAGT
TGATGTTTATAATAATTTAATTAAAACAATAAAAGACAATCTTAAACCTATGTATAAATATATGAAATTAAGAAAAGAGA
TCCTTGGTGTTGATGAGCTTCATATGTATGATATTTATACTCCACTGGTTTCTGATCTTGATATAAAAATTCCTTATGAG
GAAGCCAAAGAAATGGTTATTAATGGCCTGAAACCACTGGGGGATGAATACCTAAATATCTTGAAGGAAGGTTTTAATTC
TGGATGGATTGATGTTTATGAAAATAAGGGAAAAAGGTCAGGGGCTTATTCATCTGGATGTTACGGGGTACACCCTTATG
TTCTTTTAAATTATACTGACAACCTTGATAATGTCTTTACGCTGGCCCATGAAATGGGGCATGCTATCCATACATATTAT
TCAAACAAAAATCAACCTTTTGTGTATGCTAATTATAAGATTTTTGTGGCTGAAGTGGCATCTACCCTGAATGAAACATT
ACTTATCAAGTATCTCCTTGAGAACACACAAGATGAGAAGAAGAAAAAATATTTAATTAATCACTATCTGGAACAGTTCC
GGGGTACTGTATACCGCCAGACTATGTTCGCTGAGTTTGAAAAGATAATTCATGAAAAAGTAGAACAGGGACAGCCTTTA
ACTTCTGGATTATTGAAGGAAATATATAAAAAATTAAATGAGGAATATTACGGACCTGATGTTGTTTCTGATGAGGAGAT
TGCACTGGAATGGGCCCGTATACCTCACTTTTACTACAATTTCTATGTTTATAAATACGCAACTGGTTTTTCGGCAGCAA
CAGCCCTGGCCAATAAGATTTTAGAAGAAGGGGATAAGGCAGTTCAAAGATATATCCAGTTCTTAAAAAGTGGTGATTCT
GATTATCCATTAAACGTCCTGAAAAAGGCCGGGGTAGATATGTCGTCACCTGAGCCCATTGAATCAGCCATTTCAACCTT
TAAAGAATTTGTTGACAGGTTTGAGAAATTAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTACCGGGGCTTATTATGACCTATTAACTCTTATTTTTTAAATTACATTTGAATAAGGATGGTTTTAAATTTGTTTATAA
ATCATAAAGGAGTGAGGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAAAGTATCACTTCTCCAGAAGATATAATAAAACATAGAAAAAATGTAAGAGGGTTGTTTTAATATTGACCTGTGAT
TTATTCTTATAGCTCCCCCT

Product: Oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 598; Mature: 597

Protein sequence:

>598_residues
MAKELPERNKIDDKYKWDLEDIYKTDEEWEKDFNRVKDKLKDIATFQGKLVNSSQNLLDGLNLIMEVEEVATRLYAYAHM
RQDEDTRDQSYQSLFNRAQSLHNELASITSFMVPEILTLSREQMNKYLEEKEGLKLYRHLLDNILRQKDHYLSAKEERLI
AMAGEVTQGPYNIFSMMNNADLTFPIIKDEKGEEVRVTHGRFIELMENKNRRVRKDAFKALYSKYNEFINTFASTLNTAV
KSHIYYARVRKYNSALESALDDDNVPVDVYNNLIKTIKDNLKPMYKYMKLRKEILGVDELHMYDIYTPLVSDLDIKIPYE
EAKEMVINGLKPLGDEYLNILKEGFNSGWIDVYENKGKRSGAYSSGCYGVHPYVLLNYTDNLDNVFTLAHEMGHAIHTYY
SNKNQPFVYANYKIFVAEVASTLNETLLIKYLLENTQDEKKKKYLINHYLEQFRGTVYRQTMFAEFEKIIHEKVEQGQPL
TSGLLKEIYKKLNEEYYGPDVVSDEEIALEWARIPHFYYNFYVYKYATGFSAATALANKILEEGDKAVQRYIQFLKSGDS
DYPLNVLKKAGVDMSSPEPIESAISTFKEFVDRFEKLS

Sequences:

