Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

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The map label for this gene is 220931258

Identifier: 220931258

GI number: 220931258

Start: 425261

End: 427855

Strand: Direct

Name: 220931258

Synonym: Hore_04130

Alternate gene names: NA

Gene position: 425261-427855 (Clockwise)

Preceding gene: 220931257

Following gene: 220931259

Centisome position: 16.49

GC content: 37.69

Gene sequence:

>2595_bases
ATGAATTTTACTTATCTAGACTATCACGAGGATCTTTTTAGTAAAATAATCAGTAATGACCTTCCCAGAATCTATGTTTT
TGATAACACTAATAACATGCTCAAGGCCAGGGAATATTACAAAAAACCATTATTACAACGGGGAAGTATTTTTATTACTA
TATCAGACCTGAAAGAAAAACTATTCCCGACTGACCGCCTCATTTTAAAGGAAGAAAAGTTAGCAGTAATATTCTATGAA
TTACTGACAGAAAGAGAGAAGAAGGAACTCCAGATAAGTGACTATTTTGATGCCATTGAATTTGCCAGTGAATTTTTTAA
TTTTTTCAATGAATTAAATGAATATGGTGTTAAAAATATTGATAATTTAAGGAAATGGCAGGAGAAGAAGTATAATCTTT
TTAAAACAATCAGAAAAAGGTACCGAAAGCGTCTAGAGGAACTCAATTATACGGATCGGACCCTGGCTTTTAATTTTAAT
AACTTCTGTTCTCATTTTATGGAGGGATATAATGAACTTGTTTTTGTTAATATTGTTAACTTTACCCCGAAAGAAAAAAG
GTTGTTAAAGTTGCTTCAGGAAACAGGAAAAGAAATTAATCTGGTGTTACAGCTTTCCCCCGATGACTTTGATGAAGAGT
CCCTGAGATTAAAATCGGTAACCCTTCCTGAAGAGTTAAGTTCTGAGATTGAGTTGTATTATACAGGGGAACGTTTGACC
CAGATGGTTAATCTGATTTCAAAAATGGAGGCAGAAAACGGAAATATAACCATTCTGGATGCTGATTATAATAACACATG
CTACCATCGTCTCATATCACCTGATAAAATAGACATTGACCGGGATTTAAGTTTTACGGAAACGAAAATATACAGGTTTT
TAGAGGTTATATATAACCTTCTCAAAAATGCCGATTCCACCGATGGTTTTTTAAGGGTTGAGCTTAATGATCTGTTGGAG
GCATGTTATCTCCAGGAATTCAGGGATTACTTCAGTATTAATGAAAATGCCGTAAAAGTCCTGCAGGAACTGGCCCGGGA
GGAATATGCCTACTTTTATCCTGGCTTTATAAAAAGGTATATATCACTGAAGAGATTTGGAGAGGTCCTCGAAGAGATAG
AAAAATTAAGACAGATAGAAAACATAAATCAGTTATGTAATTACCTGGAAAACCTCAATCTGTATTTTCTCAATGACAGG
GAGATCAGTAATAATATAACCCAGTATTTTGACGCCCTGCTAGAGTTGAATTCTCTTGAAGAGATGGGGATTGTTAGTTC
CTGGGACCATTATTTTAAAGATAAGGCCCGTGGCCTTTTCCGCATGGCTTTAAATTACCTGCGATATAAAAAGGTAAAAC
CGGTTATTGACAACCAGAATAAAGGTAATAAACTTGATAGTCTGTTTTCTGCTCCCCACCTTTCCCGGGATATACTGATA
GTCCTCAATGCTTCCCGGGGGGTTATTCCTTCAGAGGCAGGGAATGATTTTATATTGACCGACAGGCAGAGGGCGGAACT
GGGTTTAGAGACAATAAATAATTTAAGATTGAGGGAGAAGTATTATTTTTACCGCCATATTTTAAACAGCCAGAAAACCA
TTATCTTCAGCCTGAAAAATCTGGAGAGCAACCTGACGACCAGCTCTTTTGTTGATGAACTCAGGTTAAAATACGGACTT
GACCTTAAAGAAGCGGAGATTACTTCCCGGCAGCTACCGGCTGTTATCCGGAGGATATTTCCTGCAAAGCCAGCTGCACT
GGGGATGGTATCTTCTGTTAGCAGAAAAGAAGATAAACTGGTTATAGAAACCGATGATTTCCCGGGAAATCAAATGTCTC
TGTCTTATTACAGGTATACAACTTTGATAGACTGTTATTATAAATTTTACCTGGAAAAGTTAGTCCGGCTTGCTGAAGAC
AGGGTGGTAGTTGACCGGGAGATGAGTCCCCTCCTCTTTGGTAATTTTGTCCATGAAGTCTTTGCTGAAGTTTTAAACCG
TCAGGGACGTAATTTAAATGTATCTAAAGAAGTGGTGGAAGAGGTTATAGTCGATAAACTTAATTCCTACAGGCTTCAGA
TTAATAACTATTACCTGCCATATTACCGGAAAGTTTTACTCCCTACAGTTCGTGATTCGGTTATCAGTTTCTTCAGGGGA
TTAAAAAGAAGGGTTAAAGGAGAGATTGTCGATATTAAAATTGAATGGCAGCCTGAAAAGAGTAAAGACCGGGTCATTTT
TAACCACGATTTTACCGATGTATTCTTAAATGGCCGGGTTGATCTTATCATCGAAACCAGTGATACCCGGTTTATTATAG
ATTTTAAAACAGGCCAGGGCAAGGAAGACCAGCTTGATTTCTATTCCCTGTTGCTTGCCCCTGATTATGGAAGCGAAAAA
AAGGTTGCTAAAGAGCTTTATAATGTCATGAAAGCCAGTTTTAAGGCCGGCGCTCCCGGTACTGAGGAGGAGTTTGCCAG
GGAAATAAGTGAGGAAATAAAGAACTTTTTTGAAGGTGGGGAATATACGACTATTTATAAATCTCGCTGTAAAGATTGTA
ACTGGATGGATATCTGCAGGGTGGTGATAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTATGTTAAAATATACTAATAAAGGAATATGTAACTTAAACTCGAATTATATATAATATAATCACTTTATTTACATAAA
GGAGGGAAAGGGTAAACCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAAGTATTGAAAGCCAGTGCAGGAACAGGGAAGACCTATCGACTTTCTTTAGAATATGTTAATTCATTGCTCCGGGGG
CAGTCCTTTGATGAAATTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 864; Mature: 864

