| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is feoB [C]
Identifier: 220931436
GI number: 220931436
Start: 644322
End: 645764
Strand: Direct
Name: feoB [C]
Synonym: Hore_05920
Alternate gene names: 220931436
Gene position: 644322-645764 (Clockwise)
Preceding gene: 220931435
Following gene: 220931437
Centisome position: 24.99
GC content: 37.35
Gene sequence:
>1443_bases ATGAAAGCCTTTTTAAAATTTGAGGACCCTCTTGAAAGGTCACTTCAAGAACTTTCTTCCCTTTTTAAAAAGAACTACCC TGTCAGTCATCGGGCCCTGGTACTTATGGTCTTATCAGGGGATAAAGAAATAGAAGACCTAATTTCCAGGTCTGAAAGTG ATAATCTGGTTGATAGAATAAAAAAACATAAGAATAAGTTAAGGAAGGATTACGGGTATCCTCTGGAGGTAGTTATCTCT AAACAGAGGAAAGAAAAAGTCAAAAAAGTAGTTGGGGAAGTTTTAAAAAAAGATCAGCAATCAGGTAATGTCCTGAAAGA GACTATAGATTTTCTGACGATAAATCCCTACAGTGGTCCTGTTATTCTGGCAATAGTTCTTATAGGATTATACTACCTGG TCGGGGTAGTAGGAGCCCGGTACCTGGTTGATTTTATTGAAAAAAACTTTTTTATAGATTATTTTAATCCTTTGATTACA GAATTTATTGAAATGATTATTCCATACCGAATTTTGCAGGAACTTTTTGTTGGTGATTATGGTATATTTACTCTGGCTTT AAGATATGCCATTGCCCTCGTTCTACCGATTGTGGGTTGTTTCTTTCTGGCTTTTTCTATTCTGGAGGATTCAGGTTATT TCCCCCGGATAGCGGTTTTATCAAATAAAATTCTAAAGGTTATTGGACTGAACGGAAGGGCTGTTATCCCCATATTACTC GGTTTTGGGTGTGGCACCATGGCTACCATTGCAACCAGGGTCCTGGAGCGTAAAAGAGAACGGATACTCGTAACCTTCCT CTTAGCCCTGGCAATACCCTGTTCCAGTCAGATGGGGTTAATAAGTGGAATTTTAGCAGGTAATCCAGTAGGTCTTTTAA TCTGGGTCATTGTTGTGGGTGCAGTCTTTACAGTAACAGGTTATTTACTGGGATTAATTTTACCAGGAAGATCAGGGGCC TTTTATATGGAATTAACTGAACTTCGTATTCCCCGACCCGTACACATTATTAAGAAGACAGTTAACCGTATGAGGTGGTA TTTTCTGGAAGTTGTCCCTTTGTTTATATATGCCAGTTTTTTTATCTGGATAGGCAGGTTAACCGGTTTATTTGAAAGGT TTTTAAACTTGCTACATCCTGTAGTAAGGATGGTTGGTCTTCCCGGGGAATCAGCTGTCATATTTTTATATGGTTTTTTT AGGAGGGATTATGGGGCAGCCGGCCTTTATGACCTCTATAGAAGTGGAGTATTAAATAACCGTTCTTTAATAGTGGTTTC AGTAATTTTAACCTTATTTGTTCCCTGTGTTGCTCATTTTTCTATGATAATCAGGGAACGGGGTCTGATTACAGGTCTGG TAATAACAGGACTTGTATTTATAATTGCCTTTACAACAGGATATATCTTAAATAATATTTTCTTTTTATTAAATATAGTA TAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAGATTATTCATAATTGATGTTCTGGTTGCAAAACAGGACGGCGATCTCTATTATGAAATTTGTTGAACATAAATTACT TTAAATCAGGGAGTTTTTCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGACCAGTGTTTTTGCTTTTAATGTTGTTGAAGATTGGGTTAGTTTCAGGCTATTGAGGCCAATTAAATATCCTGTGAT TAGATATTATTACGTGTATT
Product: ferrous iron transport protein FeoB
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480
Protein sequence:
>480_residues MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV
Sequences:
>Translated_480_residues MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV >Mature_480_residues MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRIKKHKNKLRKDYGYPLEVVIS KQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGPVILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLIT EFIEMIIPYRILQELFVGDYGIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVGAVFTVTGYLLGLILPGRSGA FYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASFFIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFF RRDYGAAGLYDLYRSGVLNNRSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=371, Percent_Identity=23.1805929919137, Blast_Score=80, Evalue=2e-16,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54191; Mature: 54191
Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHH KKHKNKLRKDYGYPLEVVISKQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGP HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCCH VILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLITEFIEMIIPYRILQELFVGDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH GIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVG HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH AVFTVTGYLLGLILPGRSGAFYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASF HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFFRRDYGAAGLYDLYRSGVLNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCC RSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKAFLKFEDPLERSLQELSSLFKKNYPVSHRALVLMVLSGDKEIEDLISRSESDNLVDRI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHH KKHKNKLRKDYGYPLEVVISKQRKEKVKKVVGEVLKKDQQSGNVLKETIDFLTINPYSGP HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCCH VILAIVLIGLYYLVGVVGARYLVDFIEKNFFIDYFNPLITEFIEMIIPYRILQELFVGDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH GIFTLALRYAIALVLPIVGCFFLAFSILEDSGYFPRIAVLSNKILKVIGLNGRAVIPILL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH GFGCGTMATIATRVLERKRERILVTFLLALAIPCSSQMGLISGILAGNPVGLLIWVIVVG HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH AVFTVTGYLLGLILPGRSGAFYMELTELRIPRPVHIIKKTVNRMRWYFLEVVPLFIYASF HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIWIGRLTGLFERFLNLLHPVVRMVGLPGESAVIFLYGFFRRDYGAAGLYDLYRSGVLNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCC RSLIVVSVILTLFVPCVAHFSMIIRERGLITGLVITGLVFIIAFTTGYILNNIFFLLNIV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]