>Translated_598_residues
MAKELPERNKIDDKYKWDLEDIYKTDEEWEKDFNRVKDKLKDIATFQGKLVNSSQNLLDGLNLIMEVEEVATRLYAYAHM
RQDEDTRDQSYQSLFNRAQSLHNELASITSFMVPEILTLSREQMNKYLEEKEGLKLYRHLLDNILRQKDHYLSAKEERLI
AMAGEVTQGPYNIFSMMNNADLTFPIIKDEKGEEVRVTHGRFIELMENKNRRVRKDAFKALYSKYNEFINTFASTLNTAV
KSHIYYARVRKYNSALESALDDDNVPVDVYNNLIKTIKDNLKPMYKYMKLRKEILGVDELHMYDIYTPLVSDLDIKIPYE
EAKEMVINGLKPLGDEYLNILKEGFNSGWIDVYENKGKRSGAYSSGCYGVHPYVLLNYTDNLDNVFTLAHEMGHAIHTYY
SNKNQPFVYANYKIFVAEVASTLNETLLIKYLLENTQDEKKKKYLINHYLEQFRGTVYRQTMFAEFEKIIHEKVEQGQPL
TSGLLKEIYKKLNEEYYGPDVVSDEEIALEWARIPHFYYNFYVYKYATGFSAATALANKILEEGDKAVQRYIQFLKSGDS
DYPLNVLKKAGVDMSSPEPIESAISTFKEFVDRFEKLS
>Mature_597_residues
AKELPERNKIDDKYKWDLEDIYKTDEEWEKDFNRVKDKLKDIATFQGKLVNSSQNLLDGLNLIMEVEEVATRLYAYAHMR
QDEDTRDQSYQSLFNRAQSLHNELASITSFMVPEILTLSREQMNKYLEEKEGLKLYRHLLDNILRQKDHYLSAKEERLIA
MAGEVTQGPYNIFSMMNNADLTFPIIKDEKGEEVRVTHGRFIELMENKNRRVRKDAFKALYSKYNEFINTFASTLNTAVK
SHIYYARVRKYNSALESALDDDNVPVDVYNNLIKTIKDNLKPMYKYMKLRKEILGVDELHMYDIYTPLVSDLDIKIPYEE
AKEMVINGLKPLGDEYLNILKEGFNSGWIDVYENKGKRSGAYSSGCYGVHPYVLLNYTDNLDNVFTLAHEMGHAIHTYYS
NKNQPFVYANYKIFVAEVASTLNETLLIKYLLENTQDEKKKKYLINHYLEQFRGTVYRQTMFAEFEKIIHEKVEQGQPLT
SGLLKEIYKKLNEEYYGPDVVSDEEIALEWARIPHFYYNFYVYKYATGFSAATALANKILEEGDKAVQRYIQFLKSGDSD
YPLNVLKKAGVDMSSPEPIESAISTFKEFVDRFEKLS

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69927; Mature: 69796

Theoretical pI: Translated: 5.59; Mature: 5.59

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKELPERNKIDDKYKWDLEDIYKTDEEWEKDFNRVKDKLKDIATFQGKLVNSSQNLLDG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LNLIMEVEEVATRLYAYAHMRQDEDTRDQSYQSLFNRAQSLHNELASITSFMVPEILTLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REQMNKYLEEKEGLKLYRHLLDNILRQKDHYLSAKEERLIAMAGEVTQGPYNIFSMMNNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC
DLTFPIIKDEKGEEVRVTHGRFIELMENKNRRVRKDAFKALYSKYNEFINTFASTLNTAV
CCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSHIYYARVRKYNSALESALDDDNVPVDVYNNLIKTIKDNLKPMYKYMKLRKEILGVDEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
HMYDIYTPLVSDLDIKIPYEEAKEMVINGLKPLGDEYLNILKEGFNSGWIDVYENKGKRS
HHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCC
GAYSSGCYGVHPYVLLNYTDNLDNVFTLAHEMGHAIHTYYSNKNQPFVYANYKIFVAEVA
CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHH
STLNETLLIKYLLENTQDEKKKKYLINHYLEQFRGTVYRQTMFAEFEKIIHEKVEQGQPL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
TSGLLKEIYKKLNEEYYGPDVVSDEEIALEWARIPHFYYNFYVYKYATGFSAATALANKI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEHHCCHHHHHHHHHHH
LEEGDKAVQRYIQFLKSGDSDYPLNVLKKAGVDMSSPEPIESAISTFKEFVDRFEKLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AKELPERNKIDDKYKWDLEDIYKTDEEWEKDFNRVKDKLKDIATFQGKLVNSSQNLLDG
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LNLIMEVEEVATRLYAYAHMRQDEDTRDQSYQSLFNRAQSLHNELASITSFMVPEILTLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REQMNKYLEEKEGLKLYRHLLDNILRQKDHYLSAKEERLIAMAGEVTQGPYNIFSMMNNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC
DLTFPIIKDEKGEEVRVTHGRFIELMENKNRRVRKDAFKALYSKYNEFINTFASTLNTAV
CCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSHIYYARVRKYNSALESALDDDNVPVDVYNNLIKTIKDNLKPMYKYMKLRKEILGVDEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
HMYDIYTPLVSDLDIKIPYEEAKEMVINGLKPLGDEYLNILKEGFNSGWIDVYENKGKRS
HHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCC
GAYSSGCYGVHPYVLLNYTDNLDNVFTLAHEMGHAIHTYYSNKNQPFVYANYKIFVAEVA
CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHH
STLNETLLIKYLLENTQDEKKKKYLINHYLEQFRGTVYRQTMFAEFEKIIHEKVEQGQPL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
TSGLLKEIYKKLNEEYYGPDVVSDEEIALEWARIPHFYYNFYVYKYATGFSAATALANKI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEHHCCHHHHHHHHHHH
LEEGDKAVQRYIQFLKSGDSDYPLNVLKKAGVDMSSPEPIESAISTFKEFVDRFEKLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]