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The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 218906395

GI number: 218906395

Start: 5002081

End: 5004081

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: BCAH820_5309

Alternate gene names: 218906395

Gene position: 5004081-5002081 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218906397

Following gene: 218906391

Centisome position: 94.37

GC content: 38.58

Gene sequence:

>2001_bases
ATGAAGGGAATTCAACTTATATTTAAAGATTGGAAAGCGATGTGGCACCATAAACATGGACGTATCGCTTTAATTTTTTT
ATTAATCGTTCCTTTAATTTATTCAGGATTCTTTTTAGCTGGATATTGGGATCCGTACGGAAGATTAGATAAATTACCTG
TTGCGATTGTAAATTTAGATAAAGGTGCCGCGATGGATGAGAAAACAATTCATGCAGGAGACGATTTCGTAAAAAATTTA
AAAGAGAATAAGGAACTGGCTTTTCATTTCGTATCAGAAAAAAATGCTGACGAAGGATTAAAAGAAGATAAGTACTATAT
GGTTGTTACGATTCCAGAGGATTTCTCTAAAAAGGTAAGTACACTTATGGATGAGAAACCAGAGCCAGCGCAGCTTCAGT
ACAAAGTAAATCCGGGTAAAAACTTTGTAGCAGCGCAAATTGGAACGACAGCTGTTGAAAATATGAAAACAAAAATTTCA
AATAGTATTACGAAATCTTATACAGAAGGTGTCTTTTCAAAGTTTCAAGACTTAGCACAAGGGTTGAATGATGCAAGTCA
TGGTGCTGGGAAGTTACATGAAGGAACGACAGATGCGAAAGATGGGGCAAATCAGCTCGCAGATGGTATTCATCGTTTAA
GTGACGGGACATCAAAAGTGAAAGAGGGAAGTGACAAACTTGCTTCTAGCCAATCTGCCTTAACTGACGGAGCAAATGGG
CTAAGTCAAGGAGCAACCTCACTTCATAGCGGGATGGAGTTATTGACACAAGGTGAAAAAACTTTACAATCAGGGGTTAG
TGAATTAAGTGCTGGTACAAATGAATGGGTGAACGGAAGTGAGAAACTTGCTGAAGGGCAAGTGAAAGCGGACAATGCAG
CAGATAGTGTAAAACAACAATTAGAAGAGTACGTGAAAAGTCATCCAGAAGTGCAGCAAGACCCTGCTTTTCAAAAGATT
ATTGCTACGTCTAATGGATTAGCTAAAGCAACAAACACCTTAAATAATAGCCAGCAACAATTGACGCAAGGTGCAAAGAA
GCTTGCGGATGGTCAACATAAGATTGAAGAAGGTATAAATACATTCGGAGTTAAGTTAAATGAGGCTACTGCTGGAACGA
AAAAGATAGCAGATGGTGCGGCGAATTTAGCTAGTGGATTTACGAAATGGGGAACTGGATTTACATCATTACAAGAAGGT
GTCAATCAACTTGCGAGTGGCGGAACAGAGCTGAATCATGGTGTTGATCAGTTAACGAACGGACTTGTTAAACTTGACGA
TGGTGCGAAAGAACTTTCTACGAAATTAGGAGAGGGCGCAGCGAAGATCGCAGATGTTCGCAATGATGATGCACGCAATA
CGATGTTCTCAGAGCCGGTTCAATTAGTGAAGTCAACAGTTTCTGACGTACCTAATTACGGTTCAGGTATTGCACCATAT
TTCTTATCGCTTGCGTTTTATGTTGGCGGAATTATGGCGTCGAATATTTTACCGCTTGGCCGTAGACAAAATATGAAAGT
AAGTGGAACAGTACATTTTATTAATAAATTAGGATTGGTATATGTAATTGGACTTATTCAAGCATTGCTTGTAGATGTAG
TTGTGCTAGGAGTTATGAAATTAGAAGTTGCAAGTGTGCCACTCTTTGTTTTATCAAGTATCGTTATTTCCTTTACGTTT
ATGACGTTTATTCTTATGTTAGTAACAGTATTTGGTCTTGTTGGAAAGTTCTTAGCGGTAACGCTTCTTGTCCTGCAGTT
AGCGACGAGCGGGGGTACTTTCCCAGGAGAATTAAATATAGCTGTTCTTAGCAAAATTGGACAATTTCTCCCAATGTCTC
ATTCTCTTAGAGGATTGCAAGATGTGATTTCTTTAGGAGATTGGTCGCAATTACAAATGCAAATTTTAATATTGTTATGC
TATCTCGTTGTTGCTGGTGGAATTGCTTGGATCATGAGCCATATACAACATAGGGAAACGAATGTAGAAAAAGTTTCTTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGATAATTAAAGATGTATTATACAGTATGGAAATGGACGTGTATAGTAAATCTGTTAAACCATTCTAATGGTGTTAAAT
TAGGAGAAGGAGTATGTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGAAAGAAGCTATCCGGTTTTTTCGGATAGCTTCTTTTTTATTTGCGTTCCATTACCGCAAAGTAATTGTTTTCATTA
TCAGCAAAGTTAAAAGCTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 666; Mature: 666

Protein sequence:

>666_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTDAKDGANQLADGIHRLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTDGANG
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAADSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
IATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWIMSHIQHRETNVEKVS

Sequences:

>Translated_666_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTDAKDGANQLADGIHRLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTDGANG
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAADSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
IATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWIMSHIQHRETNVEKVS
>Mature_666_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTDAKDGANQLADGIHRLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTDGANG
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAADSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
IATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWIMSHIQHRETNVEKVS

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71704; Mature: 71704

Theoretical pI: Translated: 6.62; Mature: 6.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLD
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
KGAAMDEKTIHAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHH
TLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLNDASHGAGKLHEGTTDAKDGANQLADGIHRLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTDGANG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCH
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAADSVKQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGIN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHH
TFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN
HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC
GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWIMSHIQHRET
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NVEKVS
CCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLD
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
KGAAMDEKTIHAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHH
TLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLNDASHGAGKLHEGTTDAKDGANQLADGIHRLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTDGANG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCH
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAADSVKQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGIN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHH
TFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN
HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC
GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWIMSHIQHRET
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NVEKVS
CCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]