Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

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The map label for this gene is spoIIIAE [H]

Identifier: 220931465

GI number: 220931465

Start: 673085

End: 674278

Strand: Direct

Name: spoIIIAE [H]

Synonym: Hore_06210

Alternate gene names: 220931465

Gene position: 673085-674278 (Clockwise)

Preceding gene: 220931464

Following gene: 220931466

Centisome position: 26.11

GC content: 33.84

Gene sequence:

>1194_bases
ATGAAAAGGTTAATCTCTATAATTATATTAATAAATATAATTCTAATGATGACAATACCGGTTTTGGCTGAGGAAACACC
CCTTAAAGAAGCCCCCCTTAATAAAGAAGATATTATATTAAACCAGATAGAAAAGATTAATTTAAATCAACTACAAAAAG
AGGTTGATAAAATAAATAAAAATATGGAGGGTTACATGCCCCACTTAAACATTAAAGAATTGATCCTTGGTTTTATGAAG
GGGGATCTTGACGTTAGCTGGGCCCAGATAGGGGGGGCTCTTCTTAAGTATCTGGGGAAGGAAGTGACTGCTAATTTTAA
AATACTGGGACAGATCATTATTTTAGCTGTTATGGCAGCAATTTTAAATGTGTTTCATAATTCTTTTACAAGTGAAACCA
TCAGTAAGACTGCGAGCATGTTAATATTTATGGTTCTGGCAATATTATCCCTGAATGGATTTAAAATAGCTGTAGAAATC
GGTATTACCACTATAGATACGATGGTTTCATTTATGCAGGCCCTTATCCCCGTTCTGTTAACTCTTCTGGTCAGTATCGG
GGCCATGACATCTGCAGCTGTTTTTCATCCCATAACCTTTATGGTTATTTCTTTTTTAAGTTCTTTGATCAGGACAATAA
TTTTTCCAATGATTTTTATTTCAGCTATTTTAAATATTGTTAATAACATTACCAGTGAATTTAAAATATCTAGACTGTCA
GGTTTATTTAAAGAATTTAGTATGGGGATGCTAGGTTTATCCCTTATTTTGTTTACAGGTATTATGGTTATACAGGGTGG
AGCAGCTGCAGTGACAGACAGTCTATCTTTACGGACAGCAAAATATCTTACCGGAACTTTTATTCCCATCATCGGGGGTA
TTTTTTCAGATGCAGTGGATTTAATTGTTAGCTGTTCATTGATTATAAAAAATGCTATAAATCTATTTGGAATGATAGTA
ATCGTTTTTATGATCTCTTATCCATTAATTAAAATAATAGCCCTGATAATAATATATAAAATTGCCGGGGCTATAATTCA
GCCCATCAGTGATGGACGGCTGGTAAATATACTCGACAATCTGGGGAATACTCTGGTTCTGATTTTTCTAGCAGTAAGTG
GAGTATCATTAATGTTCTTTATTGTACTAACTATCCTCGTCGGTTCTGCCAATTTAACAGTAATGATGAGGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGCAGCTAAAATTATTATAATGATTTTGACAATCCCGGTGATGATTACTTTGATAGAGACTATTATAGATTTAATTCCG
TAAGCAGTGAGGGGATATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGATGGATGAGTTAACCAGGTGGGTAAAGAACCTCATTTTTATTATTCTGTTTACAACCTTTATAGAAATGTTTTTA
CCTGAAAATAACATGAGAAA

Product: Sporulation stage III protein AE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 397; Mature: 397

Protein sequence:

>397_residues
MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK
GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI
GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS
GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV
IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR

Sequences:

>Translated_397_residues
MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK
GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI
GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS
GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV
IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR
>Mature_397_residues
MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINKNMEGYMPHLNIKELILGFMK
GDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAAILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEI
GITTIDTMVSFMQALIPVLLTLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS
GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVDLIVSCSLIIKNAINLFGMIV
IVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDNLGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014194 [H]

Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43333; Mature: 43333

Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
5.5 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
5.5 %Met     (Mature Protein)
5.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
NMEGYMPHLNIKELILGFMKGDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAA
CHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEIGITTIDTMVSFMQALIPVLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIVSCSLIIKNAINLFGMIVIVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
LGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MKRLISIIILINIILMMTIPVLAEETPLKEAPLNKEDIILNQIEKINLNQLQKEVDKINK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
NMEGYMPHLNIKELILGFMKGDLDVSWAQIGGALLKYLGKEVTANFKILGQIIILAVMAA
CHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILNVFHNSFTSETISKTASMLIFMVLAILSLNGFKIAVEIGITTIDTMVSFMQALIPVLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLVSIGAMTSAAVFHPITFMVISFLSSLIRTIIFPMIFISAILNIVNNITSEFKISRLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLFKEFSMGMLGLSLILFTGIMVIQGGAAAVTDSLSLRTAKYLTGTFIPIIGGIFSDAVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIVSCSLIIKNAINLFGMIVIVFMISYPLIKIIALIIIYKIAGAIIQPISDGRLVNILDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
LGNTLVLIFLAVSGVSLMFFIVLTILVGSANLTVMMR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]