Protein sequence:

>864_residues
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LLTEREKKELQISDYFDAIEFASEFFNFFNELNEYGVKNIDNLRKWQEKKYNLFKTIRKRYRKRLEELNYTDRTLAFNFN
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Sequences:

>Translated_864_residues
MNFTYLDYHEDLFSKIISNDLPRIYVFDNTNNMLKAREYYKKPLLQRGSIFITISDLKEKLFPTDRLILKEEKLAVIFYE
LLTEREKKELQISDYFDAIEFASEFFNFFNELNEYGVKNIDNLRKWQEKKYNLFKTIRKRYRKRLEELNYTDRTLAFNFN
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KVAKELYNVMKASFKAGAPGTEEEFAREISEEIKNFFEGGEYTTIYKSRCKDCNWMDICRVVIE
>Mature_864_residues
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LLTEREKKELQISDYFDAIEFASEFFNFFNELNEYGVKNIDNLRKWQEKKYNLFKTIRKRYRKRLEELNYTDRTLAFNFN
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QMVNLISKMEAENGNITILDADYNNTCYHRLISPDKIDIDRDLSFTETKIYRFLEVIYNLLKNADSTDGFLRVELNDLLE
ACYLQEFRDYFSINENAVKVLQELAREEYAYFYPGFIKRYISLKRFGEVLEEIEKLRQIENINQLCNYLENLNLYFLNDR
EISNNITQYFDALLELNSLEEMGIVSSWDHYFKDKARGLFRMALNYLRYKKVKPVIDNQNKGNKLDSLFSAPHLSRDILI
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DLKEAEITSRQLPAVIRRIFPAKPAALGMVSSVSRKEDKLVIETDDFPGNQMSLSYYRYTTLIDCYYKFYLEKLVRLAED
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KVAKELYNVMKASFKAGAPGTEEEFAREISEEIKNFFEGGEYTTIYKSRCKDCNWMDICRVVIE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 102233; Mature: 102233

Theoretical pI: Translated: 5.27; Mature: 5.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNFTYLDYHEDLFSKIISNDLPRIYVFDNTNNMLKAREYYKKPLLQRGSIFITISDLKEK
CCCEEECHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHH
LFPTDRLILKEEKLAVIFYELLTEREKKELQISDYFDAIEFASEFFNFFNELNEYGVKNI
HCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
DNLRKWQEKKYNLFKTIRKRYRKRLEELNYTDRTLAFNFNNFCSHFMEGYNELVFVNIVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEC
FTPKEKRLLKLLQETGKEINLVLQLSPDDFDEESLRLKSVTLPEELSSEIELYYTGERLT
CCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCHHEEEEECCCCHHHCCCEEEEECHHHHH
QMVNLISKMEAENGNITILDADYNNTCYHRLISPDKIDIDRDLSFTETKIYRFLEVIYNL
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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FAEVLNRQGRNLNVSKEVVEEVIVDKLNSYRLQINNYYLPYYRKVLLPTVRDSVISFFRG
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CCCCHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EYTTIYKSRCKDCNWMDICRVVIE
CEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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EYTTIYKSRCKDCNWMDICRVVIE
CEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA