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The map label for this gene is ydeR [H]

Identifier: 218904460

GI number: 218904460

Start: 3190916

End: 3192094

Strand: Reverse

Name: ydeR [H]

Synonym: BCAH820_3344

Alternate gene names: 218904460

Gene position: 3192094-3190916 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218904461

Following gene: 218904459

Centisome position: 60.2

GC content: 32.91

Gene sequence:

>1179_bases
TTGGCGATTAGTTGTGGTTCACTTGCTGCAAATATTTATTATGCACAACCAATTGTACAATTCATTGCAAAGGACTTAAA
TATCTCCTCTGATTTATCTGGATTGCTCACTACTTTGACGCAAATTGGGTATGGGCTGGGATTGTTTTTTATCGTACCAA
TGGCAGATTTATTTAAAAGTAAGAAAATAATAGGGATTCTTATCGGGCTTACTATTCTTTCGTTAATGGGTACGCTAATT
TCGACAAATGGAAATATTTTTTTACTATTAACAACTATAATTGGCATTGGAGCCTGTGCAGCTCAAATGTTAGTTCCGCT
AACAATGCGGATTGTACCTATTGAAGAGACGGGTAAATATGTGGGTAAAGTAATGAGTGGTTTATTGATTGGGATTATGA
TTGCTCGCCCATTATCTATCGGAATAGCTGACTGGTTTGGCTGGAGAATGGTATTCCTTGCTTCATTAATAGTCTTAGTT
GTTGTCTTACTGTTAATTATAAAATTTTTACCTAACTATGAAGTGATATCGACTAGTAACATGCGATATCCATATTTAAT
AGCTTCTATGGTAAAACTACTTATACATACTTCTCCGCTACAACAAAGAGCTTTTTATCACGCATGCTTATTCGCAACAT
TTAGCCTGTATTGGACAGTTATGCCCATTTTATTAAGAGCAGAGCCATTACATTTCTCAAACAATGAAATTGCATTGTTT
GGATTTGTTGCAATAGCTGGAGCGTTATTAACTCCTACTATTGGTAAAATAGCAGATAAAGGTCATATTTTTACAATGAC
TAATGTATCAATGATGCTCGTACTATTATCTGTCATACTATTATTTTTTGTTCAAGATCATTCACTATTTAGTATGATAT
TAATACTTATCTCAGGCATTTGCGTCGATATTGGTGTAGCGGGAAATTTATTATTAGGTCAAAAAGTTATCTTTAGTTTG
AATCCGGAGATAAGAAATAGACTGAATGGATTATATATGACTATTTTCTTTTTGGGAGGAGCCTTTGGTTCATGGATTGG
AAGTTATACGTACTATAAATTTAATAGTGAAGTAACTTTACTCATTGGAGTAGCTTTTCCTTTAATTGCTTTATTCGTTC
ATTTCATAAAAAATAATACAAAAAAATTATCGGAAACCAAAAGTGAGTTCATATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACCTATAGTCTTTCTTTTTTTAATAATTTCGGAATGAACGTTCCAAAAAAGAAAGGAATGGTAAAGTTGAATAACAAGA
CAAATTTTCTAATATTTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATTTATGTCTCTAAAAAGTCAGGGTTATAATCCAATTTGAGGATACCTCAAAATTGGGGGTGACGGGCAGAGAGATCA
TCATATGCCAATCAATTTAA

Product: bicyclomycin resistance protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 392; Mature: 391

Protein sequence:

>392_residues
MAISCGSLAANIYYAQPIVQFIAKDLNISSDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGLTILSLMGTLI
STNGNIFLLLTTIIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEETGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGIADWFGWRMVFLASLIVLV
VVLLLIIKFLPNYEVISTSNMRYPYLIASMVKLLIHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVMPILLRAEPLHFSNNEIALF
GFVAIAGALLTPTIGKIADKGHIFTMTNVSMMLVLLSVILLFFVQDHSLFSMILILISGICVDIGVAGNLLLGQKVIFSL
NPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSWIGSYTYYKFNSEVTLLIGVAFPLIALFVHFIKNNTKKLSETKSEFIS

Sequences:

>Translated_392_residues
MAISCGSLAANIYYAQPIVQFIAKDLNISSDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGLTILSLMGTLI
STNGNIFLLLTTIIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEETGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGIADWFGWRMVFLASLIVLV
VVLLLIIKFLPNYEVISTSNMRYPYLIASMVKLLIHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVMPILLRAEPLHFSNNEIALF
GFVAIAGALLTPTIGKIADKGHIFTMTNVSMMLVLLSVILLFFVQDHSLFSMILILISGICVDIGVAGNLLLGQKVIFSL
NPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSWIGSYTYYKFNSEVTLLIGVAFPLIALFVHFIKNNTKKLSETKSEFIS
>Mature_391_residues
AISCGSLAANIYYAQPIVQFIAKDLNISSDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKSKKIIGILIGLTILSLMGTLIS
TNGNIFLLLTTIIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEETGKYVGKVMSGLLIGIMIARPLSIGIADWFGWRMVFLASLIVLVV
VLLLIIKFLPNYEVISTSNMRYPYLIASMVKLLIHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVMPILLRAEPLHFSNNEIALFG
FVAIAGALLTPTIGKIADKGHIFTMTNVSMMLVLLSVILLFFVQDHSLFSMILILISGICVDIGVAGNLLLGQKVIFSLN
PEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSWIGSYTYYKFNSEVTLLIGVAFPLIALFVHFIKNNTKKLSETKSEFIS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43081; Mature: 42950

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAISCGSLAANIYYAQPIVQFIAKDLNISSDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKIIGILIGLTILSLMGTLISTNGNIFLLLTTIIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEETGKY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHH
VGKVMSGLLIGIMIARPLSIGIADWFGWRMVFLASLIVLVVVLLLIIKFLPNYEVISTSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCC
MRYPYLIASMVKLLIHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVMPILLRAEPLHFSNNEIALF
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEH
GFVAIAGALLTPTIGKIADKGHIFTMTNVSMMLVLLSVILLFFVQDHSLFSMILILISGI
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
CVDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSWIGSYTYYKFNSEVTL
HHHHCCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEE
LIGVAFPLIALFVHFIKNNTKKLSETKSEFIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
AISCGSLAANIYYAQPIVQFIAKDLNISSDLSGLLTTLTQIGYGLGLFFIVPMADLFKS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKIIGILIGLTILSLMGTLISTNGNIFLLLTTIIGIGACAAQMLVPLTMRIVPIEETGKY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHH
VGKVMSGLLIGIMIARPLSIGIADWFGWRMVFLASLIVLVVVLLLIIKFLPNYEVISTSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCC
MRYPYLIASMVKLLIHTSPLQQRAFYHACLFATFSLYWTVMPILLRAEPLHFSNNEIALF
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEH
GFVAIAGALLTPTIGKIADKGHIFTMTNVSMMLVLLSVILLFFVQDHSLFSMILILISGI
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
CVDIGVAGNLLLGQKVIFSLNPEIRNRLNGLYMTIFFLGGAFGSWIGSYTYYKFNSEVTL
HHHHCCCCCHHHCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEE
LIGVAFPLIALFVHFIKNNTKKLSETKSEFIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]